MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 157715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_012791	GCCG	2	8	345662	345669	0 %	0 %	50 %	50 %	239813343
10003	NC_012791	GC	3	6	345748	345753	0 %	0 %	50 %	50 %	239813343
10004	NC_012791	TGAAC	2	10	345788	345797	40 %	20 %	20 %	20 %	239813343
10005	NC_012791	CTG	2	6	345801	345806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813343
10006	NC_012791	GCT	2	6	345836	345841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813343
10007	NC_012791	CGAG	2	8	345884	345891	25 %	0 %	50 %	25 %	239813343
10008	NC_012791	CGG	2	6	345896	345901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813343
10009	NC_012791	CTG	2	6	345924	345929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813343
10010	NC_012791	CTC	2	6	345954	345959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813343
10011	NC_012791	ATGC	2	8	346023	346030	25 %	25 %	25 %	25 %	239813343
10012	NC_012791	TCT	2	6	346043	346048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813343
10013	NC_012791	TTG	2	6	346096	346101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239813343
10014	NC_012791	TCT	2	6	346175	346180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813343
10015	NC_012791	TGA	2	6	346187	346192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813343
10016	NC_012791	TGCG	2	8	346211	346218	0 %	25 %	50 %	25 %	239813343
10017	NC_012791	GCTC	2	8	346256	346263	0 %	25 %	25 %	50 %	239813343
10018	NC_012791	GGCG	2	8	346296	346303	0 %	0 %	75 %	25 %	239813343
10019	NC_012791	TCG	2	6	346324	346329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813343
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10021	NC_012791	CGC	3	9	346391	346399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813343
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10026	NC_012791	TCT	2	6	346601	346606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813343
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10032	NC_012791	GCA	2	6	346807	346812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813344
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10121	NC_012791	CCATGG	2	12	349801	349812	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239813346
10122	NC_012791	GCC	2	6	349818	349823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813346
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10124	NC_012791	GC	3	6	349847	349852	0 %	0 %	50 %	50 %	239813346
10125	NC_012791	GCGCG	2	10	349874	349883	0 %	0 %	60 %	40 %	239813346
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10141	NC_012791	TCG	2	6	350349	350354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813346
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10232	NC_012791	CTT	2	6	353830	353835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10233	NC_012791	GC	3	6	353842	353847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10243	NC_012791	GC	3	6	354189	354194	0 %	0 %	50 %	50 %	239813349
10244	NC_012791	TGG	2	6	354222	354227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813349
10245	NC_012791	CGC	2	6	354231	354236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813349
10246	NC_012791	GTC	2	6	354244	354249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813349
10247	NC_012791	GCCAG	2	10	354255	354264	20 %	0 %	40 %	40 %	239813349
10248	NC_012791	CGC	2	6	354336	354341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813349
10249	NC_012791	GCT	2	6	354342	354347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813349
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10251	NC_012791	GTC	2	6	354382	354387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813349
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10254	NC_012791	GCC	2	6	354461	354466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813349
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10263	NC_012791	CGCC	3	12	354629	354640	0 %	0 %	25 %	75 %	239813349
10264	NC_012791	TCT	2	6	354684	354689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813349
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10266	NC_012791	GCG	3	9	354701	354709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813349
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10272	NC_012791	GAT	2	6	354940	354945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813349
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10279	NC_012791	GGC	2	6	355193	355198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813350
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10283	NC_012791	TGC	2	6	355276	355281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813350
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10307	NC_012791	AAG	2	6	356356	356361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10308	NC_012791	CG	3	6	356369	356374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10309	NC_012791	TGGA	2	8	356424	356431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10310	NC_012791	CCG	2	6	356473	356478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813351
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10335	NC_012791	CTCG	2	8	357710	357717	0 %	25 %	25 %	50 %	239813352
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10344	NC_012791	AGCA	2	8	357969	357976	50 %	0 %	25 %	25 %	239813352
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10350	NC_012791	GCG	4	12	358105	358116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813352
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10352	NC_012791	GAT	2	6	358124	358129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813352
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10355	NC_012791	CAA	2	6	358244	358249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813352
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10357	NC_012791	CCGA	2	8	358374	358381	25 %	0 %	25 %	50 %	239813352
10358	NC_012791	CAC	2	6	358400	358405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813352
10359	NC_012791	CAA	2	6	358424	358429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813352
10360	NC_012791	TCGA	2	8	358476	358483	25 %	25 %	25 %	25 %	239813352
10361	NC_012791	ACG	2	6	358543	358548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813352
