MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 29840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012792	CAGCCT	2	12	206430	206441	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239820179
5502	NC_012792	CCA	2	6	206450	206455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820179
5503	NC_012792	GCG	2	6	206460	206465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820179
5504	NC_012792	GC	3	6	206471	206476	0 %	0 %	50 %	50 %	239820179
5505	NC_012792	GGA	2	6	206478	206483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820179
5506	NC_012792	TGG	2	6	206501	206506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820179
5507	NC_012792	CG	3	6	206613	206618	0 %	0 %	50 %	50 %	239820179
5508	NC_012792	GCT	2	6	206685	206690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820179
5509	NC_012792	TCGAGC	2	12	206726	206737	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239820179
5510	NC_012792	TGG	2	6	206759	206764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820179
5511	NC_012792	TCA	2	6	206819	206824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820179
5512	NC_012792	GCT	2	6	206829	206834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820179
5513	NC_012792	CGA	2	6	206841	206846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820179
5514	NC_012792	TGG	2	6	206852	206857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820179
5515	NC_012792	GCGCGA	2	12	206937	206948	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	239820179
5516	NC_012792	TCA	2	6	206951	206956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820179
5517	NC_012792	CGA	2	6	206970	206975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820179
5518	NC_012792	GGCG	2	8	206976	206983	0 %	0 %	75 %	25 %	239820179
5519	NC_012792	AGC	2	6	206984	206989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820179
5520	NC_012792	CAA	2	6	207021	207026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820179
5521	NC_012792	CTG	2	6	207034	207039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820179
5522	NC_012792	CGG	2	6	207054	207059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820179
5523	NC_012792	CTG	2	6	207073	207078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820179
5524	NC_012792	TGC	2	6	207200	207205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820179
5525	NC_012792	GTGC	2	8	207214	207221	0 %	25 %	50 %	25 %	239820179
5526	NC_012792	TCG	2	6	207224	207229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820179
5527	NC_012792	CGC	2	6	207377	207382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820180
5528	NC_012792	GAT	2	6	207419	207424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820180
5529	NC_012792	GTT	2	6	207440	207445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239820180
5530	NC_012792	GCGA	2	8	207471	207478	25 %	0 %	50 %	25 %	239820180
5531	NC_012792	GCATC	2	10	207574	207583	20 %	20 %	20 %	40 %	239820180
5532	NC_012792	TCC	2	6	207612	207617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820180
5533	NC_012792	GC	3	6	207648	207653	0 %	0 %	50 %	50 %	239820180
5534	NC_012792	ACC	2	6	207690	207695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820180
5535	NC_012792	GA	3	6	207696	207701	50 %	0 %	50 %	0 %	239820180
5536	NC_012792	GCT	2	6	207712	207717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820180
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5539	NC_012792	CGA	2	6	207793	207798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820180
5540	NC_012792	AGC	2	6	207819	207824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820180
5541	NC_012792	TGCG	2	8	207894	207901	0 %	25 %	50 %	25 %	239820180
5542	NC_012792	TGCCAT	2	12	207962	207973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	239820180
5543	NC_012792	CTT	3	9	208031	208039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820180
5544	NC_012792	TTC	2	6	208061	208066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820180
5545	NC_012792	CTT	2	6	208163	208168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820180
5546	NC_012792	TCC	2	6	208227	208232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820180
5547	NC_012792	GCT	2	6	208314	208319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820180
5548	NC_012792	G	6	6	208363	208368	0 %	0 %	100 %	0 %	239820180
5549	NC_012792	CCGGC	2	10	208390	208399	0 %	0 %	40 %	60 %	239820180
5550	NC_012792	ATT	2	6	208495	208500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_012792	CGC	2	6	208531	208536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_012792	AGG	2	6	208546	208551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_012792	CGC	2	6	208569	208574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_012792	CAG	2	6	208645	208650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_012792	CGAG	2	8	208707	208714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5556	NC_012792	GCC	2	6	208776	208781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820181
5557	NC_012792	GTG	2	6	208790	208795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820181
5558	NC_012792	TCG	2	6	208800	208805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820181
5559	NC_012792	GAG	2	6	208823	208828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820181
5560	NC_012792	CG	3	6	208829	208834	0 %	0 %	50 %	50 %	239820181
5561	NC_012792	GC	3	6	208844	208849	0 %	0 %	50 %	50 %	239820181
5562	NC_012792	GGA	2	6	208900	208905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820181
5563	NC_012792	GAA	2	6	208916	208921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820181
5564	NC_012792	GCC	2	6	208928	208933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820181
5565	NC_012792	GC	3	6	208940	208945	0 %	0 %	50 %	50 %	239820181
