MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 29840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012792	CTA	2	6	558522	558527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820512
15002	NC_012792	GGCC	2	8	558531	558538	0 %	0 %	50 %	50 %	239820512
15003	NC_012792	TGC	2	6	558575	558580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820512
15004	NC_012792	GTG	2	6	558598	558603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820512
15005	NC_012792	GCC	2	6	558625	558630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820512
15006	NC_012792	CG	3	6	558680	558685	0 %	0 %	50 %	50 %	239820512
15007	NC_012792	GCC	2	6	558688	558693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820512
15008	NC_012792	GC	3	6	558753	558758	0 %	0 %	50 %	50 %	239820512
15009	NC_012792	ATC	2	6	558784	558789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820512
15010	NC_012792	CTCG	2	8	558807	558814	0 %	25 %	25 %	50 %	239820512
15011	NC_012792	CCG	2	6	558863	558868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820512
15012	NC_012792	CTG	2	6	558934	558939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820512
15013	NC_012792	GC	4	8	558948	558955	0 %	0 %	50 %	50 %	239820512
15014	NC_012792	GGCA	2	8	559022	559029	25 %	0 %	50 %	25 %	239820513
15015	NC_012792	GC	3	6	559047	559052	0 %	0 %	50 %	50 %	239820513
15016	NC_012792	GCG	2	6	559117	559122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820513
15017	NC_012792	GCC	2	6	559182	559187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820513
15018	NC_012792	TCG	2	6	559207	559212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820513
15019	NC_012792	TCC	2	6	559261	559266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820513
15020	NC_012792	CCG	2	6	559331	559336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820513
15021	NC_012792	CGA	2	6	559484	559489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820513
15022	NC_012792	GCC	2	6	559557	559562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820513
15023	NC_012792	CGG	2	6	559572	559577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820513
15024	NC_012792	CT	3	6	559606	559611	0 %	50 %	0 %	50 %	239820514
15025	NC_012792	CGC	2	6	559690	559695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820514
15026	NC_012792	CG	3	6	559747	559752	0 %	0 %	50 %	50 %	239820514
15027	NC_012792	CGC	2	6	559815	559820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820514
15028	NC_012792	CAG	2	6	559868	559873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820514
15029	NC_012792	AGG	2	6	559950	559955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820514
15030	NC_012792	CAG	3	9	560039	560047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820514
15031	NC_012792	CG	3	6	560059	560064	0 %	0 %	50 %	50 %	239820514
15032	NC_012792	CGA	2	6	560098	560103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820514
15033	NC_012792	CTG	2	6	560159	560164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820514
15034	NC_012792	GAT	2	6	560182	560187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820514
15035	NC_012792	CG	3	6	560212	560217	0 %	0 %	50 %	50 %	239820514
15036	NC_012792	CGG	2	6	560248	560253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820514
15037	NC_012792	GCCGC	2	10	560267	560276	0 %	0 %	40 %	60 %	239820514
15038	NC_012792	TTC	2	6	560285	560290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820514
15039	NC_012792	TCT	2	6	560334	560339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820514
15040	NC_012792	CAGCG	2	10	560419	560428	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15041	NC_012792	CG	4	8	560455	560462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15042	NC_012792	TCGA	2	8	560526	560533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15043	NC_012792	GAA	2	6	560567	560572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_012792	GCTC	2	8	560580	560587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15045	NC_012792	AG	3	6	560623	560628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_012792	ACG	2	6	560718	560723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820515
15047	NC_012792	GC	3	6	560781	560786	0 %	0 %	50 %	50 %	239820515
15048	NC_012792	GCA	2	6	560836	560841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820515
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15050	NC_012792	GGT	2	6	560932	560937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820515
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15052	NC_012792	CGG	2	6	560959	560964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820515
15053	NC_012792	CAG	2	6	561020	561025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820515
15054	NC_012792	GCT	2	6	561088	561093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820515
15055	NC_012792	CCG	3	9	561115	561123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820515
15056	NC_012792	ATGTCT	2	12	561177	561188	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	239820515
15057	NC_012792	TGG	2	6	561201	561206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820515
15058	NC_012792	CGC	2	6	561229	561234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820515
15059	NC_012792	TCG	2	6	561279	561284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820515
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15064	NC_012792	TCC	2	6	561446	561451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820516
15065	NC_012792	GAT	2	6	561463	561468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820516
