MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 174391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_014931	CGCGC	2	10	628220	628229	0 %	0 %	40 %	60 %	319791257
17002	NC_014931	CTGGG	2	10	628230	628239	0 %	20 %	60 %	20 %	319791257
17003	NC_014931	GCA	2	6	628294	628299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791257
17004	NC_014931	GCC	2	6	628329	628334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791257
17005	NC_014931	GAC	3	9	628339	628347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791257
17006	NC_014931	CGG	2	6	628368	628373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791258
17007	NC_014931	GCG	2	6	628397	628402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791258
17008	NC_014931	CGA	2	6	628435	628440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791258
17009	NC_014931	CGA	2	6	628471	628476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791258
17010	NC_014931	TGC	2	6	628503	628508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791258
17011	NC_014931	GGC	2	6	628580	628585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791258
17012	NC_014931	AAC	2	6	628592	628597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791258
17013	NC_014931	CTG	2	6	628607	628612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791258
17014	NC_014931	GGCC	2	8	628618	628625	0 %	0 %	50 %	50 %	319791258
17015	NC_014931	CGA	2	6	628630	628635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791258
17016	NC_014931	GCG	2	6	628674	628679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791258
17017	NC_014931	GCC	2	6	628742	628747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791258
17018	NC_014931	GC	3	6	628750	628755	0 %	0 %	50 %	50 %	319791258
17019	NC_014931	GCC	2	6	628758	628763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791258
17020	NC_014931	GAG	2	6	628841	628846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319791258
17021	NC_014931	TGC	3	9	628872	628880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791258
17022	NC_014931	GC	4	8	628896	628903	0 %	0 %	50 %	50 %	319791258
17023	NC_014931	CG	3	6	628916	628921	0 %	0 %	50 %	50 %	319791258
17024	NC_014931	GCT	2	6	628927	628932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791258
17025	NC_014931	GAGC	2	8	628939	628946	25 %	0 %	50 %	25 %	319791258
17026	NC_014931	TGGC	2	8	628970	628977	0 %	25 %	50 %	25 %	319791258
17027	NC_014931	CTG	2	6	629009	629014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791258
17028	NC_014931	GCC	2	6	629015	629020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791258
17029	NC_014931	CG	4	8	629038	629045	0 %	0 %	50 %	50 %	319791258
17030	NC_014931	GTT	2	6	629068	629073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319791258
17031	NC_014931	TGG	2	6	629136	629141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791258
17032	NC_014931	CG	4	8	629142	629149	0 %	0 %	50 %	50 %	319791258
17033	NC_014931	GCCC	2	8	629166	629173	0 %	0 %	25 %	75 %	319791258
17034	NC_014931	CG	3	6	629176	629181	0 %	0 %	50 %	50 %	319791258
17035	NC_014931	GCT	2	6	629227	629232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791258
17036	NC_014931	TGC	2	6	629280	629285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791258
17037	NC_014931	GC	3	6	629287	629292	0 %	0 %	50 %	50 %	319791258
17038	NC_014931	AGC	2	6	629295	629300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791258
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17040	NC_014931	ACG	2	6	629310	629315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791258
17041	NC_014931	TGC	2	6	629316	629321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791258
17042	NC_014931	GGC	2	6	629425	629430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791258
17043	NC_014931	CGC	2	6	629431	629436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791258
17044	NC_014931	TGCGC	2	10	629440	629449	0 %	20 %	40 %	40 %	319791258
17045	NC_014931	GGC	2	6	629456	629461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791258
17046	NC_014931	CGG	2	6	629488	629493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791258
17047	NC_014931	GCCT	2	8	629555	629562	0 %	25 %	25 %	50 %	319791258
17048	NC_014931	GCC	2	6	629567	629572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791258
17049	NC_014931	CCGCG	2	10	629606	629615	0 %	0 %	40 %	60 %	319791258
17050	NC_014931	TGGC	2	8	629639	629646	0 %	25 %	50 %	25 %	319791258
17051	NC_014931	CCG	2	6	629685	629690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17052	NC_014931	GCT	2	6	629872	629877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791259
17053	NC_014931	CGC	2	6	630006	630011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791259
