MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_012668	CAT	2	6	2819486	2819491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608617
54002	NC_012668	TGC	2	6	2819506	2819511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608617
54003	NC_012668	TCC	2	6	2819533	2819538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229608617
54004	NC_012668	TCA	2	6	2819573	2819578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608617
54005	NC_012668	CTC	2	6	2819592	2819597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229608617
54006	NC_012668	AATC	2	8	2819642	2819649	50 %	25 %	0 %	25 %	229608617
54007	NC_012668	CGC	2	6	2819665	2819670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608617
54008	NC_012668	TCTGAA	2	12	2819702	2819713	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229608617
54009	NC_012668	AACC	2	8	2819751	2819758	50 %	0 %	0 %	50 %	229608617
54010	NC_012668	ATG	2	6	2819771	2819776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608617
54011	NC_012668	TTG	2	6	2819961	2819966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608617
54012	NC_012668	GTG	2	6	2819980	2819985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608617
54013	NC_012668	GCA	2	6	2819998	2820003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608617
54014	NC_012668	CTAAA	2	10	2820005	2820014	60 %	20 %	0 %	20 %	229608617
54015	NC_012668	GTG	2	6	2820104	2820109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54016	NC_012668	ATG	2	6	2820178	2820183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608618
54017	NC_012668	GTG	2	6	2820203	2820208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608618
54018	NC_012668	GCAG	2	8	2820240	2820247	25 %	0 %	50 %	25 %	229608618
54019	NC_012668	ATG	2	6	2820251	2820256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608618
54020	NC_012668	CGT	2	6	2820261	2820266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608618
54021	NC_012668	GAA	2	6	2820289	2820294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608618
54022	NC_012668	CAC	2	6	2820398	2820403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608618
54023	NC_012668	TGC	2	6	2820455	2820460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608618
54024	NC_012668	TCAA	2	8	2820545	2820552	50 %	25 %	0 %	25 %	229608618
54025	NC_012668	GCC	2	6	2820575	2820580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608618
54026	NC_012668	TGA	2	6	2820606	2820611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608618
54027	NC_012668	TGG	2	6	2820737	2820742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608618
54028	NC_012668	ATC	2	6	2820880	2820885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608618
54029	NC_012668	ATT	2	6	2821024	2821029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608618
54030	NC_012668	GATG	2	8	2821059	2821066	25 %	25 %	50 %	0 %	229608618
54031	NC_012668	CGA	2	6	2821169	2821174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608618
54032	NC_012668	CG	3	6	2821185	2821190	0 %	0 %	50 %	50 %	229608618
54033	NC_012668	CGG	2	6	2821206	2821211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608618
54034	NC_012668	ATC	2	6	2821273	2821278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608618
54035	NC_012668	CTGC	2	8	2821462	2821469	0 %	25 %	25 %	50 %	229608619
54036	NC_012668	TC	3	6	2821488	2821493	0 %	50 %	0 %	50 %	229608619
54037	NC_012668	TTAT	2	8	2821566	2821573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54038	NC_012668	CACC	2	8	2821620	2821627	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54039	NC_012668	CAC	2	6	2821644	2821649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54040	NC_012668	AC	3	6	2821770	2821775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54041	NC_012668	ACA	2	6	2821792	2821797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54042	NC_012668	ACT	2	6	2821814	2821819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54043	NC_012668	TTG	2	6	2821831	2821836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608620
54044	NC_012668	ATC	2	6	2821851	2821856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608620
54045	NC_012668	CTT	2	6	2821937	2821942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608620
54046	NC_012668	AAT	2	6	2821965	2821970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608620
54047	NC_012668	TGC	2	6	2822057	2822062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608620
54048	NC_012668	TGGATG	2	12	2822097	2822108	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	229608620
54049	NC_012668	T	6	6	2822115	2822120	0 %	100 %	0 %	0 %	229608620
54050	NC_012668	GCC	2	6	2822124	2822129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608620
