MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 157715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_012791	TCG	2	6	448550	448555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813433
13003	NC_012791	CAG	2	6	448561	448566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813433
13004	NC_012791	CAG	3	9	448585	448593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813433
13005	NC_012791	AGC	2	6	448601	448606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813433
13006	NC_012791	GC	4	8	448605	448612	0 %	0 %	50 %	50 %	239813433
13007	NC_012791	GGC	2	6	448617	448622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813433
13008	NC_012791	GTC	2	6	448645	448650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813433
13009	NC_012791	CGC	2	6	448665	448670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813433
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13011	NC_012791	GTT	2	6	448705	448710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239813433
13012	NC_012791	AGCAG	2	10	448743	448752	40 %	0 %	40 %	20 %	239813433
13013	NC_012791	CGT	2	6	448770	448775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813433
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13016	NC_012791	TGG	2	6	448817	448822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813433
13017	NC_012791	GC	3	6	448830	448835	0 %	0 %	50 %	50 %	239813433
13018	NC_012791	CGG	2	6	448872	448877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813433
13019	NC_012791	AGCC	2	8	448943	448950	25 %	0 %	25 %	50 %	239813433
13020	NC_012791	CGG	2	6	448951	448956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813433
13021	NC_012791	GCC	2	6	448975	448980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813433
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13024	NC_012791	GC	4	8	449058	449065	0 %	0 %	50 %	50 %	239813433
13025	NC_012791	GCGCC	2	10	449084	449093	0 %	0 %	40 %	60 %	239813433
13026	NC_012791	GC	3	6	449136	449141	0 %	0 %	50 %	50 %	239813433
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13029	NC_012791	TGCCGG	2	12	449208	449219	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	239813433
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13052	NC_012791	GCT	3	9	450006	450014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813433
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13120	NC_012791	GC	3	6	452622	452627	0 %	0 %	50 %	50 %	239813435
13121	NC_012791	GGC	2	6	452688	452693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813435
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13123	NC_012791	TCG	2	6	452741	452746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813435
13124	NC_012791	GCA	2	6	452823	452828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813435
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13166	NC_012791	GTCCCG	2	12	454065	454076	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13167	NC_012791	CGTTT	2	10	454125	454134	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13168	NC_012791	ACC	2	6	454144	454149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813436
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13208	NC_012791	GCCAC	2	10	455709	455718	20 %	0 %	20 %	60 %	239813437
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13227	NC_012791	CG	3	6	456443	456448	0 %	0 %	50 %	50 %	239813438
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13232	NC_012791	TCG	2	6	456578	456583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813438
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13235	NC_012791	GGCC	2	8	456786	456793	0 %	0 %	50 %	50 %	239813439
13236	NC_012791	GCG	2	6	456816	456821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813439
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13238	NC_012791	CTG	2	6	456835	456840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813439
13239	NC_012791	GGC	2	6	456868	456873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813439
13240	NC_012791	AGGCC	2	10	456936	456945	20 %	0 %	40 %	40 %	239813439
13241	NC_012791	CGC	2	6	457002	457007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813439
13242	NC_012791	GC	3	6	457066	457071	0 %	0 %	50 %	50 %	239813439
13243	NC_012791	CTC	2	6	457078	457083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813439
13244	NC_012791	GC	3	6	457121	457126	0 %	0 %	50 %	50 %	239813439
13245	NC_012791	CG	3	6	457150	457155	0 %	0 %	50 %	50 %	239813439
13246	NC_012791	GC	3	6	457266	457271	0 %	0 %	50 %	50 %	239813439
13247	NC_012791	GAA	2	6	457294	457299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813439
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13249	NC_012791	GCG	2	6	457316	457321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813439
13250	NC_012791	CT	3	6	457337	457342	0 %	50 %	0 %	50 %	239813439
13251	NC_012791	AC	3	6	457365	457370	50 %	0 %	0 %	50 %	239813439
13252	NC_012791	TCA	2	6	457389	457394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813439
13253	NC_012791	GC	3	6	457420	457425	0 %	0 %	50 %	50 %	239813439
13254	NC_012791	GTG	2	6	457436	457441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813439
13255	NC_012791	GCCC	2	8	457468	457475	0 %	0 %	25 %	75 %	239813439
13256	NC_012791	CGA	2	6	457501	457506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813439
13257	NC_012791	GCA	2	6	457557	457562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813439
13258	NC_012791	CATC	2	8	457566	457573	25 %	25 %	0 %	50 %	239813439
13259	NC_012791	CAG	2	6	457606	457611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813439
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13261	NC_012791	TGCG	2	8	457700	457707	0 %	25 %	50 %	25 %	239813439
13262	NC_012791	GCC	2	6	457726	457731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813439
13263	NC_012791	CGC	2	6	457774	457779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813439
13264	NC_012791	TGA	2	6	457867	457872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813440