5566	NC_012792	TCG	2	6	209000	209005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_012792	TCA	2	6	209009	209014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_012792	CCG	2	6	209018	209023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_012792	CGC	2	6	209027	209032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_012792	TCG	2	6	209054	209059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_012792	GC	3	6	209088	209093	0 %	0 %	50 %	50 %	239820182
5572	NC_012792	AGC	2	6	209095	209100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820182
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5574	NC_012792	GCAG	2	8	209130	209137	25 %	0 %	50 %	25 %	239820182
5575	NC_012792	GC	4	8	209186	209193	0 %	0 %	50 %	50 %	239820182
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5579	NC_012792	GCGA	2	8	209309	209316	25 %	0 %	50 %	25 %	239820182
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5582	NC_012792	GTC	2	6	209537	209542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820182
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5587	NC_012792	GCCGC	2	10	209775	209784	0 %	0 %	40 %	60 %	239820182
5588	NC_012792	GCC	2	6	209854	209859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820182
5589	NC_012792	GC	3	6	209863	209868	0 %	0 %	50 %	50 %	239820182
5590	NC_012792	GGT	2	6	209942	209947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239820182
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5592	NC_012792	GCAGC	2	10	210041	210050	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5593	NC_012792	GGC	2	6	210057	210062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_012792	TCG	2	6	210162	210167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820183
5595	NC_012792	CAG	2	6	210182	210187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820183
5596	NC_012792	TCG	2	6	210198	210203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820183
5597	NC_012792	GCC	2	6	210212	210217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820183
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5601	NC_012792	CGC	2	6	210319	210324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820183
5602	NC_012792	CG	4	8	210334	210341	0 %	0 %	50 %	50 %	239820183
5603	NC_012792	AAC	2	6	210392	210397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820183
5604	NC_012792	TCG	3	9	210477	210485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820183
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5606	NC_012792	CTG	2	6	210677	210682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820183
5607	NC_012792	CACC	2	8	210801	210808	25 %	0 %	0 %	75 %	239820183
5608	NC_012792	CCG	2	6	210864	210869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820183
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5610	NC_012792	GC	4	8	210941	210948	0 %	0 %	50 %	50 %	239820183
5611	NC_012792	CG	3	6	210969	210974	0 %	0 %	50 %	50 %	239820183
5612	NC_012792	GGA	2	6	210985	210990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820183
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5616	NC_012792	CCTT	2	8	211099	211106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5617	NC_012792	T	6	6	211105	211110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_012792	CGG	2	6	211156	211161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_012792	GCG	3	9	211203	211211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_012792	ATTT	2	8	211220	211227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_012792	CTG	3	9	211256	211264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_012792	ACA	2	6	211287	211292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_012792	CGC	2	6	211297	211302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_012792	CTG	2	6	211307	211312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_012792	AGG	2	6	211320	211325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_012792	GCG	2	6	211402	211407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820184
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5745	NC_012792	CGGC	2	8	215767	215774	0 %	0 %	50 %	50 %	239820189
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5870	NC_012792	GC	3	6	220045	220050	0 %	0 %	50 %	50 %	239820193
5871	NC_012792	TCA	2	6	220100	220105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820193
5872	NC_012792	GCT	2	6	220173	220178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820193
5873	NC_012792	CGC	2	6	220203	220208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820193
5874	NC_012792	GCT	2	6	220257	220262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820193
5875	NC_012792	GGA	2	6	220317	220322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239820193
5876	NC_012792	CG	3	6	220424	220429	0 %	0 %	50 %	50 %	239820194
5877	NC_012792	CCT	2	6	220477	220482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239820194
5878	NC_012792	CATG	2	8	220490	220497	25 %	25 %	25 %	25 %	239820194
5879	NC_012792	CCGG	2	8	220499	220506	0 %	0 %	50 %	50 %	239820194
5880	NC_012792	TCCT	2	8	220571	220578	0 %	50 %	0 %	50 %	239820194
5881	NC_012792	GCG	2	6	220579	220584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820194
5882	NC_012792	CG	3	6	220593	220598	0 %	0 %	50 %	50 %	239820194
5883	NC_012792	TCG	2	6	220603	220608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820194
5884	NC_012792	GCT	2	6	220625	220630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820194
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5886	NC_012792	CCG	2	6	220687	220692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820194
5887	NC_012792	GC	3	6	220778	220783	0 %	0 %	50 %	50 %	239820194
5888	NC_012792	GCG	2	6	220810	220815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820194
5889	NC_012792	ACG	2	6	220819	220824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820194
5890	NC_012792	GGC	3	9	220874	220882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820194
