MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 29840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_012792	TGC	2	6	683412	683417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18002	NC_012792	CCG	2	6	683483	683488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18003	NC_012792	CACCG	2	10	683521	683530	20 %	0 %	20 %	60 %	239820612
18004	NC_012792	CGC	2	6	683538	683543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18005	NC_012792	CGT	2	6	683556	683561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18006	NC_012792	CGTCAC	2	12	683575	683586	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239820612
18007	NC_012792	GCT	2	6	683655	683660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18008	NC_012792	TGT	2	6	683676	683681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239820612
18009	NC_012792	GCC	2	6	683708	683713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18010	NC_012792	TGC	2	6	683736	683741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18011	NC_012792	CGG	2	6	683853	683858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820612
18012	NC_012792	GCC	2	6	683863	683868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18013	NC_012792	CGT	2	6	683880	683885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18014	NC_012792	CGTCAC	2	12	683893	683904	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239820612
18015	NC_012792	CTG	3	9	683911	683919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18016	NC_012792	GCC	2	6	683926	683931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18017	NC_012792	CGCCCG	2	12	684039	684050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18018	NC_012792	GCC	2	6	684107	684112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18019	NC_012792	ACGCTG	2	12	684113	684124	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18020	NC_012792	CGT	2	6	684144	684149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18021	NC_012792	CGC	2	6	684187	684192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18022	NC_012792	CCG	2	6	684204	684209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18023	NC_012792	TCG	2	6	684231	684236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18024	NC_012792	CGT	2	6	684240	684245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18025	NC_012792	GCC	2	6	684286	684291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18026	NC_012792	CCG	2	6	684357	684362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18027	NC_012792	GCC	2	6	684394	684399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18028	NC_012792	GTG	2	6	684413	684418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820612
18029	NC_012792	CGC	2	6	684420	684425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18030	NC_012792	CAGGTC	2	12	684499	684510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18031	NC_012792	CGC	2	6	684525	684530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18032	NC_012792	CCG	2	6	684546	684551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18033	NC_012792	GCTC	2	8	684561	684568	0 %	25 %	25 %	50 %	239820612
18034	NC_012792	GGTGAT	2	12	684619	684630	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	239820612
18035	NC_012792	ACC	2	6	684652	684657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820612
18036	NC_012792	GCA	2	6	684861	684866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18037	NC_012792	GTC	2	6	684896	684901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18038	NC_012792	GAC	2	6	685004	685009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18039	NC_012792	CTGGAG	2	12	685147	685158	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	239820612
18040	NC_012792	CCCGC	2	10	685169	685178	0 %	0 %	20 %	80 %	239820612
18041	NC_012792	GCG	2	6	685205	685210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820612
18042	NC_012792	TCC	2	6	685249	685254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820612
18043	NC_012792	GCC	2	6	685276	685281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18044	NC_012792	CGC	2	6	685302	685307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18045	NC_012792	CCG	2	6	685331	685336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820612
18046	NC_012792	GTC	2	6	685345	685350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820612
18047	NC_012792	GCCG	2	8	685378	685385	0 %	0 %	50 %	50 %	239820612
18048	NC_012792	TGG	2	6	685422	685427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820612
18049	NC_012792	GA	3	6	685531	685536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18050	NC_012792	TCCT	2	8	685540	685547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18051	NC_012792	GAAC	2	8	685702	685709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18052	NC_012792	GGC	2	6	685738	685743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18053	NC_012792	TCC	2	6	685746	685751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18054	NC_012792	TGCA	2	8	685758	685765	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18055	NC_012792	TC	3	6	685825	685830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18056	NC_012792	GCG	2	6	685846	685851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18057	NC_012792	AAC	2	6	685954	685959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18058	NC_012792	GAA	2	6	685977	685982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18059	