MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_012668	GCT	2	6	2355990	2355995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608197
45003	NC_012668	AG	3	6	2356260	2356265	50 %	0 %	50 %	0 %	229608197
45004	NC_012668	CG	3	6	2356312	2356317	0 %	0 %	50 %	50 %	229608197
45005	NC_012668	ATC	2	6	2356327	2356332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608197
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45008	NC_012668	GC	3	6	2356417	2356422	0 %	0 %	50 %	50 %	229608197
45009	NC_012668	CGC	2	6	2356456	2356461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608197
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45012	NC_012668	TCTG	2	8	2356692	2356699	0 %	50 %	25 %	25 %	229608198
45013	NC_012668	GCA	2	6	2356746	2356751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608198
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45019	NC_012668	TAC	2	6	2357152	2357157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608199
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45031	NC_012668	TAA	2	6	2357745	2357750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45032	NC_012668	AAAT	2	8	2357761	2357768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45051	NC_012668	CG	3	6	2358813	2358818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45052	NC_012668	CACC	2	8	2358832	2358839	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45053	NC_012668	TC	3	6	2358885	2358890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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45087	NC_012668	GC	3	6	2361150	2361155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45088	NC_012668	T	6	6	2361156	2361161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45089	NC_012668	AGAGTC	2	12	2361185	2361196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	229608203
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45102	NC_012668	TCT	2	6	2361892	2361897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45103	NC_012668	TCCC	2	8	2361921	2361928	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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45105	NC_012668	CAGA	2	8	2362081	2362088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45106	NC_012668	GAA	2	6	2362135	2362140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45235	NC_012668	GA	3	6	2369180	2369185	50 %	0 %	50 %	0 %	229608210
45236	NC_012668	TGC	2	6	2369190	2369195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608210
45237	NC_012668	TCA	2	6	2369196	2369201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608210
45238	NC_012668	CCT	2	6	2369203	2369208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229608210
45239	NC_012668	ATT	2	6	2369292	2369297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45240	NC_012668	TAA	2	6	2369301	2369306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45241	NC_012668	TAAA	2	8	2369384	2369391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45242	NC_012668	GCA	2	6	2369412	2369417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45243	NC_012668	AC	3	6	2369505	2369510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45244	NC_012668	CAC	2	6	2369659	2369664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45245	NC_012668	AC	3	6	2369742	2369747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45246	NC_012668	T	6	6	2369973	2369978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45247	NC_012668	A	6	6	2370041	2370046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45248	NC_012668	T	6	6	2370087	2370092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45249	NC_012668	A	7	7	2370119	2370125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45250	NC_012668	TTC	2	6	2370153	2370158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608211
45251	NC_012668	GTC	2	6	2370168	2370173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608211
45252	NC_012668	GCC	3	9	2370178	2370186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608211
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45254	NC_012668	AGCCA	2	10	2370242	2370251	40 %	0 %	20 %	40 %	229608211
45255	NC_012668	ATC	2	6	2370253	2370258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608211
45256	NC_012668	GTC	2	6	2370261	2370266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608211
45257	NC_012668	ATG	2	6	2370388	2370393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608211
45258	NC_012668	GCG	2	6	2370595	2370600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608211
45259	NC_012668	CAC	2	6	2370636	2370641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608211
45260	NC_012668	AAT	2	6	2370658	2370663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608211
45261	NC_012668	GA	3	6	2370673	2370678	50 %	0 %	50 %	0 %	229608211
45262	NC_012668	TTC	2	6	2370815	2370820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608212
45263	NC_012668	ACC	2	6	2370848	2370853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608212
45264	NC_012668	GC	3	6	2370940	2370945	0 %	0 %	50 %	50 %	229608212
45265	NC_012668	TCA	2	6	2371032	2371037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608212
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45268	NC_012668	CCA	2	6	2371173	2371178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608212
45269	NC_012668	AAT	2	6	2371187	2371192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608212
45270	NC_012668	TGC	2	6	2371204	2371209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608212
45271	NC_012668	GCT	2	6	2371216	2371221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608212
45272	NC_012668	CGC	2	6	2371253	2371258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608212
45273	NC_012668	ATC	2	6	2371262	2371267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608212
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45288	NC_012668	GACG	2	8	2372125	2372132	25 %	0 %	50 %	25 %	229608212
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45291	NC_012668	CAC	2	6	2372221	2372226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608212
45292	NC_012668	GC	3	6	2372254	2372259	0 %	0 %	50 %	50 %	229608212
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45296	NC_012668	T	6	6	2372416	2372421	0 %	100 %	0 %	0 %	229608212
45297	NC_012668	TGGT	2	8	2372532	2372539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45298	NC_012668	CGGTAG	2	12	2372669	2372680	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	229608213
45299	NC_012668	GA	3	6	2372777	2372782	50 %	0 %	50 %	0 %	229608213
45300	NC_012668	GGCG	2	8	2372803	2372810	0 %	0 %	75 %	25 %	229608213
45301	NC_012668	TGC	2	6	2372831	2372836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608213
