MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 174391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_014931	GAA	2	6	445740	445745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791110
12003	NC_014931	GAG	2	6	445768	445773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_014931	CA	3	6	445797	445802	50 %	0 %	0 %	50 %	319791111
12005	NC_014931	TCA	2	6	445804	445809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791111
12006	NC_014931	ATC	2	6	445815	445820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791111
12007	NC_014931	CGC	2	6	445882	445887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791111
12008	NC_014931	GATCGT	2	12	445916	445927	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319791111
12009	NC_014931	GGC	2	6	445940	445945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791111
12010	NC_014931	CAC	3	9	445952	445960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791111
12011	NC_014931	CGG	2	6	446018	446023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791111
12012	NC_014931	CGG	2	6	446037	446042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791111
12013	NC_014931	AAG	3	9	446058	446066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791111
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12015	NC_014931	GCT	2	6	446131	446136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791112
12016	NC_014931	TCCCA	2	10	446183	446192	20 %	20 %	0 %	60 %	319791112
12017	NC_014931	GC	3	6	446276	446281	0 %	0 %	50 %	50 %	319791112
12018	NC_014931	GTG	2	6	446330	446335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791112
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12022	NC_014931	GC	3	6	446685	446690	0 %	0 %	50 %	50 %	319791112
12023	NC_014931	CTT	2	6	446788	446793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791112
12024	NC_014931	GCTGGC	2	12	446800	446811	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319791112
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12050	NC_014931	GGA	2	6	447705	447710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_014931	GACC	2	8	447722	447729	25 %	0 %	25 %	50 %	319791113
12052	NC_014931	CAG	2	6	447740	447745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791113
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12055	NC_014931	ACCGC	2	10	447835	447844	20 %	0 %	20 %	60 %	319791113
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12119	NC_014931	CG	4	8	450158	450165	0 %	0 %	50 %	50 %	319791114
12120	NC_014931	GTG	2	6	450189	450194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791114
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12123	NC_014931	TGC	2	6	450355	450360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791114
12124	NC_014931	TGC	3	9	450370	450378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791114
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12160	NC_014931	TGC	2	6	451447	451452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791116
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12236	NC_014931	CGA	2	6	453862	453867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791118
12237	NC_014931	CTTCAT	2	12	453868	453879	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319791118
12238	NC_014931	TTC	2	6	453911	453916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791118
12239	NC_014931	GAT	2	6	453992	453997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319791118
12240	NC_014931	CGCGAT	2	12	454087	454098	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319791118
12241	NC_014931	ATC	2	6	454184	454189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791118
12242	NC_014931	GGC	2	6	454217	454222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791118
12243	NC_014931	CGA	2	6	454234	454239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791118
12244	NC_014931	AGC	2	6	454374	454379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791118
12245	NC_014931	ACA	2	6	454407	454412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791118
12246	NC_014931	CGA	2	6	454413	454418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791118
12247	NC_014931	CGA	2	6	454429	454434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791118
12248	NC_014931	CAA	2	6	454468	454473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319791118
12249	NC_014931	ATC	2	6	454481	454486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791118
12250	NC_014931	GCG	2	6	454514	454519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791118
12251	NC_014931	CCG	2	6	454532	454537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791118
12252	NC_014931	GAA	2	6	454594	454599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791118
12253	NC_014931	CGAC	2	8	454635	454642	25 %	0 %	25 %	50 %	319791118
12254	NC_014931	GCTGG	2	10	454807	454816	0 %	20 %	60 %	20 %	319791118
12255	NC_014931	GCA	2	6	454890	454895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791118
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12268	NC_014931	CGC	2	6	455448	455453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791119
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12273	NC_014931	CCG	3	9	455658	455666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791119
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12277	NC_014931	TCG	2	6	455826	455831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791119
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12280	NC_014931	GCC	2	6	455996	456001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12281	NC_014931	CAAA	2	8	456022	456029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12282	NC_014931	GAG	2	6	456048	456053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319791120
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12308	NC_014931	GCT	2	6	457393	457398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791120
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12312	NC_014931	CCG	3	9	457529	457537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12313	NC_014931	AGCC	2	8	457546	457553	25 %	0 %	25 %	50 %	319791121
12314	NC_014931	CGG	2	6	457558	457563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791121
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12320	NC_014931	TGC	2	6	457877	457882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791121
