MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012668	CAA	2	6	590347	590352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_012668	AGTG	2	8	590461	590468	25 %	25 %	50 %	0 %	229606640
11503	NC_012668	TGG	2	6	590495	590500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606640
11504	NC_012668	AGC	2	6	590505	590510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606640
11505	NC_012668	CAA	2	6	590540	590545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606640
11506	NC_012668	AGC	2	6	590550	590555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606640
11507	NC_012668	GCA	2	6	590572	590577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606640
11508	NC_012668	CAG	2	6	590582	590587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606640
11509	NC_012668	AGC	2	6	590595	590600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606640
11510	NC_012668	GCA	2	6	590611	590616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606640
11511	NC_012668	CAG	2	6	590738	590743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606640
11512	NC_012668	GC	3	6	590767	590772	0 %	0 %	50 %	50 %	229606640
11513	NC_012668	AAG	2	6	590808	590813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606640
11514	NC_012668	TCA	2	6	590818	590823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606640
11515	NC_012668	GCA	2	6	590824	590829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606640
11516	NC_012668	TGG	2	6	590832	590837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606640
11517	NC_012668	GCT	2	6	590857	590862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606640
11518	NC_012668	AGC	2	6	590886	590891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606640
11519	NC_012668	CAC	2	6	590979	590984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606640
11520	NC_012668	AGC	2	6	590991	590996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606640
11521	NC_012668	A	6	6	591008	591013	100 %	0 %	0 %	0 %	229606640
11522	NC_012668	AAG	2	6	591108	591113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606640
11523	NC_012668	AGC	2	6	591150	591155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606640
11524	NC_012668	GTG	2	6	591173	591178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606640
11525	NC_012668	AAAC	2	8	591298	591305	75 %	0 %	0 %	25 %	229606640
11526	NC_012668	ACTT	2	8	591399	591406	25 %	50 %	0 %	25 %	229606640
11527	NC_012668	ACG	2	6	591549	591554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606640
11528	NC_012668	ATT	2	6	591569	591574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606640
11529	NC_012668	CAC	2	6	591586	591591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606640
11530	NC_012668	TGG	2	6	591597	591602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606640
11531	NC_012668	AGA	2	6	591709	591714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606640
11532	NC_012668	GGC	2	6	591728	591733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606640
11533	NC_012668	GC	3	6	591732	591737	0 %	0 %	50 %	50 %	229606640
11534	NC_012668	ATTG	2	8	591865	591872	25 %	50 %	25 %	0 %	229606640
11535	NC_012668	CAA	2	6	591881	591886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606640
11536	NC_012668	TAG	2	6	591912	591917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606640
11537	NC_012668	CGC	2	6	591961	591966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11538	NC_012668	AAT	2	6	591990	591995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606641
11539	NC_012668	CGTA	2	8	592065	592072	25 %	25 %	25 %	25 %	229606641
11540	NC_012668	CAT	2	6	592131	592136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606641
11541	NC_012668	GCG	2	6	592232	592237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606641
11542	NC_012668	GCG	2	6	592352	592357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606641
11543	NC_012668	GAA	2	6	592393	592398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606641
11544	NC_012668	TCTG	2	8	592442	592449	0 %	50 %	25 %	25 %	229606641
11545	NC_012668	CGG	2	6	592506	592511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606641
11546	NC_012668	ATG	2	6	592619	592624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606641
11547	NC_012668	GCTATC	2	12	592631	592642	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229606641
11548	NC_012668	GCAT	2	8	592658	592665	25 %	25 %	25 %	25 %	229606641
11549	NC_012668	ATG	2	6	592690	592695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606641
11550	NC_012668	TTA	2	6	592722	592727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606641
11551	NC_012668	CGG	2	6	592737	592742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606641
11552	NC_012668	GCT	2	6	592779	592784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_012668	TTGC	2	8	592791	592798	0 %	50 %	25 %	25 %	229606642
11554	NC_012668	TCA	2	6	592855	592860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606642
11555	NC_012668	GAT	2	6	592863	592868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606642
11556	NC_012668	CTG	2	6	592887	592892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606642
11557	NC_012668	AATC	2	8	592935	592942	50 %	25 %	0 %	25 %	229606642
11558	NC_012668	TCAG	2	8	592957	592964	25 %	25 %	25 %	25 %	229606642
11559	NC_012668	TGA	2	6	592975	592980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606642
11560	NC_012668	TTC	2	6	593029	593034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606642
11561	NC_012668	CAAG	2	8	593072	593079	50 %	0 %	25 %	25 %	229606642
11562	NC_012668	TGA	2	6	593131	593136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606642
