MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 29840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_012792	GAA	2	6	540173	540178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820503
14502	NC_012792	TCG	2	6	540180	540185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820503
14503	NC_012792	CGA	2	6	540204	540209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820503
14504	NC_012792	TCGA	2	8	540211	540218	25 %	25 %	25 %	25 %	239820503
14505	NC_012792	CCG	2	6	540235	540240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820503
14506	NC_012792	AGG	2	6	540267	540272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820503
14507	NC_012792	TCC	2	6	540298	540303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820503
14508	NC_012792	GAC	2	6	540362	540367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820503
14509	NC_012792	AAG	2	6	540452	540457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820503
14510	NC_012792	TCGCCG	2	12	540468	540479	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239820503
14511	NC_012792	CG	3	6	540507	540512	0 %	0 %	50 %	50 %	239820503
14512	NC_012792	CCTC	2	8	540522	540529	0 %	25 %	0 %	75 %	239820503
14513	NC_012792	GAA	2	6	540574	540579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820503
14514	NC_012792	GAA	2	6	540585	540590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820503
14515	NC_012792	CGG	2	6	540599	540604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820503
14516	NC_012792	GCGA	2	8	540605	540612	25 %	0 %	50 %	25 %	239820503
14517	NC_012792	CGG	2	6	540628	540633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820503
14518	NC_012792	TCC	2	6	540747	540752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820503
14519	NC_012792	CTG	3	9	540779	540787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_012792	GC	3	6	540796	540801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14521	NC_012792	GGC	2	6	540803	540808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_012792	AG	3	6	540814	540819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_012792	TAC	2	6	540846	540851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_012792	GA	3	6	540891	540896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_012792	TGGA	2	8	540901	540908	25 %	25 %	50 %	0 %	239820504
14526	NC_012792	GAAT	2	8	540957	540964	50 %	25 %	25 %	0 %	239820504
14527	NC_012792	GGA	2	6	540984	540989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820504
14528	NC_012792	GCA	2	6	541052	541057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820504
14529	NC_012792	GT	3	6	541166	541171	0 %	50 %	50 %	0 %	239820504
14530	NC_012792	ACCA	2	8	541195	541202	50 %	0 %	0 %	50 %	239820504
14531	NC_012792	CTGGGC	2	12	541240	541251	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	239820504
14532	NC_012792	TGC	2	6	541274	541279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820504
14533	NC_012792	TGA	2	6	541341	541346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820504
14534	NC_012792	TCG	2	6	541421	541426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820504
14535	NC_012792	GGT	2	6	541614	541619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820504
14536	NC_012792	GCTCG	2	10	541620	541629	0 %	20 %	40 %	40 %	239820504
14537	NC_012792	CAT	2	6	541705	541710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820504
14538	NC_012792	CG	3	6	541787	541792	0 %	0 %	50 %	50 %	239820504
14539	NC_012792	TGT	2	6	541796	541801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239820504
14540	NC_012792	GCA	2	6	541815	541820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820504
14541	NC_012792	CAG	2	6	541849	541854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820504
14542	NC_012792	AGGAT	2	10	541887	541896	40 %	20 %	40 %	0 %	239820504
14543	NC_012792	AGG	2	6	542015	542020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820505
14544	NC_012792	CGC	2	6	542035	542040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820505
14545	NC_012792	CGGCC	2	10	542080	542089	0 %	0 %	40 %	60 %	239820505
14546	NC_012792	TGA	2	6	542096	542101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820505
14547	NC_012792	TGC	2	6	542108	542113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820505
14548	NC_012792	GAC	2	6	542119	542124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820505
14549	NC_012792	CAG	2	6	542125	542130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820505
14550	NC_012792	GCT	2	6	542145	542150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820505
14551	NC_012792	GCAT	2	8	542158	542165	25 %	25 %	25 %	25 %	239820505
14552	NC_012792	CTT	2	6	542184	542189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820505
14553	NC_012792	CG	3	6	542213	542218	0 %	0 %	50 %	50 %	239820505
14554	NC_012792	GCCG	2	8	542270	542277	0 %	0 %	50 %	50 %	239820505
14555	NC_012792	CG	3	6	542280	542285	0 %	0 %	50 %	50 %	239820505
