MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016445	GTT	2	6	519871	519876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034880
10002	NC_016445	A	6	6	519928	519933	100 %	0 %	0 %	0 %	360034880
10003	NC_016445	AAT	2	6	519992	519997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034880
10004	NC_016445	GCT	2	6	520002	520007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034880
10005	NC_016445	GTC	2	6	520145	520150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_016445	AT	3	6	520172	520177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_016445	CAC	2	6	520196	520201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10008	NC_016445	GGT	2	6	520207	520212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_016445	CGAG	2	8	520229	520236	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10010	NC_016445	ACACCG	2	12	520278	520289	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	360034881
10011	NC_016445	T	6	6	520315	520320	0 %	100 %	0 %	0 %	360034881
10012	NC_016445	GATA	2	8	520342	520349	50 %	25 %	25 %	0 %	360034881
10013	NC_016445	AAT	2	6	520421	520426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_016445	AAT	2	6	520435	520440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_016445	ATA	2	6	520455	520460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034882
10016	NC_016445	CGT	2	6	520519	520524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034882
10017	NC_016445	GTG	2	6	520572	520577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034882
10018	NC_016445	GTT	2	6	520609	520614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034882
10019	NC_016445	TGT	2	6	520643	520648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034882
10020	NC_016445	GGT	2	6	520659	520664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034882
10021	NC_016445	TCAA	2	8	520745	520752	50 %	25 %	0 %	25 %	360034882
10022	NC_016445	GGC	2	6	520852	520857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034882
10023	NC_016445	AAT	2	6	520882	520887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034882
10024	NC_016445	GAC	2	6	520902	520907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034882
10025	NC_016445	AAGC	2	8	520918	520925	50 %	0 %	25 %	25 %	360034882
10026	NC_016445	GTC	2	6	520928	520933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034882
10027	NC_016445	GAT	2	6	520935	520940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034882
10028	NC_016445	GCCA	2	8	520941	520948	25 %	0 %	25 %	50 %	360034882
10029	NC_016445	A	7	7	520948	520954	100 %	0 %	0 %	0 %	360034882
10030	NC_016445	TTA	2	6	521027	521032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034882
10031	NC_016445	CT	3	6	521132	521137	0 %	50 %	0 %	50 %	360034882
10032	NC_016445	GC	3	6	521146	521151	0 %	0 %	50 %	50 %	360034882
10033	NC_016445	ATG	2	6	521172	521177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034882
10034	NC_016445	CGC	2	6	521212	521217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034882
10035	NC_016445	AGC	2	6	521238	521243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034882
10036	NC_016445	TAT	2	6	521277	521282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_016445	GGTC	2	8	521379	521386	0 %	25 %	50 %	25 %	360034883
10038	NC_016445	T	6	6	521389	521394	0 %	100 %	0 %	0 %	360034883
10039	NC_016445	AGC	2	6	521417	521422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034883
10040	NC_016445	GCG	2	6	521463	521468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034883
10041	NC_016445	TGG	2	6	521496	521501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034883
10042	NC_016445	GC	3	6	521597	521602	0 %	0 %	50 %	50 %	360034883
10043	NC_016445	TTG	2	6	521635	521640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034883
10044	NC_016445	CCT	2	6	521657	521662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034883
10045	NC_016445	T	7	7	521688	521694	0 %	100 %	0 %	0 %	360034883
10046	NC_016445	TAA	2	6	521734	521739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034883
10047	NC_016445	GC	3	6	521774	521779	0 %	0 %	50 %	50 %	360034883
10048	NC_016445	CTT	2	6	521819	521824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034883
10049	NC_016445	TCA	2	6	521837	521842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034883
10050	NC_016445	TGT	2	6	521852	521857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034883
10051	NC_016445	CGG	2	6	521898	521903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034883
10052	NC_016445	GCT	2	6	521973	521978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034883
10053	NC_016445	TGA	2	6	522027	522032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034883
10054	NC_016445	AG	3	6	522055	522060	50 %	0 %	50 %	0 %	360034883
10055	NC_016445	CAG	2	6	522148	522153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034883
10056	NC_016445	ACT	2	6	522160	522165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034883
10057	NC_016445	TCC	2	6	522202	522207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034883
10058	NC_016445	TG	3	6	522236	522241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_016445	T	6	6	522270	522275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_016445	GCC	2	6	522355	522360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_016445	GTTT	2	8	522550	522557	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_016445	AAC	2	6	522577	522582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_016445	AGAAA	2	10	522593	522602	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_016445	T	6	6	522622	522627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_016445	T	6	6	522649	522654	0 %	100 %	0 %	0 %	360034884
10066	NC_016445	TTG	2	6	522736	522741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034884
10067	NC_016445	CAG	2	6	522829	522834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034884
10068	NC_016445	ATG	2	6	522895	522900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034884
10069	NC_016445	GCC	2	6	522981	522986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034884
10070	NC_016445	CCT	2	6	523176	523181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034884
