MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 29840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_012792	CGC	2	6	520037	520042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820485
14002	NC_012792	GCT	2	6	520079	520084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14003	NC_012792	GAC	2	6	520233	520238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14004	NC_012792	CTG	2	6	520275	520280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14005	NC_012792	CCG	3	9	520325	520333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820486
14006	NC_012792	CCGG	2	8	520347	520354	0 %	0 %	50 %	50 %	239820486
14007	NC_012792	GAC	2	6	520358	520363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14008	NC_012792	CGA	2	6	520376	520381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14009	NC_012792	AGC	2	6	520387	520392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14010	NC_012792	CGC	2	6	520398	520403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820486
14011	NC_012792	TGGC	2	8	520408	520415	0 %	25 %	50 %	25 %	239820486
14012	NC_012792	GTCG	2	8	520445	520452	0 %	25 %	50 %	25 %	239820486
14013	NC_012792	CGC	2	6	520484	520489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820486
14014	NC_012792	GC	3	6	520505	520510	0 %	0 %	50 %	50 %	239820486
14015	NC_012792	GCGG	2	8	520526	520533	0 %	0 %	75 %	25 %	239820486
14016	NC_012792	GCA	2	6	520558	520563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14017	NC_012792	CGC	2	6	520583	520588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820486
14018	NC_012792	ACG	2	6	520639	520644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14019	NC_012792	T	6	6	520648	520653	0 %	100 %	0 %	0 %	239820486
14020	NC_012792	CCTC	2	8	520654	520661	0 %	25 %	0 %	75 %	239820486
14021	NC_012792	TGCCGC	2	12	520705	520716	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239820486
14022	NC_012792	GC	3	6	520715	520720	0 %	0 %	50 %	50 %	239820486
14023	NC_012792	C	6	6	520720	520725	0 %	0 %	0 %	100 %	239820486
14024	NC_012792	CCA	2	6	520741	520746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820486
14025	NC_012792	CTT	2	6	520754	520759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820486
14026	NC_012792	CTG	2	6	520866	520871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14027	NC_012792	ATG	2	6	520938	520943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820486
14028	NC_012792	GCC	2	6	520945	520950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820486
14029	NC_012792	GCC	3	9	520965	520973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820486
14030	NC_012792	GAC	2	6	521019	521024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14031	NC_012792	TGA	2	6	521026	521031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820486
14032	NC_012792	GTG	2	6	521043	521048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820486
14033	NC_012792	ACC	2	6	521053	521058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820486
14034	NC_012792	ACG	2	6	521089	521094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14035	NC_012792	GGCC	2	8	521112	521119	0 %	0 %	50 %	50 %	239820486
14036	NC_012792	CGCCCG	2	12	521147	521158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820486
14037	NC_012792	CTG	2	6	521163	521168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14038	NC_012792	TGG	3	9	521182	521190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820486
14039	NC_012792	GGC	2	6	521213	521218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820486
14040	NC_012792	CGC	2	6	521288	521293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820486
14041	NC_012792	CCGG	2	8	521320	521327	0 %	0 %	50 %	50 %	239820486
14042	NC_012792	ACT	2	6	521338	521343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820486
14043	NC_012792	CAC	2	6	521366	521371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820486
14044	NC_012792	GC	3	6	521372	521377	0 %	0 %	50 %	50 %	239820486
14045	NC_012792	CTA	2	6	521387	521392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820486
14046	NC_012792	GCGA	2	8	521406	521413	25 %	0 %	50 %	25 %	239820486
14047	NC_012792	CGG	2	6	521429	521434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820486
14048	NC_012792	GCC	2	6	521437	521442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820486
14049	NC_012792	GCT	2	6	521495	521500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14050	NC_012792	TGG	2	6	521512	521517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820486
14051	NC_012792	CA	3	6	521540	521545	50 %	0 %	0 %	50 %	239820486
14052	NC_012792	GGC	2	6	521595	521600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820486
14053	NC_012792	CACC	2	8	521626	521633	25 %	0 %	0 %	75 %	239820486
14054	NC_012792	CGA	2	6	521654	521659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14055	NC_012792	CGC	2	6	521819	521824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820486
14056	NC_012792	CG	3	6	521858	521863	0 %	0 %	50 %	50 %	239820486
14057	NC_012792	CGG	2	6	521868	521873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820486
14058	NC_012792	GCT	2	6	521939	521944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14059	NC_012792	GC	3	6	522002	522007	0 %	0 %	50 %	50 %	239820486
14060	NC_012792	TGG	2	6	522046	522051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820486
14061	NC_012792	GCC	2	6	522055	522060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820486
14062	NC_012792	TGGA	2	8	522072	522079	25 %	25 %	50 %	0 %	239820486
14063	NC_012792	AAG	2	6	522150	522155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820486
14064	NC_012792	CG	3	6	522216	522221	0 %	0 %	50 %	50 %	239820486
14065	NC_012792	TCG	2	6	522223	522228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14066	NC_012792	CGA	2	6	522238	522243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14067	NC_012792	ACG	2	6	522274	522279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14068	NC_012792	GACC	2	8	522302	522309	25 %	0 %	25 %	50 %	239820486
14069	NC_012792	CGA	2	6	522413	522418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820486