10362	NC_012791	CTA	2	6	358574	358579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813352
10363	NC_012791	CCA	2	6	358585	358590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813352
10364	NC_012791	CCGAGG	2	12	358597	358608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	239813352
10365	NC_012791	CG	3	6	358616	358621	0 %	0 %	50 %	50 %	239813352
10366	NC_012791	TCG	2	6	358639	358644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813352
10367	NC_012791	TGC	2	6	358657	358662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813352
10368	NC_012791	GCC	2	6	358671	358676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813352
10369	NC_012791	TGC	2	6	358702	358707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813352
10370	NC_012791	GCAC	2	8	358750	358757	25 %	0 %	25 %	50 %	239813352
10371	NC_012791	CAC	2	6	358767	358772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813352
10372	NC_012791	ACG	2	6	358816	358821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813352
10373	NC_012791	CTG	2	6	358844	358849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813352
10374	NC_012791	ATCGGC	2	12	358901	358912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239813352
10375	NC_012791	CGC	2	6	358923	358928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813353
10376	NC_012791	GAG	2	6	359024	359029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813353
10377	NC_012791	CTG	2	6	359075	359080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813353
10378	NC_012791	GCG	2	6	359124	359129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813353
10379	NC_012791	ACG	2	6	359148	359153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813353
10380	NC_012791	CGGC	2	8	359233	359240	0 %	0 %	50 %	50 %	239813353
10381	NC_012791	TCG	2	6	359277	359282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813353
10382	NC_012791	GCT	2	6	359332	359337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813353
10383	NC_012791	GCC	2	6	359353	359358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813353
10384	NC_012791	GCC	2	6	359375	359380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813353
10385	NC_012791	GGC	2	6	359422	359427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813353
10386	NC_012791	TTC	2	6	359465	359470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813353
10387	NC_012791	GGC	2	6	359471	359476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813353
10388	NC_012791	CAA	2	6	359494	359499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813353
10389	NC_012791	GCG	2	6	359508	359513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813353
10390	NC_012791	TGC	2	6	359514	359519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813353
10391	NC_012791	GCC	2	6	359528	359533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813353
10392	NC_012791	GC	4	8	359535	359542	0 %	0 %	50 %	50 %	239813353
10393	NC_012791	CGA	2	6	359614	359619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813353
10394	NC_012791	GCC	2	6	359624	359629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813353
10395	NC_012791	CG	4	8	359632	359639	0 %	0 %	50 %	50 %	239813353
10396	NC_012791	TGG	2	6	359648	359653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813353
10397	NC_012791	ACG	2	6	359685	359690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813353
10398	NC_012791	GCG	2	6	359702	359707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813353
10399	NC_012791	CTG	2	6	359708	359713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813353
10400	NC_012791	GC	3	6	359821	359826	0 %	0 %	50 %	50 %	239813353
10401	NC_012791	GCCG	2	8	359857	359864	0 %	0 %	50 %	50 %	239813353
10402	NC_012791	CG	4	8	359882	359889	0 %	0 %	50 %	50 %	239813353
10403	NC_012791	ACCGAC	2	12	359909	359920	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	239813353
10404	NC_012791	GCCAG	2	10	359943	359952	20 %	0 %	40 %	40 %	239813353
10405	NC_012791	CCCG	2	8	360000	360007	0 %	0 %	25 %	75 %	239813354
10406	NC_012791	CGA	2	6	360030	360035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813354
10407	NC_012791	CCG	2	6	360080	360085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813354
10408	NC_012791	CTG	2	6	360088	360093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813354
10409	NC_012791	TGA	2	6	360117	360122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813354
10410	NC_012791	CG	3	6	360129	360134	0 %	0 %	50 %	50 %	239813354
10411	NC_012791	GC	3	6	360147	360152	0 %	0 %	50 %	50 %	239813354
10412	NC_012791	GGC	2	6	360178	360183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813354
10413	NC_012791	CGCCGG	2	12	360219	360230	0 %	0 %	50 %	50 %	239813354
10414	NC_012791	CTT	2	6	360232	360237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813354
10415	NC_012791	CG	3	6	360255	360260	0 %	0 %	50 %	50 %	239813354
10416	NC_012791	CAC	2	6	360292	360297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813354
10417	NC_012791	CCT	2	6	360321	360326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813354
10418	NC_012791	TCG	2	6	360335	360340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813354
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10420	NC_012791	GCC	2	6	360382	360387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813354
10421	NC_012791	GC	3	6	360400	360405	0 %	0 %	50 %	50 %	239813354
10422	NC_012791	ACC	2	6	360449	360454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813354
10423	NC_012791	GCCGC	2	10	360462	360471	0 %	0 %	40 %	60 %	239813354
10424	NC_012791	CCG	2	6	360486	360491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813354
10425	NC_012791	CTG	2	6	360547	360552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813354
10426	NC_012791	CGT	2	6	360597	360602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813354
10427	NC_012791	AGA	2	6	360609	360614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813354
10428	NC_012791	TCT	2	6	360621	360626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813354
10429	NC_012791	GCT	2	6	360645	360650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813354
10430	NC_012791	TCG	2	6	360668	360673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813354
