MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012668	ATC	3	9	308364	308372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606401
6002	NC_012668	TTG	2	6	308373	308378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606401
6003	NC_012668	TAA	2	6	308459	308464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606401
6004	NC_012668	TAGG	2	8	308468	308475	25 %	25 %	50 %	0 %	229606401
6005	NC_012668	AGC	2	6	308541	308546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606401
6006	NC_012668	GTC	2	6	308608	308613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606401
6007	NC_012668	TGA	2	6	308762	308767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606402
6008	NC_012668	TTG	2	6	308776	308781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606402
6009	NC_012668	ACTG	2	8	308843	308850	25 %	25 %	25 %	25 %	229606402
6010	NC_012668	CAA	2	6	308877	308882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606402
6011	NC_012668	ACT	2	6	308905	308910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606402
6012	NC_012668	TTTTG	2	10	308940	308949	0 %	80 %	20 %	0 %	229606402
6013	NC_012668	CCG	2	6	309016	309021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606402
6014	NC_012668	CA	3	6	309166	309171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_012668	GAA	2	6	309200	309205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606403
6016	NC_012668	AAC	2	6	309215	309220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606403
6017	NC_012668	TTTA	2	8	309338	309345	25 %	75 %	0 %	0 %	229606403
6018	NC_012668	GCC	2	6	309388	309393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606403
6019	NC_012668	AGC	2	6	309395	309400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606403
6020	NC_012668	GCA	2	6	309466	309471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606403
6021	NC_012668	ATT	2	6	309595	309600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606403
6022	NC_012668	GAT	2	6	309601	309606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606403
6023	NC_012668	AAT	2	6	309634	309639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606403
6024	NC_012668	CAA	2	6	309730	309735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606403
6025	NC_012668	CAC	2	6	309786	309791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606403
6026	NC_012668	TGAA	2	8	309869	309876	50 %	25 %	25 %	0 %	229606403
6027	NC_012668	TTGG	2	8	309898	309905	0 %	50 %	50 %	0 %	229606403
6028	NC_012668	CCG	2	6	310003	310008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606403
6029	NC_012668	A	6	6	310027	310032	100 %	0 %	0 %	0 %	229606403
6030	NC_012668	AGA	2	6	310104	310109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606403
6031	NC_012668	CTTAC	2	10	310131	310140	20 %	40 %	0 %	40 %	229606403
6032	NC_012668	TCA	2	6	310280	310285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606403
6033	NC_012668	TAA	2	6	310290	310295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606403
6034	NC_012668	TGA	2	6	310347	310352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606403
6035	NC_012668	TAC	2	6	310365	310370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606403
6036	NC_012668	GCA	2	6	310401	310406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606403
6037	NC_012668	CAAA	2	8	310515	310522	75 %	0 %	0 %	25 %	229606403
6038	NC_012668	T	6	6	310569	310574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_012668	AGACAA	2	12	310653	310664	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6040	NC_012668	AAG	2	6	310675	310680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_012668	GAT	2	6	310696	310701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_012668	CAT	2	6	310706	310711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_012668	A	6	6	310779	310784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_012668	TAA	2	6	310808	310813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_012668	GCGGA	2	10	310817	310826	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6046	NC_012668	CCGCT	2	10	310885	310894	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6047	NC_012668	GTTTC	2	10	310970	310979	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6048	NC_012668	CAA	2	6	311076	311081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_012668	CA	4	8	311105	311112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_012668	AC	3	6	311217	311222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_012668	AAC	2	6	311248	311253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_012668	AGC	2	6	311416	311421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_012668	ACG	2	6	311470	311475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_012668	TGA	2	6	311550	311555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_012668	CCG	2	6	311578	311583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6056	NC_012668	ACC	2	6	311665	311670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_012668	CTC	2	6	311784	311789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_012668	GAG	2	6	311803	311808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_012668	CCA	2	6	311828	311833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_012668	GGT	2	6	311888	311893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_012668	GTA	2	6	311985	311990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_012668	ATTTCA	2	12	312044	312055	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6063	NC_012668	CAT	2	6	312083	312088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_012668	GCC	2	6	312158	312163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_012668	TAA	2	6	312283	312288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_012668	TC	3	6	312410	312415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_012668	ACC	2	6	312440	312445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_012668	GTA	2	6	312528	312533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_012668	CGT	2	6	312540	312545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_012668	AG	4	8	312557	312564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_012668	C	6	6	312640	312645	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6072	NC_012668	GAG	2	6	312770	312775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_012668	CGACT	2	10	312947	312956	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6074	NC_012668	CTTT	2	8	312971	312978	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6075	NC_012668	ATG	2	6	312981	