MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 157715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_012791	GCA	2	6	549776	549781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813523
16003	NC_012791	GCA	2	6	549794	549799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813523
16004	NC_012791	CGGC	2	8	549803	549810	0 %	0 %	50 %	50 %	239813523
16005	NC_012791	TCGG	2	8	549838	549845	0 %	25 %	50 %	25 %	239813523
16006	NC_012791	GCT	2	6	549858	549863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813523
16007	NC_012791	CGG	2	6	549888	549893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813523
16008	NC_012791	GC	3	6	549924	549929	0 %	0 %	50 %	50 %	239813523
16009	NC_012791	GGC	2	6	549952	549957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813523
16010	NC_012791	CGG	2	6	549963	549968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813523
16011	NC_012791	GGC	2	6	549973	549978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813523
16012	NC_012791	GGC	2	6	549994	549999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813523
16013	NC_012791	GCCG	2	8	550038	550045	0 %	0 %	50 %	50 %	239813523
16014	NC_012791	GGCGG	2	10	550050	550059	0 %	0 %	80 %	20 %	239813523
16015	NC_012791	TCG	2	6	550064	550069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813523
16016	NC_012791	CGG	3	9	550104	550112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813523
16017	NC_012791	CCA	2	6	550121	550126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813523
16018	NC_012791	GC	3	6	550178	550183	0 %	0 %	50 %	50 %	239813523
16019	NC_012791	CAC	2	6	550209	550214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813523
16020	NC_012791	GCG	2	6	550220	550225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813523
16021	NC_012791	GC	3	6	550286	550291	0 %	0 %	50 %	50 %	239813523
16022	NC_012791	ATC	2	6	550363	550368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813523
16023	NC_012791	CCA	2	6	550478	550483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813523
16024	NC_012791	CGG	2	6	550485	550490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813523
16025	NC_012791	CACGGG	2	12	550509	550520	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	239813523
16026	NC_012791	CGG	3	9	550560	550568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813523
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16028	NC_012791	AGC	2	6	550597	550602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813523
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16031	NC_012791	CG	3	6	550637	550642	0 %	0 %	50 %	50 %	239813523
16032	NC_012791	TCG	2	6	550670	550675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813523
16033	NC_012791	GCG	3	9	550733	550741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813523
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16040	NC_012791	TGC	2	6	550874	550879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813523
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16042	NC_012791	CGG	2	6	550929	550934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813523
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16051	NC_012791	GC	4	8	551300	551307	0 %	0 %	50 %	50 %	239813523
16052	NC_012791	ACC	2	6	551314	551319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813523
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16054	NC_012791	CGGCG	2	10	551409	551418	0 %	0 %	60 %	40 %	239813523
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16058	NC_012791	ACG	2	6	551462	551467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813523
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16091	NC_012791	CAG	2	6	552340	552345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813523
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16102	NC_012791	GC	3	6	552739	552744	0 %	0 %	50 %	50 %	239813523
16103	NC_012791	CG	3	6	552752	552757	0 %	0 %	50 %	50 %	239813523
16104	NC_012791	ACCG	2	8	552793	552800	25 %	0 %	25 %	50 %	239813523
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16107	NC_012791	CTGCG	2	10	552894	552903	0 %	20 %	40 %	40 %	239813524
16108	NC_012791	CGA	2	6	552926	552931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813524
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16110	NC_012791	GC	3	6	552960	552965	0 %	0 %	50 %	50 %	239813524
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16118	NC_012791	CGGC	2	8	553200	553207	0 %	0 %	50 %	50 %	239813524
16119	NC_012791	CG	3	6	553222	553227	0 %	0 %	50 %	50 %	239813524
16120	NC_012791	CGC	2	6	553256	553261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813524
16121	NC_012791	CTG	3	9	553269	553277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813524
16122	NC_012791	GCG	2	6	553278	553283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813524
16123	NC_012791	CGCC	2	8	553284	553291	0 %	0 %	25 %	75 %	239813524
16124	NC_012791	GCG	2	6	553294	553299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813524
16125	NC_012791	CGA	2	6	553331	553336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813524
16126	NC_012791	GGA	2	6	553352	553357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813524
16127	NC_012791	AAGCTG	2	12	553395	553406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239813524
16128	NC_012791	TTC	2	6	553452	553457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813524
16129	NC_012791	CCAC	2	8	553459	553466	25 %	0 %	0 %	75 %	239813524
16130	NC_012791	CCG	2	6	553502	553507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813524
16131	NC_012791	GC	3	6	553580	553585	0 %	0 %	50 %	50 %	239813524
16132	NC_012791	CGC	2	6	553595	553600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813524