13265	NC_012791	GCTG	2	8	457885	457892	0 %	25 %	50 %	25 %	239813440
13266	NC_012791	GCGCC	2	10	457915	457924	0 %	0 %	40 %	60 %	239813440
13267	NC_012791	GCC	3	9	457922	457930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813440
13268	NC_012791	GCT	2	6	457963	457968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813440
13269	NC_012791	GCC	2	6	458001	458006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813440
13270	NC_012791	GCC	2	6	458025	458030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813440
13271	NC_012791	GC	3	6	458036	458041	0 %	0 %	50 %	50 %	239813440
13272	NC_012791	CCCA	2	8	458055	458062	25 %	0 %	0 %	75 %	239813440
13273	NC_012791	CGC	2	6	458090	458095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813440
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13275	NC_012791	CG	4	8	458135	458142	0 %	0 %	50 %	50 %	239813440
13276	NC_012791	GGC	2	6	458195	458200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813440
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13280	NC_012791	CGC	2	6	458257	458262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813440
13281	NC_012791	GCA	2	6	458275	458280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813440
13282	NC_012791	CGC	2	6	458287	458292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813440
13283	NC_012791	CAG	2	6	458303	458308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813440
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13286	NC_012791	CAG	2	6	458543	458548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813440
13287	NC_012791	GCC	2	6	458586	458591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813440
13288	NC_012791	GCC	2	6	458597	458602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813440
13289	NC_012791	CGCC	2	8	458605	458612	0 %	0 %	25 %	75 %	239813440
13290	NC_012791	TTG	2	6	458613	458618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239813440
13291	NC_012791	GAT	2	6	458621	458626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813440
13292	NC_012791	GCC	2	6	458633	458638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813440
13293	NC_012791	CGG	2	6	458695	458700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813440
13294	NC_012791	CAC	2	6	458708	458713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813440
13295	NC_012791	GGC	3	9	458771	458779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813440
13296	NC_012791	TCC	2	6	458982	458987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13297	NC_012791	GCC	2	6	459079	459084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813441
13298	NC_012791	TAC	2	6	459124	459129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813441
13299	NC_012791	TGC	2	6	459140	459145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13300	NC_012791	GCCG	2	8	459273	459280	0 %	0 %	50 %	50 %	239813441
13301	NC_012791	GAA	2	6	459294	459299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813441
13302	NC_012791	GCC	2	6	459306	459311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813441
13303	NC_012791	CTA	2	6	459414	459419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813441
13304	NC_012791	GTC	2	6	459484	459489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13305	NC_012791	CTA	2	6	459591	459596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813441
13306	NC_012791	GCT	2	6	459624	459629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13307	NC_012791	GCA	2	6	459639	459644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813441
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13309	NC_012791	CGGC	2	8	459750	459757	0 %	0 %	50 %	50 %	239813441
13310	NC_012791	CAC	2	6	459786	459791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813441
13311	NC_012791	GC	3	6	459792	459797	0 %	0 %	50 %	50 %	239813441
13312	NC_012791	CAT	2	6	459804	459809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813441
13313	NC_012791	CGC	2	6	459858	459863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813441
13314	NC_012791	GCG	2	6	459908	459913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813441
13315	NC_012791	CAC	2	6	459915	459920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813441
13316	NC_012791	AAG	2	6	459946	459951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813441
13317	NC_012791	GAG	2	6	459991	459996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813441
13318	NC_012791	GTGG	2	8	460008	460015	0 %	25 %	75 %	0 %	239813441
13319	NC_012791	TCA	2	6	460028	460033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813441
13320	NC_012791	ACGGCG	2	12	460037	460048	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	239813441
13321	NC_012791	ACG	2	6	460070	460075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13322	NC_012791	CTTCGC	2	12	460083	460094	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	239813441
13323	NC_012791	CAA	2	6	460095	460100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813441
13324	NC_012791	ATC	2	6	460114	460119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813441
13325	NC_012791	GGT	2	6	460122	460127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813441
13326	NC_012791	CGA	3	9	460134	460142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13327	NC_012791	AGC	2	6	460187	460192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13328	NC_012791	GCG	2	6	460193	460198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813441
13329	NC_012791	AGG	2	6	460238	460243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813441
13330	NC_012791	GCC	2	6	460249	460254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813441
13331	NC_012791	ACC	2	6	460297	460302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813441
13332	NC_012791	GCC	2	6	460328	460333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813441
13333	NC_012791	CCGATC	2	12	460351	460362	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239813441