5891	NC_012792	CG	3	6	220902	220907	0 %	0 %	50 %	50 %	239820194
5892	NC_012792	CGC	2	6	220955	220960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820194
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5898	NC_012792	GCC	2	6	221190	221195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820194
5899	NC_012792	TGC	2	6	221218	221223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820194
5900	NC_012792	GGC	2	6	221244	221249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820194
5901	NC_012792	CGG	3	9	221318	221326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820194
5902	NC_012792	CTG	2	6	221334	221339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820194
5903	NC_012792	CTG	2	6	221352	221357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820194
5904	NC_012792	CGGC	2	8	221362	221369	0 %	0 %	50 %	50 %	239820194
5905	NC_012792	GGC	2	6	221373	221378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239820194
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5907	NC_012792	AGC	2	6	221470	221475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820194
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5909	NC_012792	GCT	2	6	221530	221535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820194
5910	NC_012792	GCA	2	6	221559	221564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820195
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5912	NC_012792	CGC	2	6	221616	221621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820195
5913	NC_012792	AGC	2	6	221651	221656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820195
5914	NC_012792	GCCG	2	8	221746	221753	0 %	0 %	50 %	50 %	239820195
5915	NC_012792	GCA	2	6	221754	221759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820195
5916	NC_012792	CAG	2	6	221791	221796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820195
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5918	NC_012792	GC	3	6	221892	221897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5919	NC_012792	CGACCG	2	12	221965	221976	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5920	NC_012792	GC	3	6	222023	222028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5921	NC_012792	TCA	3	9	222139	222147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820196
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5924	NC_012792	GGTTC	2	10	222292	222301	0 %	40 %	40 %	20 %	239820196
5925	NC_012792	CAA	2	6	222357	222362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239820197
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5927	NC_012792	CGC	2	6	222427	222432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820197
5928	NC_012792	GTT	2	6	222439	222444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239820197
5929	NC_012792	GTGG	2	8	222514	222521	0 %	25 %	75 %	0 %	239820197
5930	NC_012792	GTC	2	6	222529	222534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820197
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5933	NC_012792	TGA	2	6	222638	222643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820197
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5941	NC_012792	CG	4	8	222989	222996	0 %	0 %	50 %	50 %	239820198
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5946	NC_012792	CG	3	6	223223	223228	0 %	0 %	50 %	50 %	239820198
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5962	NC_012792	GGCC	2	8	223640	223647	0 %	0 %	50 %	50 %	239820198
5963	NC_012792	CGGC	2	8	223658	223665	0 %	0 %	50 %	50 %	239820198
5964	NC_012792	CAC	2	6	223684	223689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820198
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5966	NC_012792	TTC	2	6	223780	223785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239820198
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5973	NC_012792	CAT	2	6	224004	224009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820198
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5977	NC_012792	GC	3	6	224227	224232	0 %	0 %	50 %	50 %	239820198
5978	NC_012792	GCT	2	6	224236	224241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820198
5979	NC_012792	CGA	2	6	224330	224335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820198
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5983	NC_012792	CG	3	6	224474	224479	0 %	0 %	50 %	50 %	239820198
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5985	NC_012792	CG	4	8	224543	224550	0 %	0 %	50 %	50 %	239820198
5986	NC_012792	TCG	2	6	224569	224574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820198
5987	NC_012792	GAT	2	6	224625	224630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820198
5988	NC_012792	CGTG	2	8	224693	224700	0 %	25 %	50 %	25 %	239820198
5989	NC_012792	CAG	2	6	224721	224726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820198
5990	NC_012792	GAT	2	6	224745	224750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239820198
5991	NC_012792	CCGGT	2	10	224777	224786	0 %	20 %	40 %	40 %	239820198
5992	NC_012792	GT	3	6	224855	224860	0 %	50 %	50 %	0 %	239820198
5993	NC_012792	TCA	2	6	224870	224875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239820198
5994	NC_012792	ATG	2	6	224905	224910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5995	NC_012792	TGC	2	6	224914	224919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5996	NC_012792	AG	3	6	224924	224929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5997	NC_012792	TG	3	6	224938	224943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5998	NC_012792	GCC	2	6	224946	224951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5999	NC_012792	ACC	2	6	224985	224990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6000	NC_012792	GAA	2	6	225013	225018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239820199

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