MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 174391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014931	CTT	2	6	409498	409503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791080
11002	NC_014931	GCA	2	6	409509	409514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791080
11003	NC_014931	CCGC	2	8	409515	409522	0 %	0 %	25 %	75 %	319791080
11004	NC_014931	CGC	2	6	409566	409571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791080
11005	NC_014931	GC	3	6	409570	409575	0 %	0 %	50 %	50 %	319791080
11006	NC_014931	GTG	3	9	409595	409603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791080
11007	NC_014931	TGG	2	6	409620	409625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791080
11008	NC_014931	GCC	2	6	409666	409671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791080
11009	NC_014931	CGC	2	6	409716	409721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791080
11010	NC_014931	GGT	2	6	409765	409770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791080
11011	NC_014931	TCA	2	6	409794	409799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791080
11012	NC_014931	CCA	2	6	409926	409931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791080
11013	NC_014931	TCG	2	6	409997	410002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791080
11014	NC_014931	GGC	2	6	410047	410052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791080
11015	NC_014931	TGG	2	6	410109	410114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791080
11016	NC_014931	GTGTAG	3	18	410231	410248	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	319791080
11017	NC_014931	GC	3	6	410304	410309	0 %	0 %	50 %	50 %	319791080
11018	NC_014931	GCT	2	6	410311	410316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791080
11019	NC_014931	CCG	3	9	410366	410374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791080
11020	NC_014931	GAT	2	6	410389	410394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319791080
11021	NC_014931	GGT	2	6	410554	410559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791080
11022	NC_014931	GC	3	6	410586	410591	0 %	0 %	50 %	50 %	319791080
11023	NC_014931	CAC	2	6	410614	410619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791080
11024	NC_014931	CGT	2	6	410634	410639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791080
11025	NC_014931	CCG	2	6	410643	410648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791080
11026	NC_014931	GCC	2	6	410662	410667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791080
11027	NC_014931	CCGA	2	8	410675	410682	25 %	0 %	25 %	50 %	319791080
11028	NC_014931	AGCC	2	8	410708	410715	25 %	0 %	25 %	50 %	319791080
11029	NC_014931	CCGC	2	8	410786	410793	0 %	0 %	25 %	75 %	319791080
11030	NC_014931	GCC	2	6	410830	410835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791080
11031	NC_014931	CGT	2	6	410853	410858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791080
11032	NC_014931	CGG	2	6	410874	410879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791080
11033	NC_014931	TGT	2	6	410940	410945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319791080
11034	NC_014931	AGT	2	6	410982	410987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319791080
11035	NC_014931	GTCG	2	8	411001	411008	0 %	25 %	50 %	25 %	319791080
11036	NC_014931	GCT	2	6	411120	411125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791080
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11039	NC_014931	CTG	2	6	411274	411279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791080
11040	NC_014931	GGCG	2	8	411292	411299	0 %	0 %	75 %	25 %	319791080
11041	NC_014931	ACG	2	6	411347	411352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791080
11042	NC_014931	TGC	2	6	411459	411464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791080
11043	NC_014931	GC	3	6	411525	411530	0 %	0 %	50 %	50 %	319791080
11044	NC_014931	GCT	2	6	411567	411572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791080
11045	NC_014931	TCGG	2	8	411613	411620	0 %	25 %	50 %	25 %	319791080
11046	NC_014931	CGC	2	6	411645	411650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791080
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11050	NC_014931	CGC	2	6	411885	411890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791080
11051	NC_014931	CGA	2	6	411927	411932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791080
11052	NC_014931	CGGC	2	8	411944	411951	0 %	0 %	50 %	50 %	319791080
11053	NC_014931	CCA	2	6	411979	411984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791080
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11059	NC_014931	CGT	2	6	412230	412235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791080
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11061	NC_014931	GCC	2	6	412246	412251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791080
11062	NC_014931	AGG	2	6	412278	412283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319791080
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11065	NC_014931	GCT	2	6	412375	412380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791080
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11071	NC_014931	GTC	2	6	412535	412540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791080
