MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016445	AGCCA	2	10	318169	318178	40 %	0 %	20 %	40 %	360034691
6002	NC_016445	CGG	2	6	318301	318306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034691
6003	NC_016445	GTA	3	9	318333	318341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034691
6004	NC_016445	GTA	2	6	318352	318357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034691
6005	NC_016445	GAA	3	9	318363	318371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034691
6006	NC_016445	GGCTG	2	10	318438	318447	0 %	20 %	60 %	20 %	360034691
6007	NC_016445	ATG	2	6	318454	318459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034691
6008	NC_016445	TAGA	2	8	318574	318581	50 %	25 %	25 %	0 %	360034691
6009	NC_016445	TGC	2	6	318601	318606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034691
6010	NC_016445	GCG	2	6	318634	318639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034691
6011	NC_016445	C	6	6	318689	318694	0 %	0 %	0 %	100 %	360034691
6012	NC_016445	CGC	2	6	318702	318707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034691
6013	NC_016445	CGA	2	6	318740	318745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034691
6014	NC_016445	AAT	2	6	318753	318758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034691
6015	NC_016445	TGA	2	6	318803	318808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034691
6016	NC_016445	CAC	2	6	318831	318836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034691
6017	NC_016445	CCA	2	6	318868	318873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034691
6018	NC_016445	GCA	2	6	319019	319024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034691
6019	NC_016445	GTA	2	6	319098	319103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034691
6020	NC_016445	GCC	2	6	319110	319115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034691
6021	NC_016445	TCT	3	9	319132	319140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034691
6022	NC_016445	GGC	2	6	319179	319184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034691
6023	NC_016445	A	6	6	319188	319193	100 %	0 %	0 %	0 %	360034691
6024	NC_016445	CATCCA	2	12	319200	319211	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	360034691
6025	NC_016445	GCA	2	6	319246	319251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034691
6026	NC_016445	TAT	2	6	319337	319342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034691
6027	NC_016445	GAA	2	6	319365	319370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034691
6028	NC_016445	GAT	2	6	319452	319457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034691
6029	NC_016445	CAA	2	6	319472	319477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034691
6030	NC_016445	AGT	2	6	319489	319494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_016445	GTT	2	6	319509	319514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_016445	TGT	2	6	319529	319534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_016445	GT	3	6	319533	319538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_016445	GTG	2	6	319659	319664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_016445	TGG	2	6	319680	319685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_016445	ATAA	2	8	319735	319742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_016445	GA	3	6	319815	319820	50 %	0 %	50 %	0 %	360034692
6038	NC_016445	GCAG	2	8	319839	319846	25 %	0 %	50 %	25 %	360034692
6039	NC_016445	GAT	2	6	320030	320035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034693
6040	NC_016445	CGC	2	6	320095	320100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034693
6041	NC_016445	CG	3	6	320118	320123	0 %	0 %	50 %	50 %	360034693
6042	NC_016445	TCG	2	6	320134	320139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034693
6043	NC_016445	CATC	2	8	320242	320249	25 %	25 %	0 %	50 %	360034693
6044	NC_016445	GCG	2	6	320260	320265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034693
6045	NC_016445	TCA	2	6	320274	320279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034693
6046	NC_016445	GAT	2	6	320423	320428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034693
6047	NC_016445	GCC	2	6	320561	320566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034693
6048	NC_016445	TCA	2	6	320697	320702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034693
6049	NC_016445	GGC	2	6	320728	320733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034693
6050	NC_016445	TTGA	2	8	320756	320763	25 %	50 %	25 %	0 %	360034693
6051	NC_016445	AGC	2	6	320847	320852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034693
6052	NC_016445	GTG	2	6	320905	320910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034693
6053	NC_016445	TTC	2	6	321014	321019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034693
6054	NC_016445	CGA	2	6	321040	321045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034693
6055	NC_016445	CAT	2	6	321052	321057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034693
6056	NC_016445	GCCT	2	8	321059	321066	0 %	25 %	25 %	50 %	360034693
6057	NC_016445	ACCAC	2	10	321096	321105	40 %	0 %	0 %	60 %	360034693
6058	NC_016445	CAT	2	6	321125	321130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034693
6059	NC_016445	CAC	2	6	321199	321204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_016445	TTTAG	2	10	321294	321303	20 %	60 %	20 %	0 %	360034694
6061	NC_016445	CTG	2	6	321304	321309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034694
6062	NC_016445	CAC	2	6	321323	321328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034694
