MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio sp. Ex25 chromosome 1

Total Repeats: 62560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013456	AGC	2	6	24	29	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262392384
2	NC_013456	CT	3	6	79	84	0 %	50 %	0 %	50 %	262392384
3	NC_013456	CAA	2	6	98	103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262392384
4	NC_013456	AATA	2	8	119	126	75 %	25 %	0 %	0 %	262392384
5	NC_013456	GC	3	6	178	183	0 %	0 %	50 %	50 %	262392384
6	NC_013456	GAC	2	6	203	208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262392384
7	NC_013456	TGC	2	6	210	215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262392384
8	NC_013456	GGC	2	6	233	238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262392384
9	NC_013456	AGGTTT	2	12	247	258	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	262392384
10	NC_013456	TTC	2	6	273	278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262392384
11	NC_013456	A	6	6	347	352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013456	T	6	6	384	389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013456	ACT	2	6	416	421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392385
14	NC_013456	CGA	3	9	442	450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262392385
15	NC_013456	TTTTC	2	10	572	581	0 %	80 %	0 %	20 %	262392385
16	NC_013456	ATCT	2	8	618	625	25 %	50 %	0 %	25 %	262392385
17	NC_013456	AACC	2	8	740	747	50 %	0 %	0 %	50 %	262392385
18	NC_013456	ATC	2	6	762	767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392385
19	NC_013456	AT	3	6	1247	1252	50 %	50 %	0 %	0 %	262392385
20	NC_013456	AAACG	2	10	1314	1323	60 %	0 %	20 %	20 %	262392385
21	NC_013456	TTG	2	6	1327	1332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262392385
22	NC_013456	AAT	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262392385
23	NC_013456	CAA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262392385
24	NC_013456	CAC	2	6	1460	1465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262392385
25	NC_013456	TTC	2	6	1525	1530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262392385
26	NC_013456	CTTCA	2	10	1548	1557	20 %	40 %	0 %	40 %	262392385
27	NC_013456	ACG	2	6	1618	1623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262392385
28	NC_013456	CG	3	6	1660	1665	0 %	0 %	50 %	50 %	262392385
29	NC_013456	CCG	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262392385
30	NC_013456	TGC	2	6	2012	2017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262392385
31	NC_013456	TTA	2	6	2059	2064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262392385
32	NC_013456	TGC	2	6	2094	2099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262392385
33	NC_013456	ACG	2	6	2108	2113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262392385
34	NC_013456	CAA	2	6	2114	2119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262392385
35	NC_013456	A	6	6	2129	2134	100 %	0 %	0 %	0 %	262392385
36	NC_013456	TGA	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013456	T	6	6	2228	2233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013456	CTA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013456	AAC	2	6	2290	2295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013456	ATC	2	6	2334	2339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013456	A	6	6	2373	2378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013456	CAA	2	6	2523	2528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262392386
43	NC_013456	TGA	2	6	2537	2542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262392386
44	NC_013456	GCG	2	6	2569	2574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262392386
45	NC_013456	TCA	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392386
46	NC_013456	ATC	2	6	2755	2760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392386
47	NC_013456	ACT	2	6	2786	2791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392386
48	NC_013456	TTTG	2	8	2830	2837	0 %	75 %	25 %	0 %	262392386
49	NC_013456	TCA	2	6	2855	2860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392386
50	NC_013456	CT	3	6	2908	2913	0 %	50 %	0 %	50 %	262392386
51	NC_013456	AGT	2	6	2932	2937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262392386
52	NC_013456	GTT	2	6	2964	2969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262392386
53	NC_013456	GCA	2	6	3053	3058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262392386
54	NC_013456	CAA	2	6	3070	3075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262392386
55	NC_013456	TCC	2	6	3112	3117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262392387
56	NC_013456	TTG	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262392387
57	NC_013456	TTGCC	2	10	3388	3397	0 %	40 %	20 %	40 %	262392387
58	NC_013456	GCT	2	6	3434	3439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262392387
59	NC_013456	TTG	2	6	3537	3542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262392387
60	NC_013456	CAG	2	6	3546	3551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262392387
61	NC_013456	ACAA	2	8	3602	3609	75 %	0 %	0 %	25 %	262392387
62	NC_013456	ATC	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392387
63	NC_013456	TTG	2	6	3717	3722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262392387
64	NC_013456	GAC	2	6	3726	3731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262392387
65	NC_013456	CTC	2	6	3744	3749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262392387
66	NC_013456	T	6	6	3888	3893	0 %	100 %	0 %	0 %	262392387
67	NC_013456	CTG	2	6	3942	3947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262392387
68	NC_013456	CCA	3	9	3962	3970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262392387
69	NC_013456	GA	3	6	3996	4001	50 %	0 %	50 %	0 %	262392387
70	NC_013456	AAG	2	6	4064	4069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262392387
71	NC_013456	CAC	2	6	4091	4096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262392387
72	NC_013456	TCT	2	6	4126	4131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262392387
73	NC_013456	CAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262392387
74	NC_013456	CGT	2	6	4200	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262392387
