MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_012668	CAT	2	6	2895616	2895621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55502	NC_012668	CAGC	2	8	2895624	2895631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55503	NC_012668	A	6	6	2895653	2895658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55504	NC_012668	AAG	2	6	2895688	2895693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55505	NC_012668	AG	3	6	2895701	2895706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55506	NC_012668	A	9	9	2895749	2895757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55507	NC_012668	TAA	2	6	2895780	2895785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55508	NC_012668	GCGGA	2	10	2895789	2895798	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55509	NC_012668	CCGCT	2	10	2895857	2895866	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55510	NC_012668	T	7	7	2895890	2895896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55511	NC_012668	ACA	2	6	2895926	2895931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55512	NC_012668	GTTTC	2	10	2895992	2896001	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55513	NC_012668	CAA	2	6	2896098	2896103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55514	NC_012668	CA	4	8	2896127	2896134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55515	NC_012668	AC	3	6	2896239	2896244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55516	NC_012668	AAC	2	6	2896270	2896275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55517	NC_012668	AGC	2	6	2896438	2896443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55518	NC_012668	ACG	2	6	2896492	2896497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55519	NC_012668	TGA	2	6	2896572	2896577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55520	NC_012668	CCG	2	6	2896600	2896605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55521	NC_012668	ACC	2	6	2896687	2896692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55522	NC_012668	CTC	2	6	2896806	2896811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55523	NC_012668	GAG	2	6	2896825	2896830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55524	NC_012668	CCA	2	6	2896850	2896855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55525	NC_012668	GGT	2	6	2896910	2896915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55526	NC_012668	GTA	2	6	2897007	2897012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55527	NC_012668	ATTTCA	2	12	2897066	2897077	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55528	NC_012668	CAT	2	6	2897105	2897110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55529	NC_012668	GCC	2	6	2897180	2897185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55530	NC_012668	TAA	2	6	2897305	2897310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55531	NC_012668	TC	3	6	2897432	2897437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55532	NC_012668	ACC	2	6	2897462	2897467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55533	NC_012668	GTA	2	6	2897550	2897555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55534	NC_012668	CGT	2	6	2897562	2897567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55535	NC_012668	AG	4	8	2897579	2897586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55536	NC_012668	C	6	6	2897662	2897667	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55537	NC_012668	GAG	2	6	2897793	2897798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55538	NC_012668	CGACT	2	10	2897970	2897979	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55539	NC_012668	CTTT	2	8	2897994	2898001	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55540	NC_012668	ATG	2	6	2898004	2898009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55541	NC_012668	GCT	2	6	2898010	2898015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55542	NC_012668	GTT	2	6	2898099	2898104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55543	NC_012668	ACG	2	6	2898114	2898119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55544	NC_012668	GT	3	6	2898136	2898141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55545	NC_012668	TACT	2	8	2898153	2898160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55546	NC_012668	AGT	2	6	2898229	2898234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55547	NC_012668	TCGGT	2	10	2898344	2898353	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55548	NC_012668	CAC	2	6	2898530	2898535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55549	NC_012668	GTAC	2	8	2898555	2898562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55550	NC_012668	GTCA	2	8	2898638	2898645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55551	NC_012668	GGA	2	6	2898661	2898666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55552	NC_012668	C	6	6	2898671	2898676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55553	NC_012668	TCGC	2	8	2898818	2898825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55554	NC_012668	CTA	2	6	2898828	2898833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55555	NC_012668	TCT	2	6	2898852	2898857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55556	NC_012668	AAC	2	6	2899104	2899109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55557	NC_012668	TGT	2	6	2899213	2899218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55558	NC_012668	ACAA	2	8	2899253	2899260	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55559	NC_012668	TTG	2	6	2899268	2899273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55560	NC_012668	TGA	2	6	2899313	2899318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55561	NC_012668	CCG	2	6	2899390	2899395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55562	NC_012668	TCTAA	2	10	2899449	2899458	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55563	NC_012668	AATC	2	8	2899463	2899470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55564	NC_012668	TG	3	6	2899471	2899476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55565	NC_012668	TCA	2	6	2899482	2899487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55566	NC_012668	AGG	2	6	2899504	2899509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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55568	NC_012668	CTT	2	6	2899609	2899614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55569	NC_012668	GT	3	6	2899645	2899650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55570	NC_012668	ACG	2	6	2899746	2899751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55571	NC_012668	GT	3	6	2899814	2899819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55572	NC_012668	ATG	2	6	2899839	2899844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55573	NC_012668	CGT	2	6	2899851	2899856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55574	NC_012668	TCC	2	6	2899865	2899870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55575	NC_012668	CCA	2	6	2899901	2899906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55576	NC_012668	GAC	2	6	2899979	2899984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55577	NC_012668	GCA	2	6	2899991	2899996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55578	NC_012668	TTC	2	6	2900067	2900072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55579	NC_012668	GCC	2	6	2900310	2900315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55580	NC_012668	C	6	6	2900374	2900379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55581	NC_012668	ACC	2	6	2900456	2900461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55582	NC_012668	GCT	2	6	2900520	2900525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55583	NC_012668	CTT	2	6	2900545	2900550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55584	NC_012668	ACC	2	6	2900587	2900592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55585	NC_012668	TCC	2	6	2900594	2900599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55586	NC_012668	CTT	2	6	2900629	2900634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55590	NC_012668	CCG	2	6	2900937	2900942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55591	NC_012668	TGC	2	6	2900971	2900976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55592	NC_012668	GCC	2	6	2901002	2901007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55593	NC_012668	T	6	6	2901049	2901054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55594	NC_012668	TAA	2	6	2901100	2901105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55595	NC_012668	T	6	6	2901180	2901185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55596	NC_012668	ATC	2	6	2901190	2901195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55597	NC_012668	CA	3	6	2901206	2901211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55598	NC_012668	GATT	2	8	2901212	2901219	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55599	NC_012668	T	6	6	2901307	2901312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55600	NC_012668	GCAA	2	8	2901416	2901423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55601	NC_012668	TTA	2	6	2901444	2901449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55603	NC_012668	GATA	2	8	2901547	2901554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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55980	NC_012668	CAA	2	6	2921206	2921211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608705
55981	NC_012668	A	6	6	2921271	2921276	100 %	0 %	0 %	0 %	229608705
55982	NC_012668	GAT	2	6	2921300	2921305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608705
55983	NC_012668	CAT	2	6	2921368	2921373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608705
55984	NC_012668	CCA	2	6	2921517	2921522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608705
55985	NC_012668	T	6	6	2921653	2921658	0 %	100 %	0 %	0 %	229608705
55986	NC_012668	CCG	2	6	2921692	2921697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608705
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55988	NC_012668	GC	3	6	2921831	2921836	0 %	0 %	50 %	50 %	229608705
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55992	NC_012668	ATG	2	6	2922060	2922065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608705
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55997	NC_012668	A	7	7	2922326	2922332	100 %	0 %	0 %	0 %	229608706
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