MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_016445	ACC	2	6	908285	908290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17502	NC_016445	TAA	2	6	908374	908379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17503	NC_016445	TGG	2	6	908393	908398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17504	NC_016445	TCAAC	2	10	908466	908475	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17505	NC_016445	AC	3	6	908474	908479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17506	NC_016445	GAT	3	9	908489	908497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035241
17507	NC_016445	TGA	2	6	908555	908560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035241
17508	NC_016445	CT	3	6	908594	908599	0 %	50 %	0 %	50 %	360035241
17509	NC_016445	AAG	2	6	908632	908637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035241
17510	NC_016445	CGG	2	6	908842	908847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035241
17511	NC_016445	GCA	2	6	908899	908904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035241
17512	NC_016445	ATG	2	6	908908	908913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035241
17513	NC_016445	ACC	2	6	908983	908988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035241
17514	NC_016445	GAGCC	2	10	909104	909113	20 %	0 %	40 %	40 %	360035241
17515	NC_016445	GTG	2	6	909330	909335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035241
17516	NC_016445	AAG	2	6	909343	909348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035241
17517	NC_016445	TGAT	2	8	909379	909386	25 %	50 %	25 %	0 %	360035241
17518	NC_016445	TGC	2	6	909412	909417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035241
17519	NC_016445	GAA	2	6	909525	909530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035241
17520	NC_016445	CCG	2	6	909539	909544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035241
17521	NC_016445	AGGC	2	8	909604	909611	25 %	0 %	50 %	25 %	360035242
17522	NC_016445	T	6	6	909667	909672	0 %	100 %	0 %	0 %	360035242
17523	NC_016445	TCA	3	9	909690	909698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035242
17524	NC_016445	CTTCAA	2	12	909750	909761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035242
17525	NC_016445	GGAG	2	8	909768	909775	25 %	0 %	75 %	0 %	360035242
17526	NC_016445	GC	3	6	909871	909876	0 %	0 %	50 %	50 %	360035242
17527	NC_016445	TGA	2	6	909888	909893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035242
17528	NC_016445	GCT	2	6	909894	909899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035242
17529	NC_016445	GTC	2	6	909949	909954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035242
17530	NC_016445	TGA	2	6	910028	910033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035242
17531	NC_016445	CG	3	6	910141	910146	0 %	0 %	50 %	50 %	360035242
17532	NC_016445	AGC	2	6	910157	910162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035242
17533	NC_016445	TC	3	6	910251	910256	0 %	50 %	0 %	50 %	360035242
17534	NC_016445	TGT	2	6	910257	910262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035242
17535	NC_016445	ACC	2	6	910330	910335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035242
17536	NC_016445	GT	3	6	910357	910362	0 %	50 %	50 %	0 %	360035242
17537	NC_016445	GC	3	6	910397	910402	0 %	0 %	50 %	50 %	360035242
17538	NC_016445	CAA	2	6	910422	910427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035242
17539	NC_016445	TGA	2	6	910428	910433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035242
17540	NC_016445	ATG	2	6	910436	910441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035242
17541	NC_016445	T	6	6	910467	910472	0 %	100 %	0 %	0 %	360035242
17542	NC_016445	A	6	6	910573	910578	100 %	0 %	0 %	0 %	360035242
17543	NC_016445	TGA	2	6	910584	910589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035242
17544	NC_016445	TGAT	2	8	910601	910608	25 %	50 %	25 %	0 %	360035242
17545	NC_016445	CGCAG	2	10	910635	910644	20 %	0 %	40 %	40 %	360035242
17546	NC_016445	TGG	3	9	910745	910753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035243
17547	NC_016445	TG	3	6	910772	910777	0 %	50 %	50 %	0 %	360035243
17548	NC_016445	CAG	2	6	910807	910812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035243
17549	NC_016445	GGT	2	6	910833	910838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035243
17550	NC_016445	CG	3	6	910887	910892	0 %	0 %	50 %	50 %	360035243
17551	NC_016445	TTTG	2	8	910893	910900	0 %	75 %	25 %	0 %	360035243
17552	NC_016445	GGT	2	6	911130	911135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035243
17553	NC_016445	CTG	2	6	911138	911143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035243
17554	NC_016445	AAG	2	6	911168	911173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035243
17555	NC_016445	ATG	2	6	911207	911212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035243
17556	NC_016445	GGTTT	2	10	911252	911261	0 %	60 %	40 %	0 %	360035243
17557	NC_016445	CTT	2	6	911276	911281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035243
17558	NC_016445	GC	4	8	911336	911343	0 %	0 %	50 %	50 %	360035243
17559	NC_016445	ACC	2	6	911362	911367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035243
17560	NC_016445	TG	3	6	911462	911467	0 %	50 %	50 %	0 %	360035243
17561	NC_016445	ACA	2	6	911705	911710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035243
