MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012668	TCT	2	6	512792	512797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606565
10002	NC_012668	CAG	2	6	512823	512828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606565
10003	NC_012668	GTA	2	6	512838	512843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606565
10004	NC_012668	CCAA	2	8	512871	512878	50 %	0 %	0 %	50 %	229606565
10005	NC_012668	CTTTCT	2	12	512984	512995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606565
10006	NC_012668	CAT	2	6	513006	513011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606565
10007	NC_012668	ATC	2	6	513033	513038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606565
10008	NC_012668	GCA	2	6	513074	513079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606565
10009	NC_012668	CAC	2	6	513131	513136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606565
10010	NC_012668	GAT	2	6	513156	513161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606565
10011	NC_012668	CAA	2	6	513179	513184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606565
10012	NC_012668	CAGTG	2	10	513208	513217	20 %	20 %	40 %	20 %	229606565
10013	NC_012668	CAAC	2	8	513234	513241	50 %	0 %	0 %	50 %	229606565
10014	NC_012668	ACC	2	6	513250	513255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606565
10015	NC_012668	TTTG	2	8	513354	513361	0 %	75 %	25 %	0 %	229606565
10016	NC_012668	ATT	2	6	513387	513392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606565
10017	NC_012668	TCA	2	6	513424	513429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606565
10018	NC_012668	AGT	2	6	513452	513457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606565
10019	NC_012668	ATC	2	6	513463	513468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606565
10020	NC_012668	GTC	2	6	513522	513527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606565
10021	NC_012668	CTT	2	6	513537	513542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606565
10022	NC_012668	CAC	3	9	513569	513577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606565
10023	NC_012668	CCA	2	6	513601	513606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606565
10024	NC_012668	CAG	2	6	513612	513617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606565
10025	NC_012668	CATA	2	8	513635	513642	50 %	25 %	0 %	25 %	229606565
10026	NC_012668	ATT	2	6	513666	513671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606565
10027	NC_012668	CACT	2	8	513809	513816	25 %	25 %	0 %	50 %	229606565
10028	NC_012668	ATT	2	6	513831	513836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606565
10029	NC_012668	CAA	2	6	513909	513914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606565
10030	NC_012668	CGC	2	6	513977	513982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606565
10031	NC_012668	CGC	2	6	514041	514046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606565
10032	NC_012668	AGGAGC	2	12	514089	514100	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	229606565
10033	NC_012668	CTG	2	6	514119	514124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606565
10034	NC_012668	TTC	2	6	514144	514149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606565
10035	NC_012668	TTG	2	6	514161	514166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606565
10036	NC_012668	GAAA	2	8	514176	514183	75 %	0 %	25 %	0 %	229606565
10037	NC_012668	TTAT	2	8	514229	514236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_012668	TGG	2	6	514256	514261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_012668	TGG	2	6	514312	514317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_012668	TAA	2	6	514417	514422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_012668	GA	3	6	514470	514475	50 %	0 %	50 %	0 %	229606566
10042	NC_012668	CAAG	2	8	514494	514501	50 %	0 %	25 %	25 %	229606566
10043	NC_012668	TTC	2	6	514510	514515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606566
10044	NC_012668	GC	3	6	514530	514535	0 %	0 %	50 %	50 %	229606566
10045	NC_012668	ACA	2	6	514550	514555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606566
10046	NC_012668	TTA	2	6	514688	514693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606566
10047	NC_012668	GCGA	2	8	514696	514703	25 %	0 %	50 %	25 %	229606566
10048	NC_012668	GAG	2	6	514716	514721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606566
10049	NC_012668	CGTA	2	8	514797	514804	25 %	25 %	25 %	25 %	229606566
10050	NC_012668	AAT	2	6	514810	514815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_012668	ATT	2	6	514821	514826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606567
10052	NC_012668	ACG	2	6	514852	514857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606567
10053	NC_012668	ATG	2	6	514958	514963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606567
10054	NC_012668	AGT	2	6	514979	514984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606567
10055	NC_012668	GACGCC	2	12	515032	515043	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	229606567
10056	NC_012668	CAA	2	6	515047	515052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606567
10057	NC_012668	ACTC	2	8	515114	515121	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10058	NC_012668	TTGA	2	8	515216	515223	25 %	50 %	25 %	0 %	229606568
10059	NC_012668	CTT	2	6	515326	515331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606568
10060	NC_012668	ACC	2	6	515355	515360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606568
10061	NC_012668	T	6	6	515387	515392	0 %	100 %	0 %	0 %	229606568
10062	NC_012668	CACC	2	8	515410	515417	25 %	0 %	0 %	75 %	229606568
10063	NC_012668	CAG	3	9	515453	515461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606568
