MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_016445	GAC	2	6	2749334	2749339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52502	NC_016445	TCA	2	6	2749346	2749351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52503	NC_016445	AC	3	6	2749372	2749377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52504	NC_016445	CGT	2	6	2749440	2749445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52505	NC_016445	AC	3	6	2749541	2749546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52506	NC_016445	AAG	2	6	2749577	2749582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52507	NC_016445	GGA	2	6	2749601	2749606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52508	NC_016445	CCT	2	6	2749682	2749687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52509	NC_016445	GAT	2	6	2749693	2749698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52510	NC_016445	TGA	2	6	2749704	2749709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52511	NC_016445	CA	3	6	2749715	2749720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52512	NC_016445	GATT	2	8	2749721	2749728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52513	NC_016445	GGT	2	6	2749766	2749771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52514	NC_016445	GGT	2	6	2749801	2749806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52515	NC_016445	CAC	2	6	2749824	2749829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52516	NC_016445	GCCT	2	8	2749862	2749869	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52517	NC_016445	AGG	2	6	2749877	2749882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52518	NC_016445	CCA	2	6	2749907	2749912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52519	NC_016445	TCA	2	6	2749952	2749957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52520	NC_016445	ACA	2	6	2749996	2750001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52521	NC_016445	TTG	2	6	2750007	2750012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52522	NC_016445	CAA	2	6	2750050	2750055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52523	NC_016445	GTT	2	6	2750161	2750166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52524	NC_016445	ACA	2	6	2750170	2750175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52525	NC_016445	GAG	2	6	2750409	2750414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52526	NC_016445	GTA	2	6	2750436	2750441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52527	NC_016445	GCG	2	6	2750442	2750447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52528	NC_016445	G	6	6	2750594	2750599	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52529	NC_016445	TCC	2	6	2750604	2750609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52530	NC_016445	CTGA	2	8	2750624	2750631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52531	NC_016445	GTAC	2	8	2750708	2750715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52532	NC_016445	GTG	2	6	2750735	2750740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52533	NC_016445	GGA	2	6	2750912	2750917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52534	NC_016445	TAC	2	6	2751035	2751040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52535	NC_016445	AGTA	2	8	2751110	2751117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52536	NC_016445	AC	3	6	2751129	2751134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52537	NC_016445	CGTC	2	8	2751147	2751154	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52538	NC_016445	AAC	2	6	2751166	2751171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52539	NC_016445	AGC	2	6	2751255	2751260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52540	NC_016445	CAT	2	6	2751261	2751266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52541	NC_016445	AAAG	2	8	2751269	2751276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52542	NC_016445	AGTCG	2	10	2751291	2751300	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52543	NC_016445	CCT	2	6	2751471	2751476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52544	NC_016445	G	6	6	2751603	2751608	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52545	NC_016445	CT	4	8	2751684	2751691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52546	NC_016445	ACG	2	6	2751703	2751708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52547	NC_016445	CTA	2	6	2751714	2751719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52548	NC_016445	GGT	2	6	2751803	2751808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52549	NC_016445	GA	3	6	2751833	2751838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52550	NC_016445	TTA	2	6	2751960	2751965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52551	NC_016445	CGG	2	6	2752084	2752089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52552	NC_016445	ATG	2	6	2752160	2752165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52553	NC_016445	TGAAAT	2	12	2752193	2752204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52554	NC_016445	TAC	2	6	2752258	2752263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52555	NC_016445	ACC	2	6	2752355	2752360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52556	NC_016445	TGG	2	6	2752415	2752420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52557	NC_016445	TCC	2	6	2752441	2752446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52558	NC_016445	GGA	2	6	2752458	2752463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52559	NC_016445	GGT	2	6	2752578	2752583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52560	NC_016445	CGG	2	6	2752665	2752670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52561	NC_016445	TCA	2	6	2752693	2752698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52562	NC_016445	CGT	2	6	2752773	2752778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52563	NC_016445	GCT	2	6	2752827	2752832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52564	NC_016445	GTT	2	6	2752995	2753000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52565	NC_016445	GT	3	6	2753026	2753031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52566	NC_016445	ACA	2	6	2753087	2753092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52567	NC_016445	TG	4	8	2753136	2753143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52568	NC_016445	TTG	2	6	2753167	2753172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52569	NC_016445	GAAAC	2	10	2753269	2753278	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52570	NC_016445	AGCGG	2	10	2753354	2753363	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52571	NC_016445	TCCGC	2	10	2753422	2753431	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
52572	NC_016445	TTA	2	6	2753435	2753440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52573	NC_016445	T	6	6	2753464	2753469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52574	NC_016445	ATG	2	6	2753537	2753542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52575	NC_016445	ATC	2	6	2753547	2753552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52576	NC_016445	CTT	2	6	2753568	2753573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52577	NC_016445	TGTCTT	2	12	2753585	2753596	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52578	NC_016445	A	6	6	2753674	2753679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52579	NC_016445	TTTG	2	8	2753727	2753734	0 %	75 %	25 %	0 %	360036953
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52584	NC_016445	TGA	2	6	2753964	2753969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036953
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52590	NC_016445	TTCA	2	8	2754373	2754380	25 %	50 %	0 %	25 %	360036953
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52603	NC_016445	TG	3	6	2755078	2755083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52604	NC_016445	CGG	2	6	2755228	2755233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036954
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52619	NC_016445	CGG	2	6	2755957	2755962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036955
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