MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016445	ACTC	2	8	571722	571729	25 %	25 %	0 %	50 %	360034929
11002	NC_016445	TGG	2	6	571757	571762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034929
11003	NC_016445	CT	3	6	571846	571851	0 %	50 %	0 %	50 %	360034929
11004	NC_016445	ACGT	2	8	571914	571921	25 %	25 %	25 %	25 %	360034929
11005	NC_016445	TGC	2	6	571949	571954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034929
11006	NC_016445	AGC	2	6	571996	572001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034929
11007	NC_016445	CGG	2	6	572063	572068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034929
11008	NC_016445	GGC	2	6	572076	572081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034929
11009	NC_016445	T	6	6	572205	572210	0 %	100 %	0 %	0 %	360034930
11010	NC_016445	TGG	2	6	572227	572232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034930
11011	NC_016445	TGG	2	6	572245	572250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034930
11012	NC_016445	GCA	2	6	572297	572302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034930
11013	NC_016445	GGC	2	6	572345	572350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034930
11014	NC_016445	AATC	2	8	572355	572362	50 %	25 %	0 %	25 %	360034930
11015	NC_016445	CCA	2	6	572415	572420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034930
11016	NC_016445	GAAG	2	8	572460	572467	50 %	0 %	50 %	0 %	360034931
11017	NC_016445	CGCGTT	2	12	572665	572676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034931
11018	NC_016445	CATCG	2	10	572680	572689	20 %	20 %	20 %	40 %	360034931
11019	NC_016445	GCG	2	6	572702	572707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034931
11020	NC_016445	GTTG	2	8	572718	572725	0 %	50 %	50 %	0 %	360034931
11021	NC_016445	CAG	2	6	572730	572735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034931
11022	NC_016445	TGC	2	6	572748	572753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034931
11023	NC_016445	TCA	2	6	572771	572776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034931
11024	NC_016445	CG	3	6	572794	572799	0 %	0 %	50 %	50 %	360034931
11025	NC_016445	A	6	6	572809	572814	100 %	0 %	0 %	0 %	360034931
11026	NC_016445	GAC	2	6	572820	572825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034931
11027	NC_016445	GATT	2	8	572841	572848	25 %	50 %	25 %	0 %	360034931
11028	NC_016445	ATC	2	6	572861	572866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034931
11029	NC_016445	AAG	2	6	572888	572893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034931
11030	NC_016445	TAA	2	6	572896	572901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_016445	TAC	2	6	572921	572926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034932
11032	NC_016445	TTTC	2	8	573011	573018	0 %	75 %	0 %	25 %	360034932
11033	NC_016445	ATC	2	6	573106	573111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034932
11034	NC_016445	CCG	2	6	573184	573189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034932
11035	NC_016445	CAT	2	6	573254	573259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034932
11036	NC_016445	CGT	2	6	573281	573286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034932
11037	NC_016445	ATC	2	6	573313	573318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034932
11038	NC_016445	AAT	2	6	573319	573324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034932
11039	NC_016445	GCT	2	6	573327	573332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034932
11040	NC_016445	GCA	2	6	573368	573373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034932
11041	NC_016445	GAT	2	6	573410	573415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034932
11042	NC_016445	TGC	2	6	573448	573453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034932
11043	NC_016445	CAT	2	6	573507	573512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034932
11044	NC_016445	TTGGC	2	10	573558	573567	0 %	40 %	40 %	20 %	360034932
11045	NC_016445	TTG	2	6	573648	573653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034932
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11047	NC_016445	TGC	2	6	573681	573686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034932
11048	NC_016445	CAT	2	6	573695	573700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034932
11049	NC_016445	TGA	2	6	573788	573793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034932
11050	NC_016445	AAT	2	6	573849	573854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034932
11051	NC_016445	A	6	6	573863	573868	100 %	0 %	0 %	0 %	360034932
11052	NC_016445	TTA	2	6	573905	573910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_016445	GAT	2	6	573922	573927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_016445	A	6	6	573986	573991	100 %	0 %	0 %	0 %	360034933
11055	NC_016445	TG	3	6	574010	574015	0 %	50 %	50 %	0 %	360034933
11056	NC_016445	AAC	2	6	574056	574061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_016445	TAA	2	6	574090	574095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_016445	GCG	2	6	574179	574184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034934
11059	NC_016445	GTG	2	6	574194	574199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034934
11060	NC_016445	ACA	2	6	574207	574212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034934
11061	NC_016445	GGC	2	6	574215	574220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034934
11062	NC_016445	TGAT	2	8	574225	574232	25 %	50 %	25 %	0 %	360034934
11063	NC_016445	TTG	2	6	574272	574277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034934
11064	NC_016445	GTGA	2	8	574323	574330	25 %	25 %	50 %	0 %	360034934
11065	NC_016445	ATT	2	6	574374	574379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034934
11066	NC_016445	GCG	2	6	574386	574391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034934
11067	NC_016445	ATG	2	6	574392	574397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034934
