MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

< Previous12345678910111213...120121Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_012668	G	6	6	100083	100088	0 %	0 %	100 %	0 %	229606219
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2005	NC_012668	CAA	2	6	100183	100188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606219
2006	NC_012668	TTA	2	6	100258	100263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606219
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2011	NC_012668	TTA	2	6	100657	100662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606219
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2013	NC_012668	AAG	3	9	100712	100720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606219
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2125	NC_012668	TA	3	6	106157	106162	50 %	50 %	0 %	0 %	229606223
2126	NC_012668	T	6	6	106223	106228	0 %	100 %	0 %	0 %	229606223
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2131	NC_012668	TGC	2	6	106375	106380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606223
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2133	NC_012668	CGAG	2	8	106500	106507	25 %	0 %	50 %	25 %	229606223
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2250	NC_012668	AG	3	6	112033	112038	50 %	0 %	50 %	0 %	229606229
2251	NC_012668	GAC	2	6	112067	112072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606229
2252	NC_012668	GGTA	2	8	112125	112132	25 %	25 %	50 %	0 %	229606229
2253	NC_012668	ATC	2	6	112234	112239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606229
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2257	NC_012668	TTG	2	6	112849	112854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606230
2258	NC_012668	ATGG	2	8	112870	112877	25 %	25 %	50 %	0 %	229606230
2259	NC_012668	TGA	2	6	112923	112928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606230
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2306	NC_012668	ATT	2	6	115657	115662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2362	NC_012668	C	6	6	118718	118723	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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2364	NC_012668	T	6	6	118809	118814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2365	NC_012668	TTGC	2	8	119133	119140	0 %	50 %	25 %	25 %	229606235
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2372	NC_012668	TGG	2	6	119713	119718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606235
2373	NC_012668	ATC	2	6	119753	119758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606235
2374	NC_012668	CGG	2	6	119770	119775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606235
2375	NC_012668	GGT	3	9	119789	119797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606235
2376	NC_012668	ATCC	2	8	119814	119821	25 %	25 %	0 %	50 %	229606235
2377	NC_012668	GCA	2	6	119846	119851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606235
2378	NC_012668	GCG	2	6	119876	119881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606235
2379	NC_012668	CT	3	6	119909	119914	0 %	50 %	0 %	50 %	229606235
2380	NC_012668	TGG	2	6	119949	119954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606235
2381	NC_012668	ATC	2	6	119987	119992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606235
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2383	NC_012668	CTG	2	6	120053	120058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606235
2384	NC_012668	ATT	2	6	120172	120177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2385	NC_012668	T	6	6	120244	120249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2386	NC_012668	GAT	2	6	120258	120263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2387	NC_012668	CGC	2	6	120413	120418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606236
2388	NC_012668	TCC	2	6	120490	120495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606236
2389	NC_012668	CAA	2	6	120576	120581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606236
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2393	NC_012668	GTG	2	6	120721	120726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606236
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2395	NC_012668	A	6	6	120881	120886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2396	NC_012668	ATG	2	6	120907	120912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606237
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2401	NC_012668	GGCAA	2	10	121058	121067	40 %	0 %	40 %	20 %	229606237
2402	NC_012668	A	6	6	121066	121071	100 %	0 %	0 %	0 %	229606237
2403	NC_012668	TCA	2	6	121173	121178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606237
2404	NC_012668	CAA	2	6	121192	121197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606237
2405	NC_012668	GTGAA	2	10	121280	121289	40 %	20 %	40 %	0 %	229606237
2406	NC_012668	TTCAGT	2	12	121306	121317	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229606237
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2409	NC_012668	TG	3	6	121528	121533	0 %	50 %	50 %	0 %	229606237
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2433	NC_012668	TGG	2	6	123119	123124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606239
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2438	NC_012668	GATG	2	8	123399	123406	25 %	25 %	50 %	0 %	229606239
2439	NC_012668	TGCCA	2	10	123503	123512	20 %	20 %	20 %	40 %	229606240
2440	NC_012668	CGAT	2	8	123601	123608	25 %	25 %	25 %	25 %	229606240
2441	NC_012668	CGG	2	6	123617	123622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606240
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2443	NC_012668	CAC	2	6	123791	123796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606240
2444	NC_012668	CTG	2	6	123877	123882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606240
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2446	NC_012668	T	6	6	124084	124089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2447	NC_012668	T	6	6	124098	124103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2448	NC_012668	ATG	2	6	124227	124232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606241
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2450	NC_012668	GCCT	2	8	124299	124306	0 %	25 %	25 %	50 %	229606241
2451	NC_012668	ATG	2	6	124404	124409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606241
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2454	NC_012668	CGG	2	6	124497	124502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606241
2455	NC_012668	CTT	2	6	124620	124625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606242
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2458	NC_012668	CG	3	6	124733	124738	0 %	0 %	50 %	50 %	229606242
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2464	NC_012668	TGC	2	6	125114	125119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606242
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2474	NC_012668	CTG	2	6	125568	125573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606242
2475	NC_012668	C	7	7	125642	125648	0 %	0 %	0 %	100 %	229606242
2476	NC_012668	CTGC	2	8	125728	125735	0 %	25 %	25 %	50 %	229606242
2477	NC_012668	GCT	2	6	125825	125830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606242
2478	NC_012668	ATC	2	6	125835	125840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606242
2479	NC_012668	ATTC	2	8	125856	125863	25 %	50 %	0 %	25 %	229606242
2480	NC_012668	CCT	2	6	125866	125871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606242
2481	NC_012668	TGA	2	6	125945	125950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2482	NC_012668	GAAG	2	8	125953	125960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2483	NC_012668	AG	3	6	125959	125964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2484	NC_012668	GAT	2	6	125993	125998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606243
2485	NC_012668	GAT	2	6	126062	126067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606243
2486	NC_012668	GC	3	6	126173	126178	0 %	0 %	50 %	50 %	229606243
2487	NC_012668	CTTGG	2	10	126218	126227	0 %	40 %	40 %	20 %	229606243
2488	NC_012668	GCT	3	9	126254	126262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606243
2489	NC_012668	TGC	2	6	126268	126273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606243
2490	NC_012668	AGC	2	6	126350	126355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606243
2491	NC_012668	ACC	2	6	126394	126399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606243
2492	NC_012668	TGC	2	6	126514	126519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606243
2493	NC_012668	ATC	2	6	126537	126542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606243
2494	NC_012668	TGTT	2	8	126619	126626	0 %	75 %	25 %	0 %	229606243
2495	NC_012668	GCG	2	6	126704	126709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606243
2496	NC_012668	CGC	2	6	126717	126722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606243
2497	NC_012668	AAAGC	2	10	126858	126867	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2498	NC_012668	TCA	2	6	126931	126936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2499	NC_012668	CCA	2	6	127019	127024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2500	NC_012668	AAT	2	6	127192	127197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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