MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 29840

< Previous12...4243444546474849505152...5960Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23004	NC_012792	TGC	2	6	874194	874199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820793
23005	NC_012792	GCCG	2	8	874200	874207	0 %	0 %	50 %	50 %	239820793
23006	NC_012792	CCG	3	9	874205	874213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820793
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23011	NC_012792	GTAGCC	2	12	874482	874493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239820794
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23124	NC_012792	GCG	2	6	878154	878159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820798
23125	NC_012792	GTC	2	6	878162	878167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820798
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23127	NC_012792	GCG	2	6	878244	878249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820798
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23134	NC_012792	CTG	2	6	878474	878479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820798
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23154	NC_012792	GC	3	6	879087	879092	0 %	0 %	50 %	50 %	239820799
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23194	NC_012792	TCCGG	2	10	880635	880644	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23195	NC_012792	GCG	3	9	880681	880689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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23197	NC_012792	AGC	2	6	880710	880715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23200	NC_012792	CAT	3	9	880976	880984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820801
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23214	NC_012792	GGGC	2	8	881378	881385	0 %	0 %	75 %	25 %	239820801
23215	NC_012792	ATG	3	9	881394	881402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820801
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23217	NC_012792	GCCG	2	8	881573	881580	0 %	0 %	50 %	50 %	239820801
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23222	NC_012792	GCGCC	2	10	881772	881781	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23223	NC_012792	CGG	2	6	881783	881788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23224	NC_012792	GC	4	8	881795	881802	0 %	0 %	50 %	50 %	239820802
23225	NC_012792	TCG	2	6	881855	881860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820802
23226	NC_012792	GCCA	2	8	881906	881913	25 %	0 %	25 %	50 %	239820802
23227	NC_012792	CGG	2	6	881931	881936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820802
23228	NC_012792	ACC	2	6	881963	881968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820802
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23230	NC_012792	ATC	2	6	881999	882004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820802
23231	NC_012792	TTG	2	6	882026	882031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239820802
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23237	NC_012792	CAG	2	6	882283	882288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820802
23238	NC_012792	TCC	2	6	882314	882319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820802
23239	NC_012792	AGC	2	6	882320	882325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820802
23240	NC_012792	GCG	2	6	882342	882347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820802
23241	NC_012792	TCG	2	6	882350	882355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820802
23242	NC_012792	GCA	2	6	882378	882383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820802
23243	NC_012792	CG	3	6	882402	882407	0 %	0 %	50 %	50 %	239820802
23244	NC_012792	GCACCA	2	12	882408	882419	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	239820802
23245	NC_012792	CTG	2	6	882424	882429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820802
23246	NC_012792	GGCGC	2	10	882435	882444	0 %	0 %	60 %	40 %	239820802
23247	NC_012792	GGTC	2	8	882450	882457	0 %	25 %	50 %	25 %	239820802
23248	NC_012792	CTGC	2	8	882491	882498	0 %	25 %	25 %	50 %	239820802
23249	NC_012792	TCG	2	6	882536	882541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820802
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23254	NC_012792	TCA	2	6	882603	882608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820802
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23261	NC_012792	TTCG	2	8	882940	882947	0 %	50 %	25 %	25 %	239820802
23262	NC_012792	GAA	2	6	882964	882969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820802
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23266	NC_012792	CG	3	6	883131	883136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23267	NC_012792	GC	3	6	883198	883203	0 %	0 %	50 %	50 %	239820803
23268	NC_012792	CTTC	2	8	883208	883215	0 %	50 %	0 %	50 %	239820803
23269	NC_012792	TCG	2	6	883219	883224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820803
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23272	NC_012792	CGA	2	6	883403	883408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820803
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23274	NC_012792	GCG	2	6	883461	883466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820803
23275	NC_012792	CGCAT	2	10	883489	883498	20 %	20 %	20 %	40 %	239820803
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23292	NC_012792	CG	3	6	884028	884033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23293	NC_012792	ATC	2	6	884056	884061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23347	NC_012792	CGC	3	9	885584	885592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820804
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23365	NC_012792	GCT	2	6	886390	886395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820804
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23480	NC_012792	GAT	2	6	890793	890798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820808
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23482	NC_012792	GC	3	6	890829	890834	0 %	0 %	50 %	50 %	239820808
23483	NC_012792	GCC	2	6	890844	890849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820808
23484	NC_012792	GAC	2	6	890886	890891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820808
23485	NC_012792	TGC	2	6	890913	890918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820808
23486	NC_012792	CCT	2	6	890993	890998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23487	NC_012792	TTG	2	6	891014	891019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23488	NC_012792	CG	3	6	891107	891112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23489	NC_012792	GGC	2	6	891128	891133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23490	NC_012792	CGT	2	6	891172	891177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23491	NC_012792	CTC	2	6	891317	891322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23492	NC_012792	A	7	7	891390	891396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23493	NC_012792	GGGA	2	8	891496	891503	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23494	NC_012792	CGTG	2	8	891547	891554	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23495	NC_012792	GTGG	2	8	891555	891562	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23496	NC_012792	TCC	2	6	891592	891597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23497	NC_012792	GAA	2	6	891648	891653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23498	NC_012792	TTCGA	2	10	891668	891677	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23499	NC_012792	ACGA	2	8	891678	891685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23500	NC_012792	GA	3	6	891800	891805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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