MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_012668	CTT	2	6	2330552	2330557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608174
44502	NC_012668	AAT	2	6	2330566	2330571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608174
44503	NC_012668	CAG	2	6	2330604	2330609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608174
44504	NC_012668	CAA	2	6	2330642	2330647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608174
44505	NC_012668	ACA	2	6	2330665	2330670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608174
44506	NC_012668	ACA	2	6	2330699	2330704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44507	NC_012668	GGGC	2	8	2330715	2330722	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44508	NC_012668	TAGGCA	2	12	2330803	2330814	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44509	NC_012668	A	6	6	2330820	2330825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44510	NC_012668	CAT	3	9	2330923	2330931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608175
44511	NC_012668	GTAC	2	8	2331102	2331109	25 %	25 %	25 %	25 %	229608175
44512	NC_012668	ATC	2	6	2331129	2331134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608175
44513	NC_012668	TCA	2	6	2331141	2331146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608175
44514	NC_012668	TTGG	2	8	2331231	2331238	0 %	50 %	50 %	0 %	229608175
44515	NC_012668	CTGG	2	8	2331409	2331416	0 %	25 %	50 %	25 %	229608175
44516	NC_012668	TTC	2	6	2331464	2331469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608175
44517	NC_012668	TTTCGC	2	12	2331517	2331528	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	229608175
44518	NC_012668	TTC	2	6	2331627	2331632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608175
44519	NC_012668	TTC	2	6	2331716	2331721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608175
44520	NC_012668	CAG	2	6	2331821	2331826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608175
44521	NC_012668	AGA	2	6	2331852	2331857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608175
44522	NC_012668	CTT	2	6	2331874	2331879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608175
44523	NC_012668	ACC	2	6	2331905	2331910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608175
44524	NC_012668	ACG	2	6	2331911	2331916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608175
44525	NC_012668	ATGTCG	2	12	2332008	2332019	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229608175
44526	NC_012668	TGC	2	6	2332025	2332030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608175
44527	NC_012668	GCG	2	6	2332043	2332048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608175
44528	NC_012668	TTC	2	6	2332145	2332150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608175
44529	NC_012668	GCT	2	6	2332156	2332161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608175
44530	NC_012668	TCT	2	6	2332177	2332182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608175
44531	NC_012668	CGCTTG	2	12	2332226	2332237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608175
44532	NC_012668	TCAG	2	8	2332242	2332249	25 %	25 %	25 %	25 %	229608175
44533	NC_012668	CGC	2	6	2332301	2332306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608175
44534	NC_012668	CTT	2	6	2332372	2332377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608175
44535	NC_012668	GGC	2	6	2332394	2332399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608175
44536	NC_012668	CGG	2	6	2332401	2332406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608175
44537	NC_012668	TCA	2	6	2332422	2332427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608175
44538	NC_012668	AGCCAG	2	12	2332433	2332444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608175
44539	NC_012668	ACG	2	6	2332502	2332507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608175
44540	NC_012668	CAC	2	6	2332511	2332516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608175
44541	NC_012668	CGG	2	6	2332521	2332526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608175
44542	NC_012668	CGA	2	6	2332531	2332536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608175
44543	NC_012668	CCA	2	6	2332591	2332596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608175
44544	NC_012668	GGT	2	6	2332610	2332615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608175
44545	NC_012668	GTT	2	6	2332640	2332645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608175
44546	NC_012668	T	6	6	2332742	2332747	0 %	100 %	0 %	0 %	229608175
44547	NC_012668	T	6	6	2332768	2332773	0 %	100 %	0 %	0 %	229608175
44548	NC_012668	GC	3	6	2332781	2332786	0 %	0 %	50 %	50 %	229608175
44549	NC_012668	ATG	2	6	2332905	2332910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608175
44550	NC_012668	GCG	2	6	2332932	2332937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608175
44551	NC_012668	TCA	2	6	2332974	2332979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608175
44552	NC_012668	GGA	2	6	2333043	2333048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229608175
44553	NC_012668	GTTG	2	8	2333051	2333058	0 %	50 %	50 %	0 %	229608175
44554	NC_012668	CAG	2	6	2333093	2333098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608175
44555	NC_012668	GCC	2	6	2333238	2333243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608175
44556	NC_012668	TCGA	2	8	2333256	2333263	25 %	25 %	25 %	25 %	229608175
44557	NC_012668	T	6	6	2333399	2333404	0 %	100 %	0 %	0 %	229608175
44558	NC_012668	AGTC	2	8	2333673	2333680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44559	NC_012668	A	6	6	2333713	2333718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44560	NC_012668	GTT	2	6	2333838	2333843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44561	NC_012668	T	6	6	2333842	2333847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44562	NC_012668	GC	3	6	2333895	2333900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44563	NC_012668	A	6	6	2334011	2334016	100 %	0 %	0 %	0 %	229608176
44564	NC_012668	TGG	2	6	2334038	2334043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608176
44565	NC_012668	TGG	2	6	2334154	2334159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608176
44566	NC_012668	GC	3	6	2334182	2334187	0 %	0 %	50 %	50 %	229608176
44567	NC_012668	ATG	2	6	2334327	2334332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608176
44568	NC_012668	CGG	2	6	2334412	2334417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608176
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44575	NC_012668	T	6	6	2334731	2334736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44576	NC_012668	T	8	8	2334813	2334820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44577	NC_012668	T	6	6	2334859	2334864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44578	NC_012668	CAAT	2	8	2334866	2334873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44579	NC_012668	ATC	2	6	2334885	2334890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44581	NC_012668	T	7	7	2334911	2334917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44591	NC_012668	GTAC	2	8	2335773	2335780	25 %	25 %	25 %	25 %	229608177
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44601	NC_012668	TC	3	6	2336197	2336202	0 %	50 %	0 %	50 %	229608177
44602	NC_012668	ACG	2	6	2336224	2336229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608177
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44605	NC_012668	CTG	2	6	2336331	2336336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608177
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44608	NC_012668	CT	3	6	2336520	2336525	0 %	50 %	0 %	50 %	229608177
44609	NC_012668	GAT	2	6	2336556	2336561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608177
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44612	NC_012668	CGT	2	6	2336640	2336645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608177
44613	NC_012668	CCG	2	6	2336657	2336662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608177
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44615	NC_012668	TAC	2	6	2336694	2336699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608177
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44618	NC_012668	GC	3	6	2336786	2336791	0 %	0 %	50 %	50 %	229608177
44619	NC_012668	AAGA	2	8	2336880	2336887	75 %	0 %	25 %	0 %	229608177
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44657	NC_012668	TTGAG	2	10	2338985	2338994	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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44850	NC_012668	AC	3	6	2347999	2348004	50 %	0 %	0 %	50 %	229608189
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44973	NC_012668	TATCG	2	10	2354777	2354786	20 %	40 %	20 %	20 %	229608196
44974	NC_012668	GAT	2	6	2354795	2354800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608196
44975	NC_012668	GTGG	2	8	2354829	2354836	0 %	25 %	75 %	0 %	229608196
44976	NC_012668	TGC	2	6	2354863	2354868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608196
44977	NC_012668	GCG	2	6	2354895	2354900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608196
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44981	NC_012668	AAT	2	6	2355100	2355105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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