MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_016445	GTT	2	6	1012386	1012391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035332
19502	NC_016445	GT	3	6	1012425	1012430	0 %	50 %	50 %	0 %	360035332
19503	NC_016445	GGC	2	6	1012457	1012462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035332
19504	NC_016445	GTA	2	6	1012616	1012621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035332
19505	NC_016445	GCA	2	6	1012673	1012678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035332
19506	NC_016445	GTT	2	6	1012687	1012692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035332
19507	NC_016445	CAT	2	6	1012832	1012837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035333
19508	NC_016445	ATG	2	6	1013011	1013016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035333
19509	NC_016445	TGCCTT	2	12	1013096	1013107	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	360035333
19510	NC_016445	T	6	6	1013106	1013111	0 %	100 %	0 %	0 %	360035333
19511	NC_016445	GAC	2	6	1013166	1013171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035333
19512	NC_016445	GTA	2	6	1013195	1013200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035333
19513	NC_016445	A	6	6	1013276	1013281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19514	NC_016445	AAGA	2	8	1013285	1013292	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19515	NC_016445	TTA	2	6	1013314	1013319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19516	NC_016445	CATA	2	8	1013353	1013360	50 %	25 %	0 %	25 %	360035334
19517	NC_016445	TTC	2	6	1013382	1013387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035334
19518	NC_016445	CTGCTT	2	12	1013570	1013581	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	360035334
19519	NC_016445	TAAC	2	8	1013620	1013627	50 %	25 %	0 %	25 %	360035334
19520	NC_016445	CTTC	2	8	1013630	1013637	0 %	50 %	0 %	50 %	360035334
19521	NC_016445	TGG	2	6	1013699	1013704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035334
19522	NC_016445	CAC	2	6	1013723	1013728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035334
19523	NC_016445	CAT	2	6	1013741	1013746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035334
19524	NC_016445	GTG	2	6	1013881	1013886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035334
19525	NC_016445	GTA	2	6	1013922	1013927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035334
19526	NC_016445	CGT	2	6	1013936	1013941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035334
19527	NC_016445	GTT	2	6	1013966	1013971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035334
19528	NC_016445	GCA	2	6	1013986	1013991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035334
19529	NC_016445	TTC	2	6	1014006	1014011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035334
19530	NC_016445	GGTCT	2	10	1014024	1014033	0 %	40 %	40 %	20 %	360035334
19531	NC_016445	TAAA	2	8	1014087	1014094	75 %	25 %	0 %	0 %	360035334
19532	NC_016445	AATA	2	8	1014117	1014124	75 %	25 %	0 %	0 %	360035334
19533	NC_016445	CCA	2	6	1014132	1014137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035334
19534	NC_016445	GTT	2	6	1014150	1014155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035334
19535	NC_016445	CTT	2	6	1014197	1014202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035334
19536	NC_016445	GAT	2	6	1014276	1014281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035334
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19540	NC_016445	CATC	2	8	1014533	1014540	25 %	25 %	0 %	50 %	360035336
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19542	NC_016445	T	6	6	1014658	1014663	0 %	100 %	0 %	0 %	360035336
19543	NC_016445	GCCA	2	8	1014664	1014671	25 %	0 %	25 %	50 %	360035336
19544	NC_016445	TCA	2	6	1014739	1014744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035336
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19547	NC_016445	AGT	2	6	1015075	1015080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035336
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19549	NC_016445	AAG	2	6	1015211	1015216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035337
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19551	NC_016445	CCAA	2	8	1015486	1015493	50 %	0 %	0 %	50 %	360035337
19552	NC_016445	TTGA	2	8	1015556	1015563	25 %	50 %	25 %	0 %	360035337
19553	NC_016445	CAT	2	6	1015564	1015569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035337
19554	NC_016445	GAA	2	6	1015623	1015628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035337
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19557	NC_016445	AG	3	6	1015794	1015799	50 %	0 %	50 %	0 %	360035337
19558	NC_016445	AGAC	2	8	1015825	1015832	50 %	0 %	25 %	25 %	360035337
19559	NC_016445	AGT	2	6	1015872	1015877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035337
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19561	NC_016445	GCCG	2	8	1015894	1015901	0 %	0 %	50 %	50 %	360035337
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19564	NC_016445	TAA	3	9	1016037	1016045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035337