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15070	NC_012792	GCGCC	2	10	561625	561634	0 %	0 %	40 %	60 %	239820516
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15073	NC_012792	TTG	2	6	561998	562003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_012792	CGG	2	6	562029	562034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15075	NC_012792	GGA	2	6	562039	562044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_012792	CG	3	6	562123	562128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15077	NC_012792	TCGCC	2	10	562147	562156	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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15081	NC_012792	GGT	2	6	562268	562273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_012792	TCCGA	2	10	562281	562290	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15083	NC_012792	GGT	2	6	562291	562296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_012792	TCCGA	2	10	562304	562313	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15085	NC_012792	TCCGA	2	10	562327	562336	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15086	NC_012792	ACG	2	6	562402	562407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15088	NC_012792	AGC	2	6	562517	562522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820517
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15092	NC_012792	CAA	2	6	562705	562710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820517
15093	NC_012792	ATC	2	6	562750	562755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820517
15094	NC_012792	CAT	2	6	562809	562814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820517
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15101	NC_012792	TGA	2	6	563156	563161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820517
15102	NC_012792	GTC	2	6	563204	563209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820517
15103	NC_012792	GTC	2	6	563234	563239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820517
15104	NC_012792	TGC	2	6	563369	563374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820518
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15106	NC_012792	GGC	2	6	563526	563531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820518
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15108	NC_012792	CCGT	2	8	563635	563642	0 %	25 %	25 %	50 %	239820518
15109	NC_012792	GGA	2	6	563645	563650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820518
15110	NC_012792	GCG	2	6	563667	563672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820518
15111	NC_012792	AGCG	2	8	563759	563766	25 %	0 %	50 %	25 %	239820518
15112	NC_012792	TGA	2	6	563776	563781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820518
15113	NC_012792	GCT	2	6	563828	563833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820518
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15118	NC_012792	CA	3	6	564075	564080	50 %	0 %	0 %	50 %	239820518
15119	NC_012792	CGC	2	6	564139	564144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820518
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15121	NC_012792	AGC	2	6	564223	564228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820518
15122	NC_012792	CGA	2	6	564365	564370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820518
15123	NC_012792	CTC	2	6	564375	564380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820518
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15125	NC_012792	CT	3	6	564429	564434	0 %	50 %	0 %	50 %	239820518
15126	NC_012792	TCGG	2	8	564582	564589	0 %	25 %	50 %	25 %	239820518
15127	NC_012792	TCG	3	9	564616	564624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820518
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15131	NC_012792	GCC	2	6	564953	564958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15228	NC_012792	ACC	2	6	570270	570275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15229	NC_012792	CG	3	6	570301	570306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15230	NC_012792	GAA	2	6	570324	570329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15231	NC_012792	CG	3	6	570348	570353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15232	NC_012792	GCA	2	6	570360	570365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15233	NC_012792	AT	3	6	570421	570426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15234	NC_012792	GAA	2	6	570438	570443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820522
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15238	NC_012792	TGC	2	6	570641	570646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820522
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15241	NC_012792	TCG	2	6	571021	571026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820523
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15243	NC_012792	CAC	2	6	571044	571049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820523
15244	NC_012792	TTTCG	2	10	571067	571076	0 %	60 %	20 %	20 %	239820523
15245	NC_012792	TTC	2	6	571092	571097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820523
15246	NC_012792	GATT	2	8	571104	571111	25 %	50 %	25 %	0 %	239820523
15247	NC_012792	TAAG	2	8	571172	571179	50 %	25 %	25 %	0 %	239820523
15248	NC_012792	AGC	2	6	571204	571209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820523
15249	NC_012792	GCA	2	6	571267	571272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820523