54051	NC_012668	AGA	3	9	2822168	2822176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608620
54052	NC_012668	GGC	2	6	2822193	2822198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608620
54053	NC_012668	TAC	2	6	2822205	2822210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608620
54054	NC_012668	TGC	2	6	2822284	2822289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608620
54055	NC_012668	TGG	2	6	2822435	2822440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608620
54056	NC_012668	GTG	2	6	2822472	2822477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608620
54057	NC_012668	CAT	2	6	2822498	2822503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608620
54058	NC_012668	ATT	2	6	2822550	2822555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229608620
54059	NC_012668	GAT	2	6	2822558	2822563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608620
54060	NC_012668	GCG	2	6	2822601	2822606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608620
54061	NC_012668	TTGG	2	8	2822608	2822615	0 %	50 %	50 %	0 %	229608620
54062	NC_012668	G	6	6	2822614	2822619	0 %	0 %	100 %	0 %	229608620
54063	NC_012668	CGC	2	6	2822669	2822674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608620
54064	NC_012668	GCA	2	6	2822702	2822707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608620
54065	NC_012668	TCTA	2	8	2822727	2822734	25 %	50 %	0 %	25 %	229608620
54066	NC_012668	CAT	2	6	2822849	2822854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608620
54067	NC_012668	CAG	2	6	2822858	2822863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608620
54068	NC_012668	GTT	2	6	2822933	2822938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608620
54069	NC_012668	CTT	2	6	2822939	2822944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608620
54070	NC_012668	TAC	2	6	2822951	2822956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608620
54071	NC_012668	TAC	3	9	2822967	2822975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608620
54072	NC_012668	CCG	2	6	2823002	2823007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608620
54073	NC_012668	TGGCT	2	10	2823130	2823139	0 %	40 %	40 %	20 %	229608620
54074	NC_012668	CAT	4	12	2823152	2823163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608620
54075	NC_012668	CTT	2	6	2823164	2823169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608620
54076	NC_012668	GGC	2	6	2823188	2823193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608620
54077	NC_012668	GGGAA	2	10	2823283	2823292	40 %	0 %	60 %	0 %	229608620
54078	NC_012668	ACA	2	6	2823387	2823392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54079	NC_012668	ATA	2	6	2823470	2823475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608621
54080	NC_012668	CTT	2	6	2823555	2823560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608621
54081	NC_012668	TGG	2	6	2823576	2823581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608621
54082	NC_012668	TTGA	2	8	2823598	2823605	25 %	50 %	25 %	0 %	229608621
54083	NC_012668	CCG	2	6	2823828	2823833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608621
54084	NC_012668	GTAA	2	8	2823951	2823958	50 %	25 %	25 %	0 %	229608621
54085	NC_012668	CTT	2	6	2824041	2824046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608621
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54087	NC_012668	CGC	2	6	2824081	2824086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608621
54088	NC_012668	TTG	2	6	2824163	2824168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608621
54089	NC_012668	GGT	2	6	2824188	2824193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229608621
54090	NC_012668	TG	4	8	2824381	2824388	0 %	50 %	50 %	0 %	229608621
54091	NC_012668	ACATC	2	10	2824395	2824404	40 %	20 %	0 %	40 %	229608621
54092	NC_012668	CAC	2	6	2824476	2824481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608621
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54095	NC_012668	TTGG	2	8	2824652	2824659	0 %	50 %	50 %	0 %	229608621
54096	NC_012668	ACG	2	6	2824762	2824767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608621
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54099	NC_012668	ATCC	2	8	2825012	2825019	25 %	25 %	0 %	50 %	229608621
54100	NC_012668	GGAT	2	8	2825138	2825145	25 %	25 %	50 %	0 %	229608621
54101	NC_012668	TCCA	2	8	2825161	2825168	25 %	25 %	0 %	50 %	229608621
54102	NC_012668	ACC	2	6	2825198	2825203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608621
54103	NC_012668	TGC	2	6	2825237	2825242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608621
54104	NC_012668	CAAT	2	8	2825355	2825362	50 %	25 %	0 %	25 %	229608621
