MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19121	NC_016445	TGA	2	6	993371	993376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035312
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19123	NC_016445	TAA	2	6	993414	993419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035312
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19129	NC_016445	TGA	2	6	993644	993649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035313
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19235	NC_016445	A	6	6	998841	998846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19236	NC_016445	CGT	2	6	998852	998857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19242	NC_016445	TCCA	2	8	999164	999171	25 %	25 %	0 %	50 %	360035319
19243	NC_016445	A	6	6	999171	999176	100 %	0 %	0 %	0 %	360035319
19244	NC_016445	CTT	2	6	999216	999221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035319
19245	NC_016445	CATC	2	8	999432	999439	25 %	25 %	0 %	50 %	360035319
19246	NC_016445	T	6	6	999496	999501	0 %	100 %	0 %	0 %	360035319
19247	NC_016445	TTG	2	6	999584	999589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035319
19248	NC_016445	GCA	2	6	999645	999650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035319
19249	NC_016445	CTT	2	6	999654	999659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035319
19250	NC_016445	GGAA	2	8	999685	999692	50 %	0 %	50 %	0 %	360035319
19251	NC_016445	GTAG	2	8	999754	999761	25 %	25 %	50 %	0 %	360035319
19252	NC_016445	TCT	2	6	999797	999802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035319
19253	NC_016445	AT	3	6	999818	999823	50 %	50 %	0 %	0 %	360035319
19254	NC_016445	CATTG	2	10	999862	999871	20 %	40 %	20 %	20 %	360035319
19255	NC_016445	GTG	2	6	999872	999877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035319
19256	NC_016445	TGC	3	9	999883	999891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035319
19257	NC_016445	AGAA	2	8	999943	999950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19258	NC_016445	A	9	9	999987	999995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19259	NC_016445	GCA	2	6	999999	1000004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19260	NC_016445	TCT	2	6	1000124	1000129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035320
19261	NC_016445	ATC	2	6	1000247	1000252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035320
19262	NC_016445	TG	3	6	1000254	1000259	0 %	50 %	50 %	0 %	360035320
19263	NC_016445	AGA	2	6	1000282	1000287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035320
19264	NC_016445	CAACC	2	10	1000302	1000311	40 %	0 %	0 %	60 %	360035320
19265	NC_016445	CTT	2	6	1000320	1000325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035320
19266	NC_016445	CTT	2	6	1000353	1000358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035320
19267	NC_016445	GCC	2	6	1000364	1000369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035320
19268	NC_016445	GCT	2	6	1000370	1000375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035320
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19270	NC_016445	GTC	2	6	1000504	1000509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035320
19271	NC_016445	ATC	2	6	1000567	1000572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035320
19272	NC_016445	AGT	2	6	1000695	1000700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035320
19273	NC_016445	GTT	2	6	1000702	1000707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035320
19274	NC_016445	T	6	6	1000776	1000781	0 %	100 %	0 %	0 %	360035320
19275	NC_016445	GCA	2	6	1000782	1000787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035320
19276	NC_016445	TCA	2	6	1000793	1000798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035320
19277	NC_016445	GTAG	2	8	1000816	1000823	25 %	25 %	50 %	0 %	360035320
19278	NC_016445	CCGCTG	2	12	1000995	1001006	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	360035320
19279	NC_016445	ACA	2	6	1001013	1001018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035320
19280	NC_016445	T	6	6	1001059	1001064	0 %	100 %	0 %	0 %	360035320
19281	NC_016445	AAC	2	6	1001192	1001197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035321
19282	NC_016445	ACA	2	6	1001207	1001212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035321
19283	NC_016445	TGA	2	6	1001337	1001342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035321
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19285	NC_016445	AACC	2	8	1001375	1001382	50 %	0 %	0 %	50 %	360035321
19286	NC_016445	TGC	2	6	1001458	1001463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035321
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19289	NC_016445	GAA	2	6	1001557	1001562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035321
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19291	NC_016445	CAT	2	6	1001629	1001634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035321
19292	NC_016445	CAC	2	6	1001656	1001661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035321
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19297	NC_016445	GAT	2	6	1001875	1001880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035321
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19299	NC_016445	TAG	2	6	1001983	1001988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035322
19300	NC_016445	CAG	2	6	1002093	1002098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035322
19301	NC_016445	CCG	2	6	1002109	1002114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035322
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19304	NC_016445	TTG	2	6	1002226	1002231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035322
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19306	NC_016445	CAA	2	6	1002312	1002317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035322
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19312	NC_016445	TCA	2	6	1002679	1002684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035322
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19314	NC_016445	AACC	2	8	1002742	1002749	50 %	0 %	0 %	50 %	360035322
