MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_012668	GATT	2	8	617674	617681	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_012668	T	6	6	617684	617689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_012668	GAA	2	6	617796	617801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606663
12004	NC_012668	GCT	2	6	617831	617836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606663
12005	NC_012668	GTA	2	6	617852	617857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606663
12006	NC_012668	TGC	2	6	617889	617894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606663
12007	NC_012668	AAC	2	6	617972	617977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606663
12008	NC_012668	GCG	2	6	618005	618010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606663
12009	NC_012668	TGA	2	6	618035	618040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606663
12010	NC_012668	GCA	2	6	618085	618090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606663
12011	NC_012668	CG	3	6	618215	618220	0 %	0 %	50 %	50 %	229606663
12012	NC_012668	GTTCC	2	10	618297	618306	0 %	40 %	20 %	40 %	229606663
12013	NC_012668	ATG	2	6	618334	618339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606663
12014	NC_012668	GATATC	2	12	618370	618381	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229606663
12015	NC_012668	T	6	6	618521	618526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_012668	TGA	2	6	618535	618540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_012668	GGA	2	6	618600	618605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606664
12018	NC_012668	GCAT	2	8	618611	618618	25 %	25 %	25 %	25 %	229606664
12019	NC_012668	AGC	2	6	618668	618673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606664
12020	NC_012668	CAG	2	6	618691	618696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606664
12021	NC_012668	TGA	2	6	618783	618788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606664
12022	NC_012668	GA	3	6	618832	618837	50 %	0 %	50 %	0 %	229606664
12023	NC_012668	TC	3	6	618892	618897	0 %	50 %	0 %	50 %	229606664
12024	NC_012668	AGA	2	6	618903	618908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606664
12025	NC_012668	ATC	2	6	618944	618949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606664
12026	NC_012668	GCA	2	6	619035	619040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606664
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12028	NC_012668	TGA	2	6	619079	619084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606664
12029	NC_012668	T	6	6	619153	619158	0 %	100 %	0 %	0 %	229606664
12030	NC_012668	ATG	2	6	619220	619225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606664
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12032	NC_012668	GTAC	2	8	619311	619318	25 %	25 %	25 %	25 %	229606665
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12034	NC_012668	A	6	6	619353	619358	100 %	0 %	0 %	0 %	229606665
12035	NC_012668	GCC	2	6	619390	619395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606665
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12037	NC_012668	ATTG	2	8	619475	619482	25 %	50 %	25 %	0 %	229606665
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12040	NC_012668	TGC	2	6	619573	619578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606665
12041	NC_012668	CGAC	2	8	619580	619587	25 %	0 %	25 %	50 %	229606665
12042	NC_012668	CGA	2	6	619682	619687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606665
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12045	NC_012668	TGA	2	6	619807	619812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606666
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12049	NC_012668	AGC	2	6	620062	620067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606666
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12052	NC_012668	CAA	2	6	620148	620153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606666
12053	NC_012668	CAAG	2	8	620159	620166	50 %	0 %	25 %	25 %	229606666
12054	NC_012668	GTC	2	6	620206	620211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606666
12055	NC_012668	AGC	2	6	620248	620253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606666
12056	NC_012668	AAT	2	6	620268	620273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606666
12057	NC_012668	TTG	2	6	620344	620349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12058	NC_012668	GCC	2	6	620364	620369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12059	NC_012668	GTC	2	6	620438	620443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606667
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12064	NC_012668	TGA	2	6	620827	620832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606667
12065	NC_012668	GCT	2	6	620834	620839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606667
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12069	NC_012668	CAA	2	6	621129	621134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606667
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12103	NC_012668	GCT	2	6	622841	622846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606668
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12105	NC_012668	T	7	7	622892	622898	0 %	100 %	0 %	0 %	229606668
12106	NC_012668	GTG	2	6	622957	622962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606668
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12112	NC_012668	CACTTG	2	12	623183	623194	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229606669
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12115	NC_012668	GCGAT	2	10	623292	623301	20 %	20 %	40 %	20 %	229606669
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12118	NC_012668	GA	4	8	623389	623396	50 %	0 %	50 %	0 %	229606669
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12120	NC_012668	GGTT	2	8	623470	623477	0 %	50 %	50 %	0 %	229606669
12121	NC_012668	GCTTG	2	10	623505	623514	0 %	40 %	40 %	20 %	229606669
12122	NC_012668	GGCA	2	8	623528	623535	25 %	0 %	50 %	25 %	229606669
12123	NC_012668	CTG	2	6	623567	623572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606669
12124	NC_012668	TGA	2	6	623581	623586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606669
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12129	NC_012668	GCT	2	6	624025	624030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606669
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12133	NC_012668	TTGT	2	8	624188	624195	0 %	75 %	25 %	0 %	229606669
12134	NC_012668	TTG	2	6	624254	624259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606669
12135	NC_012668	TTG	3	9	624267	624275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606669
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12141	NC_012668	CTG	2	6	624484	624489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606670
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12221	NC_012668	T	6	6	628975	628980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12222	NC_012668	GCA	2	6	628995	629000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12227	NC_012668	ATG	2	6	629190	629195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606674
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12230	NC_012668	TCA	2	6	629268	629273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606674
12231	NC_012668	CGA	2	6	629305	629310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606674
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12233	NC_012668	CTAT	2	8	629337	629344	25 %	50 %	0 %	25 %	229606675
12234	NC_012668	GTG	2	6	629364	629369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606675
12235	NC_012668	CACTG	2	10	629425	629434	20 %	20 %	20 %	40 %	229606675
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12237	NC_012668	TGA	2	6	629494	629499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606675
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12360	NC_012668	ATT	2	6	636546	636551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606681
12361	NC_012668	GGT	2	6	636814	636819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606682
12362	NC_012668	GC	3	6	636871	636876	0 %	0 %	50 %	50 %	229606682
12363	NC_012668	AGCG	2	8	636929	636936	25 %	0 %	50 %	25 %	229606682
12364	NC_012668	CT	3	6	636959	636964	0 %	50 %	0 %	50 %	229606682
12365	NC_012668	CGAG	2	8	636985	636992	25 %	0 %	50 %	25 %	229606682
12366	NC_012668	GTTGG	2	10	636994	637003	0 %	40 %	60 %	0 %	229606682
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12368	NC_012668	CCAG	2	8	637080	637087	25 %	0 %	25 %	50 %	229606682
12369	NC_012668	GTGA	2	8	637123	637130	25 %	25 %	50 %	0 %	229606682
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12474	NC_012668	CGC	2	6	644113	644118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12475	NC_012668	T	6	6	644191	644196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12476	NC_012668	GCT	2	6	644256	644261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12477	NC_012668	AG	3	6	644271	644276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12478	NC_012668	AGG	2	6	644284	644289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12479	NC_012668	GTT	2	6	644314	644319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606690
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