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15251	NC_012792	GAT	2	6	571354	571359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15252	NC_012792	CTG	2	6	571360	571365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15253	NC_012792	TTG	2	6	571374	571379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15254	NC_012792	GCA	2	6	571391	571396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15255	NC_012792	GAA	2	6	571583	571588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820524
15256	NC_012792	TCG	2	6	571636	571641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820524
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15258	NC_012792	CGAT	2	8	571711	571718	25 %	25 %	25 %	25 %	239820524
15259	NC_012792	GGT	2	6	571799	571804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820524
15260	NC_012792	GAA	2	6	571806	571811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820524
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15262	NC_012792	GACT	2	8	572020	572027	25 %	25 %	25 %	25 %	239820524
15263	NC_012792	AGA	2	6	572033	572038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820524
15264	NC_012792	GATGAC	2	12	572092	572103	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239820524
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15269	NC_012792	TGG	2	6	572270	572275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820525
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15272	NC_012792	CGG	2	6	572429	572434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820525
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15280	NC_012792	CGC	2	6	572830	572835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15281	NC_012792	CGC	2	6	572953	572958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15282	NC_012792	ACA	2	6	572990	572995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15283	NC_012792	TGC	2	6	573046	573051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15300	NC_012792	GTC	2	6	573782	573787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820527
15301	NC_012792	GCC	2	6	573794	573799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15302	NC_012792	TAC	2	6	573801	573806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15307	NC_012792	TGA	2	6	573955	573960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820528
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15315	NC_012792	GCCC	2	8	574145	574152	0 %	0 %	25 %	75 %	239820528
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15332	NC_012792	TGT	2	6	574954	574959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15333	NC_012792	TGT	2	6	574968	574973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15334	NC_012792	CTG	2	6	575013	575018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15346	NC_012792	CCG	2	6	575503	575508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15347	NC_012792	CTG	2	6	575539	575544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820532
15348	NC_012792	A	6	6	575561	575566	100 %	0 %	0 %	0 %	239820532
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15357	NC_012792	GCC	2	6	576179	576184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820532
15358	NC_012792	GCA	2	6	576207	576212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820532
15359	NC_012792	CCCGC	2	10	576237	576246	0 %	0 %	20 %	80 %	239820532
15360	NC_012792	GCT	2	6	576247	576252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820532
15361	NC_012792	GTG	2	6	576269	576274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820532
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15363	NC_012792	GAA	2	6	576530	576535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820533
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15367	NC_012792	CGT	2	6	576769	576774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820534
15368	NC_012792	CGA	3	9	576790	576798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820534
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15383	NC_012792	GTCG	2	8	577428	577435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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15385	NC_012792	ATCG	2	8	577457	577464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15484	NC_012792	CGT	2	6	582754	582759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820538
15485	NC_012792	GCGCT	2	10	582801	582810	0 %	20 %	40 %	40 %	239820538
15486	NC_012792	CGC	2	6	582819	582824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820538
15487	NC_012792	GC	5	10	582823	582832	0 %	0 %	50 %	50 %	239820538
15488	NC_012792	CCGGT	2	10	582879	582888	0 %	20 %	40 %	40 %	239820538
15489	NC_012792	CG	3	6	582895	582900	0 %	0 %	50 %	50 %	239820538
15490	NC_012792	GC	3	6	582913	582918	0 %	0 %	50 %	50 %	239820538
15491	NC_012792	GTCAAC	2	12	583019	583030	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239820538
15492	NC_012792	GGT	2	6	583031	583036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820538
15493	NC_012792	CAC	2	6	583084	583089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820538
15494	NC_012792	CGA	2	6	583251	583256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820539
15495	NC_012792	CCG	2	6	583424	583429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820539
15496	NC_012792	GC	3	6	583447	583452	0 %	0 %	50 %	50 %	239820539
15497	NC_012792	AAG	2	6	583465	583470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820539
15498	NC_012792	CTG	2	6	583471	583476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820539
15499	NC_012792	GGT	2	6	583503	583508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820539
15500	NC_012792	GCG	2	6	583535	583540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820539

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