MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_016445	TGA	2	6	545691	545696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034903
10502	NC_016445	GAA	2	6	545719	545724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034903
10503	NC_016445	GCC	2	6	545755	545760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034903
10504	NC_016445	AGAA	2	8	545807	545814	75 %	0 %	25 %	0 %	360034903
10505	NC_016445	TGA	2	6	545829	545834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034903
10506	NC_016445	GAA	2	6	545857	545862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034903
10507	NC_016445	GCC	2	6	545893	545898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034903
10508	NC_016445	TGA	2	6	545967	545972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034903
10509	NC_016445	TGA	2	6	546063	546068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034903
10510	NC_016445	TGA	2	6	546225	546230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034903
10511	NC_016445	GCG	2	6	546356	546361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034903
10512	NC_016445	GAT	2	6	546412	546417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034903
10513	NC_016445	CGA	2	6	546543	546548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034903
10514	NC_016445	TGA	2	6	546591	546596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034903
10515	NC_016445	GTG	2	6	546674	546679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034903
10516	NC_016445	AGC	2	6	546684	546689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034903
10517	NC_016445	TTG	2	6	546767	546772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034903
10518	NC_016445	GAT	2	6	546778	546783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034903
10519	NC_016445	CAA	2	6	546793	546798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034903
10520	NC_016445	ACT	2	6	546996	547001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034904
10521	NC_016445	AG	3	6	547017	547022	50 %	0 %	50 %	0 %	360034904
10522	NC_016445	AAG	2	6	547038	547043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034904
10523	NC_016445	ATC	2	6	547074	547079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034904
10524	NC_016445	GTG	2	6	547136	547141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034904
10525	NC_016445	ACC	2	6	547151	547156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034904
10526	NC_016445	TGA	2	6	547243	547248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034904
10527	NC_016445	CGTTAT	2	12	547280	547291	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	360034904
10528	NC_016445	A	6	6	547368	547373	100 %	0 %	0 %	0 %	360034904
10529	NC_016445	GCA	2	6	547375	547380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034904
10530	NC_016445	TGAT	2	8	547503	547510	25 %	50 %	25 %	0 %	360034904
10531	NC_016445	CAT	2	6	547532	547537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034904
10532	NC_016445	GTG	2	6	547578	547583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034904
10533	NC_016445	GCG	3	9	547637	547645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034904
10534	NC_016445	T	6	6	547823	547828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_016445	T	6	6	547868	547873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_016445	TC	3	6	547884	547889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10537	NC_016445	CTG	2	6	547890	547895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_016445	TTA	2	6	548034	548039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034905
10539	NC_016445	ATC	2	6	548081	548086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034905
10540	NC_016445	TGC	2	6	548217	548222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034905
10541	NC_016445	GTG	2	6	548237	548242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034905
10542	NC_016445	GTC	2	6	548257	548262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034905
10543	NC_016445	GTGCT	2	10	548270	548279	0 %	40 %	40 %	20 %	360034905
10544	NC_016445	GGC	2	6	548323	548328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034905
10545	NC_016445	TGGT	2	8	548342	548349	0 %	50 %	50 %	0 %	360034905
10546	NC_016445	TGCG	2	8	548360	548367	0 %	25 %	50 %	25 %	360034905
10547	NC_016445	GCG	2	6	548374	548379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034905
10548	NC_016445	GCG	2	6	548417	548422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034905
10549	NC_016445	TGA	2	6	548522	548527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034905
10550	NC_016445	GTC	2	6	548618	548623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034905
10551	NC_016445	ACG	2	6	548798	548803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034905
10552	NC_016445	A	6	6	548842	548847	100 %	0 %	0 %	0 %	360034905
10553	NC_016445	CTAA	2	8	548862	548869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10554	NC_016445	ATT	2	6	548950	548955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034906
10555	NC_016445	AC	3	6	548966	548971	50 %	0 %	0 %	50 %	360034906
10556	NC_016445	CGC	2	6	549284	549289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034906
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10561	NC_016445	TGC	2	6	549524	549529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034906
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10565	NC_016445	GCG	2	6	549993	549998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034906
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10567	NC_016445	TGC	2	6	550228	550233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034907
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10575	NC_016445	T	7	7	550779	550785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_016445	GC	3	6	550796	550801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10577	NC_016445	AAG	2	6	550899	550904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034908
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10583	NC_016445	GGTGT	2	10	551123	551132	0 %	40 %	60 %	0 %	360034908
10584	NC_016445	GCA	2	6	551162	551167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034908
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10588	NC_016445	TG	3	6	551348	551353	0 %	50 %	50 %	0 %	360034909
10589	NC_016445	TTG	2	6	551357	551362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034909
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10602	NC_016445	GAA	2	6	552501	552506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034909
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10609	NC_016445	ATC	2	6	552883	552888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10619	NC_016445	ATC	2	6	553425	553430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034910
10620	NC_016445	CAT	2	6	553433	553438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034910
10621	NC_016445	CAT	2	6	553459	553464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034910
10622	NC_016445	CAA	2	6	553544	553549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034910
10623	NC_016445	CGCAAT	2	12	553583	553594	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	360034910
10624	NC_016445	CGA	2	6	553610	553615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034910
10625	NC_016445	TTG	2	6	553622	553627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034910
10626	NC_016445	ATC	2	6	553704	553709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034910
10627	NC_016445	ATC	2	6	553725	553730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034910
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10637	NC_016445	ACC	2	6	554216	554221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034910
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10642	NC_016445	TGT	2	6	554329	554334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10645	NC_016445	GTT	2	6	554433	554438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034911
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10655	NC_016445	TG	3	6	555103	555108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10680	NC_016445	AAT	2	6	556317	556322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034914
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10695	NC_016445	GAA	2	6	556836	556841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10696	NC_016445	GC	3	6	556844	556849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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