14556	NC_012792	GGCGC	2	10	542322	542331	0 %	0 %	60 %	40 %	239820505
14557	NC_012792	CGCGC	2	10	542372	542381	0 %	0 %	40 %	60 %	239820505
14558	NC_012792	GCC	2	6	542466	542471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820505
14559	NC_012792	AGC	2	6	542478	542483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820505
14560	NC_012792	CG	3	6	542644	542649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14561	NC_012792	GGC	2	6	542664	542669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14562	NC_012792	TTC	2	6	542705	542710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14563	NC_012792	GCGCG	2	10	542753	542762	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14564	NC_012792	CG	3	6	542771	542776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14565	NC_012792	AGG	2	6	542789	542794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_012792	GGAC	2	8	542803	542810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14567	NC_012792	A	6	6	542816	542821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_012792	TGA	2	6	542951	542956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_012792	CGTCT	2	10	543019	543028	0 %	40 %	20 %	40 %	239820506
14570	NC_012792	GAAC	2	8	543036	543043	50 %	0 %	25 %	25 %	239820506
14571	NC_012792	CCGCG	2	10	543058	543067	0 %	0 %	40 %	60 %	239820506
14572	NC_012792	CGC	2	6	543084	543089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820506
14573	NC_012792	GTT	2	6	543123	543128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239820506
14574	NC_012792	CGC	2	6	543137	543142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820506
14575	NC_012792	TGC	2	6	543153	543158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820506
14576	NC_012792	GCG	2	6	543167	543172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820506
14577	NC_012792	AGC	2	6	543177	543182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820506
14578	NC_012792	TTC	2	6	543309	543314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820506
14579	NC_012792	GGTG	2	8	543327	543334	0 %	25 %	75 %	0 %	239820506
14580	NC_012792	CAC	3	9	543372	543380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820506
14581	NC_012792	CGGCT	2	10	543381	543390	0 %	20 %	40 %	40 %	239820506
14582	NC_012792	CGG	2	6	543531	543536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820506
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14585	NC_012792	CAA	2	6	543678	543683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820506
14586	NC_012792	TCTGT	2	10	543718	543727	0 %	60 %	20 %	20 %	239820506
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14588	NC_012792	GC	3	6	543751	543756	0 %	0 %	50 %	50 %	239820506
14589	NC_012792	GGCT	2	8	543770	543777	0 %	25 %	50 %	25 %	239820506
14590	NC_012792	GGC	2	6	543793	543798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820506
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14592	NC_012792	CGG	2	6	543876	543881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820506
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14594	NC_012792	GTC	2	6	543967	543972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820506
14595	NC_012792	CGG	2	6	544038	544043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820506
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14602	NC_012792	GCG	2	6	544322	544327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820506
14603	NC_012792	CGG	2	6	544359	544364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820506
14604	NC_012792	CGGC	2	8	544403	544410	0 %	0 %	50 %	50 %	239820506
14605	NC_012792	GC	3	6	544409	544414	0 %	0 %	50 %	50 %	239820506
14606	NC_012792	CGG	2	6	544425	544430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820506
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14608	NC_012792	CGG	2	6	544545	544550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820506
14609	NC_012792	CACGCT	2	12	544572	544583	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239820506
14610	NC_012792	GCA	2	6	544607	544612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820506
14611	NC_012792	CCA	2	6	544613	544618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820506
14612	NC_012792	GCCGGC	2	12	544642	544653	0 %	0 %	50 %	50 %	239820506
14613	NC_012792	GCG	2	6	544714	544719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820506
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14619	NC_012792	GCAG	2	8	544819	544826	25 %	0 %	50 %	25 %	239820506
14620	NC_012792	CGGC	2	8	544844	544851	0 %	0 %	50 %	50 %	239820506
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14622	NC_012792	ACG	2	6	544891	544896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820506
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14624	NC_012792	CG	3	6	544990	544995	0 %	0 %	50 %	50 %	239820506
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14982	NC_012792	GC	3	6	557962	557967	0 %	0 %	50 %	50 %	239820511
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