MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 174391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014931	GCA	2	6	484083	484088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791141
13002	NC_014931	CACGCT	2	12	484119	484130	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319791141
13003	NC_014931	TGC	2	6	484136	484141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791141
13004	NC_014931	AAC	2	6	484192	484197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791141
13005	NC_014931	CGA	2	6	484293	484298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791141
13006	NC_014931	GCT	2	6	484380	484385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791141
13007	NC_014931	CGG	2	6	484391	484396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791141
13008	NC_014931	CAA	2	6	484431	484436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791141
13009	NC_014931	GC	3	6	484441	484446	0 %	0 %	50 %	50 %	319791141
13010	NC_014931	ACG	2	6	484448	484453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791141
13011	NC_014931	GC	3	6	484501	484506	0 %	0 %	50 %	50 %	319791141
13012	NC_014931	GCC	2	6	484606	484611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791141
13013	NC_014931	CG	3	6	484658	484663	0 %	0 %	50 %	50 %	319791141
13014	NC_014931	TGC	2	6	484682	484687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791141
13015	NC_014931	GAC	2	6	484696	484701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791141
13016	NC_014931	CTG	2	6	484717	484722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791141
13017	NC_014931	CG	3	6	484723	484728	0 %	0 %	50 %	50 %	319791141
13018	NC_014931	TGG	2	6	484736	484741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791141
13019	NC_014931	AGC	2	6	484763	484768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791141
13020	NC_014931	CGTG	2	8	484825	484832	0 %	25 %	50 %	25 %	319791141
13021	NC_014931	CAG	2	6	484833	484838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791141
13022	NC_014931	CGG	2	6	484844	484849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791141
13023	NC_014931	CG	3	6	484851	484856	0 %	0 %	50 %	50 %	319791141
13024	NC_014931	T	6	6	484869	484874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_014931	CTTT	2	8	484875	484882	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13026	NC_014931	GGC	2	6	484883	484888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_014931	GCT	2	6	485005	485010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791142
13028	NC_014931	CG	3	6	485064	485069	0 %	0 %	50 %	50 %	319791142
13029	NC_014931	CCGGC	2	10	485084	485093	0 %	0 %	40 %	60 %	319791142
13030	NC_014931	GTCG	2	8	485097	485104	0 %	25 %	50 %	25 %	319791142
13031	NC_014931	CCG	3	9	485132	485140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791142
13032	NC_014931	AGC	3	9	485261	485269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791142
13033	NC_014931	CGC	2	6	485385	485390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791142
13034	NC_014931	GCG	2	6	485399	485404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791142
13035	NC_014931	ATCGA	2	10	485416	485425	40 %	20 %	20 %	20 %	319791142
13036	NC_014931	GGCGCT	2	12	485430	485441	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319791142
13037	NC_014931	GGCC	2	8	485466	485473	0 %	0 %	50 %	50 %	319791142
13038	NC_014931	ACC	2	6	485503	485508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791142
13039	NC_014931	CG	3	6	485567	485572	0 %	0 %	50 %	50 %	319791142
13040	NC_014931	TCA	2	6	485621	485626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791142
13041	NC_014931	GAC	2	6	485659	485664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791142
13042	NC_014931	CGC	2	6	485733	485738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791142
13043	NC_014931	CTG	2	6	485746	485751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791142
13044	NC_014931	GGT	2	6	485760	485765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791142
13045	NC_014931	CGC	2	6	485790	485795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791142
13046	NC_014931	CGC	2	6	485802	485807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791142
13047	NC_014931	GCC	3	9	485836	485844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791142
13048	NC_014931	GGC	2	6	485865	485870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791142
13049	NC_014931	GCC	2	6	485932	485937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791142
13050	NC_014931	CCA	2	6	486003	486008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791142
13051	NC_014931	CG	3	6	486026	486031	0 %	0 %	50 %	50 %	319791142
13052	NC_014931	GTG	2	6	486211	486216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791142
13053	NC_014931	CTG	2	6	486247	486252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_014931	GAA	2	6	486321	486326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_014931	GCC	2	6	486328	486333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13056	NC_014931	CTCGA	2	10	486396	486405	20 %	20 %	20 %	40 %	319791143
13057	NC_014931	TGGA	2	8	486438	486445	25 %	25 %	50 %	0 %	319791143
13058	NC_014931	CGC	2	6	486451	486456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791143