13334	NC_012791	CGA	2	6	460371	460376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13335	NC_012791	GTG	2	6	460414	460419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813441
13336	NC_012791	GTG	2	6	460489	460494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813441
13337	NC_012791	CG	3	6	460515	460520	0 %	0 %	50 %	50 %	239813441
13338	NC_012791	TCG	2	6	460547	460552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13339	NC_012791	GAA	2	6	460587	460592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813441
13340	NC_012791	ACT	2	6	460622	460627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813441
13341	NC_012791	CGG	2	6	460650	460655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813441
13342	NC_012791	CTG	2	6	460678	460683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13343	NC_012791	CG	3	6	460686	460691	0 %	0 %	50 %	50 %	239813441
13344	NC_012791	CGA	2	6	460734	460739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13345	NC_012791	GCT	2	6	460752	460757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13346	NC_012791	CTA	2	6	460785	460790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813441
13347	NC_012791	CGA	2	6	460797	460802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13348	NC_012791	GGC	2	6	460807	460812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813441
13349	NC_012791	ACC	2	6	460820	460825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813441
13350	NC_012791	CGC	2	6	460826	460831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813441
13351	NC_012791	TCG	2	6	460868	460873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13352	NC_012791	CAC	2	6	460878	460883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813441
13353	NC_012791	CGG	2	6	460908	460913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813441
13354	NC_012791	CG	3	6	460989	460994	0 %	0 %	50 %	50 %	239813441
13355	NC_012791	CACCG	2	10	461010	461019	20 %	0 %	20 %	60 %	239813441
13356	NC_012791	ACG	2	6	461042	461047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13357	NC_012791	CGG	2	6	461130	461135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813441
13358	NC_012791	GCC	2	6	461152	461157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813441
13359	NC_012791	GCG	2	6	461166	461171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813441
13360	NC_012791	TGC	2	6	461186	461191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13361	NC_012791	CGACTA	2	12	461199	461210	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239813441
13362	NC_012791	ACA	2	6	461225	461230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813441
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13364	NC_012791	CTG	2	6	461332	461337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813441
13365	NC_012791	CGC	2	6	461357	461362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813441
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13369	NC_012791	GCGCG	2	10	461502	461511	0 %	0 %	60 %	40 %	239813441
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13388	NC_012791	AAGG	2	8	462102	462109	50 %	0 %	50 %	0 %	239813442
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13427	NC_012791	CATCG	2	10	463299	463308	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13428	NC_012791	CG	3	6	463307	463312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13429	NC_012791	GGAG	2	8	463350	463357	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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13441	NC_012791	GGCC	2	8	463937	463944	0 %	0 %	50 %	50 %	239813444
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13459	NC_012791	GC	3	6	464637	464642	0 %	0 %	50 %	50 %	239813444
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13462	NC_012791	GGC	2	6	464770	464775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13463	NC_012791	CAA	2	6	464821	464826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13464	NC_012791	GCC	2	6	464828	464833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13465	NC_012791	CGCC	2	8	464906	464913	0 %	0 %	25 %	75 %	239813445
13466	NC_012791	ATGG	2	8	464937	464944	25 %	25 %	50 %	0 %	239813445
13467	NC_012791	CGG	2	6	465027	465032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813445
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13471	NC_012791	CTG	2	6	465121	465126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813445
13472	NC_012791	GAA	2	6	465147	465152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813445
13473	NC_012791	TCGA	2	8	465226	465233	25 %	25 %	25 %	25 %	239813445
13474	NC_012791	AAG	2	6	465253	465258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813445
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13478	NC_012791	CAA	2	6	465357	465362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813445
13479	NC_012791	CGGC	2	8	465371	465378	0 %	0 %	50 %	50 %	239813445
13480	NC_012791	GCC	2	6	465420	465425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813445
13481	NC_012791	GCG	2	6	465447	465452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813445
13482	NC_012791	ACC	2	6	465461	465466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813445
13483	NC_012791	GAG	2	6	465478	465483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813445
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13486	NC_012791	GTC	2	6	465673	465678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813445
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13490	NC_012791	GGCG	2	8	465780	465787	0 %	0 %	75 %	25 %	239813445
13491	NC_012791	GCC	2	6	465790	465795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813445
13492	NC_012791	GGT	2	6	465879	465884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813445
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13499	NC_012791	GCC	2	6	466076	466081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813445
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