MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012668	TGGTG	2	10	670874	670883	0 %	40 %	60 %	0 %	229606710
13002	NC_012668	GCAA	2	8	670930	670937	50 %	0 %	25 %	25 %	229606710
13003	NC_012668	TGGC	2	8	671014	671021	0 %	25 %	50 %	25 %	229606710
13004	NC_012668	ATA	2	6	671033	671038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606710
13005	NC_012668	GGAA	2	8	671043	671050	50 %	0 %	50 %	0 %	229606710
13006	NC_012668	GCA	2	6	671060	671065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606710
13007	NC_012668	TGA	2	6	671323	671328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606710
13008	NC_012668	CGA	2	6	671360	671365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606710
13009	NC_012668	TCA	2	6	671473	671478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606710
13010	NC_012668	GCC	2	6	671490	671495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606710
13011	NC_012668	CGC	2	6	671595	671600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606710
13012	NC_012668	CTT	2	6	671744	671749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606710
13013	NC_012668	GCT	2	6	671819	671824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606710
13014	NC_012668	TTG	2	6	671907	671912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606710
13015	NC_012668	CGG	2	6	671924	671929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606710
13016	NC_012668	TTGA	2	8	671991	671998	25 %	50 %	25 %	0 %	229606710
13017	NC_012668	CCAT	2	8	672010	672017	25 %	25 %	0 %	50 %	229606710
13018	NC_012668	CAG	2	6	672072	672077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606710
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13021	NC_012668	AAAT	2	8	672226	672233	75 %	25 %	0 %	0 %	229606711
13022	NC_012668	GATC	2	8	672287	672294	25 %	25 %	25 %	25 %	229606711
13023	NC_012668	CCT	2	6	672328	672333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606711
13024	NC_012668	AGG	2	6	672378	672383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606711
13025	NC_012668	CGA	2	6	672419	672424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606711
13026	NC_012668	T	6	6	672678	672683	0 %	100 %	0 %	0 %	229606711
13027	NC_012668	GAT	3	9	672747	672755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606711
13028	NC_012668	ACC	2	6	672822	672827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606711
13029	NC_012668	TTG	2	6	672879	672884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606711
13030	NC_012668	TTGA	2	8	672894	672901	25 %	50 %	25 %	0 %	229606711
13031	NC_012668	GTT	2	6	672920	672925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606711
13032	NC_012668	CAG	2	6	672954	672959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606711
13033	NC_012668	GA	3	6	673089	673094	50 %	0 %	50 %	0 %	229606711
13034	NC_012668	ATC	2	6	673186	673191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606711
13035	NC_012668	ATT	2	6	673227	673232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606711
13036	NC_012668	ATG	2	6	673234	673239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606711
13037	NC_012668	CACTCA	2	12	673256	673267	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	229606711
13038	NC_012668	TTG	2	6	673291	673296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_012668	CAA	2	6	673324	673329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_012668	ATT	2	6	673400	673405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606712
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13043	NC_012668	T	6	6	673510	673515	0 %	100 %	0 %	0 %	229606712
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13046	NC_012668	CAATTG	2	12	673569	673580	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229606712
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13050	NC_012668	TGGA	2	8	673846	673853	25 %	25 %	50 %	0 %	229606712
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13052	NC_012668	AGACG	2	10	673975	673984	40 %	0 %	40 %	20 %	229606712
13053	NC_012668	AT	3	6	673990	673995	50 %	50 %	0 %	0 %	229606712
13054	NC_012668	GCGAG	2	10	674113	674122	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13055	NC_012668	T	6	6	674149	674154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_012668	AGT	2	6	674177	674182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606713
13057	NC_012668	TTG	2	6	674328	674333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606713
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13059	NC_012668	CTG	2	6	674372	674377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606713
13060	NC_012668	GCT	2	6	674482	674487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606713
13061	NC_012668	ACG	2	6	674511	674516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606713
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13063	NC_012668	GC	3	6	674654	674659	0 %	0 %	50 %	50 %	229606713
13064	NC_012668	TGA	2	6	674669	674674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606713
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13088	NC_012668	TAA	2	6	675678	675683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13102	NC_012668	ACCAA	2	10	676773	676782	60 %	0 %	0 %	40 %	229606715
13103	NC_012668	AAG	2	6	676810	676815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606715
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13242	NC_012668	GCT	2	6	684307	684312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606721
13243	NC_012668	CTT	2	6	684343	684348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606721
13244	NC_012668	TGT	2	6	684361	684366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606721
13245	NC_012668	CCA	2	6	684389	684394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606721
13246	NC_012668	ATC	2	6	684413	684418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606721
13247	NC_012668	CAC	2	6	684494	684499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606721
13248	NC_012668	TTC	2	6	684533	684538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606721
13249	NC_012668	CAGTT	2	10	684572	684581	20 %	40 %	20 %	20 %	229606721
13250	NC_012668	CCA	2	6	684760	684765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13251	NC_012668	AT	3	6	684795	684800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13252	NC_012668	TGT	2	6	684884	684889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13253	NC_012668	T	6	6	684911	684916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13254	NC_012668	AAT	2	6	685066	685071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606722
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13258	NC_012668	CTG	2	6	685246	685251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606722
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13261	NC_012668	GCT	2	6	685414	685419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606722
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13280	NC_012668	GTC	2	6	685866	685871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606722
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13289	NC_012668	AGCG	2	8	686196	686203	25 %	0 %	50 %	25 %	229606723
13290	NC_012668	TGC	2	6	686219	686224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606723
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13294	NC_012668	CAAG	2	8	686346	686353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13479	NC_012668	GGC	2	6	695447	695452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606733
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13481	NC_012668	CCCG	2	8	695483	695490	0 %	0 %	25 %	75 %	229606733
13482	NC_012668	TGC	2	6	695515	695520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606733
13483	NC_012668	AGA	2	6	695531	695536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606733
13484	NC_012668	TG	3	6	695571	695576	0 %	50 %	50 %	0 %	229606733
13485	NC_012668	CGG	2	6	695596	695601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606733
13486	NC_012668	GC	3	6	695630	695635	0 %	0 %	50 %	50 %	229606733
13487	NC_012668	ATC	2	6	695644	695649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606733
13488	NC_012668	TGA	2	6	695741	695746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606733
13489	NC_012668	CGC	2	6	695866	695871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606733
13490	NC_012668	CTG	2	6	695937	695942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606733
13491	NC_012668	AGG	2	6	695947	695952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606733
13492	NC_012668	TCT	2	6	696000	696005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606733
13493	NC_012668	GCT	2	6	696045	696050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606733
13494	NC_012668	CG	3	6	696126	696131	0 %	0 %	50 %	50 %	229606733
13495	NC_012668	GCA	2	6	696151	696156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606733
13496	NC_012668	TGA	2	6	696212	696217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606733
13497	NC_012668	ATG	2	6	696495	696500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606734
13498	NC_012668	ATT	2	6	696506	696511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606734
13499	NC_012668	TGG	2	6	696528	696533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606734
13500	NC_012668	ATGGGC	2	12	696567	696578	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	229606734

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