14070	NC_012792	AAC	2	6	522534	522539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820486
14071	NC_012792	TTG	2	6	522587	522592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239820487
14072	NC_012792	CTCG	2	8	522615	522622	0 %	25 %	25 %	50 %	239820487
14073	NC_012792	CCG	2	6	522625	522630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820487
14074	NC_012792	CAG	2	6	522685	522690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820487
14075	NC_012792	GCA	3	9	522702	522710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820487
14076	NC_012792	AGC	2	6	522806	522811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820487
14077	NC_012792	TGC	2	6	522812	522817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820487
14078	NC_012792	CGCA	2	8	522831	522838	25 %	0 %	25 %	50 %	239820487
14079	NC_012792	TCG	2	6	522886	522891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820487
14080	NC_012792	GCCA	2	8	522910	522917	25 %	0 %	25 %	50 %	239820487
14081	NC_012792	GTC	2	6	522994	522999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820487
14082	NC_012792	GCT	2	6	523023	523028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820487
14083	NC_012792	CCAG	2	8	523061	523068	25 %	0 %	25 %	50 %	239820487
14084	NC_012792	CTG	2	6	523087	523092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820487
14085	NC_012792	GAG	2	6	523222	523227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820487
14086	NC_012792	GC	4	8	523242	523249	0 %	0 %	50 %	50 %	239820487
14087	NC_012792	ACT	2	6	523301	523306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820487
14088	NC_012792	ATC	2	6	523350	523355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_012792	GTC	2	6	523356	523361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14090	NC_012792	GCG	2	6	523362	523367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_012792	GCAC	2	8	523433	523440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14092	NC_012792	GC	3	6	523477	523482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14093	NC_012792	GCC	2	6	523551	523556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14094	NC_012792	CAT	2	6	523572	523577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820488
14095	NC_012792	TTCTT	2	10	523594	523603	0 %	80 %	0 %	20 %	239820488
14096	NC_012792	GCAC	2	8	523634	523641	25 %	0 %	25 %	50 %	239820488
14097	NC_012792	CGC	2	6	523671	523676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820488
14098	NC_012792	GGGA	2	8	523751	523758	25 %	0 %	75 %	0 %	239820488
14099	NC_012792	GGC	2	6	523863	523868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820488
14100	NC_012792	GTCA	2	8	523869	523876	25 %	25 %	25 %	25 %	239820488
14101	NC_012792	TGAT	2	8	523901	523908	25 %	50 %	25 %	0 %	239820488
14102	NC_012792	AAG	2	6	523951	523956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820488
14103	NC_012792	CGT	3	9	524028	524036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820488
14104	NC_012792	CTTG	2	8	524046	524053	0 %	50 %	25 %	25 %	239820488
14105	NC_012792	T	6	6	524116	524121	0 %	100 %	0 %	0 %	239820488
14106	NC_012792	T	6	6	524137	524142	0 %	100 %	0 %	0 %	239820488
14107	NC_012792	CGT	2	6	524385	524390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820488
14108	NC_012792	GCG	2	6	524469	524474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820488
14109	NC_012792	CCG	2	6	524502	524507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820488
14110	NC_012792	CGC	2	6	524566	524571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820488
14111	NC_012792	AG	3	6	524590	524595	50 %	0 %	50 %	0 %	239820488
14112	NC_012792	ATC	2	6	524656	524661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14113	NC_012792	CCG	2	6	524716	524721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14114	NC_012792	CG	4	8	524846	524853	0 %	0 %	50 %	50 %	239820489
14115	NC_012792	GCA	2	6	524900	524905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820489
14116	NC_012792	TCGCCG	2	12	524919	524930	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239820489
14117	NC_012792	CGC	2	6	524946	524951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820489
14118	NC_012792	AGC	2	6	524955	524960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820489
14119	NC_012792	CAG	3	9	524986	524994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820489
14120	NC_012792	TCG	2	6	525000	525005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820489
14121	NC_012792	CGAC	2	8	525030	525037	25 %	0 %	25 %	50 %	239820489
14122	NC_012792	CTG	2	6	525062	525067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820489
14123	NC_012792	GC	3	6	525083	525088	0 %	0 %	50 %	50 %	239820489
14124	NC_012792	GGC	2	6	525169	525174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820489
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14127	NC_012792	CG	3	6	525318	525323	0 %	0 %	50 %	50 %	239820489
14128	NC_012792	GGC	2	6	525326	525331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820489
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14150	NC_012792	TGC	2	6	526223	526228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820490
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14152	NC_012792	TCG	2	6	526268	526273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820490
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14231	NC_012792	CGAGCG	2	12	529339	529350	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	239820493
14232	NC_012792	CGA	2	6	529405	529410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820493
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14234	NC_012792	GC	3	6	529624	529629	0 %	0 %	50 %	50 %	239820493
14235	NC_012792	ACG	2	6	529668	529673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820493
14236	NC_012792	GCC	2	6	529725	529730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820493
14237	NC_012792	GAT	2	6	529750	529755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820493
14238	NC_012792	ACC	2	6	529763	529768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820493
