MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_016445	CA	3	6	651505	651510	50 %	0 %	0 %	50 %	360035007
12502	NC_016445	ATC	2	6	651535	651540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035007
12503	NC_016445	GGT	2	6	651542	651547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035007
12504	NC_016445	TATC	2	8	651653	651660	25 %	50 %	0 %	25 %	360035007
12505	NC_016445	CGC	2	6	651698	651703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035007
12506	NC_016445	ATG	2	6	651823	651828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035007
12507	NC_016445	TGG	2	6	651920	651925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035007
12508	NC_016445	GAA	2	6	651927	651932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035007
12509	NC_016445	AAAAGA	2	12	651953	651964	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	360035007
12510	NC_016445	TGG	2	6	652049	652054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035007
12511	NC_016445	GGT	2	6	652061	652066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035007
12512	NC_016445	TGA	2	6	652112	652117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035007
12513	NC_016445	TGTA	2	8	652123	652130	25 %	50 %	25 %	0 %	360035007
12514	NC_016445	GTT	2	6	652186	652191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_016445	GCA	2	6	652218	652223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035008
12516	NC_016445	ACGT	2	8	652282	652289	25 %	25 %	25 %	25 %	360035008
12517	NC_016445	GTA	2	6	652364	652369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035008
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12519	NC_016445	GCA	2	6	652408	652413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035008
12520	NC_016445	CCA	2	6	652420	652425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035008
12521	NC_016445	GGC	2	6	652442	652447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035008
12522	NC_016445	GC	3	6	652489	652494	0 %	0 %	50 %	50 %	360035008
12523	NC_016445	CAAT	2	8	652576	652583	50 %	25 %	0 %	25 %	360035008
12524	NC_016445	GC	3	6	652661	652666	0 %	0 %	50 %	50 %	360035008
12525	NC_016445	ACC	2	6	652803	652808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035008
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12529	NC_016445	CGGA	2	8	652987	652994	25 %	0 %	50 %	25 %	360035008
12530	NC_016445	GCA	3	9	653047	653055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035008
12531	NC_016445	TGA	2	6	653173	653178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_016445	GAA	2	6	653194	653199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_016445	GTA	3	9	653214	653222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_016445	GAC	2	6	653267	653272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_016445	CTT	2	6	653279	653284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_016445	TA	3	6	653295	653300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_016445	GCG	2	6	653303	653308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_016445	ATT	2	6	653340	653345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035009
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12552	NC_016445	A	6	6	653927	653932	100 %	0 %	0 %	0 %	360035009
12553	NC_016445	TTA	2	6	653958	653963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_016445	TAT	2	6	654010	654015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_016445	GCC	2	6	654097	654102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035010
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12599	NC_016445	CTGA	2	8	656798	656805	25 %	25 %	25 %	25 %	360035013
12600	NC_016445	TGA	2	6	656815	656820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035013
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12602	NC_016445	GGC	2	6	657046	657051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035013
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12611	NC_016445	T	6	6	657504	657509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_016445	GCA	2	6	657528	657533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12616	NC_016445	CCA	2	6	657725	657730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035014
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12621	NC_016445	CAG	2	6	658104	658109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035014
12622	NC_016445	CA	3	6	658124	658129	50 %	0 %	0 %	50 %	360035014
12623	NC_016445	GATA	2	8	658160	658167	50 %	25 %	25 %	0 %	360035014
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12723	NC_016445	TTTG	2	8	662897	662904	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12724	NC_016445	GCT	2	6	662991	662996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12727	NC_016445	TGT	2	6	663075	663080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12728	NC_016445	TG	3	6	663097	663102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12729	NC_016445	CAAC	2	8	663178	663185	50 %	0 %	0 %	50 %	360035020
12730	NC_016445	GTT	2	6	663210	663215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035020
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12740	NC_016445	TGC	2	6	663535	663540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035020
12741	NC_016445	ACA	2	6	663541	663546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035020
12742	NC_016445	TGA	2	6	663554	663559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035020
12743	NC_016445	GTG	2	6	663636	663641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035020
12744	NC_016445	TCT	2	6	663655	663660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035020
12745	NC_016445	GAA	2	6	663702	663707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035020
12746	NC_016445	ATG	2	6	663723	663728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035020
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12749	NC_016445	GAT	2	6	663860	663865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035020
12750	NC_016445	GCG	2	6	663867	663872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035020
12751	NC_016445	GAT	2	6	663917	663922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035020
12752	NC_016445	CT	3	6	663947	663952	0 %	50 %	0 %	50 %	360035020
12753	NC_016445	ATG	2	6	663963	663968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035020
12754	NC_016445	CACC	2	8	663972	663979	25 %	0 %	0 %	75 %	360035020
12755	NC_016445	GCA	2	6	663996	664001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035020
12756	NC_016445	TTGA	2	8	664054	664061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12757	NC_016445	TCT	2	6	664065	664070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12758	NC_016445	A	6	6	664147	664152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12759	NC_016445	ACA	2	6	664243	664248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035021
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12764	NC_016445	ATT	2	6	664566	664571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035021
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12776	NC_016445	ATC	2	6	665215	665220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035022
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12781	NC_016445	T	6	6	665383	665388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12782	NC_016445	TGG	2	6	665491	665496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035023
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12786	NC_016445	GAC	2	6	665692	665697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035023
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12842	NC_016445	GT	3	6	668460	668465	0 %	50 %	50 %	0 %	360035025
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12856	NC_016445	TTGGT	2	10	669066	669075	0 %	60 %	40 %	0 %	360035026
12857	NC_016445	GGTT	2	8	669090	669097	0 %	50 %	50 %	0 %	360035026
12858	NC_016445	A	6	6	669185	669190	100 %	0 %	0 %	0 %	360035026
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12860	NC_016445	GCG	2	6	669251	669256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035027
12861	NC_016445	GTT	2	6	669299	669304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035027
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12981	NC_016445	TCT	2	6	675431	675436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035033
12982	NC_016445	GCTTCT	2	12	675437	675448	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	360035033
12983	NC_016445	ACG	2	6	675461	675466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035033
12984	NC_016445	CTT	2	6	675486	675491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035033
12985	NC_016445	TAA	2	6	675544	675549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035033
12986	NC_016445	TTA	2	6	675620	675625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12987	NC_016445	ATG	2	6	675685	675690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12988	NC_016445	TTTA	2	8	675691	675698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12989	NC_016445	AGC	2	6	675737	675742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12990	NC_016445	ATA	2	6	675767	675772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12991	NC_016445	TA	3	6	675780	675785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12992	NC_016445	AATGA	2	10	675820	675829	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12993	NC_016445	TC	3	6	675903	675908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12995	NC_016445	TTG	2	6	676117	676122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12996	NC_016445	ATG	2	6	676202	676207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12997	NC_016445	T	6	6	676241	676246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12998	NC_016445	CTT	2	6	676283	676288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035034
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