MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55120	NC_012668	CAA	2	6	2875926	2875931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608670
55121	NC_012668	CA	3	6	2875976	2875981	50 %	0 %	0 %	50 %	229608670
55122	NC_012668	ACC	2	6	2876107	2876112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608670
55123	NC_012668	TGAC	2	8	2876221	2876228	25 %	25 %	25 %	25 %	229608670
55124	NC_012668	GCC	2	6	2876242	2876247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608670
55125	NC_012668	TCA	2	6	2876334	2876339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55126	NC_012668	CAT	2	6	2876356	2876361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55127	NC_012668	ACT	2	6	2876373	2876378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55128	NC_012668	T	6	6	2876400	2876405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55129	NC_012668	TAAT	2	8	2876420	2876427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55130	NC_012668	T	6	6	2876431	2876436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55131	NC_012668	A	7	7	2876534	2876540	100 %	0 %	0 %	0 %	229608671
55132	NC_012668	GCT	2	6	2876579	2876584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608671
55133	NC_012668	AACTTC	2	12	2876612	2876623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608671
55134	NC_012668	GTT	2	6	2876651	2876656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608671
55135	NC_012668	TTC	2	6	2876657	2876662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608671
55136	NC_012668	TC	3	6	2876778	2876783	0 %	50 %	0 %	50 %	229608671
55137	NC_012668	CTG	2	6	2876802	2876807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608671
55138	NC_012668	CGG	2	6	2876815	2876820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608671
55139	NC_012668	CGA	2	6	2876932	2876937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608671
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55144	NC_012668	CTG	2	6	2877129	2877134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608671
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55146	NC_012668	ATA	2	6	2877182	2877187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55147	NC_012668	AAG	2	6	2877214	2877219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55148	NC_012668	TCA	2	6	2877225	2877230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55149	NC_012668	TTC	2	6	2877263	2877268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55151	NC_012668	CCT	2	6	2877346	2877351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55152	NC_012668	CTG	2	6	2877432	2877437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55153	NC_012668	TGA	2	6	2877478	2877483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608672
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55156	NC_012668	GAT	2	6	2877687	2877692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608672
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55160	NC_012668	CGAG	2	8	2878105	2878112	25 %	0 %	50 %	25 %	229608672
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55163	NC_012668	TAT	2	6	2878166	2878171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608672
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55171	NC_012668	GCT	2	6	2878488	2878493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608674
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55174	NC_012668	CG	3	6	2878753	2878758	0 %	0 %	50 %	50 %	229608674
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55178	NC_012668	AAGAGC	2	12	2878892	2878903	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	229608674
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55188	NC_012668	TGC	2	6	2879250	2879255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55221	NC_012668	TTA	2	6	2880889	2880894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608677
55222	NC_012668	TTG	2	6	2880985	2880990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608677
55223	NC_012668	GATG	2	8	2881046	2881053	25 %	25 %	50 %	0 %	229608677
55224	NC_012668	CACCG	2	10	2881095	2881104	20 %	0 %	20 %	60 %	229608677
55225	NC_012668	TGA	2	6	2881163	2881168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608677
55226	NC_012668	CAC	2	6	2881293	2881298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608677
55227	NC_012668	A	6	6	2881382	2881387	100 %	0 %	0 %	0 %	229608677
55228	NC_012668	A	6	6	2881419	2881424	100 %	0 %	0 %	0 %	229608677
55229	NC_012668	ATC	2	6	2881489	2881494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608677
55230	NC_012668	AGAT	2	8	2881528	2881535	50 %	25 %	25 %	0 %	229608677
55231	NC_012668	GAT	2	6	2881563	2881568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608677
55232	NC_012668	ATG	2	6	2881573	2881578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608677
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55234	NC_012668	GCTT	2	8	2881666	2881673	0 %	50 %	25 %	25 %	229608677
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55236	NC_012668	CAA	2	6	2881772	2881777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608677
55237	NC_012668	TCA	2	6	2881888	2881893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608677
55238	NC_012668	ATT	2	6	2881902	2881907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608677
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55240	NC_012668	GC	3	6	2882141	2882146	0 %	0 %	50 %	50 %	229608677
55241	NC_012668	CAC	2	6	2882325	2882330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608677
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55243	NC_012668	CCAA	2	8	2882394	2882401	50 %	0 %	0 %	50 %	229608677