312986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_012668	GCT	2	6	312987	312992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_012668	GTT	2	6	313076	313081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_012668	ACG	2	6	313091	313096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_012668	GT	3	6	313113	313118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_012668	TACT	2	8	313130	313137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6081	NC_012668	AGT	2	6	313206	313211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_012668	TCGGT	2	10	313321	313330	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6083	NC_012668	CAC	2	6	313507	313512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_012668	GTAC	2	8	313532	313539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_012668	GTCA	2	8	313615	313622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6086	NC_012668	GGA	2	6	313638	313643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_012668	C	6	6	313648	313653	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6088	NC_012668	TCGC	2	8	313795	313802	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_012668	CTA	2	6	313805	313810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_012668	TCT	2	6	313829	313834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_012668	GTT	3	9	314070	314078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_012668	AAC	2	6	314081	314086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_012668	TGT	2	6	314190	314195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_012668	ACAA	2	8	314230	314237	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6095	NC_012668	TTG	2	6	314245	314250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_012668	TGA	2	6	314290	314295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_012668	TGG	2	6	314335	314340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_012668	CCT	2	6	314365	314370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_012668	AGGC	2	8	314378	314385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6100	NC_012668	GTG	2	6	314418	314423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_012668	ACC	2	6	314441	314446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_012668	ACC	2	6	314476	314481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6103	NC_012668	AATC	2	8	314519	314526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_012668	TG	3	6	314527	314532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_012668	TCA	2	6	314538	314543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_012668	ATC	2	6	314549	314554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6108	NC_012668	TCC	2	6	314641	314646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6109	NC_012668	CTT	2	6	314665	314670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_012668	GT	3	6	314701	314706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_012668	ACG	2	6	314802	314807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_012668	GT	3	6	314870	314875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_012668	ATG	2	6	314895	314900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_012668	CGT	2	6	314907	314912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_012668	TCC	2	6	314921	314926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_012668	CCA	2	6	314957	314962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_012668	GAC	2	6	315035	315040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6119	NC_012668	TTC	2	6	315123	315128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_012668	C	6	6	315430	315435	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6121	NC_012668	ACC	2	6	315512	315517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_012668	GCT	2	6	315576	315581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_012668	CTT	2	6	315601	315606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_012668	TTAAC	2	10	315635	315644	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6125	NC_012668	TCC	2	6	315650	315655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6126	NC_012668	CTT	2	6	315685	315690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_012668	CTG	2	6	315744	315749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_012668	ATC	2	6	315794	315799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6130	NC_012668	CCG	2	6	315993	315998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6131	NC_012668	TGC	2	6	316027	316032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_012668	GCC	2	6	316058	316063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6133	NC_012668	T	6	6	316105	316110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_012668	TAA	2	6	316156	316161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6255	NC_012668	TGG	2	6	321947	321952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_012668	TTAG	2	8	321957	321964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_012668	GTT	2	6	321977	321982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_012668	AAG	2	6	322015	322020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_012668	AAC	2	6	322023	322028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6260	NC_012668	TTAA	2	8	322032	322039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_012668	T	6	6	322084	322089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6262	NC_012668	AAAAC	2	10	322094	322103	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6269	NC_012668	CAGGC	2	10	322728	322737	20 %	0 %	40 %	40 %	229606411
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6282	NC_012668	GCT	2	6	323314	323319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606411
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6287	NC_012668	A	6	6	323456	323461	100 %	0 %	0 %	0 %	229606411
6288	NC_012668	CGAC	2	8	323514	323521	25 %	0 %	25 %	50 %	229606411
6289	NC_012668	GCG	2	6	323525	323530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606411
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6291	NC_012668	CTG	2	6	323744	323749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606411
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6323	NC_012668	A	6	6	325310	325315	100 %	0 %	0 %	0 %	229606412
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6326	NC_012668	TACT	2	8	325435	325442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6327	NC_012668	GTT	2	6	325497	325502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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