MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_012668	GGC	2	6	2227741	2227746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608089
42502	NC_012668	CTTC	2	8	2227752	2227759	0 %	50 %	0 %	50 %	229608089
42503	NC_012668	TCC	2	6	2227835	2227840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229608089
42504	NC_012668	CCG	2	6	2227872	2227877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608089
42505	NC_012668	GCC	2	6	2227880	2227885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608089
42506	NC_012668	TCA	2	6	2227905	2227910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608089
42507	NC_012668	GAT	2	6	2227918	2227923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608089
42508	NC_012668	GATG	2	8	2228008	2228015	25 %	25 %	50 %	0 %	229608089
42509	NC_012668	ACA	2	6	2228094	2228099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608089
42510	NC_012668	GCA	2	6	2228133	2228138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608089
42511	NC_012668	GAA	2	6	2228153	2228158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608089
42512	NC_012668	AAG	2	6	2228163	2228168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608089
42513	NC_012668	CTC	2	6	2228188	2228193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229608089
42514	NC_012668	TTC	2	6	2228204	2228209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608089
42515	NC_012668	ATGGA	2	10	2228259	2228268	40 %	20 %	40 %	0 %	229608089
42516	NC_012668	A	6	6	2228291	2228296	100 %	0 %	0 %	0 %	229608089
42517	NC_012668	CAA	2	6	2228347	2228352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608089
42518	NC_012668	CAC	2	6	2228410	2228415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608089
42519	NC_012668	TGTT	2	8	2228469	2228476	0 %	75 %	25 %	0 %	229608089
42520	NC_012668	ATC	2	6	2228478	2228483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608089
42521	NC_012668	GTCA	2	8	2228497	2228504	25 %	25 %	25 %	25 %	229608089
42522	NC_012668	CTG	2	6	2228534	2228539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608089
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42524	NC_012668	ACTGT	2	10	2228594	2228603	20 %	40 %	20 %	20 %	229608089
42525	NC_012668	GAT	2	6	2228608	2228613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608089
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42527	NC_012668	TGA	2	6	2228673	2228678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608089
42528	NC_012668	C	6	6	2228730	2228735	0 %	0 %	0 %	100 %	229608089
42529	NC_012668	CTC	2	6	2228870	2228875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229608089
42530	NC_012668	AAG	2	6	2228960	2228965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42531	NC_012668	CGA	2	6	2229006	2229011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42532	NC_012668	ACT	2	6	2229019	2229024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42533	NC_012668	AAT	2	6	2229067	2229072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42534	NC_012668	CAT	2	6	2229076	2229081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42535	NC_012668	ATCA	2	8	2229087	2229094	50 %	25 %	0 %	25 %	229608090
42536	NC_012668	ATT	2	6	2229206	2229211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608090
42537	NC_012668	GTGA	2	8	2229233	2229240	25 %	25 %	50 %	0 %	229608090
42538	NC_012668	AT	3	6	2229369	2229374	50 %	50 %	0 %	0 %	229608090
42539	NC_012668	GAA	2	6	2229485	2229490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608090
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42542	NC_012668	ATCC	2	8	2229614	2229621	25 %	25 %	0 %	50 %	229608090
42543	NC_012668	ACT	2	6	2229633	2229638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608090
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42546	NC_012668	ATA	2	6	2229768	2229773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608090
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42550	NC_012668	TTA	2	6	2229903	2229908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608090
42551	NC_012668	A	6	6	2230020	2230025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42552	NC_012668	GCC	2	6	2230026	2230031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42553	NC_012668	GGC	2	6	2230038	2230043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42554	NC_012668	GCAG	2	8	2230078	2230085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42555	NC_012668	TAG	2	6	2230241	2230246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608091
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42568	NC_012668	AAT	2	6	2230958	2230963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42569	NC_012668	A	6	6	2231027	2231032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42570	NC_012668	ATTC	2	8	2231046	2231053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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42572	NC_012668	TC	3	6	2231091	2231096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42573	NC_012668	TTC	2	6	2231109	2231114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42574	NC_012668	ATT	2	6	2231146	2231151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42575	NC_012668	GTT	2	6	2231161	2231166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42578	NC_012668	ATC	2	6	2231250	2231255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42584	NC_012668	AAG	2	6	2231511	2231516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608092
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42591	NC_012668	GTA	2	6	2231840	2231845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608092
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42602	NC_012668	CGGT	2	8	2232403	2232410	0 %	25 %	50 %	25 %	229608093
42603	NC_012668	ATG	3	9	2232445	2232453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608093
42604	NC_012668	TCTT	2	8	2232460	2232467	0 %	75 %	0 %	25 %	229608093
42605	NC_012668	CAG	2	6	2232561	2232566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608093
42606	NC_012668	GAT	2	6	2232576	2232581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608093
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42608	NC_012668	AATC	2	8	2232653	2232660	50 %	25 %	0 %	25 %	229608093
42609	NC_012668	TCT	2	6	2232683	2232688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608093
42610	NC_012668	GCG	2	6	2232783	2232788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608093
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42612	NC_012668	CGA	2	6	2232932	2232937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608093
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42616	NC_012668	T	6	6	2233055	2233060	0 %	100 %	0 %	0 %	229608093
42617	NC_012668	CAT	2	6	2233092	2233097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608093
42618	NC_012668	TGTCCA	2	12	2233109	2233120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229608093
42619	NC_012668	ACC	2	6	2233219	2233224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608093
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42622	NC_012668	CAC	2	6	2233314	2233319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608093
42623	NC_012668	GCATCT	2	12	2233355	2233366	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229608093
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42630	NC_012668	TAT	2	6	2233826	2233831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42631	NC_012668	ACA	2	6	2233844	2233849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42632	NC_012668	AC	3	6	2233866	2233871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42633	NC_012668	AT	3	6	2233934	2233939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42634	NC_012668	AAG	2	6	2233970	2233975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42635	NC_012668	TTCC	2	8	2233996	2234003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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42974	NC_012668	ACTG	2	8	2252857	2252864	25 %	25 %	25 %	25 %	229608110
42975	NC_012668	CAG	2	6	2252873	2252878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608110
42976	NC_012668	TCG	2	6	2252880	2252885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608110
42977	NC_012668	TGA	2	6	2252929	2252934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608110
42978	NC_012668	AGC	2	6	2252943	2252948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608110
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42980	NC_012668	CTC	2	6	2253107	2253112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229608110
42981	NC_012668	ACG	2	6	2253119	2253124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608110
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42983	NC_012668	CCA	2	6	2253207	2253212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608110
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42985	NC_012668	CAT	2	6	2253295	2253300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608110
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42989	NC_012668	TCA	2	6	2253451	2253456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608110
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42991	NC_012668	CAT	3	9	2253560	2253568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608110
42992	NC_012668	TCCA	2	8	2253641	2253648	25 %	25 %	0 %	50 %	229608110
42993	NC_012668	TTC	2	6	2253749	2253754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608110
42994	NC_012668	GCG	2	6	2253920	2253925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608110
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42998	NC_012668	GCA	2	6	2254305	2254310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608111
42999	NC_012668	CCCTG	2	10	2254361	2254370	0 %	20 %	20 %	60 %	229608111
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