10064	NC_012668	CG	3	6	515480	515485	0 %	0 %	50 %	50 %	229606568
10065	NC_012668	TGC	2	6	515502	515507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606568
10066	NC_012668	GCC	2	6	515510	515515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606568
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10068	NC_012668	TGC	2	6	515522	515527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606568
10069	NC_012668	ATC	2	6	515561	515566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606568
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10071	NC_012668	CG	3	6	515646	515651	0 %	0 %	50 %	50 %	229606568
10072	NC_012668	TCA	2	6	515754	515759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606568
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10081	NC_012668	GAGG	2	8	516112	516119	25 %	0 %	75 %	0 %	229606569
10082	NC_012668	TTGAT	2	10	516120	516129	20 %	60 %	20 %	0 %	229606569
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10089	NC_012668	GCA	2	6	516570	516575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606569
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10091	NC_012668	AAT	2	6	516623	516628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_012668	ATT	2	6	516683	516688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606570
10093	NC_012668	GGC	2	6	516750	516755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606570
10094	NC_012668	CAGA	2	8	516890	516897	50 %	0 %	25 %	25 %	229606570
10095	NC_012668	ATCA	2	8	517107	517114	50 %	25 %	0 %	25 %	229606570
10096	NC_012668	CA	3	6	517276	517281	50 %	0 %	0 %	50 %	229606570
10097	NC_012668	AGA	2	6	517383	517388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606570
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10099	NC_012668	AGT	2	6	517496	517501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10101	NC_012668	ACT	2	6	517541	517546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_012668	TG	3	6	517594	517599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_012668	AAT	2	6	517623	517628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_012668	CGA	2	6	517658	517663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_012668	TGAG	2	8	517728	517735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_012668	CTG	2	6	517925	517930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606571
10107	NC_012668	ATG	2	6	517947	517952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606571
10108	NC_012668	GCC	2	6	517980	517985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606571
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10110	NC_012668	GTAC	2	8	518012	518019	25 %	25 %	25 %	25 %	229606571
10111	NC_012668	CGG	2	6	518034	518039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606571
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10121	NC_012668	GTG	2	6	518333	518338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606571
10122	NC_012668	AAC	2	6	518387	518392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606571
10123	NC_012668	GAA	2	6	518399	518404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606571
10124	NC_012668	CTA	2	6	518413	518418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606571
10125	NC_012668	TTG	2	6	518435	518440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606571
10126	NC_012668	CGA	2	6	518443	518448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606571
10127	NC_012668	CAA	2	6	518464	518469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606571
10128	NC_012668	TTC	2	6	518489	518494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606571
10129	NC_012668	CTG	2	6	518510	518515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606571
10130	NC_012668	CAAC	2	8	518521	518528	50 %	0 %	0 %	50 %	229606571
10131	NC_012668	ATT	2	6	518531	518536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606571
10132	NC_012668	GTG	2	6	518568	518573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606571
10133	NC_012668	AGA	2	6	518575	518580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606571
10134	NC_012668	GCC	2	6	518626	518631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606571
10135	NC_012668	TGA	2	6	518658	518663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606571
10136	NC_012668	A	6	6	518663	518668	100 %	0 %	0 %	0 %	229606571
10137	NC_012668	CTTT	2	8	518706	518713	0 %	75 %	0 %	25 %	229606571
10138	NC_012668	CGTG	2	8	518737	518744	0 %	25 %	50 %	25 %	229606571
10139	NC_012668	GCCAAC	2	12	518774	518785	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	229606571
10140	NC_012668	GATT	2	8	518806	518813	25 %	50 %	25 %	0 %	229606571
10141	NC_012668	CGTG	2	8	518815	518822	0 %	25 %	50 %	25 %	229606571
10142	NC_012668	TTA	2	6	518837	518842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606571
10143	NC_012668	ATA	2	6	518871	518876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606571
10144	NC_012668	AGA	2	6	518880	518885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606571
10145	NC_012668	TAC	2	6	518897	518902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606571
10146	NC_012668	CTCGTC	2	12	518952	518963	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	229606571
10147	NC_012668	ACCA	2	8	518993	519000	50 %	0 %	0 %	50 %	229606571
10148	NC_012668	GGC	2	6	519029	519034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606571
10149	NC_012668	AG	3	6	519088	519093	50 %	0 %	50 %	0 %	229606571
10150	NC_012668	AGA	2	6	519106	519111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606571
10151	NC_012668	AGA	2	6	519195	519200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10152	NC_012668	GCA	2	6	519244	519249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606572
