MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 29840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_012792	GC	3	6	583559	583564	0 %	0 %	50 %	50 %	239820539
15502	NC_012792	ACC	2	6	583565	583570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820539
15503	NC_012792	CGA	2	6	583581	583586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820539
15504	NC_012792	G	6	6	583638	583643	0 %	0 %	100 %	0 %	239820539
15505	NC_012792	TGA	2	6	583712	583717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820539
15506	NC_012792	GCA	2	6	583726	583731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820539
15507	NC_012792	GTG	2	6	583756	583761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820539
15508	NC_012792	GCC	2	6	583777	583782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820539
15509	NC_012792	GCA	2	6	583833	583838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820539
15510	NC_012792	CGG	2	6	583869	583874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820539
15511	NC_012792	TGG	2	6	583982	583987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820539
15512	NC_012792	TCG	2	6	584039	584044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820539
15513	NC_012792	CTG	2	6	584047	584052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820539
15514	NC_012792	AC	3	6	584053	584058	50 %	0 %	0 %	50 %	239820539
15515	NC_012792	CTT	2	6	584085	584090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820539
15516	NC_012792	ATG	2	6	584179	584184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820539
15517	NC_012792	GTG	2	6	584227	584232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820539
15518	NC_012792	CCG	2	6	584280	584285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820539
15519	NC_012792	CAG	2	6	584329	584334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820539
15520	NC_012792	CGC	2	6	584361	584366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820539
15521	NC_012792	CG	3	6	584422	584427	0 %	0 %	50 %	50 %	239820539
15522	NC_012792	CG	3	6	584437	584442	0 %	0 %	50 %	50 %	239820539
15523	NC_012792	AGCCG	2	10	584451	584460	20 %	0 %	40 %	40 %	239820539
15524	NC_012792	CTT	2	6	584562	584567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820539
15525	NC_012792	TCG	2	6	584600	584605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820539
15526	NC_012792	TGC	2	6	584654	584659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820539
15527	NC_012792	GTG	2	6	584680	584685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820539
15528	NC_012792	CTT	2	6	584700	584705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820539
15529	NC_012792	GGT	2	6	584775	584780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820539
15530	NC_012792	GGCC	2	8	584787	584794	0 %	0 %	50 %	50 %	239820539
15531	NC_012792	TAC	2	6	584965	584970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820539
15532	NC_012792	CGT	2	6	585035	585040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820539
15533	NC_012792	CGCT	2	8	585044	585051	0 %	25 %	25 %	50 %	239820539
15534	NC_012792	GAGC	2	8	585057	585064	25 %	0 %	50 %	25 %	239820539
15535	NC_012792	CTA	2	6	585067	585072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820539
15536	NC_012792	GTG	2	6	585115	585120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820539
15537	NC_012792	GCA	2	6	585202	585207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820539
15538	NC_012792	TGC	2	6	585246	585251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820539
15539	NC_012792	TGG	2	6	585258	585263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820539
15540	NC_012792	TGGC	2	8	585300	585307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15541	NC_012792	CGG	3	9	585388	585396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_012792	GC	3	6	585408	585413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15543	NC_012792	TCG	2	6	585502	585507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15544	NC_012792	GCA	2	6	585512	585517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15545	NC_012792	CGT	2	6	585518	585523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15546	NC_012792	GCA	2	6	585527	585532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15547	NC_012792	CTG	2	6	585536	585541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15548	NC_012792	CA	3	6	585548	585553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15549	NC_012792	CTG	2	6	585632	585637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15550	NC_012792	CCG	2	6	585652	585657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15551	NC_012792	GAT	2	6	585660	585665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_012792	CTCC	2	8	585835	585842	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15553	NC_012792	TCG	2	6	585855	585860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15554	NC_012792	AGC	2	6	585910	585915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820540
15555	NC_012792	AGT	2	6	585925	585930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820540
15556	NC_012792	GCT	2	6	585988	585993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820540
15557	NC_012792	GCT	2	6	585999	586004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820540
15558	NC_012792	CAC	3	9	586026	586034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820540
15559	NC_012792	GAA	2	6	586136	586141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820540
15560	NC_012792	AGC	2	6	586146	586151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820540
15561	NC_012792	CCA	2	6	586220	586225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820540
15562	NC_012792	GAACTG	2	12	586252	586263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239820540
15563	NC_012792	GCG	2	6	586319	586324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820540
15564	NC_012792	AG	3	6	586332	586337	50 %	0 %	50 %	0 %	239820540
15565	NC_012792	CGC	2	6	586386	586391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820540
15566	NC_012792	ATC	2	6	586444	586449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820540
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15569	NC_012792	CTT	2	6	586555	586560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15570	NC_012792	ATG	2	6	586666	586671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_012792	CGG	2	6	586712	586717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15572	NC_012792	TCA	2	6	586729	586734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15573	NC_012792	GCG	3	9	586778	586786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15574	NC_012792	GCG	2	6	586814	586819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15575	NC_012792	CGG	2	6	586872	586877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15576	NC_012792	GC	3	6	586933	586938	0 %	0 %	50 %	50 %	239820541
15577	NC_012792	CCA	2	6	587162	587167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820541
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15579	NC_012792	CAT	2	6	587214	587219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820541
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15581	NC_012792	CG	3	6	587307	587312	0 %	0 %	50 %	50 %	239820541
