MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_016445	TCA	2	6	779850	779855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035129
15002	NC_016445	CGC	2	6	779900	779905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035129
15003	NC_016445	CG	3	6	779957	779962	0 %	0 %	50 %	50 %	360035129
15004	NC_016445	AG	3	6	779981	779986	50 %	0 %	50 %	0 %	360035129
15005	NC_016445	ACC	2	6	780095	780100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035129
15006	NC_016445	ACC	2	6	780111	780116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035129
15007	NC_016445	TCT	2	6	780195	780200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035129
15008	NC_016445	CAG	2	6	780254	780259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035129
15009	NC_016445	TTG	2	6	780326	780331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035129
15010	NC_016445	ATCA	2	8	780659	780666	50 %	25 %	0 %	25 %	360035129
15011	NC_016445	TTG	2	6	780668	780673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035129
15012	NC_016445	GCATCG	2	12	780678	780689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	360035129
15013	NC_016445	A	6	6	780903	780908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_016445	TAA	2	6	781061	781066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035130
15015	NC_016445	GAA	2	6	781070	781075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035130
15016	NC_016445	ACA	2	6	781084	781089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035130
15017	NC_016445	TCA	2	6	781144	781149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035130
15018	NC_016445	G	6	6	781154	781159	0 %	0 %	100 %	0 %	360035130
15019	NC_016445	CAT	2	6	781178	781183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035130
15020	NC_016445	AGC	2	6	781326	781331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035130
15021	NC_016445	CGG	2	6	781342	781347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035130
15022	NC_016445	GCA	2	6	781681	781686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035130
15023	NC_016445	GCAA	2	8	781704	781711	50 %	0 %	25 %	25 %	360035130
15024	NC_016445	TGC	2	6	781722	781727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035130
15025	NC_016445	GAA	2	6	781752	781757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035130
15026	NC_016445	TCA	2	6	781858	781863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035130
15027	NC_016445	GA	3	6	781905	781910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_016445	TGG	2	6	781955	781960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_016445	GC	3	6	781976	781981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15030	NC_016445	AG	3	6	782007	782012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_016445	TAG	2	6	782014	782019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_016445	GA	3	6	782063	782068	50 %	0 %	50 %	0 %	360035131
15033	NC_016445	CT	3	6	782147	782152	0 %	50 %	0 %	50 %	360035131
15034	NC_016445	GCG	2	6	782159	782164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035131
15035	NC_016445	CAT	3	9	782191	782199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035131
15036	NC_016445	GCA	2	6	782246	782251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035131
15037	NC_016445	CG	3	6	782347	782352	0 %	0 %	50 %	50 %	360035131
15038	NC_016445	TCA	2	6	782375	782380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035131
15039	NC_016445	TCA	2	6	782412	782417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035131
15040	NC_016445	GCA	2	6	782483	782488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035131
15041	NC_016445	GGT	2	6	782521	782526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035131
15042	NC_016445	TTCA	2	8	782530	782537	25 %	50 %	0 %	25 %	360035131
15043	NC_016445	GGC	2	6	782544	782549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035131
15044	NC_016445	GGC	2	6	782694	782699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035131
15045	NC_016445	GCT	2	6	782823	782828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035131
15046	NC_016445	AAG	2	6	782898	782903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035131
15047	NC_016445	TGT	2	6	782912	782917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035131
15048	NC_016445	ATTT	2	8	783027	783034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_016445	ATT	2	6	783044	783049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_016445	CA	3	6	783060	783065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15051	NC_016445	GAAAT	2	10	783104	783113	60 %	20 %	20 %	0 %	360035132
15052	NC_016445	CA	3	6	783172	783177	50 %	0 %	0 %	50 %	360035132
15053	NC_016445	CGA	2	6	783343	783348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035132
15054	NC_016445	GCA	2	6	783363	783368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035132
15055	NC_016445	CGC	2	6	783379	783384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035132
15056	NC_016445	GGC	2	6	783440	783445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035132
15057	NC_016445	ATC	2	6	783495	783500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035132
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15059	NC_016445	GCTG	2	8	783600	783607	0 %	25 %	50 %	25 %	360035132
15060	NC_016445	GTA	2	6	783638	783643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035132
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15062	NC_016445	CGA	2	6	783751	783756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035132
15063	NC_016445	TGA	2	6	783772	783777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035132
15064	NC_016445	CTT	2	6	783799	783804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035133
15065	NC_016445	CCG	2	6	783854	783859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035133
15066	NC_016445	AAT	2	6	784039	784044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035133
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15068	NC_016445	T	8	8	784140	784147	0 %	100 %	0 %	0 %	360035133
15069	NC_016445	ATC	2	6	784148	784153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035133
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15071	NC_016445	GC	3	6	784373	784378	0 %	0 %	50 %	50 %	360035134
15072	NC_016445	CAG	2	6	784391	784396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035134
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15074	NC_016445	GAT	2	6	784463	784468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035134
