MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016445	CTGG	2	8	292861	292868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_016445	GA	3	6	292913	292918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_016445	CAT	2	6	292926	292931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_016445	ATG	2	6	292933	292938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_016445	GTT	2	6	293021	293026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_016445	TGT	2	6	293035	293040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034670
5507	NC_016445	TTG	2	6	293046	293051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034670
5508	NC_016445	ACTC	2	8	293089	293096	25 %	25 %	0 %	50 %	360034670
5509	NC_016445	CGG	2	6	293197	293202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034670
5510	NC_016445	GAA	2	6	293216	293221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034670
5511	NC_016445	TCGC	2	8	293249	293256	0 %	25 %	25 %	50 %	360034670
5512	NC_016445	TGG	2	6	293289	293294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034670
5513	NC_016445	CG	3	6	293300	293305	0 %	0 %	50 %	50 %	360034670
5514	NC_016445	CGG	2	6	293412	293417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034670
5515	NC_016445	CGC	3	9	293455	293463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034670
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5517	NC_016445	ATTG	2	8	293485	293492	25 %	50 %	25 %	0 %	360034670
5518	NC_016445	GAA	2	6	293561	293566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034670
5519	NC_016445	AGA	3	9	293572	293580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034670
5520	NC_016445	GAA	3	9	293597	293605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034670
5521	NC_016445	ATC	2	6	293654	293659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034670
5522	NC_016445	GTC	2	6	293661	293666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034670
5523	NC_016445	TGA	2	6	293776	293781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034670
5524	NC_016445	TTGA	2	8	293795	293802	25 %	50 %	25 %	0 %	360034670
5525	NC_016445	GCGT	2	8	293811	293818	0 %	25 %	50 %	25 %	360034670
5526	NC_016445	TTG	2	6	293900	293905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034670
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5529	NC_016445	CTGCA	2	10	294096	294105	20 %	20 %	20 %	40 %	360034670
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5538	NC_016445	TGA	2	6	294480	294485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034670
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5540	NC_016445	T	6	6	294538	294543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_016445	GA	4	8	294554	294561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_016445	TCA	2	6	294642	294647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034671
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5544	NC_016445	GTCA	2	8	294691	294698	25 %	25 %	25 %	25 %	360034671
5545	NC_016445	ATC	2	6	294710	294715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034671
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5547	NC_016445	ACTG	2	8	294763	294770	25 %	25 %	25 %	25 %	360034671
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5550	NC_016445	GGCT	2	8	294847	294854	0 %	25 %	50 %	25 %	360034671
5551	NC_016445	CAAG	2	8	294940	294947	50 %	0 %	25 %	25 %	360034671
5552	NC_016445	TGA	2	6	295161	295166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034671
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5554	NC_016445	AGCC	2	8	295233	295240	25 %	0 %	25 %	50 %	360034671
5555	NC_016445	CA	3	6	295338	295343	50 %	0 %	0 %	50 %	360034671
5556	NC_016445	GC	3	6	295424	295429	0 %	0 %	50 %	50 %	360034671
5557	NC_016445	GTTTT	2	10	295484	295493	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_016445	GGTG	2	8	295547	295554	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_016445	TA	3	6	295557	295562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_016445	AGA	2	6	295606	295611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_016445	TTAA	2	8	295651	295658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5592	NC_016445	CACC	2	8	297203	297210	25 %	0 %	0 %	75 %	360034673
5593	NC_016445	CATTT	2	10	297225	297234	20 %	60 %	0 %	20 %	360034673
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5598	NC_016445	A	6	6	297379	297384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_016445	A	6	6	297387	297392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_016445	TCCG	2	8	297425	297432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_016445	GTT	2	6	297484	297489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_016445	TGT	2	6	297498	297503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5614	NC_016445	A	6	6	298057	298062	100 %	0 %	0 %	0 %	360034674
5615	NC_016445	TGG	2	6	298066	298071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034674
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5749	NC_016445	GAT	2	6	303681	303686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5994	NC_016445	ACC	2	6	317726	317731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034690
5995	NC_016445	AAG	2	6	317748	317753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034690
5996	NC_016445	TTAT	2	8	317909	317916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5997	NC_016445	TTCCC	2	10	318016	318025	0 %	40 %	0 %	60 %	360034691
5998	NC_016445	GCC	2	6	318115	318120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034691
5999	NC_016445	AGA	2	6	318140	318145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034691
6000	NC_016445	TGA	3	9	318146	318154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034691

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