15582	NC_012792	CCA	2	6	587342	587347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820541
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15584	NC_012792	CAC	2	6	587388	587393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820541
15585	NC_012792	GCG	2	6	587436	587441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820541
15586	NC_012792	TGA	2	6	587471	587476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820541
15587	NC_012792	TCG	2	6	587551	587556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820541
15588	NC_012792	GA	3	6	587685	587690	50 %	0 %	50 %	0 %	239820541
15589	NC_012792	TGG	2	6	587708	587713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820541
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15591	NC_012792	CCT	2	6	587765	587770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15592	NC_012792	CGT	2	6	587784	587789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15593	NC_012792	GGCC	2	8	587804	587811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15594	NC_012792	GCCG	2	8	587825	587832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15595	NC_012792	CCCG	2	8	587835	587842	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15596	NC_012792	GCT	2	6	587862	587867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15597	NC_012792	GC	4	8	587870	587877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15598	NC_012792	CAG	2	6	587891	587896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15600	NC_012792	CGCAC	2	10	587964	587973	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15601	NC_012792	AGC	2	6	588015	588020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15602	NC_012792	CCG	2	6	588045	588050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820542
15603	NC_012792	TCA	2	6	588177	588182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820542
15604	NC_012792	CGA	2	6	588205	588210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820542
15605	NC_012792	GCC	2	6	588226	588231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820542
15606	NC_012792	CTA	2	6	588274	588279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820542
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15608	NC_012792	GCAG	2	8	588364	588371	25 %	0 %	50 %	25 %	239820542
15609	NC_012792	AGCC	2	8	588427	588434	25 %	0 %	25 %	50 %	239820542
15610	NC_012792	CGC	2	6	588497	588502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820542
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15612	NC_012792	GCC	2	6	588573	588578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820542
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15614	NC_012792	GGTG	2	8	588598	588605	0 %	25 %	75 %	0 %	239820542
15615	NC_012792	CGGTGT	2	12	588642	588653	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	239820542
15616	NC_012792	GGC	2	6	588655	588660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820542
15617	NC_012792	GGCGC	2	10	588664	588673	0 %	0 %	60 %	40 %	239820542
15618	NC_012792	CCAA	2	8	588738	588745	50 %	0 %	0 %	50 %	239820542
15619	NC_012792	GCAACG	2	12	588783	588794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820542
15620	NC_012792	TGG	2	6	588852	588857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820542
15621	NC_012792	ACG	2	6	588864	588869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820542
15622	NC_012792	TGC	2	6	588978	588983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820542
15623	NC_012792	CGGC	2	8	589035	589042	0 %	0 %	50 %	50 %	239820542
15624	NC_012792	GCG	2	6	589050	589055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820542
15625	NC_012792	CGA	2	6	589081	589086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820542
15626	NC_012792	CGGC	2	8	589131	589138	0 %	0 %	50 %	50 %	239820542
15627	NC_012792	CCG	2	6	589195	589200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820542
15628	NC_012792	CGC	3	9	589203	589211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820542
15629	NC_012792	TGC	2	6	589236	589241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820542
15630	NC_012792	ACG	2	6	589254	589259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820542
15631	NC_012792	GCC	2	6	589305	589310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15632	NC_012792	A	8	8	589315	589322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15633	NC_012792	CGG	2	6	589408	589413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820543
15634	NC_012792	GGCG	2	8	589453	589460	0 %	0 %	75 %	25 %	239820543
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15642	NC_012792	TGGCGC	2	12	589767	589778	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	239820543
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15660	NC_012792	CGG	2	6	590596	590601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820544
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15662	NC_012792	ACGC	2	8	590625	590632	25 %	0 %	25 %	50 %	239820544
15663	NC_012792	GGCG	2	8	590634	590641	0 %	0 %	75 %	25 %	239820544
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15668	NC_012792	GTC	2	6	590969	590974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15732	NC_012792	GCA	2	6	593380	593385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820547
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15737	NC_012792	TGCA	2	8	593634	593641	25 %	25 %	25 %	25 %	239820547
15738	NC_012792	GC	3	6	593726	593731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15739	NC_012792	GCCACC	2	12	593772	593783	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	239820548
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15982	NC_012792	GCT	2	6	603300	603305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820555
15983	NC_012792	GC	3	6	603306	603311	0 %	0 %	50 %	50 %	239820555
15984	NC_012792	ACG	2	6	603332	603337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820555
15985	NC_012792	CGT	2	6	603419	603424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820555
15986	NC_012792	GCTG	2	8	603428	603435	0 %	25 %	50 %	25 %	239820555
15987	NC_012792	AGC	3	9	603448	603456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820555
15988	NC_012792	GCG	2	6	603488	603493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820555
15989	NC_012792	T	6	6	603542	603547	0 %	100 %	0 %	0 %	239820555
15990	NC_012792	CGC	2	6	603596	603601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820556
15991	NC_012792	GGC	2	6	603605	603610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820556
15992	NC_012792	TCGC	2	8	603625	603632	0 %	25 %	25 %	50 %	239820556
15993	NC_012792	GC	3	6	603631	603636	0 %	0 %	50 %	50 %	239820556
15994	NC_012792	GTG	2	6	603672	603677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820556
15995	NC_012792	CGG	2	6	603689	603694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820556
15996	NC_012792	GCT	2	6	603716	603721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820556
15997	NC_012792	CGC	2	6	603722	603727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820556
15998	NC_012792	ACA	2	6	603766	603771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820556
15999	NC_012792	ATGGC	2	10	603793	603802	20 %	20 %	40 %	20 %	239820556
16000	NC_012792	CG	3	6	603820	603825	0 %	0 %	50 %	50 %	239820556

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