55244	NC_012668	GCTGAC	2	12	2882433	2882444	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	229608677
55245	NC_012668	CTC	2	6	2882447	2882452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229608677
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55333	NC_012668	TGC	2	6	2887239	2887244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608680
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55350	NC_012668	A	6	6	2888266	2888271	100 %	0 %	0 %	0 %	229608680
55351	NC_012668	ATT	2	6	2888275	2888280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608680
55352	NC_012668	GCAAC	2	10	2888322	2888331	40 %	0 %	20 %	40 %	229608680
55353	NC_012668	GAC	2	6	2888332	2888337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608680
55354	NC_012668	ACC	2	6	2888343	2888348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608680
55355	NC_012668	GAT	2	6	2888368	2888373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608680
55356	NC_012668	GTT	2	6	2888421	2888426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608680
55357	NC_012668	CTG	2	6	2888479	2888484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608680
55358	NC_012668	TCA	2	6	2888551	2888556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55359	NC_012668	GAT	2	6	2888564	2888569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608681
55360	NC_012668	CCA	2	6	2888605	2888610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608681
55361	NC_012668	CACATA	2	12	2888726	2888737	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	229608681
55362	NC_012668	GCA	2	6	2888821	2888826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608681
55363	NC_012668	ACCC	2	8	2888849	2888856	25 %	0 %	0 %	75 %	229608681
55364	NC_012668	ATTG	2	8	2888873	2888880	25 %	50 %	25 %	0 %	229608681
55365	NC_012668	CAC	2	6	2888897	2888902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608681
55366	NC_012668	GCT	2	6	2888917	2888922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608681
55367	NC_012668	CAC	2	6	2889079	2889084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608681
55368	NC_012668	A	6	6	2889100	2889105	100 %	0 %	0 %	0 %	229608681
55369	NC_012668	CTG	2	6	2889237	2889242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608681
55370	NC_012668	GGC	2	6	2889250	2889255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608681
55371	NC_012668	GGC	2	6	2889294	2889299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608681
55372	NC_012668	CTC	2	6	2889359	2889364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229608681
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55374	NC_012668	CAAC	3	12	2889503	2889514	50 %	0 %	0 %	50 %	229608681
55375	NC_012668	CCA	2	6	2889543	2889548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608682
55376	NC_012668	AAAC	2	8	2889561	2889568	75 %	0 %	0 %	25 %	229608682
55377	NC_012668	GC	3	6	2889810	2889815	0 %	0 %	50 %	50 %	229608682
55378	NC_012668	CGG	2	6	2889817	2889822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608682
55379	NC_012668	TGC	2	6	2889926	2889931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608682
55380	NC_012668	CAC	2	6	2889936	2889941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608682
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55382	NC_012668	CAG	2	6	2890042	2890047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608682
55383	NC_012668	GCT	2	6	2890077	2890082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608682
55384	NC_012668	TCA	2	6	2890086	2890091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608682
55385	NC_012668	TCT	2	6	2890136	2890141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608682
55386	NC_012668	GCA	2	6	2890161	2890166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608682
55387	NC_012668	CAC	2	6	2890255	2890260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608682
55388	NC_012668	GCG	2	6	2890323	2890328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608682
55389	NC_012668	ATC	2	6	2890354	2890359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608682
55390	NC_012668	T	6	6	2890360	2890365	0 %	100 %	0 %	0 %	229608682
55391	NC_012668	GCA	2	6	2890392	2890397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608682
55392	NC_012668	TGC	2	6	2890448	2890453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608682
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55395	NC_012668	GCT	2	6	2890581	2890586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608682
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55397	NC_012668	ATCC	2	8	2890754	2890761	25 %	25 %	0 %	50 %	229608682
55398	NC_012668	CAC	2	6	2890762	2890767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608682
55399	NC_012668	A	8	8	2890782	2890789	100 %	0 %	0 %	0 %	229608682
55400	NC_012668	CGCGC	2	10	2890882	2890891	0 %	0 %	40 %	60 %	229608683
55401	NC_012668	TCT	2	6	2890922	2890927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608683
55402	NC_012668	GAC	2	6	2890941	2890946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608683
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55406	NC_012668	GT	3	6	2891038	2891043	0 %	50 %	50 %	0 %	229608683
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55412	NC_012668	GTAAT	2	10	2891234	2891243	40 %	40 %	20 %	0 %	229608683
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55414	NC_012668	CAC	2	6	2891286	2891291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608683
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55417	NC_012668	CAGC	2	8	2891415	2891422	25 %	0 %	25 %	50 %	229608683
