MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_016445	GCT	2	6	2619802	2619807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036827
50002	NC_016445	ATC	2	6	2619821	2619826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036827
50003	NC_016445	CAG	2	6	2619839	2619844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036827
50004	NC_016445	TCA	2	6	2619861	2619866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036827
50005	NC_016445	GAT	2	6	2619881	2619886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036827
50006	NC_016445	GTG	2	6	2619913	2619918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036827
50007	NC_016445	CAA	2	6	2619922	2619927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036827
50008	NC_016445	AAG	2	6	2620014	2620019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036827
50009	NC_016445	TGC	2	6	2620059	2620064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036827
50010	NC_016445	GC	3	6	2620063	2620068	0 %	0 %	50 %	50 %	360036827
50011	NC_016445	GC	3	6	2620115	2620120	0 %	0 %	50 %	50 %	360036827
50012	NC_016445	ATG	2	6	2620184	2620189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036827
50013	NC_016445	TGA	2	6	2620209	2620214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036827
50014	NC_016445	TGGCG	2	10	2620247	2620256	0 %	20 %	60 %	20 %	360036827
50015	NC_016445	CG	3	6	2620255	2620260	0 %	0 %	50 %	50 %	360036827
50016	NC_016445	CCA	2	6	2620335	2620340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036827
50017	NC_016445	AAT	2	6	2620376	2620381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036827
50018	NC_016445	AGCG	2	8	2620382	2620389	25 %	0 %	50 %	25 %	360036827
50019	NC_016445	AGC	2	6	2620398	2620403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036827
50020	NC_016445	GGC	2	6	2620511	2620516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036827
50021	NC_016445	CAA	2	6	2620546	2620551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036827
50022	NC_016445	ATT	2	6	2620579	2620584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360036827
50023	NC_016445	TAA	2	6	2620675	2620680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360036827
50024	NC_016445	GAC	2	6	2620688	2620693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036827
50025	NC_016445	CGC	3	9	2620719	2620727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036827
50026	NC_016445	CG	4	8	2620768	2620775	0 %	0 %	50 %	50 %	360036827
50027	NC_016445	TGC	2	6	2620840	2620845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036827
50028	NC_016445	GC	3	6	2620848	2620853	0 %	0 %	50 %	50 %	360036827
50029	NC_016445	TTG	2	6	2620863	2620868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036827
50030	NC_016445	CTG	2	6	2620949	2620954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036827
50031	NC_016445	AGA	2	6	2621047	2621052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036827
50032	NC_016445	ATG	3	9	2621130	2621138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036827
50033	NC_016445	TGA	2	6	2621148	2621153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036827
50034	NC_016445	CG	3	6	2621294	2621299	0 %	0 %	50 %	50 %	360036827
50035	NC_016445	AAAG	2	8	2621474	2621481	75 %	0 %	25 %	0 %	360036827
50036	NC_016445	CAT	2	6	2621545	2621550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036827
50037	NC_016445	TAGA	2	8	2621651	2621658	50 %	25 %	25 %	0 %	360036827
50038	NC_016445	GCG	2	6	2621664	2621669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50039	NC_016445	GAA	2	6	2621700	2621705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50040	NC_016445	GAG	2	6	2621753	2621758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50041	NC_016445	GTG	2	6	2621763	2621768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50042	NC_016445	A	6	6	2621784	2621789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50043	NC_016445	GCA	2	6	2621832	2621837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50044	NC_016445	CTA	2	6	2621844	2621849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50045	NC_016445	CAT	2	6	2622000	2622005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50046	NC_016445	TTC	3	9	2622137	2622145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50047	NC_016445	CGA	2	6	2622196	2622201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50048	NC_016445	CTGAG	2	10	2622213	2622222	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50049	NC_016445	AGCGA	2	10	2622239	2622248	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50050	NC_016445	ATG	2	6	2622265	2622270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50051	NC_016445	TTTA	2	8	2622284	2622291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50052	NC_016445	TGT	2	6	2622306	2622311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50053	NC_016445	T	6	6	2622323	2622328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50054	NC_016445	GCTT	2	8	2622431	2622438	0 %	50 %	25 %	25 %	360036828
50055	NC_016445	GTT	2	6	2622517	2622522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036828
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50059	NC_016445	GCTG	2	8	2622623	2622630	0 %	25 %	50 %	25 %	360036828
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50063	NC_016445	T	7	7	2622768	2622774	0 %	100 %	0 %	0 %	360036828
50064	NC_016445	TAAA	2	8	2622806	2622813	75 %	25 %	0 %	0 %	360036828
50065	NC_016445	GCC	2	6	2622824	2622829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036828
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50070	NC_016445	ATT	2	6	2623080	2623085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50071	NC_016445	CG	3	6	2623098	2623103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50072	NC_016445	GAG	2	6	2623112	2623117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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50089	NC_016445	A	6	6	2624006	2624011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50090	NC_016445	GTGG	2	8	2624030	2624037	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50091	NC_016445	A	6	6	2624056	2624061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50092	NC_016445	CGG	2	6	2624247	2624252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036830
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50119	NC_016445	GAT	2	6	2625584	2625589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036830
50120	NC_016445	GTC	2	6	2625620	2625625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036830
50121	NC_016445	TCGC	2	8	2625677	2625684	0 %	25 %	25 %	50 %	360036830
50122	NC_016445	GCC	2	6	2625695	2625700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036830
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50124	NC_016445	TTG	2	6	2625924	2625929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50125	NC_016445	GAT	2	6	2625938	2625943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50126	NC_016445	GCA	2	6	2625948	2625953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50150	NC_016445	TTG	2	6	2627058	2627063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50151	NC_016445	TCT	2	6	2627122	2627127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036832