12321	NC_014931	CAT	2	6	457884	457889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791121
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12325	NC_014931	TCG	2	6	457987	457992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791121
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12335	NC_014931	TCG	4	12	458266	458277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791121
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12341	NC_014931	GAGG	2	8	458560	458567	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12342	NC_014931	CTGA	2	8	458700	458707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12343	NC_014931	GGAC	2	8	458711	458718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12344	NC_014931	C	6	6	458753	458758	0 %	0 %	0 %	100 %	319791122
12345	NC_014931	ACG	2	6	458820	458825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791122
12346	NC_014931	GC	3	6	458830	458835	0 %	0 %	50 %	50 %	319791122
12347	NC_014931	CGA	2	6	458869	458874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791122
12348	NC_014931	CCGC	2	8	458878	458885	0 %	0 %	25 %	75 %	319791122
12349	NC_014931	TGCCGG	2	12	458896	458907	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319791122
12350	NC_014931	CTG	4	12	458978	458989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791122
12351	NC_014931	CGCGC	3	15	458997	459011	0 %	0 %	40 %	60 %	319791122
12352	NC_014931	CG	3	6	459026	459031	0 %	0 %	50 %	50 %	319791122
12353	NC_014931	CGCC	2	8	459071	459078	0 %	0 %	25 %	75 %	319791122
12354	NC_014931	CGA	2	6	459154	459159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791122
12355	NC_014931	CG	3	6	459297	459302	0 %	0 %	50 %	50 %	319791122
12356	NC_014931	AGG	2	6	459324	459329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319791122
12357	NC_014931	GCG	2	6	459342	459347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791122
12358	NC_014931	AGC	3	9	459396	459404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791122
12359	NC_014931	ACG	2	6	459420	459425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791122
12360	NC_014931	CTG	2	6	459428	459433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791122
12361	NC_014931	GC	4	8	459483	459490	0 %	0 %	50 %	50 %	319791122
12362	NC_014931	CGA	2	6	459508	459513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791122
12363	NC_014931	CTG	2	6	459530	459535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791122
12364	NC_014931	CTG	2	6	459548	459553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791122
12365	NC_014931	GCG	2	6	459573	459578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791122
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12367	NC_014931	GAC	2	6	459593	459598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791122
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12370	NC_014931	CCG	2	6	459795	459800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791122
12371	NC_014931	CTGGTG	2	12	459812	459823	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319791122
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12373	NC_014931	GC	3	6	459842	459847	0 %	0 %	50 %	50 %	319791122
12374	NC_014931	GGGC	2	8	459880	459887	0 %	0 %	75 %	25 %	319791122
12375	NC_014931	TCG	2	6	459923	459928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791122
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12377	NC_014931	GAACTG	2	12	459944	459955	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319791122
12378	NC_014931	CGC	2	6	459959	459964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791122
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12382	NC_014931	CGATG	2	10	460132	460141	20 %	20 %	40 %	20 %	319791122
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12388	NC_014931	GGCC	2	8	460260	460267	0 %	0 %	50 %	50 %	319791122
12389	NC_014931	ACG	2	6	460317	460322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791122
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12398	NC_014931	GCG	2	6	460597	460602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791122
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12407	NC_014931	GC	3	6	460837	460842	0 %	0 %	50 %	50 %	319791122
12408	NC_014931	GCAA	2	8	460910	460917	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12409	NC_014931	CGAC	2	8	461049	461056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12410	NC_014931	TCC	2	6	461064	461069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12411	NC_014931	TCC	2	6	461073	461078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12412	NC_014931	TCT	2	6	461079	461084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12413	NC_014931	CAC	2	6	461098	461103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12414	NC_014931	AGG	2	6	461165	461170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12415	NC_014931	TCAT	2	8	461171	461178	25 %	50 %	0 %	25 %	319791123
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12423	NC_014931	GCC	2	6	461544	461549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12431	NC_014931	CGA	2	6	462003	462008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791124
12432	NC_014931	CTG	2	6	462094	462099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791124
12433	NC_014931	GCT	3	9	462217	462225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12435	NC_014931	GCC	2	6	462278	462283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12443	NC_014931	TGCTGG	2	12	462571	462582	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319791125
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12463	NC_014931	CAC	2	6	463215	463220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791125
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12465	NC_014931	CTT	2	6	463369	463374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791126
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12472	NC_014931	GCTG	2	8	463692	463699	0 %	25 %	50 %	25 %	319791126
12473	NC_014931	TCG	2	6	463766	463771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791126
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12475	NC_014931	TCC	2	6	463864	463869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12479	NC_014931	GC	3	6	463971	463976	0 %	0 %	50 %	50 %	319791127
12480	NC_014931	CAG	2	6	464069	464074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791127
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