45302	NC_012668	TTGG	2	8	2372951	2372958	0 %	50 %	50 %	0 %	229608213
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45304	NC_012668	CCA	2	6	2373041	2373046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608213
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45306	NC_012668	AAT	2	6	2373163	2373168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608213
45307	NC_012668	CGT	2	6	2373170	2373175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608213
45308	NC_012668	ATC	2	6	2373199	2373204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608213
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45310	NC_012668	AGCA	2	8	2373348	2373355	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45311	NC_012668	TAA	2	6	2373408	2373413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45312	NC_012668	T	8	8	2373728	2373735	0 %	100 %	0 %	0 %	229608214
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45317	NC_012668	CTACT	2	10	2374105	2374114	20 %	40 %	0 %	40 %	229608214
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45319	NC_012668	GATTTC	2	12	2374282	2374293	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229608214
45320	NC_012668	GCT	2	6	2374296	2374301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608214
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45323	NC_012668	GTG	2	6	2374417	2374422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608214
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45332	NC_012668	CGG	2	6	2374974	2374979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608214
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45338	NC_012668	TTGA	2	8	2375206	2375213	25 %	50 %	25 %	0 %	229608214
45339	NC_012668	GC	3	6	2375215	2375220	0 %	0 %	50 %	50 %	229608214
45340	NC_012668	AAG	2	6	2375288	2375293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608214
45341	NC_012668	TGG	2	6	2375335	2375340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608214
45342	NC_012668	T	6	6	2375412	2375417	0 %	100 %	0 %	0 %	229608214
45343	NC_012668	A	6	6	2375452	2375457	100 %	0 %	0 %	0 %	229608214
45344	NC_012668	GCAC	2	8	2375521	2375528	25 %	0 %	25 %	50 %	229608214
45345	NC_012668	GAT	2	6	2375647	2375652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608214
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45347	NC_012668	CAATAC	2	12	2375773	2375784	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	229608214
45348	NC_012668	TGA	2	6	2375928	2375933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608214
45349	NC_012668	CGA	2	6	2375989	2375994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608215
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45351	NC_012668	AACC	2	8	2376024	2376031	50 %	0 %	0 %	50 %	229608215
45352	NC_012668	GAT	2	6	2376095	2376100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608215
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45354	NC_012668	ATC	2	6	2376257	2376262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608215
45355	NC_012668	TGA	2	6	2376285	2376290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608215
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45458	NC_012668	CAA	2	6	2381355	2381360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608220
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45463	NC_012668	CCAA	2	8	2381708	2381715	50 %	0 %	0 %	50 %	229608220
45464	NC_012668	CTTG	2	8	2381819	2381826	0 %	50 %	25 %	25 %	229608220
45465	NC_012668	GTG	2	6	2381849	2381854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608220
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45468	NC_012668	TA	3	6	2382000	2382005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45469	NC_012668	TGGA	2	8	2382025	2382032	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45470	NC_012668	TG	3	6	2382044	2382049	0 %	50 %	50 %	0 %	229608221
45471	NC_012668	TCA	2	6	2382120	2382125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608221
45472	NC_012668	GATT	3	12	2382219	2382230	25 %	50 %	25 %	0 %	229608221
45473	NC_012668	CGC	2	6	2382310	2382315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608221
45474	NC_012668	GGC	2	6	2382323	2382328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608221
45475	NC_012668	TTCT	2	8	2382330	2382337	0 %	75 %	0 %	25 %	229608221
45476	NC_012668	GAA	2	6	2382365	2382370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608221
45477	NC_012668	CTG	2	6	2382407	2382412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608221
45478	NC_012668	TGC	2	6	2382480	2382485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608221
45479	NC_012668	GC	3	6	2382484	2382489	0 %	0 %	50 %	50 %	229608221
45480	NC_012668	AGC	2	6	2382504	2382509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608221
45481	NC_012668	CGC	2	6	2382512	2382517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608221
45482	NC_012668	CAC	3	9	2382526	2382534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608221
45483	NC_012668	CGCA	2	8	2382546	2382553	25 %	0 %	25 %	50 %	229608221
45484	NC_012668	CCT	2	6	2382557	2382562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229608221
45485	NC_012668	TGA	2	6	2382580	2382585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608221
45486	NC_012668	CCA	2	6	2382642	2382647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608221
45487	NC_012668	TGC	2	6	2382709	2382714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608221
45488	NC_012668	AGC	2	6	2382750	2382755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608221
45489	NC_012668	GGC	2	6	2382767	2382772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608221
45490	NC_012668	TGGG	2	8	2382792	2382799	0 %	25 %	75 %	0 %	229608221
45491	NC_012668	TGA	2	6	2382826	2382831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608221
45492	NC_012668	GCC	2	6	2382916	2382921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608221
45493	NC_012668	TGA	3	9	2383008	2383016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608221
45494	NC_012668	AGA	2	6	2383048	2383053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608221
45495	NC_012668	CATGC	2	10	2383071	2383080	20 %	20 %	20 %	40 %	229608221
45496	NC_012668	GAGCT	2	10	2383172	2383181	20 %	20 %	40 %	20 %	229608221
45497	NC_012668	GAGCT	2	10	2383226	2383235	20 %	20 %	40 %	20 %	229608221
45498	NC_012668	CAC	2	6	2383250	2383255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608222
45499	NC_012668	GCC	2	6	2383273	2383278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608222
45500	NC_012668	CGT	2	6	2383305	2383310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608222

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