11563	NC_012668	TGG	2	6	593188	593193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606642
11564	NC_012668	CA	3	6	593194	593199	50 %	0 %	0 %	50 %	229606642
11565	NC_012668	TCG	2	6	593224	593229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606642
11566	NC_012668	GC	3	6	593230	593235	0 %	0 %	50 %	50 %	229606642
11567	NC_012668	GCC	2	6	593303	593308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606642
11568	NC_012668	CAT	2	6	593486	593491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606643
11569	NC_012668	T	6	6	593526	593531	0 %	100 %	0 %	0 %	229606643
11570	NC_012668	GAT	2	6	593623	593628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606643
11571	NC_012668	CCG	2	6	593651	593656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606643
11572	NC_012668	CAAGC	2	10	593714	593723	40 %	0 %	20 %	40 %	229606643
11573	NC_012668	ATTG	2	8	593725	593732	25 %	50 %	25 %	0 %	229606643
11574	NC_012668	AAG	2	6	593733	593738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606643
11575	NC_012668	AC	3	6	593815	593820	50 %	0 %	0 %	50 %	229606643
11576	NC_012668	CGC	2	6	593954	593959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606643
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11578	NC_012668	TTC	2	6	594251	594256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606643
11579	NC_012668	CTT	2	6	594394	594399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606643
11580	NC_012668	CGC	2	6	594413	594418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606643
11581	NC_012668	TGA	2	6	594469	594474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606643
11582	NC_012668	GT	3	6	594497	594502	0 %	50 %	50 %	0 %	229606643
11583	NC_012668	TG	3	6	594525	594530	0 %	50 %	50 %	0 %	229606643
11584	NC_012668	CG	3	6	594571	594576	0 %	0 %	50 %	50 %	229606643
11585	NC_012668	AGTT	2	8	594603	594610	25 %	50 %	25 %	0 %	229606643
11586	NC_012668	TGC	2	6	594612	594617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606643
11587	NC_012668	A	6	6	594618	594623	100 %	0 %	0 %	0 %	229606643
11588	NC_012668	CTG	2	6	594626	594631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606643
11589	NC_012668	TGCA	2	8	594741	594748	25 %	25 %	25 %	25 %	229606643
11590	NC_012668	A	6	6	594777	594782	100 %	0 %	0 %	0 %	229606643
11591	NC_012668	TTG	2	6	594800	594805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606643
11592	NC_012668	CAA	2	6	594884	594889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606643
11593	NC_012668	TTTG	2	8	594904	594911	0 %	75 %	25 %	0 %	229606643
11594	NC_012668	CCAA	2	8	594954	594961	50 %	0 %	0 %	50 %	229606643
11595	NC_012668	CA	3	6	595075	595080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11596	NC_012668	GGT	2	6	595102	595107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606644
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11599	NC_012668	GCA	2	6	595249	595254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606644
11600	NC_012668	CTG	2	6	595313	595318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606644
11601	NC_012668	A	6	6	595324	595329	100 %	0 %	0 %	0 %	229606644
11602	NC_012668	TGG	2	6	595400	595405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606645
11603	NC_012668	CAAG	2	8	595605	595612	50 %	0 %	25 %	25 %	229606645
11604	NC_012668	CGC	2	6	595638	595643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606645
11605	NC_012668	AGCT	2	8	595659	595666	25 %	25 %	25 %	25 %	229606645
11606	NC_012668	CGG	2	6	595730	595735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606645
11607	NC_012668	A	7	7	595736	595742	100 %	0 %	0 %	0 %	229606645
11608	NC_012668	T	6	6	595756	595761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_012668	CT	3	6	595765	595770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11610	NC_012668	T	6	6	595814	595819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_012668	TTG	2	6	595880	595885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606646
11612	NC_012668	GGC	2	6	595915	595920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606646
11613	NC_012668	TGG	2	6	595923	595928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606646
11614	NC_012668	TA	3	6	596139	596144	50 %	50 %	0 %	0 %	229606646
11615	NC_012668	CTG	2	6	596171	596176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606646
11616	NC_012668	GCT	2	6	596188	596193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606646
11617	NC_012668	GGT	2	6	596270	596275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606646
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11619	NC_012668	CGC	2	6	596466	596471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606646
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11621	NC_012668	TTC	2	6	596534	596539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606646
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11989	NC_012668	TGG	2	6	616854	616859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11990	NC_012668	TTG	2	6	616865	616870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11991	NC_012668	TTG	2	6	616884	616889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11992	NC_012668	TAA	2	6	616931	616936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11993	NC_012668	A	6	6	616935	616940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11994	NC_012668	GCT	2	6	617003	617008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606662
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11997	NC_012668	CCA	2	6	617128	617133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606662
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