11068	NC_016445	GTGA	2	8	574428	574435	25 %	25 %	50 %	0 %	360034934
11069	NC_016445	TTGG	2	8	574443	574450	0 %	50 %	50 %	0 %	360034934
11070	NC_016445	CA	3	6	574614	574619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11071	NC_016445	CCA	2	6	574692	574697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034935
11072	NC_016445	CTT	2	6	574754	574759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034935
11073	NC_016445	TGG	3	9	574788	574796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034935
11074	NC_016445	GAA	2	6	574810	574815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034935
11075	NC_016445	TCA	2	6	574843	574848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034935
11076	NC_016445	CAG	2	6	574855	574860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034935
11077	NC_016445	CTT	2	6	574889	574894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034935
11078	NC_016445	A	6	6	574901	574906	100 %	0 %	0 %	0 %	360034935
11079	NC_016445	TGG	2	6	574973	574978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034935
11080	NC_016445	CGC	2	6	575003	575008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034935
11081	NC_016445	GCC	2	6	575053	575058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034935
11082	NC_016445	GCC	2	6	575088	575093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034935
11083	NC_016445	CGCTG	2	10	575130	575139	0 %	20 %	40 %	40 %	360034935
11084	NC_016445	CAA	2	6	575227	575232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034935
11085	NC_016445	GC	3	6	575300	575305	0 %	0 %	50 %	50 %	360034935
11086	NC_016445	GCC	2	6	575329	575334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034935
11087	NC_016445	CTG	2	6	575344	575349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034935
11088	NC_016445	GCC	3	9	575551	575559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034935
11089	NC_016445	TG	3	6	575635	575640	0 %	50 %	50 %	0 %	360034935
11090	NC_016445	GGT	2	6	575652	575657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034935
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11092	NC_016445	TGA	2	6	575789	575794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034935
11093	NC_016445	TTGCT	2	10	575873	575882	0 %	60 %	20 %	20 %	360034935
11094	NC_016445	GCG	2	6	575923	575928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034935
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11099	NC_016445	CAT	2	6	576139	576144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034935
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11101	NC_016445	TTGG	2	8	576220	576227	0 %	50 %	50 %	0 %	360034935
11102	NC_016445	GTG	2	6	576307	576312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034935
11103	NC_016445	GGT	2	6	576378	576383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034935
11104	NC_016445	CGC	2	6	576435	576440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034935
11105	NC_016445	AACG	2	8	576484	576491	50 %	0 %	25 %	25 %	360034935
11106	NC_016445	CAG	2	6	576571	576576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034935
11107	NC_016445	TGG	2	6	576602	576607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034935
11108	NC_016445	GCG	2	6	576665	576670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034935
11109	NC_016445	CCG	2	6	576692	576697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034935
11110	NC_016445	GCA	2	6	576700	576705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034935
11111	NC_016445	TTGA	2	8	576721	576728	25 %	50 %	25 %	0 %	360034935
11112	NC_016445	GAT	2	6	576738	576743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034935
11113	NC_016445	CAT	2	6	576768	576773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034935
11114	NC_016445	ATGG	2	8	576849	576856	25 %	25 %	50 %	0 %	360034935
11115	NC_016445	AGG	2	6	576955	576960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_016445	CCT	2	6	576965	576970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11117	NC_016445	CAA	2	6	576997	577002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_016445	ACT	2	6	577013	577018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_016445	GGC	2	6	577033	577038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_016445	AG	3	6	577040	577045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_016445	TC	3	6	577208	577213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11122	NC_016445	TTTG	2	8	577246	577253	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_016445	ATTA	2	8	577266	577273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11135	NC_016445	TACC	2	8	578226	578233	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11159	NC_016445	A	6	6	579206	579211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11160	NC_016445	AG	3	6	579237	579242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11161	NC_016445	AAG	2	6	579254	579259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11234	NC_016445	CAAG	2	8	583540	583547	50 %	0 %	25 %	25 %	360034941
11235	NC_016445	A	6	6	583560	583565	100 %	0 %	0 %	0 %	360034941
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11242	NC_016445	TGGC	2	8	583715	583722	0 %	25 %	50 %	25 %	360034941
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11486	NC_016445	CAC	2	6	596687	596692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034951
11487	NC_016445	TCT	2	6	596710	596715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034951
11488	NC_016445	CAG	2	6	596736	596741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034951
11489	NC_016445	TCC	2	6	596830	596835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034951
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11491	NC_016445	GAT	2	6	597033	597038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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