MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_012668	GTC	2	6	2408772	2408777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608244
46003	NC_012668	GGC	2	6	2408792	2408797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608244
46004	NC_012668	T	7	7	2408806	2408812	0 %	100 %	0 %	0 %	229608244
46005	NC_012668	GCC	2	6	2408862	2408867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608244
46006	NC_012668	ACC	2	6	2408940	2408945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608244
46007	NC_012668	CAC	2	6	2408963	2408968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608244
46008	NC_012668	GCG	2	6	2408989	2408994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608244
46009	NC_012668	CT	3	6	2409045	2409050	0 %	50 %	0 %	50 %	229608244
46010	NC_012668	CCG	2	6	2409094	2409099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608244
46011	NC_012668	TTA	2	6	2409140	2409145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608244
46012	NC_012668	AAC	2	6	2409244	2409249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608244
46013	NC_012668	ATCG	2	8	2409269	2409276	25 %	25 %	25 %	25 %	229608244
46014	NC_012668	ACC	2	6	2409435	2409440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608244
46015	NC_012668	TCG	2	6	2409445	2409450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608244
46016	NC_012668	GTTGG	2	10	2409580	2409589	0 %	40 %	60 %	0 %	229608244
46017	NC_012668	CA	3	6	2409668	2409673	50 %	0 %	0 %	50 %	229608244
46018	NC_012668	AGC	2	6	2409709	2409714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608244
46019	NC_012668	CCTCGC	2	12	2409776	2409787	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	229608244
46020	NC_012668	GC	3	6	2409849	2409854	0 %	0 %	50 %	50 %	229608244
46021	NC_012668	TCAC	2	8	2409916	2409923	25 %	25 %	0 %	50 %	229608244
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46023	NC_012668	CTG	2	6	2410093	2410098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608245
46024	NC_012668	A	6	6	2410117	2410122	100 %	0 %	0 %	0 %	229608245
46025	NC_012668	TGC	2	6	2410148	2410153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608245
46026	NC_012668	GCT	2	6	2410158	2410163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608245
46027	NC_012668	CTG	2	6	2410186	2410191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608245
46028	NC_012668	GCG	2	6	2410216	2410221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608245
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46032	NC_012668	CTG	2	6	2410606	2410611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608245
46033	NC_012668	T	6	6	2410625	2410630	0 %	100 %	0 %	0 %	229608245
46034	NC_012668	TTGC	2	8	2410840	2410847	0 %	50 %	25 %	25 %	229608245
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46038	NC_012668	GTGG	2	8	2410894	2410901	0 %	25 %	75 %	0 %	229608245
46039	NC_012668	TGG	2	6	2410928	2410933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608245
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46042	NC_012668	ACA	2	6	2411093	2411098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608245
46043	NC_012668	TGA	2	6	2411151	2411156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608245
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46045	NC_012668	TGG	2	6	2411280	2411285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608245
46046	NC_012668	GA	3	6	2411306	2411311	50 %	0 %	50 %	0 %	229608245
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46050	NC_012668	CTTGG	2	10	2411480	2411489	0 %	40 %	40 %	20 %	229608245
46051	NC_012668	TGA	2	6	2411577	2411582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608245
46052	NC_012668	ACCG	2	8	2411583	2411590	25 %	0 %	25 %	50 %	229608245
46053	NC_012668	AGC	2	6	2411612	2411617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608245
46054	NC_012668	GATG	2	8	2411697	2411704	25 %	25 %	50 %	0 %	229608245
46055	NC_012668	TCA	2	6	2411745	2411750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608245
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46057	NC_012668	CT	3	6	2411816	2411821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46058	NC_012668	CGCAG	2	10	2411841	2411850	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46059	NC_012668	T	7	7	2411934	2411940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46060	NC_012668	GAA	2	6	2411957	2411962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46061	NC_012668	CG	3	6	2411978	2411983	0 %	0 %	50 %	50 %	229608246
46062	NC_012668	TTG	2	6	2411997	2412002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608246
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46067	NC_012668	TTTC	2	8	2412188	2412195	0 %	75 %	0 %	25 %	229608246
46068	NC_012668	CTA	2	6	2412209	2412214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608246
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46073	NC_012668	GAC	2	6	2412347	2412352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608246
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46086	NC_012668	GTA	2	6	2413005	2413010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46108	NC_012668	CGAT	2	8	2414496	2414503	25 %	25 %	25 %	25 %	229608248
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46112	NC_012668	CGC	2	6	2414605	2414610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46113	NC_012668	CT	3	6	2414639	2414644	0 %	50 %	0 %	50 %	229608249
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46116	NC_012668	CA	3	6	2414780	2414785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46117	NC_012668	T	6	6	2414820	2414825	0 %	100 %	0 %	0 %	229608250
46118	NC_012668	CTG	2	6	2414836	2414841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608250
46119	NC_012668	AGG	2	6	2414892	2414897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229608250
46120	NC_012668	CGC	2	6	2414933	2414938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608251
46121	NC_012668	CTA	2	6	2415022	2415027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608251