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50199	NC_016445	GGA	2	6	2629383	2629388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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50202	NC_016445	CTG	2	6	2629498	2629503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036834
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50214	NC_016445	CTT	2	6	2630216	2630221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036835
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50217	NC_016445	GGC	2	6	2630318	2630323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036835
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50219	NC_016445	GCA	2	6	2630399	2630404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036835
50220	NC_016445	T	6	6	2630501	2630506	0 %	100 %	0 %	0 %	360036835
50221	NC_016445	GC	3	6	2630507	2630512	0 %	0 %	50 %	50 %	360036835
50222	NC_016445	AGCTC	2	10	2630537	2630546	20 %	20 %	20 %	40 %	360036835
50223	NC_016445	GT	3	6	2630854	2630859	0 %	50 %	50 %	0 %	360036835
50224	NC_016445	GGT	2	6	2630889	2630894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036835
50225	NC_016445	GGT	2	6	2630925	2630930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036835
50226	NC_016445	CAA	2	6	2630948	2630953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036835
50227	NC_016445	AGA	2	6	2631041	2631046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036835
50228	NC_016445	CAC	2	6	2631066	2631071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360036835
50229	NC_016445	ATC	2	6	2631094	2631099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360036835
50230	NC_016445	GAA	2	6	2631225	2631230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360036835
50231	NC_016445	TTTG	2	8	2631239	2631246	0 %	75 %	25 %	0 %	360036835
50232	NC_016445	GCA	2	6	2631308	2631313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036835
50233	NC_016445	TACCAG	2	12	2631348	2631359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	360036835
50234	NC_016445	GCC	2	6	2631361	2631366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036835
50235	NC_016445	TGG	2	6	2631403	2631408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036835
50236	NC_016445	CAA	2	6	2631431	2631436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036835
50237	NC_016445	TC	3	6	2631437	2631442	0 %	50 %	0 %	50 %	360036835
50238	NC_016445	GTA	2	6	2631531	2631536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036835
50239	NC_016445	T	6	6	2631666	2631671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50240	NC_016445	TTAA	2	8	2631676	2631683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50241	NC_016445	TAA	2	6	2631718	2631723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50242	NC_016445	TCG	2	6	2631796	2631801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036836
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50354	NC_016445	CG	3	6	2637754	2637759	0 %	0 %	50 %	50 %	360036840
50355	NC_016445	GCT	2	6	2637770	2637775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036840
50356	NC_016445	GGTC	2	8	2637797	2637804	0 %	25 %	50 %	25 %	360036840
50357	NC_016445	TGC	2	6	2637847	2637852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036840
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50362	NC_016445	GGC	2	6	2638499	2638504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036840
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50383	NC_016445	GCA	2	6	2639647	2639652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360036842
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50386	NC_016445	AGACA	2	10	2639699	2639708	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50387	NC_016445	GAT	2	6	2639716	2639721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036843
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50428	NC_016445	CTTT	2	8	2641231	2641238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50429	NC_016445	CTT	2	6	2641275	2641280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036844
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50432	NC_016445	CATCGA	2	12	2641496	2641507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	360036844
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50434	NC_016445	GCC	2	6	2641557	2641562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360036844
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50442	NC_016445	TAAA	2	8	2641791	2641798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50443	NC_016445	CT	3	6	2641847	2641852	0 %	50 %	0 %	50 %	360036845
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50459	NC_016445	AAG	2	6	2642839	2642844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50460	NC_016445	TGG	2	6	2642941	2642946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036846
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50462	NC_016445	CGG	2	6	2643034	2643039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360036846
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50464	NC_016445	CG	3	6	2643137	2643142	0 %	0 %	50 %	50 %	360036846
50465	NC_016445	TGG	2	6	2643157	2643162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360036846
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50469	NC_016445	CTG	3	9	2643397	2643405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036846
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50471	NC_016445	CTG	2	6	2643463	2643468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360036846
50472	NC_016445	GCTG	2	8	2643506	2643513	0 %	25 %	50 %	25 %	360036846
50473	NC_016445	A	6	6	2643519	2643524	100 %	0 %	0 %	0 %	360036846
50474	NC_016445	GTT	2	6	2643560	2643565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360036846
50475	NC_016445	GATT	2	8	2643567	2643574	25 %	50 %	25 %	0 %	360036846
50476	NC_016445	T	7	7	2643598	2643604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50477	NC_016445	CTC	2	6	2643705	2643710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50478	NC_016445	TTG	2	6	2643759	2643764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50479	NC_016445	AGGGG	2	10	2643795	2643804	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50480	NC_016445	AAG	2	6	2643823	2643828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50481	NC_016445	G	6	6	2643828	2643833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50482	NC_016445	C	6	6	2643846	2643851	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50483	NC_016445	AAGT	2	8	2643901	2643908	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50484	NC_016445	AG	4	8	2643925	2643932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50485	NC_016445	ATG	2	6	2643935	2643940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036847
50486	NC_016445	GC	3	6	2644076	2644081	0 %	0 %	50 %	50 %	360036847
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50492	NC_016445	ATG	2	6	2644308	2644313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036847
50493	NC_016445	CAA	2	6	2644363	2644368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360036847
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50498	NC_016445	A	6	6	2644608	2644613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50499	NC_016445	ATG	2	6	2644680	2644685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360036848
50500	NC_016445	CTT	2	6	2644808	2644813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360036848

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