MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12005	NC_016445	GCG	2	6	623724	623729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034982
12006	NC_016445	CTG	2	6	623756	623761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034982
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12013	NC_016445	TCGG	2	8	624126	624133	0 %	25 %	50 %	25 %	360034982
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12045	NC_016445	GAGT	2	8	626019	626026	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12122	NC_016445	TGAA	2	8	629904	629911	50 %	25 %	25 %	0 %	360034989
12123	NC_016445	CTG	2	6	629957	629962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034989
12124	NC_016445	CAA	2	6	630046	630051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034989
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12132	NC_016445	GTTG	2	8	630403	630410	0 %	50 %	50 %	0 %	360034989
12133	NC_016445	TTGGG	2	10	630426	630435	0 %	40 %	60 %	0 %	360034989
12134	NC_016445	CGT	2	6	630547	630552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034989
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12136	NC_016445	GGA	2	6	630793	630798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034989
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12139	NC_016445	CT	3	6	630827	630832	0 %	50 %	0 %	50 %	360034989
12140	NC_016445	GAT	2	6	630926	630931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034989
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12142	NC_016445	GAT	2	6	631054	631059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034989
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12148	NC_016445	GGAT	2	8	631339	631346	25 %	25 %	50 %	0 %	360034990
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12151	NC_016445	TGC	2	6	631501	631506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034990
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12156	NC_016445	CTTG	2	8	631817	631824	0 %	50 %	25 %	25 %	360034990
12157	NC_016445	GCCA	2	8	631971	631978	25 %	0 %	25 %	50 %	360034990
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12162	NC_016445	GTC	2	6	632244	632249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034990
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12191	NC_016445	CAT	2	6	634006	634011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034991
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12194	NC_016445	CAT	2	6	634116	634121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034991
12195	NC_016445	TGG	2	6	634125	634130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034991
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12208	NC_016445	ATG	2	6	634721	634726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034992
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12211	NC_016445	TTC	2	6	634942	634947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034992
12212	NC_016445	TTG	2	6	634954	634959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034992
12213	NC_016445	GAC	2	6	634963	634968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034992
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12215	NC_016445	G	6	6	634980	634985	0 %	0 %	100 %	0 %	360034992
12216	NC_016445	ATG	2	6	634998	635003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034992
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12218	NC_016445	AACC	2	8	635024	635031	50 %	0 %	0 %	50 %	360034992
12219	NC_016445	ATT	2	6	635105	635110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034993
12220	NC_016445	TGA	2	6	635127	635132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034993
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12223	NC_016445	TGT	2	6	635271	635276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12224	NC_016445	GTG	2	6	635442	635447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12225	NC_016445	T	6	6	635451	635456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12226	NC_016445	AATT	2	8	635513	635520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12227	NC_016445	TG	3	6	635534	635539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12228	NC_016445	GTT	2	6	635562	635567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12229	NC_016445	ACA	2	6	635594	635599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12230	NC_016445	CTG	2	6	635691	635696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034994
12231	NC_016445	CTG	2	6	635755	635760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034994
12232	NC_016445	GACA	2	8	635942	635949	50 %	0 %	25 %	25 %	360034994
12233	NC_016445	GAA	2	6	636098	636103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034994
12234	NC_016445	GAAA	2	8	636107	636114	75 %	0 %	25 %	0 %	360034994
12235	NC_016445	GA	3	6	636124	636129	50 %	0 %	50 %	0 %	360034994
12236	NC_016445	TGA	2	6	636161	636166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034994
12237	NC_016445	TGA	3	9	636211	636219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034994
12238	NC_016445	CA	3	6	636225	636230	50 %	0 %	0 %	50 %	360034994
12239	NC_016445	GTGG	2	8	636329	636336	0 %	25 %	75 %	0 %	360034994
12240	NC_016445	GAC	2	6	636378	636383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034994
12241	NC_016445	ACGA	2	8	636474	636481	50 %	0 %	25 %	25 %	360034994
12242	NC_016445	A	6	6	636510	636515	100 %	0 %	0 %	0 %	360034994
12243	NC_016445	TTA	2	6	636557	636562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034994