17054	NC_014931	TGG	2	6	630093	630098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791259
17055	NC_014931	TGCG	2	8	630225	630232	0 %	25 %	50 %	25 %	319791259
17056	NC_014931	GCG	2	6	630255	630260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791259
17057	NC_014931	GCCG	2	8	630289	630296	0 %	0 %	50 %	50 %	319791259
17058	NC_014931	A	6	6	630320	630325	100 %	0 %	0 %	0 %	319791259
17059	NC_014931	AAG	2	6	630353	630358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791259
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17061	NC_014931	CGGG	2	8	630379	630386	0 %	0 %	75 %	25 %	319791259
17062	NC_014931	TCG	2	6	630405	630410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791259
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17067	NC_014931	GCC	2	6	630520	630525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791259
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17072	NC_014931	CGA	2	6	630667	630672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791259
17073	NC_014931	GCGG	2	8	630692	630699	0 %	0 %	75 %	25 %	319791259
17074	NC_014931	CGGC	2	8	630702	630709	0 %	0 %	50 %	50 %	319791259
17075	NC_014931	CG	4	8	630745	630752	0 %	0 %	50 %	50 %	319791259
17076	NC_014931	ACC	2	6	630776	630781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791259
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17079	NC_014931	GCCCGA	2	12	630850	630861	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319791259
17080	NC_014931	TGC	2	6	630882	630887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791259
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17084	NC_014931	CGA	2	6	630934	630939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791259
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17086	NC_014931	GCA	2	6	631048	631053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791259
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17089	NC_014931	CCA	2	6	631134	631139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791259
17090	NC_014931	GCT	2	6	631180	631185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791259
17091	NC_014931	GTCGA	2	10	631187	631196	20 %	20 %	40 %	20 %	319791259
17092	NC_014931	GC	3	6	631220	631225	0 %	0 %	50 %	50 %	319791259
17093	NC_014931	GCA	2	6	631269	631274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791259
17094	NC_014931	TGCG	2	8	631278	631285	0 %	25 %	50 %	25 %	319791259
17095	NC_014931	CAA	2	6	631288	631293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791259
17096	NC_014931	ACC	2	6	631322	631327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791259
17097	NC_014931	CCGCG	2	10	631432	631441	0 %	0 %	40 %	60 %	319791259
17098	NC_014931	CGC	2	6	631497	631502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791259
17099	NC_014931	TCCT	2	8	631506	631513	0 %	50 %	0 %	50 %	319791259
17100	NC_014931	CGA	2	6	631519	631524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791259
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17102	NC_014931	GAT	2	6	631660	631665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319791259
17103	NC_014931	CG	3	6	631666	631671	0 %	0 %	50 %	50 %	319791259
17104	NC_014931	AGACCG	2	12	631758	631769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791259
17105	NC_014931	GGC	2	6	631796	631801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791259
17106	NC_014931	CAT	2	6	631810	631815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791259
17107	NC_014931	AGG	2	6	631839	631844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319791259
17108	NC_014931	GC	3	6	631869	631874	0 %	0 %	50 %	50 %	319791259
17109	NC_014931	GGC	2	6	631901	631906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791259
17110	NC_014931	GCC	2	6	631926	631931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791259
17111	NC_014931	GTG	2	6	631943	631948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791259
17112	NC_014931	CGA	2	6	631954	631959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791259
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17114	NC_014931	TGGA	2	8	632018	632025	25 %	25 %	50 %	0 %	319791259
17115	NC_014931	GAT	2	6	632041	632046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319791259
17116	NC_014931	ATC	2	6	632063	632068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791259
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17118	NC_014931	GCT	2	6	632125	632130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791259
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17120	NC_014931	GCT	2	6	632194	632199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791259
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