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15077	NC_016445	CAG	2	6	784799	784804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035134
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15080	NC_016445	TAGTG	2	10	784885	784894	20 %	40 %	40 %	0 %	360035134
15081	NC_016445	ATCA	2	8	784949	784956	50 %	25 %	0 %	25 %	360035134
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15084	NC_016445	TGG	2	6	785044	785049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035134
15085	NC_016445	CATCG	2	10	785063	785072	20 %	20 %	20 %	40 %	360035134
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15087	NC_016445	CG	3	6	785186	785191	0 %	0 %	50 %	50 %	360035134
15088	NC_016445	CAG	2	6	785201	785206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035134
15089	NC_016445	TCA	3	9	785286	785294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035134
15090	NC_016445	CG	3	6	785355	785360	0 %	0 %	50 %	50 %	360035134
15091	NC_016445	GGGC	2	8	785434	785441	0 %	0 %	75 %	25 %	360035134
15092	NC_016445	GAT	2	6	785486	785491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035134
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15094	NC_016445	TGC	2	6	785601	785606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035134
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15096	NC_016445	CCTGAC	2	12	785650	785661	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	360035134
15097	NC_016445	TGC	2	6	785670	785675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15098	NC_016445	ATT	2	6	785690	785695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_016445	CAA	2	6	785708	785713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15100	NC_016445	A	7	7	785712	785718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_016445	TGCC	2	8	785818	785825	0 %	25 %	25 %	50 %	360035135
15102	NC_016445	ATCA	2	8	785864	785871	50 %	25 %	0 %	25 %	360035135
15103	NC_016445	TGGC	2	8	785920	785927	0 %	25 %	50 %	25 %	360035135
15104	NC_016445	CCAC	2	8	785958	785965	25 %	0 %	0 %	75 %	360035135
15105	NC_016445	ATC	2	6	785994	785999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035135
15106	NC_016445	CGATA	2	10	786008	786017	40 %	20 %	20 %	20 %	360035135
15107	NC_016445	GGGTT	2	10	786259	786268	0 %	40 %	60 %	0 %	360035135
15108	NC_016445	CCA	2	6	786274	786279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035135
15109	NC_016445	CAC	2	6	786299	786304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035135
15110	NC_016445	AAG	2	6	786328	786333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035135
15111	NC_016445	CGA	2	6	786382	786387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035135
15112	NC_016445	GCG	2	6	786402	786407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035135
15113	NC_016445	TGC	2	6	786464	786469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035135
15114	NC_016445	CAA	2	6	786472	786477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035135
15115	NC_016445	TGCG	2	8	786523	786530	0 %	25 %	50 %	25 %	360035135
15116	NC_016445	CAC	2	6	786557	786562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035135
15117	NC_016445	GAT	2	6	786566	786571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035135
15118	NC_016445	GTTG	2	8	786608	786615	0 %	50 %	50 %	0 %	360035135
15119	NC_016445	TGC	2	6	786680	786685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035135
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15121	NC_016445	AGT	2	6	786779	786784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035135
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15134	NC_016445	TGC	2	6	787335	787340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15230	NC_016445	ATG	2	6	792620	792625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035142
15231	NC_016445	GAC	2	6	792646	792651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035142
15232	NC_016445	TGC	2	6	792777	792782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035142
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15234	NC_016445	CTTG	2	8	792842	792849	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15235	NC_016445	T	6	6	792901	792906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15236	NC_016445	GCAGC	2	10	792962	792971	20 %	0 %	40 %	40 %	360035143
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15238	NC_016445	GT	5	10	793000	793009	0 %	50 %	50 %	0 %	360035143
15239	NC_016445	TGG	2	6	793021	793026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035143
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15241	NC_016445	GCG	2	6	793113	793118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035143
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15243	NC_016445	GTG	2	6	793194	793199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035143
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15364	NC_016445	AAT	2	6	798814	798819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15368	NC_016445	CTG	2	6	798998	799003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035149
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15485	NC_016445	TGC	2	6	804758	804763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035155
15486	NC_016445	ACC	2	6	804764	804769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035155
15487	NC_016445	ACC	2	6	804776	804781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035155
15488	NC_016445	AGC	2	6	804787	804792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035155
15489	NC_016445	CAC	3	9	804850	804858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035155
15490	NC_016445	CAC	2	6	804970	804975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035155
15491	NC_016445	GTAC	2	8	805014	805021	25 %	25 %	25 %	25 %	360035155
15492	NC_016445	GTAG	2	8	805038	805045	25 %	25 %	50 %	0 %	360035155
15493	NC_016445	ACG	2	6	805247	805252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035155
15494	NC_016445	CAGCTC	2	12	805274	805285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	360035155
15495	NC_016445	GAGC	2	8	805351	805358	25 %	0 %	50 %	25 %	360035155
15496	NC_016445	GCA	2	6	805419	805424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035155
15497	NC_016445	TCT	2	6	805446	805451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035155
15498	NC_016445	GCT	2	6	805464	805469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035155
15499	NC_016445	ATG	2	6	805476	805481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035155
15500	NC_016445	GC	3	6	805530	805535	0 %	0 %	50 %	50 %	360035155

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