NC_012792	CGC	2	6	685992	685997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18060	NC_012792	ACC	2	6	686128	686133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18061	NC_012792	TGA	2	6	686200	686205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_012792	A	6	6	686249	686254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18063	NC_012792	GCG	2	6	686264	686269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18064	NC_012792	CTGGTG	2	12	686275	686286	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18065	NC_012792	GCCC	2	8	686320	686327	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18066	NC_012792	GTT	2	6	686340	686345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_012792	CGG	2	6	686367	686372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18068	NC_012792	GCC	2	6	686398	686403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18069	NC_012792	CAA	2	6	686421	686426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18070	NC_012792	CCG	3	9	686443	686451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18071	NC_012792	TCCG	2	8	686467	686474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18072	NC_012792	CGC	2	6	686489	686494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18073	NC_012792	CAC	2	6	686639	686644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820613
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18075	NC_012792	TTG	2	6	686761	686766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239820613
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18078	NC_012792	GCACCG	2	12	686933	686944	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	239820613
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18080	NC_012792	TCT	2	6	687041	687046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820613
18081	NC_012792	GGT	2	6	687090	687095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820613
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18085	NC_012792	CGACA	2	10	687372	687381	40 %	0 %	20 %	40 %	239820613
18086	NC_012792	GCGA	2	8	687501	687508	25 %	0 %	50 %	25 %	239820613
18087	NC_012792	CGG	2	6	687566	687571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820613
18088	NC_012792	CCG	2	6	687580	687585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820613
18089	NC_012792	TCC	2	6	687589	687594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820613
18090	NC_012792	GGC	2	6	687611	687616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820613
18091	NC_012792	GCGAT	2	10	687668	687677	20 %	20 %	40 %	20 %	239820613
18092	NC_012792	GGCG	2	8	687678	687685	0 %	0 %	75 %	25 %	239820613
18093	NC_012792	GTT	2	6	687693	687698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239820613
18094	NC_012792	CGA	2	6	687740	687745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820613
18095	NC_012792	GACG	2	8	687759	687766	25 %	0 %	50 %	25 %	239820613
18096	NC_012792	CGC	2	6	687777	687782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820613
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18098	NC_012792	GCG	2	6	687860	687865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18099	NC_012792	GC	3	6	687991	687996	0 %	0 %	50 %	50 %	239820614
18100	NC_012792	GGC	2	6	688019	688024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820614
18101	NC_012792	CGG	2	6	688057	688062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820614
18102	NC_012792	GGC	2	6	688166	688171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820614
18103	NC_012792	CCCG	2	8	688192	688199	0 %	0 %	25 %	75 %	239820614
18104	NC_012792	ATC	2	6	688224	688229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820614
18105	NC_012792	GCCC	2	8	688252	688259	0 %	0 %	25 %	75 %	239820614
18106	NC_012792	CCA	2	6	688267	688272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820614
18107	NC_012792	AGT	2	6	688335	688340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820614
18108	NC_012792	GCC	2	6	688377	688382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820614
18109	NC_012792	T	6	6	688400	688405	0 %	100 %	0 %	0 %	239820614
18110	NC_012792	CGC	2	6	688406	688411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820614
18111	NC_012792	CG	3	6	688483	688488	0 %	0 %	50 %	50 %	239820614
18112	NC_012792	GCG	2	6	688522	688527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820614
18113	NC_012792	CCT	2	6	688537	688542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820614
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18115	NC_012792	CGG	2	6	688588	688593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820614
18116	NC_012792	GCC	2	6	688613	688618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820614
18117	NC_012792	TGG	2	6	688686	688691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820614
18118	NC_012792	CAG	2	6	688694	688699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820614
18119	NC_012792	GC	3	6	688700	688705	0 %	0 %	50 %	50 %	239820614
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18121	NC_012792	CGC	3	9	688717	688725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820614
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18479	NC_012792	ATC	2	6	702952	702957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820627
18480	NC_012792	CGA	2	6	702969	702974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820627
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