13059	NC_014931	AAC	2	6	486537	486542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791143
13060	NC_014931	TGC	2	6	486556	486561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791143
13061	NC_014931	GCAG	2	8	486581	486588	25 %	0 %	50 %	25 %	319791143
13062	NC_014931	GC	3	6	486612	486617	0 %	0 %	50 %	50 %	319791143
13063	NC_014931	AAG	2	6	486753	486758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791143
13064	NC_014931	GGT	2	6	486797	486802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791143
13065	NC_014931	GCG	2	6	486812	486817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791143
13066	NC_014931	GAA	2	6	486827	486832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791143
13067	NC_014931	CAA	2	6	486857	486862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791143
13068	NC_014931	GCC	2	6	486920	486925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791143
13069	NC_014931	ACC	2	6	486961	486966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791143
13070	NC_014931	GAG	2	6	486978	486983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319791143
13071	NC_014931	TCA	2	6	487027	487032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791143
13072	NC_014931	CG	4	8	487043	487050	0 %	0 %	50 %	50 %	319791143
13073	NC_014931	TCG	3	9	487168	487176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791143
13074	NC_014931	CAGCGG	2	12	487190	487201	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319791143
13075	NC_014931	GTG	2	6	487212	487217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791143
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13077	NC_014931	GTC	2	6	487386	487391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791143
13078	NC_014931	ATG	2	6	487395	487400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319791143
13079	NC_014931	GTG	2	6	487410	487415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791143
13080	NC_014931	GGC	2	6	487416	487421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791143
13081	NC_014931	GGC	2	6	487445	487450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791143
13082	NC_014931	CGA	2	6	487451	487456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791143
13083	NC_014931	GCAC	2	8	487507	487514	25 %	0 %	25 %	50 %	319791143
13084	NC_014931	TATG	2	8	487565	487572	25 %	50 %	25 %	0 %	319791143
13085	NC_014931	GCC	2	6	487582	487587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791143
13086	NC_014931	CGAC	2	8	487621	487628	25 %	0 %	25 %	50 %	319791143
13087	NC_014931	GCC	3	9	487655	487663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13088	NC_014931	GCG	2	6	487669	487674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_014931	GTG	2	6	487741	487746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_014931	AAC	2	6	487748	487753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_014931	GAAT	2	8	487754	487761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_014931	CCG	2	6	487765	487770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13093	NC_014931	TCG	2	6	487870	487875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791144
13094	NC_014931	CGT	2	6	487886	487891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791144
13095	NC_014931	CGGCCA	2	12	487940	487951	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319791144
13096	NC_014931	TTC	2	6	487995	488000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791144
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13098	NC_014931	TGC	2	6	488044	488049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791144
13099	NC_014931	GC	3	6	488048	488053	0 %	0 %	50 %	50 %	319791144
13100	NC_014931	TCG	2	6	488077	488082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791144
13101	NC_014931	TGC	2	6	488137	488142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791144
13102	NC_014931	TCA	2	6	488188	488193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791144
13103	NC_014931	CGG	2	6	488215	488220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791144
13104	NC_014931	GGT	2	6	488234	488239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791144
13105	NC_014931	CGC	2	6	488242	488247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791144
13106	NC_014931	TTC	2	6	488337	488342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791144
13107	NC_014931	CAC	2	6	488403	488408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791144
13108	NC_014931	CTG	2	6	488484	488489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791144
13109	NC_014931	AAG	2	6	488553	488558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791144
13110	NC_014931	GTC	2	6	488583	488588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791144
13111	NC_014931	GAA	2	6	488654	488659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791144
13112	NC_014931	CTT	2	6	488663	488668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791144
13113	NC_014931	ATG	2	6	488670	488675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319791144
13114	NC_014931	TGC	2	6	488704	488709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791144
13115	NC_014931	TCA	2	6	488746	488751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791144
13116	NC_014931	AC	3	6	488816	488821	50 %	0 %	0 %	50 %	319791144