75	NC_013456	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262392387
76	NC_013456	CAA	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262392387
77	NC_013456	GCA	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262392387
78	NC_013456	TCA	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392387
79	NC_013456	GCA	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262392387
80	NC_013456	ACC	2	6	4590	4595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262392387
81	NC_013456	TG	3	6	4621	4626	0 %	50 %	50 %	0 %	262392387
82	NC_013456	GTT	2	6	4688	4693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262392387
83	NC_013456	A	6	6	4704	4709	100 %	0 %	0 %	0 %	262392387
84	NC_013456	A	6	6	4736	4741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013456	CCA	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013456	ATATA	2	10	4760	4769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013456	TTGC	2	8	4811	4818	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013456	TTTA	2	8	4867	4874	25 %	75 %	0 %	0 %	262392388
89	NC_013456	GGT	2	6	4931	4936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262392388
90	NC_013456	CCG	2	6	4978	4983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262392388
91	NC_013456	AGA	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262392388
92	NC_013456	AGAA	2	8	5048	5055	75 %	0 %	25 %	0 %	262392388
93	NC_013456	AGA	3	9	5111	5119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262392388
94	NC_013456	TCG	2	6	5126	5131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262392388
95	NC_013456	GCAATG	2	12	5148	5159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	262392388
96	NC_013456	GAT	2	6	5160	5165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262392388
97	NC_013456	CGG	2	6	5189	5194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262392388
98	NC_013456	TCGC	2	8	5272	5279	0 %	25 %	25 %	50 %	262392388
99	NC_013456	GCTG	2	8	5291	5298	0 %	25 %	50 %	25 %	262392388
100	NC_013456	CGA	2	6	5318	5323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262392388
101	NC_013456	TCT	2	6	5434	5439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262392388
102	NC_013456	GTT	2	6	5472	5477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262392388
103	NC_013456	TGG	2	6	5560	5565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262392388
104	NC_013456	ACTC	2	8	5590	5597	25 %	25 %	0 %	50 %	262392388
105	NC_013456	AG	3	6	5648	5653	50 %	0 %	50 %	0 %	262392388
106	NC_013456	CAT	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392388
107	NC_013456	CAA	2	6	5828	5833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262392388
108	NC_013456	TG	3	6	5840	5845	0 %	50 %	50 %	0 %	262392388
109	NC_013456	AGA	2	6	5864	5869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262392388
110	NC_013456	AGA	2	6	5915	5920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262392388
111	NC_013456	AGCCGC	2	12	5963	5974	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	262392388
112	NC_013456	CAT	2	6	5990	5995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392388
113	NC_013456	GGAT	2	8	5999	6006	25 %	25 %	50 %	0 %	262392388
114	NC_013456	TGA	2	6	6026	6031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262392388
115	NC_013456	ATTA	2	8	6092	6099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013456	TCG	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013456	AAGC	2	8	6284	6291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013456	ATC	2	6	6392	6397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392389
119	NC_013456	AAG	3	9	6401	6409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262392389
120	NC_013456	TGA	2	6	6441	6446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262392389
121	NC_013456	CAC	2	6	6480	6485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262392389
122	NC_013456	TAATG	2	10	6520	6529	40 %	40 %	20 %	0 %	262392389
123	NC_013456	GC	3	6	6556	6561	0 %	0 %	50 %	50 %	262392389
124	NC_013456	ATC	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392389
125	NC_013456	TTC	2	6	6671	6676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262392389
126	NC_013456	CAAC	2	8	6699	6706	50 %	0 %	0 %	50 %	262392389
127	NC_013456	CCA	2	6	6724	6729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262392389
128	NC_013456	CAA	2	6	6733	6738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262392389
129	NC_013456	ATG	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262392389
130	NC_013456	TCA	2	6	6804	6809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392389
131	NC_013456	AC	3	6	6819	6824	50 %	0 %	0 %	50 %	262392389
132	NC_013456	CGATCA	2	12	6840	6851	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	262392389
133	NC_013456	CAAG	2	8	6854	6861	50 %	0 %	25 %	25 %	262392389
134	NC_013456	CTT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262392389
135	NC_013456	AAT	2	6	6902	6907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262392389
136	NC_013456	TCCCA	2	10	7004	7013	20 %	20 %	0 %	60 %	262392389
137	NC_013456	AAC	2	6	7117	7122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013456	TGCAT	2	10	7169	7178	20 %	40 %	20 %	20 %	262392390
139	NC_013456	T	6	6	7294	7299	0 %	100 %	0 %	0 %	262392390
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142	NC_013456	TGA	2	6	7406	7411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262392390
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147	NC_013456	CT	3	6	7567	7572	0 %	50 %	0 %	50 %	262392390
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149	NC_013456	GGCAC	2	10	7654	7663	20 %	0 %	40 %	40 %	262392391
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152	NC_013456	CTCA	2	8	7788	7795	25 %	25 %	0 %	50 %	262392391
153	NC_013456	CAT	2	6	7823	7828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392391
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155	NC_013456	TGT	2	6	7894	7899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262392391