10431	NC_012791	GC	3	6	360683	360688	0 %	0 %	50 %	50 %	239813354
10432	NC_012791	GCC	2	6	360785	360790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813354
10433	NC_012791	TGG	2	6	360795	360800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813354
10434	NC_012791	TCT	2	6	360833	360838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813354
10435	NC_012791	GGC	2	6	360859	360864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813354
10436	NC_012791	CGT	2	6	360885	360890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813354
10437	NC_012791	TGA	2	6	360900	360905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813354
10438	NC_012791	GCCG	2	8	360915	360922	0 %	0 %	50 %	50 %	239813354
10439	NC_012791	TGG	2	6	360962	360967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813354
10440	NC_012791	GGCCG	2	10	360988	360997	0 %	0 %	60 %	40 %	239813354
10441	NC_012791	GCC	2	6	361060	361065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813354
10442	NC_012791	CCT	2	6	361120	361125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10443	NC_012791	CTG	2	6	361196	361201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813355
10444	NC_012791	CCA	2	6	361208	361213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813355
10445	NC_012791	CAC	2	6	361272	361277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813355
10446	NC_012791	CGG	2	6	361408	361413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813355
10447	NC_012791	CGC	2	6	361458	361463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813355
10448	NC_012791	GAC	2	6	361468	361473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813355
10449	NC_012791	CGC	2	6	361476	361481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813355
10450	NC_012791	ACAG	2	8	361497	361504	50 %	0 %	25 %	25 %	239813355
10451	NC_012791	T	6	6	361578	361583	0 %	100 %	0 %	0 %	239813355
10452	NC_012791	GCT	2	6	361602	361607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813355
10453	NC_012791	CGG	2	6	361632	361637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813355
10454	NC_012791	TTC	2	6	361687	361692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813355
10455	NC_012791	CTGATC	2	12	361705	361716	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	239813355
10456	NC_012791	GCA	2	6	361721	361726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813355
10457	NC_012791	GCC	2	6	361768	361773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813355
10458	NC_012791	GC	3	6	361776	361781	0 %	0 %	50 %	50 %	239813355
10459	NC_012791	CCG	2	6	361823	361828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813355
10460	NC_012791	CGA	2	6	361836	361841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813355
10461	NC_012791	CTG	2	6	361852	361857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813355
10462	NC_012791	CGCTG	2	10	361869	361878	0 %	20 %	40 %	40 %	239813355
10463	NC_012791	GGCT	2	8	361912	361919	0 %	25 %	50 %	25 %	239813355
10464	NC_012791	GC	3	6	361971	361976	0 %	0 %	50 %	50 %	239813355
10465	NC_012791	CG	4	8	361994	362001	0 %	0 %	50 %	50 %	239813355
10466	NC_012791	GCC	2	6	362002	362007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813355
10467	NC_012791	GCG	2	6	362012	362017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813355
10468	NC_012791	CAC	2	6	362058	362063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813355
10469	NC_012791	CCGG	2	8	362064	362071	0 %	0 %	50 %	50 %	239813355
10470	NC_012791	GCG	3	9	362108	362116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813355
10471	NC_012791	GC	4	8	362125	362132	0 %	0 %	50 %	50 %	239813355
10472	NC_012791	GCCT	2	8	362137	362144	0 %	25 %	25 %	50 %	239813355
10473	NC_012791	TGG	2	6	362153	362158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813355
10474	NC_012791	CG	3	6	362173	362178	0 %	0 %	50 %	50 %	239813355
10475	NC_012791	CTC	2	6	362185	362190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813355
10476	NC_012791	AGC	2	6	362194	362199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813355
10477	NC_012791	CCGCG	2	10	362220	362229	0 %	0 %	40 %	60 %	239813355
10478	NC_012791	GCC	2	6	362255	362260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813355
10479	NC_012791	GCT	2	6	362298	362303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813355
10480	NC_012791	ACA	2	6	362339	362344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813355
10481	NC_012791	GGT	2	6	362379	362384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813355
10482	NC_012791	GC	3	6	362395	362400	0 %	0 %	50 %	50 %	239813355
10483	NC_012791	GTG	2	6	362416	362421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813355
10484	NC_012791	CCG	2	6	362444	362449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813355
10485	NC_012791	CTG	2	6	362464	362469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813355
10486	NC_012791	CCA	2	6	362474	362479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813355
10487	NC_012791	TGC	2	6	362528	362533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813355
10488	NC_012791	CG	3	6	362555	362560	0 %	0 %	50 %	50 %	239813355
10489	NC_012791	GC	3	6	362566	362571	0 %	0 %	50 %	50 %	239813355
10490	NC_012791	CG	3	6	362598	362603	0 %	0 %	50 %	50 %	239813355
10491	NC_012791	CGA	2	6	362616	362621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813355
10492	NC_012791	GAC	3	9	362635	362643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813355
10493	NC_012791	GCT	2	6	362694	362699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813355
10494	NC_012791	TTC	2	6	362782	362787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813355
10495	NC_012791	GC	4	8	362789	362796	0 %	0 %	50 %	50 %	239813355
10496	NC_012791	GGC	2	6	362847	362852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813355
10497	NC_012791	CGC	2	6	362888	362893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813355
10498	NC_012791	GC	3	6	362896	362901	0 %	0 %	50 %	50 %	239813355
10499	NC_012791	GC	3	6	362940	362945	0 %	0 %	50 %	50 %	239813355
10500	NC_012791	GCT	2	6	362961	362966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813355

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