MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_016445	CTT	2	6	597467	597472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034952
11503	NC_016445	GTT	3	9	597481	597489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034952
11504	NC_016445	GAA	2	6	597499	597504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034952
11505	NC_016445	GCGCT	2	10	597523	597532	0 %	20 %	40 %	40 %	360034952
11506	NC_016445	ATG	2	6	597611	597616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034952
11507	NC_016445	ATC	2	6	597617	597622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034952
11508	NC_016445	GTT	2	6	597638	597643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034952
11509	NC_016445	TGC	2	6	597726	597731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034952
11510	NC_016445	TAC	2	6	597803	597808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034952
11511	NC_016445	CCG	2	6	597812	597817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034952
11512	NC_016445	GC	3	6	597930	597935	0 %	0 %	50 %	50 %	360034952
11513	NC_016445	ATT	2	6	597947	597952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034952
11514	NC_016445	ATC	2	6	598000	598005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034952
11515	NC_016445	ATA	2	6	598169	598174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034952
11516	NC_016445	TCA	2	6	598187	598192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034952
11517	NC_016445	TGC	2	6	598212	598217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034952
11518	NC_016445	AGTGTG	2	12	598304	598315	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_016445	GCT	2	6	598334	598339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_016445	TTG	2	6	598364	598369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_016445	CTGC	2	8	598538	598545	0 %	25 %	25 %	50 %	360034953
11522	NC_016445	T	6	6	598611	598616	0 %	100 %	0 %	0 %	360034954
11523	NC_016445	TTC	2	6	598667	598672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034954
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11525	NC_016445	T	6	6	598716	598721	0 %	100 %	0 %	0 %	360034954
11526	NC_016445	GCA	2	6	598724	598729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034954
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11528	NC_016445	GC	3	6	598827	598832	0 %	0 %	50 %	50 %	360034954
11529	NC_016445	CAA	2	6	598972	598977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034954
11530	NC_016445	T	6	6	599029	599034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_016445	TCA	2	6	599080	599085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_016445	TGA	2	6	599093	599098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_016445	A	6	6	599181	599186	100 %	0 %	0 %	0 %	360034955
11534	NC_016445	CTC	2	6	599329	599334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034955
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11536	NC_016445	CTG	2	6	599496	599501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034955
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11539	NC_016445	ACC	2	6	599838	599843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034956
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11541	NC_016445	CG	3	6	599995	600000	0 %	0 %	50 %	50 %	360034956
11542	NC_016445	GCC	2	6	600119	600124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034956
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11545	NC_016445	TCG	2	6	600391	600396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034956
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11547	NC_016445	TGCC	2	8	600577	600584	0 %	25 %	25 %	50 %	360034956
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11554	NC_016445	GCA	2	6	600945	600950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034956
11555	NC_016445	TGT	2	6	601025	601030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034956
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11560	NC_016445	AG	3	6	601192	601197	50 %	0 %	50 %	0 %	360034956
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11564	NC_016445	TTGA	2	8	601374	601381	25 %	50 %	25 %	0 %	360034956
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11569	NC_016445	TGA	2	6	601862	601867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034957
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11593	NC_016445	GATA	2	8	603251	603258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_016445	GCAAA	2	10	603293	603302	60 %	0 %	20 %	20 %	360034960
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11602	NC_016445	TG	3	6	603781	603786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_016445	ATA	2	6	603886	603891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034961
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11605	NC_016445	CG	3	6	603939	603944	0 %	0 %	50 %	50 %	360034961
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11617	NC_016445	TTA	2	6	604561	604566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_016445	T	6	6	604567	604572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_016445	CTG	2	6	604581	604586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11986	NC_016445	T	7	7	622709	622715	0 %	100 %	0 %	0 %	360034980
11987	NC_016445	GCA	2	6	622876	622881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034980
11988	NC_016445	CCG	2	6	622897	622902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034980
11989	NC_016445	TG	3	6	622954	622959	0 %	50 %	50 %	0 %	360034980
11990	NC_016445	GGT	2	6	622971	622976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034980
11991	NC_016445	ATTA	2	8	623030	623037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11992	NC_016445	T	7	7	623104	623110	0 %	100 %	0 %	0 %	360034981
11993	NC_016445	TGC	2	6	623195	623200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034981
11994	NC_016445	TCT	2	6	623226	623231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11995	NC_016445	GCTG	2	8	623258	623265	0 %	25 %	50 %	25 %	360034982
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11997	NC_016445	AG	3	6	623361	623366	50 %	0 %	50 %	0 %	360034982
11998	NC_016445	CTT	2	6	623395	623400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034982
11999	NC_016445	GCT	2	6	623422	623427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034982
12000	NC_016445	AG	3	6	623444	623449	50 %	0 %	50 %	0 %	360034982

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