MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_016445	CTT	2	6	2723430	2723435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036928
52003	NC_016445	CCT	2	6	2723436	2723441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360036928
52004	NC_016445	AAGG	2	8	2723537	2723544	50 %	0 %	50 %	0 %	360036928
52005	NC_016445	GAT	2	6	2723570	2723575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036928
52006	NC_016445	TCT	2	6	2723637	2723642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036928
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52008	NC_016445	T	7	7	2723746	2723752	0 %	100 %	0 %	0 %	360036928
52009	NC_016445	GAA	2	6	2723799	2723804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52010	NC_016445	TG	4	8	2723827	2723834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52011	NC_016445	TAA	2	6	2723847	2723852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52012	NC_016445	A	6	6	2723851	2723856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52013	NC_016445	A	6	6	2723878	2723883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52014	NC_016445	T	6	6	2723911	2723916	0 %	100 %	0 %	0 %	360036929
52015	NC_016445	CAT	2	6	2723950	2723955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036929
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52022	NC_016445	CTCTT	2	10	2724204	2724213	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52023	NC_016445	ATG	2	6	2724218	2724223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036930
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52053	NC_016445	CGG	2	6	2726413	2726418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52054	NC_016445	T	6	6	2726435	2726440	0 %	100 %	0 %	0 %	360036934
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52100	NC_016445	GA	3	6	2729022	2729027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52101	NC_016445	GCAA	2	8	2729070	2729077	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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52117	NC_016445	TCT	2	6	2730323	2730328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036937
52118	NC_016445	CCA	2	6	2730367	2730372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036937
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52123	NC_016445	CCA	2	6	2730584	2730589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036937
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52129	NC_016445	CGA	2	6	2730939	2730944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036937
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52131	NC_016445	TTCGT	2	10	2731145	2731154	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52132	NC_016445	TCAG	2	8	2731164	2731171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52133	NC_016445	TG	3	6	2731220	2731225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52134	NC_016445	GA	3	6	2731253	2731258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52135	NC_016445	CGC	2	6	2731262	2731267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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52155	NC_016445	GC	3	6	2732201	2732206	0 %	0 %	50 %	50 %	360036939
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52198	NC_016445	GC	3	6	2733964	2733969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52199	NC_016445	T	6	6	2734048	2734053	0 %	100 %	0 %	0 %	360036940
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52210	NC_016445	GCG	2	6	2734661	2734666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036940
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52212	NC_016445	ATC	2	6	2734718	2734723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036940
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52214	NC_016445	CGT	2	6	2734824	2734829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036940
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52221	NC_016445	A	6	6	2735210	2735215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52222	NC_016445	T	6	6	2735253	2735258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52223	NC_016445	GGTT	2	8	2735290	2735297	0 %	50 %	50 %	0 %	360036941
52224	NC_016445	TCGC	2	8	2735311	2735318	0 %	25 %	25 %	50 %	360036941
52225	NC_016445	GGC	2	6	2735384	2735389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036941
52226	NC_016445	CTAT	2	8	2735486	2735493	25 %	50 %	0 %	25 %	360036941
52227	NC_016445	TGTTTG	2	12	2735510	2735521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036941
52228	NC_016445	TCGC	2	8	2735575	2735582	0 %	25 %	25 %	50 %	360036941
52229	NC_016445	GCC	2	6	2735593	2735598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036941
52230	NC_016445	CGGTGA	2	12	2735630	2735641	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	360036941
52231	NC_016445	ATA	2	6	2735819	2735824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036941
52232	NC_016445	ATG	3	9	2735842	2735850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036941
52233	NC_016445	ATCG	2	8	2735865	2735872	25 %	25 %	25 %	25 %	360036941
52234	NC_016445	TGG	2	6	2735879	2735884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036941
52235	NC_016445	TGGCG	2	10	2735918	2735927	0 %	20 %	60 %	20 %	360036941
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52341	NC_016445	CAT	2	6	2741358	2741363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036943
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52344	NC_016445	AAAC	2	8	2741577	2741584	75 %	0 %	0 %	25 %	360036943
52345	NC_016445	T	7	7	2741588	2741594	0 %	100 %	0 %	0 %	360036943
52346	NC_016445	GTG	2	6	2741871	2741876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036944
52347	NC_016445	GAT	2	6	2741889	2741894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036944
52348	NC_016445	ACC	2	6	2741979	2741984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036944
52349	NC_016445	CTG	3	9	2742013	2742021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036944
52350	NC_016445	GTTTT	2	10	2742144	2742153	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52351	NC_016445	A	6	6	2742158	2742163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52352	NC_016445	TTAA	2	8	2742208	2742215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52353	NC_016445	GTT	2	6	2742219	2742224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52354	NC_016445	CTT	2	6	2742227	2742232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52355	NC_016445	CTTAA	2	10	2742257	2742266	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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52465	NC_016445	TAGA	2	8	2747642	2747649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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