MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 174391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_014931	GTC	3	9	664078	664086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791288
18002	NC_014931	GCCGC	2	10	664160	664169	0 %	0 %	40 %	60 %	319791288
18003	NC_014931	GGT	2	6	664192	664197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791288
18004	NC_014931	AGC	2	6	664223	664228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791288
18005	NC_014931	CG	4	8	664234	664241	0 %	0 %	50 %	50 %	319791288
18006	NC_014931	GCT	2	6	664254	664259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791288
18007	NC_014931	GC	3	6	664270	664275	0 %	0 %	50 %	50 %	319791288
18008	NC_014931	CGGC	2	8	664283	664290	0 %	0 %	50 %	50 %	319791288
18009	NC_014931	CTT	2	6	664327	664332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791288
18010	NC_014931	GCA	2	6	664359	664364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791288
18011	NC_014931	GTG	2	6	664367	664372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791288
18012	NC_014931	GCT	2	6	664452	664457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791288
18013	NC_014931	TGC	2	6	664485	664490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791288
18014	NC_014931	CCG	2	6	664530	664535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791288
18015	NC_014931	CGC	3	9	664626	664634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791288
18016	NC_014931	GGC	2	6	664635	664640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791288
18017	NC_014931	GCCG	2	8	664648	664655	0 %	0 %	50 %	50 %	319791288
18018	NC_014931	TCA	2	6	664695	664700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791288
18019	NC_014931	TTGCTG	2	12	664714	664725	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319791289
18020	NC_014931	CGT	3	9	664726	664734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791289
18021	NC_014931	GGT	2	6	664735	664740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791289
18022	NC_014931	GGGGTT	2	12	664765	664776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791289
18023	NC_014931	GCCG	2	8	664806	664813	0 %	0 %	50 %	50 %	319791289
18024	NC_014931	GCGA	2	8	664824	664831	25 %	0 %	50 %	25 %	319791289
18025	NC_014931	CAG	2	6	664832	664837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791289
18026	NC_014931	CG	3	6	664845	664850	0 %	0 %	50 %	50 %	319791289
18027	NC_014931	CCGA	2	8	664857	664864	25 %	0 %	25 %	50 %	319791289
18028	NC_014931	CAT	2	6	664868	664873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791289
18029	NC_014931	CGCTTG	2	12	664875	664886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791289
18030	NC_014931	CCATGT	2	12	664897	664908	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319791289
18031	NC_014931	GCG	3	9	664939	664947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791289
18032	NC_014931	GCC	2	6	664988	664993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791289
18033	NC_014931	TCG	2	6	665043	665048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791289
18034	NC_014931	AGCC	2	8	665052	665059	25 %	0 %	25 %	50 %	319791289
18035	NC_014931	AGC	2	6	665077	665082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791289
18036	NC_014931	GC	3	6	665161	665166	0 %	0 %	50 %	50 %	319791289
18037	NC_014931	TGC	2	6	665181	665186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791289
18038	NC_014931	GC	3	6	665201	665206	0 %	0 %	50 %	50 %	319791289
18039	NC_014931	GC	3	6	665236	665241	0 %	0 %	50 %	50 %	319791289
18040	NC_014931	CCA	2	6	665263	665268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791289
18041	NC_014931	CAC	2	6	665420	665425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791289
18042	NC_014931	GC	4	8	665435	665442	0 %	0 %	50 %	50 %	319791289
18043	NC_014931	GC	3	6	665445	665450	0 %	0 %	50 %	50 %	319791289
18044	NC_014931	CCGGG	2	10	665470	665479	0 %	0 %	60 %	40 %	319791289
18045	NC_014931	ACC	2	6	665484	665489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791289
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18047	NC_014931	GGTGC	2	10	665509	665518	0 %	20 %	60 %	20 %	319791289
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18050	NC_014931	GTA	2	6	665558	665563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319791289
18051	NC_014931	GC	3	6	665596	665601	0 %	0 %	50 %	50 %	319791289
18052	NC_014931	TCG	2	6	665616	665621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791289
18053	NC_014931	CGC	2	6	665684	665689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791289
18054	NC_014931	GCAC	2	8	665691	665698	25 %	0 %	25 %	50 %	319791289
18055	NC_014931	CTT	2	6	665771	665776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791290
18056	NC_014931	GCA	3	9	665779	665787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791290
18057	NC_014931	GC	3	6	665836	665841	0 %	0 %	50 %	50 %	319791290
18058	NC_014931	GCC	2	6	665894	665899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791290
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18061	NC_014931	TGG	2	6	665937	665942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791290
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18066	NC_014931	GGT	2	6	666233	666238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_014931	GC	3	6	666286	666291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18068	NC_014931	GTGC	2	8	666298	666305	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18069	NC_014931	CG	3	6	666312	666317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18070	NC_014931	GTG	2	6	666329	666334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18071	NC_014931	GC	4	8	666339	666346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18072	NC_014931	A	6	6	666351	666356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18073	NC_014931	CGA	2	6	666415	666420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18074	NC_014931	CAAT	2	8	666534	666541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18075	NC_014931	GAA	2	6	666586	666591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791291
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18077	NC_014931	CTG	3	9	666623	666631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791291
18078	NC_014931	CGA	2	6	666646	666651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791291
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18082	NC_014931	CG	4	8	666783	666790	0 %	0 %	50 %	50 %	319791291
18083	NC_014931	GGCACC	2	12	666791	666802	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319791291
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18092	NC_014931	CGA	3	9	667204	667212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791291
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18095	NC_014931	CGC	2	6	667322	667327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791291
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18101	NC_014931	GC	3	6	667546	667551	0 %	0 %	50 %	50 %	319791291
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18105	NC_014931	GC	3	6	667639	667644	0 %	0 %	50 %	50 %	319791291
18106	NC_014931	CGT	2	6	667767	667772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791291
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18363	NC_014931	CGC	2	6	677010	677015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18364	NC_014931	ATGCCA	2	12	677021	677032	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18365	NC_014931	GCT	2	6	677076	677081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18366	NC_014931	CAG	2	6	677083	677088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18367	NC_014931	GCCA	2	8	677117	677124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18368	NC_014931	TGC	2	6	677166	677171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18369	NC_014931	GGC	2	6	677189	677194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18370	NC_014931	CGC	2	6	677227	677232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18371	NC_014931	GCG	2	6	677255	677260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18372	NC_014931	CA	3	6	677274	677279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18373	NC_014931	TGC	2	6	677297	677302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18374	NC_014931	CCAT	2	8	677333	677340	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18375	NC_014931	T	6	6	677349	677354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18405	NC_014931	CCAG	2	8	678458	678465	25 %	0 %	25 %	50 %	319791301
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18473	NC_014931	CG	4	8	681056	681063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18474	NC_014931	CTC	2	6	681111	681116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319791303
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18479	NC_014931	ACGCC	2	10	681226	681235	20 %	0 %	20 %	60 %	319791303
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18483	NC_014931	TGG	2	6	681370	681375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791303
18484	NC_014931	GCC	2	6	681379	681384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791303
18485	NC_014931	GTT	2	6	681395	681400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319791303
18486	NC_014931	GCC	2	6	681405	681410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791303
18487	NC_014931	CGG	2	6	681460	681465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791303
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18491	NC_014931	GTG	2	6	681516	681521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791303
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18499	NC_014931	CTG	2	6	681849	681854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791303
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