MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54502	NC_012668	AGC	2	6	2845105	2845110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608638
54503	NC_012668	TTG	2	6	2845164	2845169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608638
54504	NC_012668	CA	3	6	2845235	2845240	50 %	0 %	0 %	50 %	229608638
54505	NC_012668	GC	3	6	2845261	2845266	0 %	0 %	50 %	50 %	229608638
54506	NC_012668	ATGG	2	8	2845302	2845309	25 %	25 %	50 %	0 %	229608638
54507	NC_012668	TC	3	6	2845316	2845321	0 %	50 %	0 %	50 %	229608638
54508	NC_012668	GATTTC	2	12	2845367	2845378	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229608639
54509	NC_012668	CGC	2	6	2845408	2845413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608639
54510	NC_012668	TTAA	2	8	2845650	2845657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54512	NC_012668	TA	3	6	2845746	2845751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54514	NC_012668	AAAAC	2	10	2845815	2845824	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54515	NC_012668	GC	3	6	2845879	2845884	0 %	0 %	50 %	50 %	229608640
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54517	NC_012668	GGCT	2	8	2846068	2846075	0 %	25 %	50 %	25 %	229608640
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54531	NC_012668	A	6	6	2846765	2846770	100 %	0 %	0 %	0 %	229608640
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54855	NC_012668	GCT	2	6	2863026	2863031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608657
54856	NC_012668	GA	4	8	2863040	2863047	50 %	0 %	50 %	0 %	229608657
54857	NC_012668	TTG	2	6	2863090	2863095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608657
54858	NC_012668	TATT	2	8	2863224	2863231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54859	NC_012668	GC	3	6	2863352	2863357	0 %	0 %	50 %	50 %	229608658
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54889	NC_012668	CT	3	6	2864699	2864704	0 %	50 %	0 %	50 %	229608659
54890	NC_012668	TGTT	2	8	2864709	2864716	0 %	75 %	25 %	0 %	229608659
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54898	NC_012668	ATCA	2	8	2865075	2865082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54899	NC_012668	A	6	6	2865106	2865111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54911	NC_012668	GCACC	2	10	2865603	2865612	20 %	0 %	20 %	60 %	229608660
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54919	NC_012668	CATCA	2	10	2865838	2865847	40 %	20 %	0 %	40 %	229608660
54920	NC_012668	TCAA	2	8	2865947	2865954	50 %	25 %	0 %	25 %	229608660
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54922	NC_012668	AAGGCG	2	12	2866037	2866048	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	229608660
54923	NC_012668	TTG	2	6	2866132	2866137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608661
54924	NC_012668	GCC	2	6	2866146	2866151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608661
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54926	NC_012668	CAAA	2	8	2866262	2866269	75 %	0 %	0 %	25 %	229608661
54927	NC_012668	GGT	2	6	2866287	2866292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608661
54928	NC_012668	TGA	2	6	2866336	2866341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608661
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54931	NC_012668	ACCG	2	8	2866422	2866429	25 %	0 %	25 %	50 %	229608661
54932	NC_012668	ATC	2	6	2866477	2866482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608661
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54934	NC_012668	CCA	2	6	2866580	2866585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608661
54935	NC_012668	CTG	2	6	2866623	2866628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608661
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54937	NC_012668	AATC	2	8	2866730	2866737	50 %	25 %	0 %	25 %	229608661
54938	NC_012668	TCG	2	6	2866775	2866780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608661
54939	NC_012668	CTT	2	6	2866793	2866798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608661
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54947	NC_012668	GTTC	2	8	2867246	2867253	0 %	50 %	25 %	25 %	229608661
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54951	NC_012668	CTT	3	9	2867516	2867524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608661
54952	NC_012668	CAC	3	9	2867582	2867590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608661
54953	NC_012668	GCA	2	6	2867617	2867622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608661
54954	NC_012668	CGA	2	6	2867669	2867674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608661
54955	NC_012668	TGA	2	6	2867699	2867704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608661
54956	NC_012668	CGTATC	2	12	2867724	2867735	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229608661
54957	NC_012668	CTT	2	6	2868042	2868047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608662
54958	NC_012668	GTT	2	6	2868060	2868065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608662
54959	NC_012668	CTA	2	6	2868122	2868127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608662
54960	NC_012668	ACC	2	6	2868129	2868134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608662
54961	NC_012668	AGA	2	6	2868227	2868232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608662
54962	NC_012668	ATG	2	6	2868253	2868258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608662
54963	NC_012668	TTG	2	6	2868348	2868353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54964	NC_012668	GTG	2	6	2868451	2868456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608663
54965	NC_012668	ACG	2	6	2868470	2868475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608663
54966	NC_012668	CG	3	6	2868474	2868479	0 %	0 %	50 %	50 %	229608663
54967	NC_012668	TCA	2	6	2868513	2868518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608663
54968	NC_012668	GTA	2	6	2868551	2868556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608663
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54970	NC_012668	AAT	2	6	2868634	2868639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608663
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54972	NC_012668	TGC	2	6	2868695	2868700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608663
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54975	NC_012668	ACG	2	6	2868791	2868796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608663
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54990	NC_012668	ACG	2	6	2869523	2869528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608663
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54993	NC_012668	CAA	2	6	2869670	2869675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54994	NC_012668	GAT	2	6	2869794	2869799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608664
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54998	NC_012668	GAAGAT	2	12	2869997	2870008	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	229608664
54999	NC_012668	A	6	6	2870021	2870026	100 %	0 %	0 %	0 %	229608664
55000	NC_012668	GGT	2	6	2870090	2870095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608664

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