14239	NC_012792	CGATCT	2	12	529809	529820	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	239820493
14240	NC_012792	ACA	2	6	529839	529844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820493
14241	NC_012792	GCT	2	6	529861	529866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820493
14242	NC_012792	TTC	2	6	529874	529879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820493
14243	NC_012792	CAG	2	6	529880	529885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820493
14244	NC_012792	CCA	2	6	529936	529941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820493
14245	NC_012792	CGA	2	6	529957	529962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820493
14246	NC_012792	GC	3	6	530029	530034	0 %	0 %	50 %	50 %	239820493
14247	NC_012792	ATC	2	6	530039	530044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820493
14248	NC_012792	GTCCA	2	10	530045	530054	20 %	20 %	20 %	40 %	239820493
14249	NC_012792	GC	3	6	530117	530122	0 %	0 %	50 %	50 %	239820493
14250	NC_012792	CCCA	2	8	530131	530138	25 %	0 %	0 %	75 %	239820493
14251	NC_012792	AGA	2	6	530196	530201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820493
14252	NC_012792	GCC	2	6	530208	530213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820493
14253	NC_012792	AGC	2	6	530259	530264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820493
14254	NC_012792	CGC	2	6	530267	530272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820493
14255	NC_012792	CTG	3	9	530273	530281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820493
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14257	NC_012792	GACCG	2	10	530304	530313	20 %	0 %	40 %	40 %	239820493
14258	NC_012792	GAT	2	6	530314	530319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820493
14259	NC_012792	GCC	2	6	530401	530406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820493
14260	NC_012792	CGG	2	6	530440	530445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820493
14261	NC_012792	CGC	2	6	530446	530451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820493
14262	NC_012792	CGG	2	6	530463	530468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820493
14263	NC_012792	ACGCC	2	10	530523	530532	20 %	0 %	20 %	60 %	239820493
14264	NC_012792	GCGCC	2	10	530544	530553	0 %	0 %	40 %	60 %	239820493
14265	NC_012792	ACG	2	6	530595	530600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820493
14266	NC_012792	GAC	2	6	530612	530617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820493
14267	NC_012792	TTCGAC	2	12	530624	530635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	239820493
14268	NC_012792	CGA	2	6	530665	530670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820493
14269	NC_012792	CCTG	2	8	530755	530762	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14270	NC_012792	CA	3	6	530767	530772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14271	NC_012792	TTC	2	6	530801	530806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820494
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14273	NC_012792	CTG	2	6	530881	530886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820494
14274	NC_012792	CTT	2	6	530954	530959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820494
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14276	NC_012792	CGG	2	6	530990	530995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820494
14277	NC_012792	TGC	2	6	531028	531033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820494
14278	NC_012792	CGT	2	6	531038	531043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820494
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14280	NC_012792	CCGACT	2	12	531159	531170	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239820494
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14282	NC_012792	GCGT	2	8	531188	531195	0 %	25 %	50 %	25 %	239820494
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14300	NC_012792	TCGC	2	8	531928	531935	0 %	25 %	25 %	50 %	239820494
14301	NC_012792	ATGC	2	8	531936	531943	25 %	25 %	25 %	25 %	239820494
14302	NC_012792	GC	3	6	531942	531947	0 %	0 %	50 %	50 %	239820494
14303	NC_012792	AGG	2	6	531967	531972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820494
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14305	NC_012792	GTT	2	6	532052	532057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14306	NC_012792	CG	3	6	532207	532212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14307	NC_012792	AGC	2	6	532225	532230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14309	NC_012792	CGC	2	6	532344	532349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14310	NC_012792	CGC	2	6	532399	532404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14311	NC_012792	GGTC	2	8	532464	532471	0 %	25 %	50 %	25 %	239820495
14312	NC_012792	GCTC	2	8	532479	532486	0 %	25 %	25 %	50 %	239820495
14313	NC_012792	GGTC	2	8	532501	532508	0 %	25 %	50 %	25 %	239820495
14314	NC_012792	GGCG	2	8	532519	532526	0 %	0 %	75 %	25 %	239820495
14315	NC_012792	CAA	2	6	532534	532539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820495
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14331	NC_012792	GGC	2	6	533215	533220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820496
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14353	NC_012792	TCG	2	6	534031	534036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820496
14354	NC_012792	TGCCG	2	10	534053	534062	0 %	20 %	40 %	40 %	239820496
14355	NC_012792	CCG	3	9	534106	534114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820496
14356	NC_012792	GCC	2	6	534195	534200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820496
14357	NC_012792	GGCCG	2	10	534255	534264	0 %	0 %	60 %	40 %	239820496
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14487	NC_012792	AGGA	2	8	539466	539473	50 %	0 %	50 %	0 %	239820502
14488	NC_012792	CCCG	2	8	539489	539496	0 %	0 %	25 %	75 %	239820502
14489	NC_012792	TCT	2	6	539509	539514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820502
14490	NC_012792	GCT	2	6	539522	539527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820502
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