MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_012668	TCACGA	2	12	2279375	2279386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	229608128
43502	NC_012668	T	6	6	2279425	2279430	0 %	100 %	0 %	0 %	229608128
43503	NC_012668	ATT	2	6	2279515	2279520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608128
43504	NC_012668	TGGT	2	8	2279655	2279662	0 %	50 %	50 %	0 %	229608128
43505	NC_012668	GAT	2	6	2279685	2279690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608128
43506	NC_012668	TGG	2	6	2279734	2279739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608128
43507	NC_012668	ATA	2	6	2279747	2279752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608128
43508	NC_012668	GGC	2	6	2279800	2279805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608128
43509	NC_012668	TCTT	2	8	2279900	2279907	0 %	75 %	0 %	25 %	229608128
43510	NC_012668	AACA	2	8	2279944	2279951	75 %	0 %	0 %	25 %	229608128
43511	NC_012668	CAA	2	6	2279966	2279971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608128
43512	NC_012668	TCAA	2	8	2279999	2280006	50 %	25 %	0 %	25 %	229608128
43513	NC_012668	GT	3	6	2280036	2280041	0 %	50 %	50 %	0 %	229608128
43514	NC_012668	TACCCT	2	12	2280054	2280065	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	229608128
43515	NC_012668	CAC	2	6	2280109	2280114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608128
43516	NC_012668	TGT	2	6	2280144	2280149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608128
43517	NC_012668	T	6	6	2280243	2280248	0 %	100 %	0 %	0 %	229608128
43518	NC_012668	TCT	2	6	2280287	2280292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608128
43519	NC_012668	CT	3	6	2280326	2280331	0 %	50 %	0 %	50 %	229608128
43520	NC_012668	A	6	6	2280342	2280347	100 %	0 %	0 %	0 %	229608128
43521	NC_012668	TGA	2	6	2280438	2280443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608128
43522	NC_012668	GAT	2	6	2280485	2280490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608128
43523	NC_012668	TTG	2	6	2280509	2280514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608128
43524	NC_012668	TTC	2	6	2280532	2280537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608128
43525	NC_012668	TGC	2	6	2280559	2280564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608128
43526	NC_012668	TGC	2	6	2280645	2280650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43527	NC_012668	TAG	2	6	2280652	2280657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43528	NC_012668	TTG	2	6	2280665	2280670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43529	NC_012668	TCTA	2	8	2280804	2280811	25 %	50 %	0 %	25 %	229608129
43530	NC_012668	AAC	2	6	2280820	2280825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608129
43531	NC_012668	TGC	2	6	2280888	2280893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608129
43532	NC_012668	CTT	2	6	2280897	2280902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608129
43533	NC_012668	T	6	6	2280910	2280915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43534	NC_012668	AATT	2	8	2280924	2280931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43535	NC_012668	ATC	2	6	2280986	2280991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43536	NC_012668	T	6	6	2281003	2281008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43537	NC_012668	TTA	2	6	2281053	2281058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608130
43538	NC_012668	TGA	2	6	2281107	2281112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608130
43539	NC_012668	A	8	8	2281142	2281149	100 %	0 %	0 %	0 %	229608130
43540	NC_012668	GTT	2	6	2281212	2281217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608130
43541	NC_012668	GTT	2	6	2281255	2281260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608130
43542	NC_012668	TC	3	6	2281297	2281302	0 %	50 %	0 %	50 %	229608130
43543	NC_012668	AAGA	2	8	2281303	2281310	75 %	0 %	25 %	0 %	229608130
43544	NC_012668	TA	3	6	2281441	2281446	50 %	50 %	0 %	0 %	229608130
43545	NC_012668	AGA	2	6	2281536	2281541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608130
43546	NC_012668	AAC	2	6	2281592	2281597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608131
43547	NC_012668	GAA	2	6	2281627	2281632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608131
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43549	NC_012668	TCA	2	6	2281724	2281729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608131
43550	NC_012668	AAT	2	6	2281751	2281756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608131
43551	NC_012668	GAA	2	6	2281775	2281780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608131
43552	NC_012668	TCGG	2	8	2281799	2281806	0 %	25 %	50 %	25 %	229608131
43553	NC_012668	GCC	2	6	2281891	2281896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608131
43554	NC_012668	GA	3	6	2281917	2281922	50 %	0 %	50 %	0 %	229608131
43555	NC_012668	T	6	6	2281976	2281981	0 %	100 %	0 %	0 %	229608131
43556	NC_012668	AGC	2	6	2282138	2282143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608131
43557	NC_012668	GAAT	2	8	2282152	2282159	50 %	25 %	25 %	0 %	229608131
43558	NC_012668	ATA	2	6	2282213	2282218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608131
43559	NC_012668	AAG	2	6	2282301	2282306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608131
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43561	NC_012668	TTG	2	6	2282379	2282384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608131
43562	NC_012668	TC	3	6	2282395	2282400	0 %	50 %	0 %	50 %	229608131
43563	NC_012668	CTT	2	6	2282456	2282461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608131
43564	NC_012668	AGCT	2	8	2282598	2282605	25 %	25 %	25 %	25 %	229608131