16133	NC_012791	GC	3	6	553599	553604	0 %	0 %	50 %	50 %	239813524
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16140	NC_012791	GC	3	6	553902	553907	0 %	0 %	50 %	50 %	239813524
16141	NC_012791	CGGCG	2	10	553947	553956	0 %	0 %	60 %	40 %	239813525
16142	NC_012791	ACC	2	6	553982	553987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813525
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16144	NC_012791	TGC	2	6	554003	554008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813525
16145	NC_012791	TGCA	2	8	554014	554021	25 %	25 %	25 %	25 %	239813525
16146	NC_012791	GGT	2	6	554049	554054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813525
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16149	NC_012791	TGC	2	6	554126	554131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813525
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16154	NC_012791	GCCG	2	8	554294	554301	0 %	0 %	50 %	50 %	239813525
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16157	NC_012791	GC	3	6	554571	554576	0 %	0 %	50 %	50 %	239813525
16158	NC_012791	GGCC	2	8	554589	554596	0 %	0 %	50 %	50 %	239813525
16159	NC_012791	GCC	3	9	554598	554606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813525
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16177	NC_012791	GC	3	6	555136	555141	0 %	0 %	50 %	50 %	239813526
16178	NC_012791	CGT	2	6	555213	555218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813526
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16182	NC_012791	GC	5	10	555364	555373	0 %	0 %	50 %	50 %	239813526
16183	NC_012791	CGC	2	6	555430	555435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813526
16184	NC_012791	CAG	2	6	555448	555453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813526
16185	NC_012791	CGA	2	6	555501	555506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813526
16186	NC_012791	GCG	2	6	555527	555532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813526
16187	NC_012791	GTG	2	6	555558	555563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16188	NC_012791	TGG	2	6	555591	555596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16189	NC_012791	GTG	2	6	555638	555643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813527
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16226	NC_012791	TGGC	2	8	556685	556692	0 %	25 %	50 %	25 %	239813527
16227	NC_012791	GC	3	6	556709	556714	0 %	0 %	50 %	50 %	239813527
16228	NC_012791	CTCGGC	2	12	556729	556740	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239813527
16229	NC_012791	CTC	2	6	556780	556785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813527
16230	NC_012791	GC	3	6	556857	556862	0 %	0 %	50 %	50 %	239813527
16231	NC_012791	GCC	2	6	556876	556881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813527
16232	NC_012791	CG	3	6	556888	556893	0 %	0 %	50 %	50 %	239813527
16233	NC_012791	GC	3	6	556918	556923	0 %	0 %	50 %	50 %	239813527
16234	NC_012791	GC	3	6	556990	556995	0 %	0 %	50 %	50 %	239813527
16235	NC_012791	AGC	2	6	557024	557029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813527
16236	NC_012791	CCA	2	6	557031	557036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813527
16237	NC_012791	CGATGC	2	12	557040	557051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239813527
16238	NC_012791	AGCG	2	8	557060	557067	25 %	0 %	50 %	25 %	239813527
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16362	NC_012791	GC	3	6	560553	560558	0 %	0 %	50 %	50 %	239813529
16363	NC_012791	GCC	2	6	560607	560612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813529
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16365	NC_012791	GC	3	6	560672	560677	0 %	0 %	50 %	50 %	239813529
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16480	NC_012791	CGC	2	6	564048	564053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813533
16481	NC_012791	ACG	2	6	564079	564084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813533
16482	NC_012791	TCCG	2	8	564100	564107	0 %	25 %	25 %	50 %	239813533
16483	NC_012791	GAC	2	6	564114	564119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813533
16484	NC_012791	GCG	2	6	564122	564127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813533
16485	NC_012791	GGT	2	6	564203	564208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813533
16486	NC_012791	GC	5	10	564281	564290	0 %	0 %	50 %	50 %	239813533
16487	NC_012791	TCACGC	2	12	564361	564372	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239813533
16488	NC_012791	ACT	2	6	564418	564423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813533
16489	NC_012791	GGC	2	6	564474	564479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813533
16490	NC_012791	ACGGAA	2	12	564559	564570	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16491	NC_012791	CAT	2	6	564574	564579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813534
16492	NC_012791	ACA	2	6	564581	564586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813534
16493	NC_012791	CGC	2	6	564598	564603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813534
16494	NC_012791	TCA	2	6	564624	564629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813534
16495	NC_012791	GCCG	2	8	564646	564653	0 %	0 %	50 %	50 %	239813534
16496	NC_012791	CGC	2	6	564657	564662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813534
16497	NC_012791	TTC	2	6	564683	564688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813534
16498	NC_012791	GGC	2	6	564689	564694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813534
16499	NC_012791	GCCG	2	8	564706	564713	0 %	0 %	50 %	50 %	239813534
16500	NC_012791	GCT	2	6	564766	564771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813534

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