19315	NC_016445	TCA	2	6	1002794	1002799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035322
19316	NC_016445	ATC	2	6	1002871	1002876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035323
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19320	NC_016445	TTC	2	6	1003006	1003011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035323
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19323	NC_016445	TCG	2	6	1003124	1003129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035323
19324	NC_016445	CGAT	2	8	1003133	1003140	25 %	25 %	25 %	25 %	360035323
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19327	NC_016445	GAG	2	6	1003218	1003223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360035323
19328	NC_016445	GAT	2	6	1003258	1003263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035323
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19330	NC_016445	GTT	2	6	1003338	1003343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035323
19331	NC_016445	GCTC	2	8	1003347	1003354	0 %	25 %	25 %	50 %	360035323
19332	NC_016445	GC	4	8	1003433	1003440	0 %	0 %	50 %	50 %	360035323
19333	NC_016445	TGC	2	6	1003454	1003459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035323
19334	NC_016445	CCA	2	6	1003463	1003468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035323
19335	NC_016445	GTT	2	6	1003650	1003655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035323
19336	NC_016445	CAG	2	6	1003656	1003661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035323
19337	NC_016445	ATC	2	6	1003681	1003686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035323
19338	NC_016445	CGT	2	6	1003741	1003746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035323
19339	NC_016445	TGT	2	6	1003883	1003888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035323
19340	NC_016445	TTG	2	6	1003937	1003942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19341	NC_016445	CAT	2	6	1003972	1003977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19342	NC_016445	ATCA	2	8	1004104	1004111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19343	NC_016445	GAT	2	6	1004129	1004134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19344	NC_016445	AGC	2	6	1004158	1004163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19345	NC_016445	AG	3	6	1004257	1004262	50 %	0 %	50 %	0 %	360035324
19346	NC_016445	GGC	2	6	1004272	1004277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035324
19347	NC_016445	T	6	6	1004414	1004419	0 %	100 %	0 %	0 %	360035324
19348	NC_016445	TC	3	6	1004448	1004453	0 %	50 %	0 %	50 %	360035324
19349	NC_016445	TCTG	2	8	1004460	1004467	0 %	50 %	25 %	25 %	360035324
19350	NC_016445	AGG	2	6	1004474	1004479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360035324
19351	NC_016445	GC	3	6	1004546	1004551	0 %	0 %	50 %	50 %	360035324
19352	NC_016445	GAT	2	6	1004697	1004702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035324
19353	NC_016445	TC	3	6	1004724	1004729	0 %	50 %	0 %	50 %	360035324
19354	NC_016445	AAAG	2	8	1004766	1004773	75 %	0 %	25 %	0 %	360035324
19355	NC_016445	CTAT	2	8	1004840	1004847	25 %	50 %	0 %	25 %	360035324
19356	NC_016445	ATG	2	6	1004869	1004874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035324
19357	NC_016445	GTT	2	6	1004904	1004909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035324
19358	NC_016445	TCT	2	6	1004918	1004923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035324
19359	NC_016445	ATT	2	6	1004938	1004943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035324
19360	NC_016445	ATC	2	6	1004974	1004979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035324
19361	NC_016445	AAC	3	9	1005013	1005021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035324
19362	NC_016445	TCT	2	6	1005022	1005027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035324
19363	NC_016445	TGGTT	2	10	1005063	1005072	0 %	60 %	40 %	0 %	360035325
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19392	NC_016445	A	6	6	1006490	1006495	100 %	0 %	0 %	0 %	360035326
19393	NC_016445	TTTG	2	8	1006547	1006554	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19394	NC_016445	TCT	2	6	1006658	1006663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035327
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19478	NC_016445	GGT	2	6	1011139	1011144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035332
19479	NC_016445	CGGT	2	8	1011358	1011365	0 %	25 %	50 %	25 %	360035332
19480	NC_016445	GA	3	6	1011371	1011376	50 %	0 %	50 %	0 %	360035332
19481	NC_016445	GCA	2	6	1011468	1011473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035332
19482	NC_016445	ATG	2	6	1011483	1011488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035332
19483	NC_016445	CAA	2	6	1011490	1011495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035332
19484	NC_016445	GGA	2	6	1011539	1011544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360035332
19485	NC_016445	CAT	2	6	1011550	1011555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035332
19486	NC_016445	TCA	2	6	1011624	1011629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035332
19487	NC_016445	TCA	2	6	1011705	1011710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035332
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19489	NC_016445	CTG	2	6	1011742	1011747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035332
19490	NC_016445	TTG	2	6	1011809	1011814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035332
19491	NC_016445	GTT	2	6	1011825	1011830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035332
19492	NC_016445	GCC	2	6	1011873	1011878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035332
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19496	NC_016445	GA	4	8	1012013	1012020	50 %	0 %	50 %	0 %	360035332
19497	NC_016445	GAGTA	2	10	1012089	1012098	40 %	20 %	40 %	0 %	360035332
19498	NC_016445	CAGC	2	8	1012189	1012196	25 %	0 %	25 %	50 %	360035332
19499	NC_016445	ATC	2	6	1012197	1012202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035332
19500	NC_016445	GAG	2	6	1012370	1012375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360035332

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