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55420	NC_012668	CAAA	2	8	2891617	2891624	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55421	NC_012668	AT	3	6	2891652	2891657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55422	NC_012668	AAGCA	2	10	2891669	2891678	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55423	NC_012668	AAC	2	6	2891683	2891688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55424	NC_012668	T	7	7	2891704	2891710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55425	NC_012668	ACA	2	6	2891775	2891780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55426	NC_012668	ATG	2	6	2891940	2891945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608684
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55429	NC_012668	GAA	2	6	2892057	2892062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608684
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55450	NC_012668	AAGC	2	8	2892837	2892844	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55451	NC_012668	GAA	2	6	2892899	2892904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608685
55452	NC_012668	CGTA	2	8	2892971	2892978	25 %	25 %	25 %	25 %	229608685
55453	NC_012668	A	6	6	2893038	2893043	100 %	0 %	0 %	0 %	229608685
55454	NC_012668	GT	3	6	2893053	2893058	0 %	50 %	50 %	0 %	229608685
55455	NC_012668	TGAT	2	8	2893114	2893121	25 %	50 %	25 %	0 %	229608685
55456	NC_012668	TCA	2	6	2893138	2893143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608685
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55459	NC_012668	CT	3	6	2893290	2893295	0 %	50 %	0 %	50 %	229608685
55460	NC_012668	AGA	2	6	2893298	2893303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608685
55461	NC_012668	TATG	2	8	2893366	2893373	25 %	50 %	25 %	0 %	229608685
55462	NC_012668	TTGC	2	8	2893388	2893395	0 %	50 %	25 %	25 %	229608685
55463	NC_012668	CAA	2	6	2893409	2893414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608685
55464	NC_012668	AGC	2	6	2893472	2893477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608685
55465	NC_012668	AGA	2	6	2893481	2893486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608685
55466	NC_012668	GCA	2	6	2893524	2893529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608685
55467	NC_012668	ACC	2	6	2893563	2893568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608685
55468	NC_012668	TGA	2	6	2893589	2893594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608685
55469	NC_012668	TGA	2	6	2893625	2893630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608685
55470	NC_012668	GCC	2	6	2893638	2893643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608685
55471	NC_012668	CAT	2	6	2893667	2893672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608685
55472	NC_012668	CACT	2	8	2893731	2893738	25 %	25 %	0 %	50 %	229608685
55473	NC_012668	CTA	2	6	2893766	2893771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608685
55474	NC_012668	TGA	2	6	2893808	2893813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608685
55475	NC_012668	GAT	2	6	2893836	2893841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608685
55476	NC_012668	TGA	2	6	2893846	2893851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608685
55477	NC_012668	ACTACG	2	12	2893927	2893938	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	229608685
55478	NC_012668	CGC	2	6	2893989	2893994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608685
55479	NC_012668	TGA	2	6	2894053	2894058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608685
55480	NC_012668	GAT	2	6	2894121	2894126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608685
55481	NC_012668	CTG	2	6	2894190	2894195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608685
55482	NC_012668	TG	3	6	2894289	2894294	0 %	50 %	50 %	0 %	229608686
55483	NC_012668	CAT	2	6	2894425	2894430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608686
55484	NC_012668	ACT	2	6	2894464	2894469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608686
55485	NC_012668	TTA	2	6	2894535	2894540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608687
55486	NC_012668	CTG	2	6	2894631	2894636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608687
55487	NC_012668	GGC	2	6	2894821	2894826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608687
55488	NC_012668	AAGCA	2	10	2894832	2894841	60 %	0 %	20 %	20 %	229608687
55489	NC_012668	ACC	2	6	2894868	2894873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608687
55490	NC_012668	ACC	2	6	2894883	2894888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608687
55491	NC_012668	AACA	2	8	2894911	2894918	75 %	0 %	0 %	25 %	229608687
55492	NC_012668	GTTGC	2	10	2895182	2895191	0 %	40 %	40 %	20 %	229608687
55493	NC_012668	CCT	2	6	2895265	2895270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229608688
55494	NC_012668	TGT	2	6	2895277	2895282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608688
55495	NC_012668	ATA	2	6	2895291	2895296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608688
55496	NC_012668	CTG	2	6	2895399	2895404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608688
55497	NC_012668	CCA	2	6	2895428	2895433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608688
55498	NC_012668	CCT	2	6	2895445	2895450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229608688
55499	NC_012668	AG	3	6	2895511	2895516	50 %	0 %	50 %	0 %	229608688
55500	NC_012668	T	6	6	2895608	2895613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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