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11075	NC_014931	TCT	3	9	412676	412684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_014931	GC	4	8	412704	412711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11077	NC_014931	GCAC	2	8	412713	412720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11085	NC_014931	CCG	3	9	413060	413068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791081
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11087	NC_014931	CAC	2	6	413098	413103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319791081
11088	NC_014931	GGTCG	2	10	413128	413137	0 %	20 %	60 %	20 %	319791081
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11091	NC_014931	CG	4	8	413298	413305	0 %	0 %	50 %	50 %	319791081
11092	NC_014931	GCAC	2	8	413313	413320	25 %	0 %	25 %	50 %	319791081
11093	NC_014931	GTTC	2	8	413337	413344	0 %	50 %	25 %	25 %	319791081
11094	NC_014931	GCA	2	6	413346	413351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791081
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11101	NC_014931	TGTCT	2	10	413698	413707	0 %	60 %	20 %	20 %	319791081
11102	NC_014931	AGA	2	6	413745	413750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_014931	CGC	2	6	413786	413791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791082
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11106	NC_014931	CG	4	8	413869	413876	0 %	0 %	50 %	50 %	319791082
11107	NC_014931	CG	3	6	413902	413907	0 %	0 %	50 %	50 %	319791082
11108	NC_014931	ATC	3	9	413922	413930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791082
11109	NC_014931	AGC	2	6	413941	413946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791082
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11111	NC_014931	CG	3	6	413996	414001	0 %	0 %	50 %	50 %	319791082
11112	NC_014931	GGC	2	6	414005	414010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791082
11113	NC_014931	CG	3	6	414029	414034	0 %	0 %	50 %	50 %	319791082
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11115	NC_014931	GATC	2	8	414064	414071	25 %	25 %	25 %	25 %	319791082
11116	NC_014931	GCCA	2	8	414074	414081	25 %	0 %	25 %	50 %	319791082
11117	NC_014931	CGA	2	6	414098	414103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791082
11118	NC_014931	CGT	2	6	414149	414154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791082
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11120	NC_014931	GTG	2	6	414321	414326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791082
11121	NC_014931	CT	3	6	414384	414389	0 %	50 %	0 %	50 %	319791082
11122	NC_014931	TCT	2	6	414444	414449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791082
11123	NC_014931	GAA	2	6	414452	414457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319791082
11124	NC_014931	TTG	2	6	414467	414472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319791082
11125	NC_014931	TG	4	8	414471	414478	0 %	50 %	50 %	0 %	319791082
11126	NC_014931	TGG	2	6	414496	414501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791082
11127	NC_014931	CTT	2	6	414511	414516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319791082
11128	NC_014931	CGA	2	6	414541	414546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791082
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11231	NC_014931	TCA	2	6	418204	418209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791085
11232	NC_014931	GCA	2	6	418248	418253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791085
11233	NC_014931	GCT	2	6	418260	418265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791085
11234	NC_014931	CGG	3	9	418306	418314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791085
11235	NC_014931	GTT	2	6	418421	418426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11236	NC_014931	T	7	7	418496	418502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11237	NC_014931	CCG	2	6	418503	418508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11363	NC_014931	CAT	2	6	422658	422663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319791089
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11468	NC_014931	GCT	2	6	426682	426687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791091
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11478	NC_014931	CAGATG	2	12	427111	427122	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319791091
11479	NC_014931	GCC	2	6	427130	427135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319791091
11480	NC_014931	GGC	2	6	427144	427149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791091
11481	NC_014931	GAC	2	6	427168	427173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319791091
11482	NC_014931	GGC	3	9	427189	427197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791091
11483	NC_014931	GGT	2	6	427198	427203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319791091
11484	NC_014931	GGC	6	18	427225	427242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791091
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11487	NC_014931	GTC	2	6	427326	427331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791091
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11492	NC_014931	CT	3	6	427401	427406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11493	NC_014931	TGC	2	6	427410	427415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11497	NC_014931	GTC	2	6	427584	427589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319791092
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11500	NC_014931	CGG	2	6	427625	427630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319791092

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