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12363	NC_016445	CCA	2	6	643155	643160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035000
12364	NC_016445	GAT	2	6	643234	643239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035000
12365	NC_016445	AGC	2	6	643273	643278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035000
12366	NC_016445	TCT	2	6	643292	643297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035000
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12368	NC_016445	AGC	2	6	643345	643350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035000
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12374	NC_016445	AG	3	6	643481	643486	50 %	0 %	50 %	0 %	360035000
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12392	NC_016445	GC	3	6	644531	644536	0 %	0 %	50 %	50 %	360035000
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12399	NC_016445	CTT	3	9	645057	645065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035001
12400	NC_016445	TCAG	2	8	645110	645117	25 %	25 %	25 %	25 %	360035001
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12403	NC_016445	TGA	2	6	645330	645335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035001
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12416	NC_016445	A	7	7	645970	645976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12417	NC_016445	GTC	2	6	646076	646081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12419	NC_016445	A	8	8	646186	646193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12420	NC_016445	TTG	2	6	646233	646238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12428	NC_016445	CTG	2	6	647117	647122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035003
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12433	NC_016445	GCG	3	9	647357	647365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12434	NC_016445	ATC	2	6	647414	647419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12437	NC_016445	ACTTC	2	10	647522	647531	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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12439	NC_016445	TAA	2	6	647614	647619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12440	NC_016445	TGT	2	6	647620	647625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12442	NC_016445	CA	4	8	647670	647677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12443	NC_016445	CAT	2	6	647679	647684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12458	NC_016445	TCG	2	6	648730	648735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12459	NC_016445	GTAT	2	8	648789	648796	25 %	50 %	25 %	0 %	360035005
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12461	NC_016445	GCTTG	2	10	648827	648836	0 %	40 %	40 %	20 %	360035005
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12467	NC_016445	TGC	2	6	649451	649456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035005
12468	NC_016445	A	6	6	649667	649672	100 %	0 %	0 %	0 %	360035005
12469	NC_016445	TC	3	6	649702	649707	0 %	50 %	0 %	50 %	360035005
12470	NC_016445	CGGGG	2	10	649858	649867	0 %	0 %	80 %	20 %	360035006
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12473	NC_016445	A	6	6	650066	650071	100 %	0 %	0 %	0 %	360035006
12474	NC_016445	GTT	2	6	650110	650115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035006
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12476	NC_016445	GGT	2	6	650186	650191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035006
12477	NC_016445	GCTCTT	2	12	650239	650250	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	360035006
12478	NC_016445	AC	3	6	650257	650262	50 %	0 %	0 %	50 %	360035006
12479	NC_016445	GGC	2	6	650263	650268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035006
12480	NC_016445	GGC	2	6	650284	650289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035006
12481	NC_016445	A	7	7	650309	650315	100 %	0 %	0 %	0 %	360035006
12482	NC_016445	TGA	2	6	650340	650345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035006
12483	NC_016445	TGC	2	6	650397	650402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035006
12484	NC_016445	GC	3	6	650440	650445	0 %	0 %	50 %	50 %	360035006
12485	NC_016445	GAT	2	6	650570	650575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12486	NC_016445	T	6	6	650601	650606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12487	NC_016445	CGC	2	6	650615	650620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12488	NC_016445	CAT	2	6	650638	650643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12489	NC_016445	TGG	2	6	650660	650665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12490	NC_016445	GAC	2	6	650808	650813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035007
12491	NC_016445	CAG	2	6	650832	650837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035007
12492	NC_016445	GC	3	6	650843	650848	0 %	0 %	50 %	50 %	360035007
12493	NC_016445	GTG	2	6	650856	650861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035007
12494	NC_016445	AT	3	6	650908	650913	50 %	50 %	0 %	0 %	360035007
12495	NC_016445	AT	3	6	651143	651148	50 %	50 %	0 %	0 %	360035007
12496	NC_016445	AGC	2	6	651171	651176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035007
12497	NC_016445	TGC	2	6	651275	651280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035007
12498	NC_016445	AG	3	6	651324	651329	50 %	0 %	50 %	0 %	360035007
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12500	NC_016445	TGAT	2	8	651460	651467	25 %	50 %	25 %	0 %	360035007

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