MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012668	TGA	2	6	334273	334278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606417
6502	NC_012668	TAC	2	6	334361	334366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606417
6503	NC_012668	TGG	2	6	334406	334411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606417
6504	NC_012668	AAACCG	2	12	334413	334424	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	229606417
6505	NC_012668	CAGC	2	8	334502	334509	25 %	0 %	25 %	50 %	229606417
6506	NC_012668	GC	3	6	334671	334676	0 %	0 %	50 %	50 %	229606417
6507	NC_012668	TAC	2	6	334694	334699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606417
6508	NC_012668	TGG	2	6	334776	334781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606417
6509	NC_012668	GCC	2	6	334802	334807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606417
6510	NC_012668	ATG	2	6	334866	334871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606417
6511	NC_012668	AAG	2	6	334899	334904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606417
6512	NC_012668	TTGC	2	8	335170	335177	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6513	NC_012668	TC	3	6	335220	335225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6514	NC_012668	TCT	2	6	335231	335236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_012668	TGC	2	6	335359	335364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_012668	TAA	2	6	335400	335405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_012668	CAC	2	6	335469	335474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6518	NC_012668	TTA	2	6	335547	335552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606418
6519	NC_012668	TTGA	2	8	335676	335683	25 %	50 %	25 %	0 %	229606418
6520	NC_012668	TCA	2	6	335716	335721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606418
6521	NC_012668	CGG	2	6	335731	335736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606418
6522	NC_012668	TCA	2	6	335840	335845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606418
6523	NC_012668	CTG	2	6	335917	335922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606418
6524	NC_012668	AGAA	2	8	335998	336005	75 %	0 %	25 %	0 %	229606419
6525	NC_012668	AAG	2	6	336026	336031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606419
6526	NC_012668	AGTT	2	8	336039	336046	25 %	50 %	25 %	0 %	229606419
6527	NC_012668	GCACCA	2	12	336152	336163	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	229606419
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6530	NC_012668	CAG	2	6	336231	336236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606419
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6532	NC_012668	TTG	2	6	336414	336419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606419
6533	NC_012668	TTG	2	6	336453	336458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606419
6534	NC_012668	AAT	2	6	336465	336470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606419
6535	NC_012668	TTC	2	6	336533	336538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606420
6536	NC_012668	CTG	2	6	336610	336615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606420
6537	NC_012668	GCG	2	6	336688	336693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606420
6538	NC_012668	A	6	6	336853	336858	100 %	0 %	0 %	0 %	229606420
6539	NC_012668	ACG	2	6	336902	336907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606420
6540	NC_012668	TTA	2	6	336950	336955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606420
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6543	NC_012668	CGTA	2	8	336996	337003	25 %	25 %	25 %	25 %	229606420
6544	NC_012668	GCC	2	6	337054	337059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606420
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6547	NC_012668	GCAAT	2	10	337142	337151	40 %	20 %	20 %	20 %	229606420
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6551	NC_012668	CGTG	2	8	337267	337274	0 %	25 %	50 %	25 %	229606420
6552	NC_012668	AGC	2	6	337415	337420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606420
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6554	NC_012668	AAG	2	6	337457	337462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606420
6555	NC_012668	GGC	2	6	337564	337569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606420
6556	NC_012668	CA	3	6	337589	337594	50 %	0 %	0 %	50 %	229606420
6557	NC_012668	GAT	2	6	337632	337637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606420
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6559	NC_012668	GAT	2	6	337707	337712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606420
6560	NC_012668	ACA	2	6	337743	337748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606420
6561	NC_012668	A	6	6	337807	337812	100 %	0 %	0 %	0 %	229606420
6562	NC_012668	GCC	2	6	337828	337833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6563	NC_012668	CAAT	2	8	337859	337866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6564	NC_012668	ACT	2	6	337876	337881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_012668	TTTTG	2	10	337932	337941	0 %	80 %	20 %	0 %	229606421
6566	NC_012668	GAA	2	6	338105	338110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606422
6567	NC_012668	GTCA	2	8	338122	338129	25 %	25 %	25 %	25 %	229606422
6568	NC_012668	GTC	2	6	338204	338209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606422
6569	NC_012668	GCA	2	6	338248	338253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606422
6570	NC_012668	ATGG	2	8	338332	338339	25 %	25 %	50 %	0 %	229606422
6571	NC_012668	TGGTAC	2	12	338449	338460	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229606422
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6573	NC_012668	ACT	2	6	338617	338622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606422
6574	NC_012668	TGG	2	6	338703	338708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606422
6575	NC_012668	TGG	2	6	338715	338720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606422
6576	NC_012668	GGCC	2	8	338734	338741	0 %	0 %	50 %	50 %	229606422
6577	NC_012668	ATC	2	6	338762	338767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606422
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6579	NC_012668	GCTAG	2	10	338914	338923	20 %	20 %	40 %	20 %	229606422
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6581	NC_012668	GC	3	6	339028	339033	0 %	0 %	50 %	50 %	229606423
6582	NC_012668	TCG	2	6	339100	339105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606424
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6586	NC_012668	TAAA	2	8	339376	339383	75 %	25 %	0 %	0 %	229606424
6587	NC_012668	CTG	2	6	339402	339407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606424
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6589	NC_012668	GAC	2	6	339748	339753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606424
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6592	NC_012668	GC	3	6	339897	339902	0 %	0 %	50 %	50 %	229606424
6593	NC_012668	CTG	2	6	339976	339981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606424
6594	NC_012668	CAT	2	6	340024	340029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606424
6595	NC_012668	AAGAG	2	10	340034	340043	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_012668	TAC	2	6	340093	340098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606425
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6600	NC_012668	CAT	2	6	340249	340254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606425
6601	NC_012668	GCA	2	6	340283	340288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606425
6602	NC_012668	ATG	2	6	340292	340297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606425
6603	NC_012668	A	6	6	340331	340336	100 %	0 %	0 %	0 %	229606425
6604	NC_012668	T	6	6	340364	340369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_012668	T	6	6	340391	340396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_012668	CAC	2	6	340410	340415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6607	NC_012668	AC	3	6	340414	340419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6608	NC_012668	CTT	2	6	340442	340447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_012668	A	7	7	340495	340501	100 %	0 %	0 %	0 %	229606426
6610	NC_012668	GC	3	6	340504	340509	0 %	0 %	50 %	50 %	229606426
6611	NC_012668	ATC	2	6	340672	340677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606426
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6613	NC_012668	GAG	2	6	340805	340810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606426
6614	NC_012668	GAA	2	6	340811	340816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606426
6615	NC_012668	GCT	2	6	340834	340839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606426
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6617	NC_012668	A	7	7	341009	341015	100 %	0 %	0 %	0 %	229606426
6618	NC_012668	CGG	2	6	341022	341027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606426
6619	NC_012668	AAG	2	6	341109	341114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606426
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6621	NC_012668	TGA	2	6	341182	341187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606426
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6623	NC_012668	GT	3	6	341217	341222	0 %	50 %	50 %	0 %	229606426
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6996	NC_012668	TGGTG	2	10	359645	359654	0 %	40 %	60 %	0 %	229606439
6997	NC_012668	CCCAA	2	10	359690	359699	40 %	0 %	0 %	60 %	229606439
6998	NC_012668	GCGCA	2	10	359701	359710	20 %	0 %	40 %	40 %	229606439
6999	NC_012668	CTCG	2	8	359745	359752	0 %	25 %	25 %	50 %	229606439
7000	NC_012668	GCG	2	6	359859	359864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606439

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