43565	NC_012668	TAG	2	6	2282743	2282748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608131
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43567	NC_012668	ATGA	2	8	2283048	2283055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43568	NC_012668	TTA	2	6	2283081	2283086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43569	NC_012668	A	6	6	2283104	2283109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43570	NC_012668	AAAAG	2	10	2283136	2283145	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43571	NC_012668	A	6	6	2283211	2283216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43572	NC_012668	TCG	2	6	2283230	2283235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43573	NC_012668	ATT	2	6	2283239	2283244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43574	NC_012668	AGA	2	6	2283310	2283315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608132
43575	NC_012668	GAA	2	6	2283365	2283370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608132
43576	NC_012668	TTTG	2	8	2283385	2283392	0 %	75 %	25 %	0 %	229608132
43577	NC_012668	TGT	2	6	2283417	2283422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608132
43578	NC_012668	GCT	2	6	2283439	2283444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608132
43579	NC_012668	TGA	2	6	2283478	2283483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608132
43580	NC_012668	GCA	2	6	2283504	2283509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608132
43581	NC_012668	TTGC	2	8	2283555	2283562	0 %	50 %	25 %	25 %	229608132
43582	NC_012668	GGAAT	2	10	2283575	2283584	40 %	20 %	40 %	0 %	229608132
43583	NC_012668	GTT	2	6	2283598	2283603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608132
43584	NC_012668	CAAA	2	8	2283680	2283687	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43585	NC_012668	AAT	2	6	2283693	2283698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43586	NC_012668	GATT	2	8	2283707	2283714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43587	NC_012668	AAT	2	6	2283775	2283780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43588	NC_012668	AAACAA	2	12	2283809	2283820	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43589	NC_012668	TTTA	2	8	2283889	2283896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43590	NC_012668	CAG	2	6	2283919	2283924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608133
43591	NC_012668	GTA	2	6	2283973	2283978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608133
43592	NC_012668	CAT	2	6	2283991	2283996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608133
43593	NC_012668	TAAA	3	12	2284132	2284143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43594	NC_012668	GTG	2	6	2284177	2284182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43595	NC_012668	AGC	2	6	2284183	2284188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43596	NC_012668	TCA	3	9	2284221	2284229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43597	NC_012668	CTG	3	9	2284269	2284277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43598	NC_012668	AAT	2	6	2284348	2284353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43599	NC_012668	ACT	2	6	2284371	2284376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43600	NC_012668	GGC	2	6	2284391	2284396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43601	NC_012668	AGTG	2	8	2284398	2284405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43602	NC_012668	ATAG	2	8	2284419	2284426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43603	NC_012668	GAAC	2	8	2284443	2284450	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43604	NC_012668	TGC	2	6	2284653	2284658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608135
43605	NC_012668	GCA	2	6	2284717	2284722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608135
43606	NC_012668	TCAT	2	8	2284731	2284738	25 %	50 %	0 %	25 %	229608135
43607	NC_012668	AGC	2	6	2284752	2284757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608135
43608	NC_012668	ACT	2	6	2284776	2284781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608135
43609	NC_012668	ATG	3	9	2284796	2284804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608135
43610	NC_012668	CTT	2	6	2284893	2284898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608135
43611	NC_012668	CAA	2	6	2284931	2284936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608135
43612	NC_012668	TTGCC	2	10	2285022	2285031	0 %	40 %	20 %	40 %	229608135
43613	NC_012668	TG	3	6	2285066	2285071	0 %	50 %	50 %	0 %	229608135
43614	NC_012668	ATC	2	6	2285154	2285159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608135
43615	NC_012668	A	6	6	2285256	2285261	100 %	0 %	0 %	0 %	229608135
43616	NC_012668	TG	3	6	2285274	2285279	0 %	50 %	50 %	0 %	229608135
43617	NC_012668	GAGTAA	2	12	2285284	2285295	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	229608135
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43620	NC_012668	CAA	2	6	2285476	2285481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608135
43621	NC_012668	CAA	2	6	2285483	2285488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608135
43622	NC_012668	AGC	2	6	2285535	2285540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608135
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43642	NC_012668	CT	3	6	2286311	2286316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43643	NC_012668	T	6	6	2286337	2286342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43644	NC_012668	TAA	2	6	2286398	2286403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43645	NC_012668	CGT	2	6	2286490	2286495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608136