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157	NC_013456	GTA	2	6	8019	8024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013456	TCA	2	6	8053	8058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_013456	TA	3	6	8094	8099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013456	GCACTG	2	12	8224	8235	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	262392392
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164	NC_013456	GAG	2	6	8372	8377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262392392
165	NC_013456	TTG	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262392392
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173	NC_013456	CAA	2	6	8891	8896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262392393
174	NC_013456	AAC	2	6	8926	8931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262392393
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184	NC_013456	CAT	2	6	9706	9711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_013456	TCAG	2	8	9744	9751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
186	NC_013456	TGA	2	6	9797	9802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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216	NC_013456	AGT	2	6	11105	11110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262392395
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232	NC_013456	TTGT	2	8	11837	11844	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
233	NC_013456	GAATG	2	10	11853	11862	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
234	NC_013456	CACTC	2	10	11900	11909	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
235	NC_013456	ATC	2	6	11910	11915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
236	NC_013456	T	7	7	11919	11925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_013456	ATC	2	6	11999	12004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392397
238	NC_013456	A	6	6	12026	12031	100 %	0 %	0 %	0 %	262392397
239	NC_013456	TGC	2	6	12050	12055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262392397
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241	NC_013456	CTT	2	6	12151	12156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262392397
242	NC_013456	TCG	2	6	12180	12185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262392397
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245	NC_013456	GCG	2	6	12243	12248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262392397
246	NC_013456	GTTC	2	8	12255	12262	0 %	50 %	25 %	25 %	262392397
247	NC_013456	CAAG	2	8	12275	12282	50 %	0 %	25 %	25 %	262392397
248	NC_013456	CAG	2	6	12283	12288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262392397
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253	NC_013456	TTGA	2	8	12518	12525	25 %	50 %	25 %	0 %	262392397
254	NC_013456	TGG	2	6	12610	12615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262392397
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394	NC_013456	CTG	2	6	19310	19315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262392402
395	NC_013456	A	6	6	19326	19331	100 %	0 %	0 %	0 %	262392402
396	NC_013456	TCT	2	6	19394	19399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262392402
397	NC_013456	TCC	2	6	19407	19412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
398	NC_013456	TCG	2	6	19435	19440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_013456	GAATA	2	10	19517	19526	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
400	NC_013456	AAAAT	2	10	19573	19582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_013456	ATT	2	6	19602	19607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_013456	GAC	2	6	19633	19638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_013456	CT	3	6	19794	19799	0 %	50 %	0 %	50 %	262392403
404	NC_013456	CAA	2	6	19867	19872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_013456	CTA	2	6	19934	19939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
406	NC_013456	CTA	2	6	20250	20255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392404
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430	NC_013456	TGG	2	6	21631	21636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262392404
431	NC_013456	CG	4	8	21689	21696	0 %	0 %	50 %	50 %	262392404
432	NC_013456	CGT	2	6	21721	21726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_013456	GCT	2	6	21739	21744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_013456	ACA	2	6	21759	21764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262392405
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437	NC_013456	CAAA	2	8	21958	21965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
438	NC_013456	AATTTT	2	12	22037	22048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_013456	AGA	2	6	22058	22063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_013456	T	6	6	22107	22112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_013456	TTA	2	6	22114	22119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_013456	AATT	2	8	22131	22138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_013456	ATC	3	9	22140	22148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_013456	A	6	6	22153	22158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_013456	GAA	2	6	22171	22176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
446	NC_013456	CGT	2	6	22202	22207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_013456	TG	3	6	22225	22230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
448	NC_013456	ATTG	2	8	22235	22242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
449	NC_013456	ACA	2	6	22286	22291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_013456	TCA	2	6	22295	22300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_013456	CAAGAT	2	12	22340	22351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	262392406
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453	NC_013456	ACTT	2	8	22494	22501	25 %	50 %	0 %	25 %	262392406
454	NC_013456	ACT	2	6	22508	22513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262392406
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461	NC_013456	GTAAA	2	10	22684	22693	60 %	20 %	20 %	0 %	262392406
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491	NC_013456	GGC	2	6	23792	23797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262392406
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