17562	NC_016445	TGA	2	6	911719	911724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035243
17563	NC_016445	GCC	2	6	911757	911762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035244
17564	NC_016445	GAGG	2	8	911832	911839	25 %	0 %	75 %	0 %	360035244
17565	NC_016445	AGC	2	6	911842	911847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035244
17566	NC_016445	AATC	2	8	911919	911926	50 %	25 %	0 %	25 %	360035244
17567	NC_016445	ATT	2	6	911934	911939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035244
17568	NC_016445	C	6	6	911965	911970	0 %	0 %	0 %	100 %	360035244
17569	NC_016445	AGCGTT	2	12	912011	912022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	360035244
17570	NC_016445	ATCC	2	8	912039	912046	25 %	25 %	0 %	50 %	360035244
17571	NC_016445	GAA	2	6	912102	912107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035244
17572	NC_016445	A	7	7	912106	912112	100 %	0 %	0 %	0 %	360035244
17573	NC_016445	GGT	2	6	912115	912120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035244
17574	NC_016445	TG	3	6	912189	912194	0 %	50 %	50 %	0 %	360035244
17575	NC_016445	CAG	2	6	912288	912293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035244
17576	NC_016445	GCA	2	6	912297	912302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035244
17577	NC_016445	GCT	2	6	912333	912338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035244
17578	NC_016445	TTG	2	6	912359	912364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035244
17579	NC_016445	TTC	2	6	912392	912397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035245
17580	NC_016445	ATCA	2	8	912452	912459	50 %	25 %	0 %	25 %	360035245
17581	NC_016445	CGG	2	6	912540	912545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035245
17582	NC_016445	TCG	2	6	912603	912608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035245
17583	NC_016445	ATG	2	6	912650	912655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035245
17584	NC_016445	TGA	2	6	912682	912687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035245
17585	NC_016445	ATCA	2	8	912863	912870	50 %	25 %	0 %	25 %	360035245
17586	NC_016445	GTG	2	6	912903	912908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035245
17587	NC_016445	GCA	2	6	913048	913053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035245
17588	NC_016445	AGTG	2	8	913114	913121	25 %	25 %	50 %	0 %	360035245
17589	NC_016445	CG	3	6	913126	913131	0 %	0 %	50 %	50 %	360035245
17590	NC_016445	CAG	2	6	913136	913141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035245
17591	NC_016445	TTTGA	2	10	913265	913274	20 %	60 %	20 %	0 %	360035245
17592	NC_016445	GAGC	2	8	913371	913378	25 %	0 %	50 %	25 %	360035245
17593	NC_016445	CGA	2	6	913444	913449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035245
17594	NC_016445	TCA	2	6	913501	913506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17595	NC_016445	TAC	2	6	913633	913638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035246
17596	NC_016445	AG	3	6	913709	913714	50 %	0 %	50 %	0 %	360035246
17597	NC_016445	AGC	2	6	913729	913734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035246
17598	NC_016445	AAT	2	6	913890	913895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035246
17599	NC_016445	ATTG	2	8	913973	913980	25 %	50 %	25 %	0 %	360035246
17600	NC_016445	GTCG	2	8	914006	914013	0 %	25 %	50 %	25 %	360035246
17601	NC_016445	GCGTTA	2	12	914034	914045	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	360035246
17602	NC_016445	AG	4	8	914101	914108	50 %	0 %	50 %	0 %	360035246
17603	NC_016445	TGA	2	6	914270	914275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035246
17604	NC_016445	TTTAGT	2	12	914303	914314	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	360035246
17605	NC_016445	TCA	2	6	914332	914337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035246
17606	NC_016445	CTT	2	6	914341	914346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035246
17607	NC_016445	TAC	2	6	914350	914355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035246
17608	NC_016445	TTAT	2	8	914362	914369	25 %	75 %	0 %	0 %	360035246
17609	NC_016445	GGT	2	6	914399	914404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035246
17610	NC_016445	CAT	3	9	914549	914557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035246
17611	NC_016445	TTCG	2	8	914746	914753	0 %	50 %	25 %	25 %	360035246
17612	NC_016445	TACC	2	8	914838	914845	25 %	25 %	0 %	50 %	360035246
17613	NC_016445	AAT	2	6	914856	914861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035246
17614	NC_016445	GCA	2	6	914909	914914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035246
17615	NC_016445	TC	3	6	914945	914950	0 %	50 %	0 %	50 %	360035246
17616	NC_016445	AGC	2	6	914980	914985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035246
17617	NC_016445	AGAA	2	8	914996	915003	75 %	0 %	25 %	0 %	360035246
17618	NC_016445	TCAA	2	8	915025	915032	50 %	25 %	0 %	25 %	360035246
17619	NC_016445	TGAT	2	8	915142	915149	25 %	50 %	25 %	0 %	360035246
17620	NC_016445	TGC	2	6	915194	915199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035246
17621	NC_016445	CAA	2	6	915222	915227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035246
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