6063	NC_016445	CAA	2	6	321342	321347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034694
6064	NC_016445	CAT	2	6	321532	321537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034694
6065	NC_016445	TGGT	2	8	321549	321556	0 %	50 %	50 %	0 %	360034694
6066	NC_016445	GATTCA	2	12	321593	321604	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	360034694
6067	NC_016445	GCG	2	6	321638	321643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034694
6068	NC_016445	GATT	2	8	321659	321666	25 %	50 %	25 %	0 %	360034694
6069	NC_016445	GGA	2	6	321710	321715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034694
6070	NC_016445	TGA	2	6	321730	321735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034694
6071	NC_016445	AGG	2	6	321769	321774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034694
6072	NC_016445	GCA	2	6	321797	321802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034694
6073	NC_016445	ATG	2	6	321817	321822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034694
6074	NC_016445	ACT	2	6	321862	321867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034694
6075	NC_016445	GCG	2	6	321899	321904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034694
6076	NC_016445	ACT	2	6	321910	321915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034694
6077	NC_016445	GGCT	2	8	322046	322053	0 %	25 %	50 %	25 %	360034694
6078	NC_016445	GACGC	2	10	322080	322089	20 %	0 %	40 %	40 %	360034694
6079	NC_016445	T	6	6	322093	322098	0 %	100 %	0 %	0 %	360034694
6080	NC_016445	GAA	2	6	322190	322195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_016445	GCT	2	6	322219	322224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_016445	TGT	2	6	322263	322268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_016445	TC	3	6	322269	322274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6084	NC_016445	TTA	2	6	322283	322288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034695
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6086	NC_016445	GTGAT	2	10	322370	322379	20 %	40 %	40 %	0 %	360034695
6087	NC_016445	CGT	2	6	322402	322407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034695
6088	NC_016445	GC	3	6	322493	322498	0 %	0 %	50 %	50 %	360034695
6089	NC_016445	ATCC	2	8	322510	322517	25 %	25 %	0 %	50 %	360034695
6090	NC_016445	GAT	2	6	322528	322533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034695
6091	NC_016445	GAC	2	6	322549	322554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034695
6092	NC_016445	GTG	2	6	322772	322777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_016445	TTGG	2	8	322836	322843	0 %	50 %	50 %	0 %	360034696
6094	NC_016445	GCA	2	6	322851	322856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034696
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6098	NC_016445	CA	3	6	323164	323169	50 %	0 %	0 %	50 %	360034697
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6101	NC_016445	GC	3	6	323384	323389	0 %	0 %	50 %	50 %	360034697
6102	NC_016445	GCG	2	6	323513	323518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034697
6103	NC_016445	CAGG	2	8	323589	323596	25 %	0 %	50 %	25 %	360034697
6104	NC_016445	GC	3	6	323644	323649	0 %	0 %	50 %	50 %	360034697
6105	NC_016445	GCGG	2	8	323686	323693	0 %	0 %	75 %	25 %	360034697
6106	NC_016445	TTTG	2	8	323694	323701	0 %	75 %	25 %	0 %	360034697
6107	NC_016445	CAT	2	6	323767	323772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034697
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6109	NC_016445	CCG	2	6	323818	323823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034697
6110	NC_016445	A	6	6	323857	323862	100 %	0 %	0 %	0 %	360034697
6111	NC_016445	CTT	2	6	323953	323958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034698
6112	NC_016445	ACTC	2	8	323969	323976	25 %	25 %	0 %	50 %	360034698
6113	NC_016445	CAG	3	9	324065	324073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034698
6114	NC_016445	TG	3	6	324091	324096	0 %	50 %	50 %	0 %	360034698
6115	NC_016445	T	6	6	324099	324104	0 %	100 %	0 %	0 %	360034698
6116	NC_016445	CAG	2	6	324128	324133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034698
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6118	NC_016445	CAG	2	6	324251	324256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034698
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6123	NC_016445	GT	3	6	324469	324474	0 %	50 %	50 %	0 %	360034698
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6128	NC_016445	TGC	2	6	324606	324611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034698
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6492	NC_016445	CCA	2	6	341639	341644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034716
6493	NC_016445	GCA	2	6	341695	341700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034716
6494	NC_016445	AC	3	6	341740	341745	50 %	0 %	0 %	50 %	360034716
6495	NC_016445	CAC	2	6	341788	341793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034716
6496	NC_016445	A	6	6	341839	341844	100 %	0 %	0 %	0 %	360034716
6497	NC_016445	GAT	2	6	341859	341864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034716
6498	NC_016445	AGC	2	6	341962	341967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034716
6499	NC_016445	ACCTCT	2	12	341989	342000	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	360034716
6500	NC_016445	CCT	2	6	342058	342063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034716

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