13117	NC_014931	GGT	2	6	488894	488899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791144
13118	NC_014931	AGC	2	6	488916	488921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791144
13119	NC_014931	GAC	2	6	488948	488953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791144
13120	NC_014931	CAC	2	6	488966	488971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791144
13121	NC_014931	CTT	2	6	488981	488986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791144
13122	NC_014931	GCATC	2	10	489025	489034	20 %	20 %	20 %	40 %	319791144
13123	NC_014931	TCT	2	6	489043	489048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791144
13124	NC_014931	TTC	2	6	489066	489071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791144
13125	NC_014931	GGC	2	6	489099	489104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791144
13126	NC_014931	CGG	2	6	489122	489127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791144
13127	NC_014931	TGA	2	6	489142	489147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319791144
13128	NC_014931	GGAA	2	8	489154	489161	50 %	0 %	50 %	0 %	319791144
13129	NC_014931	GCC	2	6	489163	489168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791144
13130	NC_014931	GCA	2	6	489185	489190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791144
13131	NC_014931	CGAT	2	8	489199	489206	25 %	25 %	25 %	25 %	319791144
13132	NC_014931	GC	3	6	489246	489251	0 %	0 %	50 %	50 %	319791144
13133	NC_014931	ACGGC	2	10	489256	489265	20 %	0 %	40 %	40 %	319791144
13134	NC_014931	CCG	2	6	489277	489282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791144
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13139	NC_014931	CTG	2	6	489431	489436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791144
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13141	NC_014931	GC	3	6	489498	489503	0 %	0 %	50 %	50 %	319791144
13142	NC_014931	CG	3	6	489550	489555	0 %	0 %	50 %	50 %	319791144
13143	NC_014931	CGT	2	6	489557	489562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791144
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13151	NC_014931	TGGC	2	8	489871	489878	0 %	25 %	50 %	25 %	319791145
13152	NC_014931	CGA	2	6	489879	489884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791145
13153	NC_014931	GC	4	8	489921	489928	0 %	0 %	50 %	50 %	319791145
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13160	NC_014931	TCG	2	6	490088	490093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791145
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13162	NC_014931	CAGC	2	8	490174	490181	25 %	0 %	25 %	50 %	319791145
13163	NC_014931	GCA	2	6	490206	490211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791145
13164	NC_014931	GCAGC	2	10	490222	490231	20 %	0 %	40 %	40 %	319791145
13165	NC_014931	AGC	3	9	490229	490237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791145
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13191	NC_014931	CGAG	2	8	491091	491098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13192	NC_014931	GAAA	2	8	491126	491133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13193	NC_014931	GCG	2	6	491177	491182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13197	NC_014931	GCC	2	6	491340	491345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13222	NC_014931	CCTG	2	8	492317	492324	0 %	25 %	25 %	50 %	319791147
13223	NC_014931	TCGCGC	2	12	492352	492363	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319791148
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13225	NC_014931	CCA	3	9	492431	492439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791148
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13229	NC_014931	TGC	2	6	492551	492556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791148
13230	NC_014931	TGA	2	6	492557	492562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319791148
13231	NC_014931	GTC	2	6	492615	492620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791148
13232	NC_014931	GCGTG	2	10	492623	492632	0 %	20 %	60 %	20 %	319791148
13233	NC_014931	GAA	2	6	492636	492641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791148
13234	NC_014931	TGT	2	6	492647	492652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319791148
13235	NC_014931	GCC	2	6	492657	492662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791148
13236	NC_014931	GC	3	6	492663	492668	0 %	0 %	50 %	50 %	319791148
13237	NC_014931	CGC	2	6	492680	492685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791148
13238	NC_014931	GCG	2	6	492689	492694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791148
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13482	NC_014931	GCA	2	6	501251	501256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791155
13483	NC_014931	CGT	2	6	501290	501295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791155
13484	NC_014931	CG	3	6	501308	501313	0 %	0 %	50 %	50 %	319791155
13485	NC_014931	GCG	2	6	501347	501352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791155
13486	NC_014931	TCG	2	6	501398	501403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791155
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13490	NC_014931	ATC	2	6	501559	501564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791155
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