MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

< Previous12...3233343536373839404142...115116Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_016445	CAG	2	6	936282	936287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035265
18003	NC_016445	TGC	2	6	936350	936355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035265
18004	NC_016445	TTA	2	6	936411	936416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035265
18005	NC_016445	CGA	2	6	936427	936432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035265
18006	NC_016445	GAA	3	9	936435	936443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035265
18007	NC_016445	AGC	2	6	936445	936450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035265
18008	NC_016445	AAGC	2	8	936477	936484	50 %	0 %	25 %	25 %	360035265
18009	NC_016445	GATT	2	8	936485	936492	25 %	50 %	25 %	0 %	360035265
18010	NC_016445	TCA	2	6	936497	936502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035265
18011	NC_016445	TGA	2	6	936548	936553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035265
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18014	NC_016445	TTA	2	6	936612	936617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035265
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18021	NC_016445	ATGA	2	8	937175	937182	50 %	25 %	25 %	0 %	360035266
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18035	NC_016445	TCTTG	2	10	937720	937729	0 %	60 %	20 %	20 %	360035266
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18043	NC_016445	TGC	2	6	938114	938119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18045	NC_016445	CGG	2	6	938247	938252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035267
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18061	NC_016445	TTTG	2	8	939053	939060	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18110	NC_016445	T	7	7	941208	941214	0 %	100 %	0 %	0 %	360035269
18111	NC_016445	ACGGCG	2	12	941228	941239	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	360035269
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18120	NC_016445	GGC	2	6	941591	941596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035269
18121	NC_016445	GTAAC	2	10	941620	941629	40 %	20 %	20 %	20 %	360035269
18122	NC_016445	GGC	2	6	941637	941642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035269
18123	NC_016445	TG	3	6	941703	941708	0 %	50 %	50 %	0 %	360035269
18124	NC_016445	ACCG	2	8	941753	941760	25 %	0 %	25 %	50 %	360035269
18125	NC_016445	GCG	2	6	941771	941776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035269
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18128	NC_016445	GC	3	6	941876	941881	0 %	0 %	50 %	50 %	360035269
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18131	NC_016445	TGA	2	6	942031	942036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035269
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18133	NC_016445	CAC	2	6	942128	942133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035269
18134	NC_016445	TGG	2	6	942141	942146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035269
18135	NC_016445	ACTGC	2	10	942213	942222	20 %	20 %	20 %	40 %	360035269
18136	NC_016445	GTA	2	6	942235	942240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035269
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18138	NC_016445	GCC	2	6	942320	942325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035269
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18141	NC_016445	T	6	6	942449	942454	0 %	100 %	0 %	0 %	360035269
18142	NC_016445	TGT	2	6	942502	942507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035269
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18145	NC_016445	GAT	2	6	942676	942681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035269
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18147	NC_016445	AGC	2	6	942714	942719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035269
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18149	NC_016445	CCAG	2	8	942735	942742	25 %	0 %	25 %	50 %	360035269
18150	NC_016445	CAC	2	6	942803	942808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035269
18151	NC_016445	TGC	2	6	942813	942818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035269
18152	NC_016445	GAT	2	6	942841	942846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035269
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18169	NC_016445	ACC	2	6	943810	943815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035270
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18182	NC_016445	GGCGAG	2	12	944455	944466	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	360035270
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18185	NC_016445	TCACT	2	10	944613	944622	20 %	40 %	0 %	40 %	360035270
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18193	NC_016445	GAAT	2	8	945236	945243	50 %	25 %	25 %	0 %	360035270
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18210	NC_016445	CT	3	6	945970	945975	0 %	50 %	0 %	50 %	360035271
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18212	NC_016445	CA	3	6	945981	945986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18213	NC_016445	ATA	2	6	946067	946072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18214	NC_016445	T	6	6	946118	946123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18215	NC_016445	TGG	2	6	946230	946235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18216	NC_016445	AGTG	2	8	946246	946253	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18217	NC_016445	AT	3	6	946365	946370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18218	NC_016445	CA	3	6	946371	946376	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18219	NC_016445	TCA	2	6	946380	946385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18220	NC_016445	GATA	2	8	946397	946404	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18221	NC_016445	ATA	2	6	946407	946412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18222	NC_016445	TGT	2	6	946465	946470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035272
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18237	NC_016445	CAT	2	6	947393	947398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035272
18238	NC_016445	AAC	2	6	947419	947424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035272
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18353	NC_016445	CATT	2	8	954128	954135	25 %	50 %	0 %	25 %	360035279
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18483	NC_016445	GGC	2	6	960734	960739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035287
18484	NC_016445	GGA	2	6	960763	960768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360035287
18485	NC_016445	T	6	6	960769	960774	0 %	100 %	0 %	0 %	360035287
18486	NC_016445	CG	3	6	960775	960780	0 %	0 %	50 %	50 %	360035287
18487	NC_016445	GC	3	6	960824	960829	0 %	0 %	50 %	50 %	360035287
18488	NC_016445	CGC	2	6	960929	960934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035287
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18491	NC_016445	GC	3	6	961171	961176	0 %	0 %	50 %	50 %	360035287
18492	NC_016445	TCA	2	6	961198	961203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035287
18493	NC_016445	CATT	2	8	961270	961277	25 %	50 %	0 %	25 %	360035287
18494	NC_016445	CAAG	2	8	961342	961349	50 %	0 %	25 %	25 %	360035287
18495	NC_016445	GCT	2	6	961420	961425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035287
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18500	NC_016445	CG	3	6	961597	961602	0 %	0 %	50 %	50 %	360035287

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