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43659	NC_012668	T	7	7	2287848	2287854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43660	NC_012668	CTG	2	6	2287884	2287889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608137
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43688	NC_012668	ATT	2	6	2289062	2289067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43691	NC_012668	TCA	2	6	2289127	2289132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43693	NC_012668	CACT	2	8	2289184	2289191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43694	NC_012668	GCT	2	6	2289200	2289205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43718	NC_012668	ATCTT	2	10	2290834	2290843	20 %	60 %	0 %	20 %	229608139
43719	NC_012668	TTTC	2	8	2290969	2290976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43720	NC_012668	TGT	2	6	2290983	2290988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43721	NC_012668	GAGG	2	8	2291000	2291007	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43722	NC_012668	TGA	2	6	2291026	2291031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43723	NC_012668	ATC	2	6	2291037	2291042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43724	NC_012668	A	6	6	2291136	2291141	100 %	0 %	0 %	0 %	229608140
43725	NC_012668	AAAG	2	8	2291222	2291229	75 %	0 %	25 %	0 %	229608140
43726	NC_012668	CTG	2	6	2291316	2291321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608140
43727	NC_012668	TGG	2	6	2291378	2291383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608140
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43729	NC_012668	GT	3	6	2291479	2291484	0 %	50 %	50 %	0 %	229608140
43730	NC_012668	TTA	2	6	2291519	2291524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608140
43731	NC_012668	GCCAAA	2	12	2291529	2291540	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	229608140
43732	NC_012668	GCAG	2	8	2291576	2291583	25 %	0 %	50 %	25 %	229608140
43733	NC_012668	GCT	2	6	2291611	2291616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608140
43734	NC_012668	TGG	2	6	2291674	2291679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608140
43735	NC_012668	GAA	2	6	2291739	2291744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608140
43736	NC_012668	AACG	2	8	2291829	2291836	50 %	0 %	25 %	25 %	229608140
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43856	NC_012668	CAA	2	6	2297754	2297759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608144
43857	NC_012668	GTT	2	6	2297822	2297827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608144
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43882	NC_012668	TGGT	2	8	2299425	2299432	0 %	50 %	50 %	0 %	229608145
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43969	NC_012668	T	7	7	2303974	2303980	0 %	100 %	0 %	0 %	229608148
43970	NC_012668	TTC	2	6	2304074	2304079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608148
43971	NC_012668	CACC	2	8	2304112	2304119	25 %	0 %	0 %	75 %	229608148
43972	NC_012668	CCAA	2	8	2304154	2304161	50 %	0 %	0 %	50 %	229608148
43973	NC_012668	CAT	2	6	2304230	2304235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608148
43974	NC_012668	ATC	3	9	2304243	2304251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608148
43975	NC_012668	ACTG	2	8	2304305	2304312	25 %	25 %	25 %	25 %	229608148
43976	NC_012668	ACC	2	6	2304431	2304436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608148
43977	NC_012668	CAT	2	6	2304463	2304468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608148
43978	NC_012668	TCA	2	6	2304486	2304491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608148
43979	NC_012668	CG	3	6	2304494	2304499	0 %	0 %	50 %	50 %	229608148
43980	NC_012668	C	6	6	2304509	2304514	0 %	0 %	0 %	100 %	229608148
43981	NC_012668	ACT	2	6	2304740	2304745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608148
43982	NC_012668	CCG	2	6	2304750	2304755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608148
43983	NC_012668	CCA	2	6	2304822	2304827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608149
43984	NC_012668	GTC	2	6	2304857	2304862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608149
43985	NC_012668	TCAA	2	8	2304929	2304936	50 %	25 %	0 %	25 %	229608149
43986	NC_012668	TCT	2	6	2304992	2304997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608149
43987	NC_012668	AAT	2	6	2305072	2305077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608149
43988	NC_012668	TC	4	8	2305106	2305113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43989	NC_012668	GCT	2	6	2305182	2305187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608150
43990	NC_012668	ACTTT	2	10	2305191	2305200	20 %	60 %	0 %	20 %	229608150
43991	NC_012668	GAA	2	6	2305244	2305249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608150
43992	NC_012668	GTAA	2	8	2305252	2305259	50 %	25 %	25 %	0 %	229608150
43993	NC_012668	TGG	2	6	2305414	2305419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608150
43994	NC_012668	TCA	2	6	2305465	2305470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608150
43995	NC_012668	GAA	2	6	2305508	2305513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608150
43996	NC_012668	TGAGC	2	10	2305551	2305560	20 %	20 %	40 %	20 %	229608150
43997	NC_012668	ACC	2	6	2305604	2305609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608150
43998	NC_012668	TG	3	6	2305638	2305643	0 %	50 %	50 %	0 %	229608150
43999	NC_012668	AAG	2	6	2305704	2305709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608150
44000	NC_012668	GACC	2	8	2305723	2305730	25 %	0 %	25 %	50 %	229608150

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