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10073	NC_016445	GCA	2	6	523508	523513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034885
10074	NC_016445	GGC	2	6	523526	523531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034885
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10076	NC_016445	TCAG	2	8	523594	523601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10077	NC_016445	TCGAC	2	10	523676	523685	20 %	20 %	20 %	40 %	360034886
10078	NC_016445	TGT	2	6	523691	523696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034886
10079	NC_016445	CATC	2	8	523698	523705	25 %	25 %	0 %	50 %	360034886
10080	NC_016445	CTTTG	2	10	523749	523758	0 %	60 %	20 %	20 %	360034886
10081	NC_016445	AG	3	6	523991	523996	50 %	0 %	50 %	0 %	360034886
10082	NC_016445	AGC	2	6	524075	524080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034886
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10084	NC_016445	AGA	2	6	524090	524095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034886
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10086	NC_016445	CCA	2	6	524279	524284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034887
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10088	NC_016445	GGT	2	6	524349	524354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034887
10089	NC_016445	TGGC	2	8	524514	524521	0 %	25 %	50 %	25 %	360034887
10090	NC_016445	GT	3	6	524526	524531	0 %	50 %	50 %	0 %	360034887
10091	NC_016445	TGA	2	6	524545	524550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034887
10092	NC_016445	GA	3	6	524595	524600	50 %	0 %	50 %	0 %	360034887
10093	NC_016445	AGC	2	6	524608	524613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034887
10094	NC_016445	TCT	2	6	524633	524638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034887
10095	NC_016445	ATC	2	6	524764	524769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034887
10096	NC_016445	CAAA	2	8	524792	524799	75 %	0 %	0 %	25 %	360034887
10097	NC_016445	CAG	2	6	524845	524850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034887
10098	NC_016445	TGC	2	6	524871	524876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034887
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10100	NC_016445	GAAT	2	8	524955	524962	50 %	25 %	25 %	0 %	360034887
10101	NC_016445	T	7	7	525064	525070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_016445	TCT	2	6	525072	525077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_016445	AAT	2	6	525099	525104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_016445	A	6	6	525117	525122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_016445	T	6	6	525157	525162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_016445	TAA	2	6	525266	525271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034888
10107	NC_016445	CTG	2	6	525306	525311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034888
10108	NC_016445	TGA	2	6	525316	525321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034888
10109	NC_016445	CAA	2	6	525338	525343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034888
10110	NC_016445	CT	3	6	525459	525464	0 %	50 %	0 %	50 %	360034888
10111	NC_016445	TGA	2	6	525521	525526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034888
10112	NC_016445	TTC	2	6	525573	525578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034888
10113	NC_016445	GGGT	2	8	525631	525638	0 %	25 %	75 %	0 %	360034888
10114	NC_016445	CAG	2	6	525703	525708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034888
10115	NC_016445	CAT	2	6	525785	525790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034888
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10117	NC_016445	GATG	2	8	525902	525909	25 %	25 %	50 %	0 %	360034888
10118	NC_016445	AAG	2	6	525910	525915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034888
10119	NC_016445	AGA	2	6	525926	525931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034888
10120	NC_016445	CAA	2	6	525950	525955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034888
10121	NC_016445	TAT	2	6	526184	526189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034888
10122	NC_016445	GAT	2	6	526191	526196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034888
10123	NC_016445	GCG	2	6	526197	526202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034888
10124	NC_016445	CTT	2	6	526213	526218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034888
10125	NC_016445	TTGA	2	8	526239	526246	25 %	50 %	25 %	0 %	360034888
10126	NC_016445	ATG	2	6	526366	526371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034888
10127	NC_016445	TGA	2	6	526411	526416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034888
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10143	NC_016445	TCTG	2	8	527403	527410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10144	NC_016445	CAT	2	6	527493	527498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034889
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10160	NC_016445	T	7	7	528191	528197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10162	NC_016445	GAAG	2	8	528249	528256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10232	NC_016445	C	6	6	532428	532433	0 %	0 %	0 %	100 %	360034896
10233	NC_016445	TGC	2	6	532435	532440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034896
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10242	NC_016445	TCA	2	6	532944	532949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034896
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10366	NC_016445	AGA	2	6	539859	539864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034900
10367	NC_016445	AAT	2	6	539990	539995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10368	NC_016445	GAT	2	6	540041	540046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034901
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10398	NC_016445	ATT	2	6	541921	541926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10401	NC_016445	AT	3	6	541981	541986	50 %	50 %	0 %	0 %	360034903
10402	NC_016445	CTG	2	6	542059	542064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034903
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