MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_012668	GCA	2	6	1014707	1014712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607035
19503	NC_012668	AGA	2	6	1014790	1014795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607035
19504	NC_012668	GCG	2	6	1014813	1014818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607035
19505	NC_012668	AG	3	6	1014907	1014912	50 %	0 %	50 %	0 %	229607035
19506	NC_012668	CG	3	6	1014962	1014967	0 %	0 %	50 %	50 %	229607035
19507	NC_012668	AAG	2	6	1015020	1015025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607035
19508	NC_012668	CGC	2	6	1015104	1015109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229607036
19509	NC_012668	TGC	2	6	1015164	1015169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607036
19510	NC_012668	GTG	2	6	1015202	1015207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607036
19511	NC_012668	GAA	2	6	1015304	1015309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607036
19512	NC_012668	ACA	2	6	1015336	1015341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607036
19513	NC_012668	AAG	2	6	1015386	1015391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607036
19514	NC_012668	GAA	3	9	1015410	1015418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607036
19515	NC_012668	CTG	3	9	1015501	1015509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607037
19516	NC_012668	T	6	6	1015510	1015515	0 %	100 %	0 %	0 %	229607037
19517	NC_012668	ATT	2	6	1015564	1015569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229607037
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19519	NC_012668	GC	3	6	1015633	1015638	0 %	0 %	50 %	50 %	229607037
19520	NC_012668	ATT	2	6	1015642	1015647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229607037
19521	NC_012668	AAG	2	6	1015724	1015729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607037
19522	NC_012668	GAT	2	6	1015794	1015799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607037
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19524	NC_012668	CGC	2	6	1015825	1015830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229607037
19525	NC_012668	TATC	2	8	1015833	1015840	25 %	50 %	0 %	25 %	229607037
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19527	NC_012668	CGC	2	6	1015921	1015926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229607037
19528	NC_012668	TAT	2	6	1015927	1015932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229607037
19529	NC_012668	AGGTG	2	10	1015938	1015947	20 %	20 %	60 %	0 %	229607037
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19541	NC_012668	GCGG	2	8	1016938	1016945	0 %	0 %	75 %	25 %	229607037
19542	NC_012668	TGA	2	6	1016952	1016957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607037
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19544	NC_012668	GGC	2	6	1017052	1017057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607037
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19546	NC_012668	TGA	2	6	1017123	1017128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607037
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19550	NC_012668	TGGG	2	8	1017400	1017407	0 %	25 %	75 %	0 %	229607038
19551	NC_012668	GGC	2	6	1017488	1017493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607038
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19553	NC_012668	ACC	2	6	1017536	1017541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607038
19554	NC_012668	CAC	2	6	1017601	1017606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229607038
19555	NC_012668	T	6	6	1017616	1017621	0 %	100 %	0 %	0 %	229607038
19556	NC_012668	GCGCG	2	10	1017697	1017706	0 %	0 %	60 %	40 %	229607038
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19559	NC_012668	TGCC	2	8	1017871	1017878	0 %	25 %	25 %	50 %	229607038
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19563	NC_012668	GC	3	6	1017992	1017997	0 %	0 %	50 %	50 %	229607038
19564	NC_012668	GCAC	2	8	1018063	1018070	25 %	0 %	25 %	50 %	229607038
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19617	NC_012668	CGG	2	6	1020472	1020477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607040
19618	NC_012668	TGG	2	6	1020487	1020492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607040
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19719	NC_012668	GCG	2	6	1025798	1025803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607044
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19722	NC_012668	TGC	2	6	1025935	1025940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607044
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19727	NC_012668	T	7	7	1026431	1026437	0 %	100 %	0 %	0 %	229607045
19728	NC_012668	TGG	2	6	1026439	1026444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607045
19729	NC_012668	GGT	2	6	1026459	1026464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607045
19730	NC_012668	CGA	2	6	1026475	1026480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229607045
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19852	NC_012668	AAG	2	6	1032646	1032651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607050
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19922	NC_012668	T	7	7	1036027	1036033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19967	NC_012668	CAT	2	6	1038070	1038075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607054
19968	NC_012668	CGG	2	6	1038223	1038228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607054
19969	NC_012668	ATC	2	6	1038275	1038280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607054
19970	NC_012668	GGC	2	6	1038352	1038357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607054
19971	NC_012668	TGA	2	6	1038390	1038395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607054
19972	NC_012668	GGC	2	6	1038407	1038412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607054
19973	NC_012668	AGGTG	2	10	1038529	1038538	20 %	20 %	60 %	0 %	229607054
19974	NC_012668	CAA	2	6	1038557	1038562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607054
19975	NC_012668	AAG	2	6	1038672	1038677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607054
19976	NC_012668	ATCG	2	8	1038758	1038765	25 %	25 %	25 %	25 %	229607054
19977	NC_012668	GAA	2	6	1038785	1038790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229607054
19978	NC_012668	CGT	2	6	1038926	1038931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607054
19979	NC_012668	ACA	2	6	1038945	1038950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607054
19980	NC_012668	ATG	2	6	1039026	1039031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607054
19981	NC_012668	GGT	2	6	1039082	1039087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607054
19982	NC_012668	ACT	2	6	1039119	1039124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607054
19983	NC_012668	CGC	2	6	1039135	1039140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229607054
19984	NC_012668	CAT	2	6	1039171	1039176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607054
19985	NC_012668	CGTG	2	8	1039270	1039277	0 %	25 %	50 %	25 %	229607054
19986	NC_012668	CGG	2	6	1039309	1039314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607054
19987	NC_012668	CAA	2	6	1039418	1039423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607054
19988	NC_012668	CGT	2	6	1039586	1039591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607054
19989	NC_012668	GAAT	2	8	1039618	1039625	50 %	25 %	25 %	0 %	229607054
19990	NC_012668	CTG	2	6	1039634	1039639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607054
19991	NC_012668	TGA	2	6	1039651	1039656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607054
19992	NC_012668	GTG	2	6	1039700	1039705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229607054
19993	NC_012668	GGC	2	6	1039709	1039714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229607054
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19995	NC_012668	TGA	2	6	1039857	1039862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229607054
19996	NC_012668	TGC	2	6	1039918	1039923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229607054
19997	NC_012668	GTTT	2	8	1039936	1039943	0 %	75 %	25 %	0 %	229607054
19998	NC_012668	GC	3	6	1039979	1039984	0 %	0 %	50 %	50 %	229607054
19999	NC_012668	CAA	2	6	1040009	1040014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229607054
20000	NC_012668	TAC	2	6	1040042	1040047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229607054

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