MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 174391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014931	CCG	2	6	520121	520126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791173
14002	NC_014931	AGC	2	6	520132	520137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791173
14003	NC_014931	CAA	2	6	520143	520148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791173
14004	NC_014931	CAC	2	6	520212	520217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791173
14005	NC_014931	CGA	2	6	520218	520223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791173
14006	NC_014931	GC	3	6	520236	520241	0 %	0 %	50 %	50 %	319791173
14007	NC_014931	GC	3	6	520314	520319	0 %	0 %	50 %	50 %	319791173
14008	NC_014931	CAA	2	6	520329	520334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791173
14009	NC_014931	GGC	3	9	520372	520380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791173
14010	NC_014931	GACC	2	8	520412	520419	25 %	0 %	25 %	50 %	319791173
14011	NC_014931	TGC	2	6	520431	520436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_014931	CGC	2	6	520457	520462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_014931	GCC	2	6	520472	520477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14014	NC_014931	CTC	2	6	520522	520527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14015	NC_014931	CGT	2	6	520580	520585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791174
14016	NC_014931	GCC	2	6	520598	520603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791174
14017	NC_014931	GCT	2	6	520615	520620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791174
14018	NC_014931	GCC	2	6	520628	520633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791174
14019	NC_014931	GC	3	6	520652	520657	0 %	0 %	50 %	50 %	319791174
14020	NC_014931	CCGG	2	8	520715	520722	0 %	0 %	50 %	50 %	319791174
14021	NC_014931	GGT	2	6	520732	520737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791174
14022	NC_014931	TTC	2	6	520742	520747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791174
14023	NC_014931	CCG	2	6	520828	520833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791174
14024	NC_014931	ACG	2	6	520857	520862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791174
14025	NC_014931	AGC	2	6	520872	520877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791174
14026	NC_014931	TAC	2	6	520883	520888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791174
14027	NC_014931	CGA	2	6	520912	520917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791174
14028	NC_014931	AGC	2	6	520950	520955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791174
14029	NC_014931	CAT	2	6	520981	520986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791174
14030	NC_014931	GC	3	6	521068	521073	0 %	0 %	50 %	50 %	319791174
14031	NC_014931	TGGC	2	8	521100	521107	0 %	25 %	50 %	25 %	319791174
14032	NC_014931	TGGCCG	2	12	521118	521129	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319791174
14033	NC_014931	CCG	2	6	521154	521159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791174
14034	NC_014931	TGC	2	6	521175	521180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791174
14035	NC_014931	AAG	2	6	521210	521215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791174
14036	NC_014931	CGGC	2	8	521284	521291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14037	NC_014931	CCG	2	6	521377	521382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14038	NC_014931	CCT	2	6	521426	521431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319791175
14039	NC_014931	ACA	2	6	521438	521443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791175
14040	NC_014931	C	6	6	521444	521449	0 %	0 %	0 %	100 %	319791175
14041	NC_014931	TCGT	2	8	521450	521457	0 %	50 %	25 %	25 %	319791175
14042	NC_014931	GCC	2	6	521465	521470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791175
14043	NC_014931	GC	3	6	521480	521485	0 %	0 %	50 %	50 %	319791175
14044	NC_014931	GGCC	2	8	521493	521500	0 %	0 %	50 %	50 %	319791175
14045	NC_014931	CCG	2	6	521525	521530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791175
14046	NC_014931	GCA	2	6	521534	521539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791175
14047	NC_014931	ACG	2	6	521573	521578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791175
14048	NC_014931	ATC	3	9	521632	521640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791175
14049	NC_014931	GC	4	8	521645	521652	0 %	0 %	50 %	50 %	319791175
14050	NC_014931	GC	3	6	521715	521720	0 %	0 %	50 %	50 %	319791175
14051	NC_014931	TAC	2	6	521722	521727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791175
14052	NC_014931	CGA	2	6	521748	521753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791175
14053	NC_014931	CCA	2	6	521825	521830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791175
14054	NC_014931	GCT	2	6	521838	521843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791175
14055	NC_014931	ACG	2	6	521858	521863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791175
14056	NC_014931	GC	3	6	521873	521878	0 %	0 %	50 %	50 %	319791175
14057	NC_014931	GCC	2	6	521931	521936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791175
14058	NC_014931	GCC	2	6	521998	522003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791175
14059	NC_014931	CCGG	2	8	522031	522038	0 %	0 %	50 %	50 %	319791175
14060	NC_014931	ACC	2	6	522094	522099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791175
14061	NC_014931	CCG	2	6	522139	522144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791176
14062	NC_014931	CGT	2	6	522221	522226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791176