46122	NC_012668	TGC	2	6	2415084	2415089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608251
46123	NC_012668	TG	4	8	2415099	2415106	0 %	50 %	50 %	0 %	229608251
46124	NC_012668	GCT	2	6	2415153	2415158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608251
46125	NC_012668	CAT	2	6	2415162	2415167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608251
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46127	NC_012668	GCA	2	6	2415306	2415311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608251
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46131	NC_012668	GCA	2	6	2415643	2415648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608251
46132	NC_012668	CGTG	2	8	2415660	2415667	0 %	25 %	50 %	25 %	229608251
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46134	NC_012668	ACCA	2	8	2415868	2415875	50 %	0 %	0 %	50 %	229608251
46135	NC_012668	CGC	3	9	2415904	2415912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608251
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46144	NC_012668	CG	3	6	2416213	2416218	0 %	0 %	50 %	50 %	229608251
46145	NC_012668	CGG	2	6	2416263	2416268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608251
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46147	NC_012668	CG	3	6	2416412	2416417	0 %	0 %	50 %	50 %	229608251
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46154	NC_012668	ATC	2	6	2416785	2416790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608252
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46160	NC_012668	GA	3	6	2417091	2417096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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46219	NC_012668	TTCA	2	8	2420028	2420035	25 %	50 %	0 %	25 %	229608255
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46232	NC_012668	CGA	2	6	2420930	2420935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608256
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46234	NC_012668	ACGC	2	8	2421065	2421072	25 %	0 %	25 %	50 %	229608256
46235	NC_012668	CGA	2	6	2421078	2421083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608256
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46238	NC_012668	GGC	2	6	2421165	2421170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608256
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46250	NC_012668	CAT	2	6	2421595	2421600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46253	NC_012668	TTA	2	6	2421851	2421856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46259	NC_012668	GCA	2	6	2422060	2422065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608257
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46326	NC_012668	AAT	2	6	2425847	2425852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46327	NC_012668	TTC	2	6	2425924	2425929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46340	NC_012668	TCAA	2	8	2426440	2426447	50 %	25 %	0 %	25 %	229608260
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46468	NC_012668	AACG	2	8	2433425	2433432	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46469	NC_012668	CG	3	6	2433435	2433440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46470	NC_012668	CAT	2	6	2433458	2433463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608267
46471	NC_012668	AAC	2	6	2433474	2433479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608267
46472	NC_012668	ATC	2	6	2433557	2433562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608267
46473	NC_012668	TCA	2	6	2433568	2433573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608267
46474	NC_012668	CAT	3	9	2433578	2433586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608267
46475	NC_012668	CAC	2	6	2433748	2433753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608267
46476	NC_012668	GAA	2	6	2433788	2433793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608267
46477	NC_012668	TGG	2	6	2433889	2433894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608267
46478	NC_012668	CGC	3	9	2433946	2433954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608267
46479	NC_012668	TG	3	6	2434005	2434010	0 %	50 %	50 %	0 %	229608267
46480	NC_012668	GTAA	2	8	2434034	2434041	50 %	25 %	25 %	0 %	229608267
46481	NC_012668	ACC	2	6	2434043	2434048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608267
46482	NC_012668	CT	3	6	2434131	2434136	0 %	50 %	0 %	50 %	229608267
46483	NC_012668	TCGG	2	8	2434464	2434471	0 %	25 %	50 %	25 %	229608267
46484	NC_012668	TCG	2	6	2434501	2434506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608267
46485	NC_012668	TGA	2	6	2434538	2434543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608267
46486	NC_012668	TGA	2	6	2434583	2434588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608267
46487	NC_012668	TTG	2	6	2434599	2434604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608267
46488	NC_012668	CCCA	2	8	2434676	2434683	25 %	0 %	0 %	75 %	229608267
46489	NC_012668	AAT	2	6	2434775	2434780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46490	NC_012668	AAC	2	6	2434797	2434802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46491	NC_012668	AATCA	2	10	2434815	2434824	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46492	NC_012668	TCA	2	6	2434878	2434883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46493	NC_012668	TGA	2	6	2435047	2435052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608268
46494	NC_012668	CAG	2	6	2435057	2435062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608268
46495	NC_012668	AAC	2	6	2435079	2435084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608268
46496	NC_012668	CGC	2	6	2435095	2435100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608268
46497	NC_012668	GTTA	2	8	2435101	2435108	25 %	50 %	25 %	0 %	229608268
46498	NC_012668	TCA	2	6	2435116	2435121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608268
46499	NC_012668	T	6	6	2435143	2435148	0 %	100 %	0 %	0 %	229608268
46500	NC_012668	GTG	2	6	2435202	2435207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608268

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