10153	NC_012668	GGT	2	6	519266	519271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606572
10154	NC_012668	TTG	2	6	519299	519304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606572
10155	NC_012668	GCAG	2	8	519395	519402	25 %	0 %	50 %	25 %	229606572
10156	NC_012668	TGC	2	6	519471	519476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606572
10157	NC_012668	AAGTG	2	10	519571	519580	40 %	20 %	40 %	0 %	229606572
10158	NC_012668	CTCA	2	8	519590	519597	25 %	25 %	0 %	50 %	229606572
10159	NC_012668	CCAA	2	8	519642	519649	50 %	0 %	0 %	50 %	229606572
10160	NC_012668	CTA	2	6	519658	519663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606572
10161	NC_012668	CAC	2	6	519694	519699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606572
10162	NC_012668	AGCTC	2	10	519745	519754	20 %	20 %	20 %	40 %	229606572
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10164	NC_012668	GTG	2	6	520038	520043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606572
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10166	NC_012668	CTGCG	2	10	520193	520202	0 %	20 %	40 %	40 %	229606572
10167	NC_012668	TGG	2	6	520245	520250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606572
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10170	NC_012668	CGGA	2	8	520491	520498	25 %	0 %	50 %	25 %	229606573
10171	NC_012668	TAA	2	6	520590	520595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606573
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10177	NC_012668	TCAA	2	8	520922	520929	50 %	25 %	0 %	25 %	229606573
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10180	NC_012668	CAG	2	6	521059	521064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606573
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10183	NC_012668	GCA	2	6	521193	521198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606573
10184	NC_012668	GAT	2	6	521239	521244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606573
10185	NC_012668	GA	3	6	521420	521425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10186	NC_012668	TGA	2	6	521522	521527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606574
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10189	NC_012668	TGA	2	6	521576	521581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606574
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10192	NC_012668	TCA	2	6	521710	521715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606574
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10197	NC_012668	GGT	2	6	521795	521800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606574
10198	NC_012668	TGC	2	6	521821	521826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606574
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10210	NC_012668	TGA	2	6	522371	522376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606574
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10214	NC_012668	AAGCG	2	10	522530	522539	40 %	0 %	40 %	20 %	229606574
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10217	NC_012668	GCG	2	6	522585	522590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606574
10218	NC_012668	GC	3	6	522622	522627	0 %	0 %	50 %	50 %	229606574
10219	NC_012668	GCGG	2	8	522717	522724	0 %	0 %	75 %	25 %	229606574
10220	NC_012668	CCGTAA	2	12	522740	522751	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	229606574
10221	NC_012668	TGT	2	6	522817	522822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606574
10222	NC_012668	AAG	2	6	522829	522834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606574
10223	NC_012668	TCA	2	6	522844	522849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606574
10224	NC_012668	TGA	2	6	522875	522880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606574
10225	NC_012668	CAT	4	12	522911	522922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606574
10226	NC_012668	CTG	2	6	522960	522965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606574
10227	NC_012668	TTGA	2	8	522996	523003	25 %	50 %	25 %	0 %	229606574
10228	NC_012668	CCA	2	6	523029	523034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606574
10229	NC_012668	GAA	2	6	523046	523051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606574
10230	NC_012668	GATG	2	8	523115	523122	25 %	25 %	50 %	0 %	229606574
10231	NC_012668	CGC	2	6	523199	523204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606574
10232	NC_012668	GCC	2	6	523228	523233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606574
10233	NC_012668	TGC	2	6	523249	523254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606574
10234	NC_012668	TG	3	6	523291	523296	0 %	50 %	50 %	0 %	229606574
10235	NC_012668	AAG	2	6	523354	523359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606574
10236	NC_012668	GCTGA	2	10	523398	523407	20 %	20 %	40 %	20 %	229606574
10237	NC_012668	TACT	2	8	523458	523465	25 %	50 %	0 %	25 %	229606574
10238	NC_012668	TTGA	2	8	523533	523540	25 %	50 %	25 %	0 %	229606574
10239	NC_012668	GTG	2	6	523561	523566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606574
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10486	NC_012668	CAG	2	6	535814	535819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606587
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10488	NC_012668	CGT	2	6	535868	535873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606587
10489	NC_012668	GCT	2	6	535883	535888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606587
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10491	NC_012668	CGAT	2	8	536056	536063	25 %	25 %	25 %	25 %	229606587
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