14063	NC_014931	GTC	2	6	522261	522266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791176
14064	NC_014931	TCG	2	6	522316	522321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791176
14065	NC_014931	GC	3	6	522329	522334	0 %	0 %	50 %	50 %	319791176
14066	NC_014931	CCG	2	6	522389	522394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791176
14067	NC_014931	CG	4	8	522393	522400	0 %	0 %	50 %	50 %	319791176
14068	NC_014931	GC	3	6	522467	522472	0 %	0 %	50 %	50 %	319791176
14069	NC_014931	CGA	2	6	522497	522502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791176
14070	NC_014931	GGT	2	6	522512	522517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791176
14071	NC_014931	GAA	2	6	522527	522532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791176
14072	NC_014931	GAG	2	6	522540	522545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319791176
14073	NC_014931	CTG	2	6	522558	522563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791176
14074	NC_014931	GCG	2	6	522616	522621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791176
14075	NC_014931	CGC	3	9	522624	522632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791176
14076	NC_014931	GC	5	10	522642	522651	0 %	0 %	50 %	50 %	319791176
14077	NC_014931	CTG	2	6	522675	522680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791176
14078	NC_014931	ATC	2	6	522732	522737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791176
14079	NC_014931	TCA	2	6	522769	522774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791176
14080	NC_014931	CGTG	2	8	522785	522792	0 %	25 %	50 %	25 %	319791176
14081	NC_014931	TCA	3	9	522820	522828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791176
14082	NC_014931	TCG	2	6	522868	522873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791176
14083	NC_014931	AGGG	2	8	522923	522930	25 %	0 %	75 %	0 %	319791176
14084	NC_014931	TTC	2	6	522936	522941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14085	NC_014931	GCA	2	6	522971	522976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791177
14086	NC_014931	GCA	2	6	522998	523003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791177
14087	NC_014931	GCT	2	6	523013	523018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791177
14088	NC_014931	AGG	2	6	523045	523050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319791177
14089	NC_014931	GAA	2	6	523095	523100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791177
14090	NC_014931	GCG	2	6	523101	523106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791177
14091	NC_014931	CG	3	6	523105	523110	0 %	0 %	50 %	50 %	319791177
14092	NC_014931	CG	3	6	523147	523152	0 %	0 %	50 %	50 %	319791177
14093	NC_014931	ACG	2	6	523153	523158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791177
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14095	NC_014931	CGA	2	6	523207	523212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791177
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14099	NC_014931	CG	3	6	523346	523351	0 %	0 %	50 %	50 %	319791177
14100	NC_014931	AAC	2	6	523356	523361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791177
14101	NC_014931	CGA	3	9	523367	523375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791177
14102	NC_014931	GC	3	6	523398	523403	0 %	0 %	50 %	50 %	319791177
14103	NC_014931	GAACGA	2	12	523457	523468	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	319791177
14104	NC_014931	GCGCT	3	15	523471	523485	0 %	20 %	40 %	40 %	319791177
14105	NC_014931	ACG	3	9	523504	523512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791177
14106	NC_014931	CGA	2	6	523559	523564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791177
14107	NC_014931	CGA	2	6	523577	523582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791177
14108	NC_014931	GCT	2	6	523613	523618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791177
14109	NC_014931	GC	3	6	523647	523652	0 %	0 %	50 %	50 %	319791177
14110	NC_014931	GC	4	8	523682	523689	0 %	0 %	50 %	50 %	319791177
14111	NC_014931	GAA	2	6	523716	523721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791177
14112	NC_014931	AGC	2	6	523753	523758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791177
14113	NC_014931	GCT	2	6	523766	523771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791177
14114	NC_014931	CG	3	6	523772	523777	0 %	0 %	50 %	50 %	319791177
14115	NC_014931	GAA	2	6	523818	523823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791177
14116	NC_014931	GCCGG	2	10	523868	523877	0 %	0 %	60 %	40 %	319791177
14117	NC_014931	TCG	2	6	523882	523887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791177
14118	NC_014931	GC	3	6	524017	524022	0 %	0 %	50 %	50 %	319791177
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14120	NC_014931	TCA	2	6	524086	524091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791177
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14122	NC_014931	TCG	2	6	524140	524145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791177
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14125	NC_014931	CGA	2	6	524213	524218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791177
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14231	NC_014931	CGAG	2	8	528677	528684	25 %	0 %	50 %	25 %	319791182
14232	NC_014931	CGA	2	6	528686	528691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791182
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14235	NC_014931	CG	4	8	528746	528753	0 %	0 %	50 %	50 %	319791182
14236	NC_014931	CGG	2	6	528755	528760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791182
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