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19566	NC_016445	GCGATG	2	12	1016141	1016152	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	360035337
19567	NC_016445	AAGGT	2	10	1016202	1016211	40 %	20 %	40 %	0 %	360035337
19568	NC_016445	ATA	2	6	1016308	1016313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035337
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19571	NC_016445	TTAA	2	8	1016568	1016575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19572	NC_016445	TCG	2	6	1016602	1016607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19573	NC_016445	ACC	2	6	1016612	1016617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19575	NC_016445	TTG	2	6	1016659	1016664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19583	NC_016445	AAC	2	6	1017275	1017280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035339
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19588	NC_016445	TGA	2	6	1017463	1017468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035339
19589	NC_016445	GCT	2	6	1017531	1017536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035339
19590	NC_016445	ACGGC	2	10	1017538	1017547	20 %	0 %	40 %	40 %	360035339
19591	NC_016445	TC	3	6	1017553	1017558	0 %	50 %	0 %	50 %	360035339
19592	NC_016445	GAA	2	6	1017678	1017683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035339
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19597	NC_016445	GCATT	2	10	1017808	1017817	20 %	40 %	20 %	20 %	360035339
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19602	NC_016445	CG	3	6	1018198	1018203	0 %	0 %	50 %	50 %	360035339
19603	NC_016445	AGC	2	6	1018330	1018335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035339
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19612	NC_016445	AT	3	6	1018630	1018635	50 %	50 %	0 %	0 %	360035340
19613	NC_016445	TGA	2	6	1018642	1018647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035340
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19615	NC_016445	TTA	2	6	1018898	1018903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035340
19616	NC_016445	AGA	2	6	1018999	1019004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035340
19617	NC_016445	GAT	2	6	1019098	1019103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035340
19618	NC_016445	GATT	2	8	1019142	1019149	25 %	50 %	25 %	0 %	360035340
19619	NC_016445	GCT	2	6	1019188	1019193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035340
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19639	NC_016445	A	7	7	1019928	1019934	100 %	0 %	0 %	0 %	360035340
19640	NC_016445	ATGG	2	8	1019978	1019985	25 %	25 %	50 %	0 %	360035340
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19646	NC_016445	GCA	2	6	1020120	1020125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035340
19647	NC_016445	CAT	2	6	1020130	1020135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035340
19648	NC_016445	TCT	2	6	1020204	1020209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19649	NC_016445	TTG	2	6	1020239	1020244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035341
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19657	NC_016445	GTA	2	6	1020703	1020708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035341
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19714	NC_016445	GTGC	2	8	1024042	1024049	0 %	25 %	50 %	25 %	360035343
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19718	NC_016445	CAA	2	6	1024350	1024355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035343
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19722	NC_016445	TGGT	2	8	1024639	1024646	0 %	50 %	50 %	0 %	360035343
19723	NC_016445	CAT	2	6	1024647	1024652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035343
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19725	NC_016445	GCA	2	6	1024742	1024747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035343
19726	NC_016445	TTA	2	6	1024771	1024776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035343
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19728	NC_016445	T	6	6	1024808	1024813	0 %	100 %	0 %	0 %	360035343
19729	NC_016445	GCA	2	6	1024915	1024920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035343
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19731	NC_016445	CCA	2	6	1024965	1024970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035343
19732	NC_016445	AAAG	2	8	1025045	1025052	75 %	0 %	25 %	0 %	360035343
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19852	NC_016445	CAT	2	6	1030235	1030240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035346
19853	NC_016445	TGA	2	6	1030310	1030315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035346
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19963	NC_016445	ATG	2	6	1035739	1035744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035346
19964	NC_016445	TAC	2	6	1035838	1035843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035346
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