54105	NC_012668	GGC	2	6	2825386	2825391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608621
54106	NC_012668	CAA	2	6	2825404	2825409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608621
54107	NC_012668	TC	3	6	2825440	2825445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54108	NC_012668	ACAAGG	2	12	2825463	2825474	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54109	NC_012668	GA	3	6	2825479	2825484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54110	NC_012668	AAT	2	6	2825511	2825516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54111	NC_012668	ATT	2	6	2825544	2825549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54112	NC_012668	GA	3	6	2825565	2825570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54113	NC_012668	GA	3	6	2825614	2825619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54114	NC_012668	TG	3	6	2825642	2825647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54115	NC_012668	GCA	2	6	2825917	2825922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608622
54116	NC_012668	CGA	2	6	2825961	2825966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608622
54117	NC_012668	GT	3	6	2825979	2825984	0 %	50 %	50 %	0 %	229608622
54118	NC_012668	A	6	6	2825993	2825998	100 %	0 %	0 %	0 %	229608622
54119	NC_012668	GAT	2	6	2826031	2826036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608622
54120	NC_012668	CCT	2	6	2826061	2826066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229608622
54121	NC_012668	TG	3	6	2826075	2826080	0 %	50 %	50 %	0 %	229608622
54122	NC_012668	CTTGG	2	10	2826148	2826157	0 %	40 %	40 %	20 %	229608622
54123	NC_012668	T	6	6	2826220	2826225	0 %	100 %	0 %	0 %	229608622
54124	NC_012668	ACC	2	6	2826243	2826248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608622
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54126	NC_012668	AAC	2	6	2826417	2826422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608622
54127	NC_012668	GCT	2	6	2826495	2826500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608622
54128	NC_012668	ACTG	2	8	2826503	2826510	25 %	25 %	25 %	25 %	229608622
54129	NC_012668	CAG	2	6	2826542	2826547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608622
54130	NC_012668	GCA	2	6	2826565	2826570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608622
54131	NC_012668	TGT	2	6	2826660	2826665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608623
54132	NC_012668	TGT	2	6	2826696	2826701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608623
54133	NC_012668	CG	3	6	2826715	2826720	0 %	0 %	50 %	50 %	229608623
54134	NC_012668	TTTG	2	8	2826737	2826744	0 %	75 %	25 %	0 %	229608623
54135	NC_012668	CT	3	6	2826819	2826824	0 %	50 %	0 %	50 %	229608623
54136	NC_012668	TCAATA	2	12	2826948	2826959	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	229608623
54137	NC_012668	TGC	2	6	2827113	2827118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608623
54138	NC_012668	TGC	2	6	2827203	2827208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608623
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54140	NC_012668	CAAT	2	8	2827370	2827377	50 %	25 %	0 %	25 %	229608624
54141	NC_012668	CGA	2	6	2827434	2827439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608624
54142	NC_012668	CTT	2	6	2827446	2827451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229608624
54143	NC_012668	GCA	2	6	2827500	2827505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608624
54144	NC_012668	GCC	2	6	2827539	2827544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229608624
54145	NC_012668	TGGT	2	8	2827590	2827597	0 %	50 %	50 %	0 %	229608624
54146	NC_012668	TCA	2	6	2827598	2827603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229608624
54147	NC_012668	TGC	2	6	2827622	2827627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608624
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54150	NC_012668	TGC	2	6	2827688	2827693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608624
54151	NC_012668	GA	3	6	2827794	2827799	50 %	0 %	50 %	0 %	229608624
54152	NC_012668	ACC	2	6	2827808	2827813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608624
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54154	NC_012668	ACC	2	6	2827868	2827873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608624
54155	NC_012668	CAGC	2	8	2827920	2827927	25 %	0 %	25 %	50 %	229608624
54156	NC_012668	CA	3	6	2828034	2828039	50 %	0 %	0 %	50 %	229608624
54157	NC_012668	TCAA	2	8	2828156	2828163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54158	NC_012668	GAC	2	6	2828210	2828215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54159	NC_012668	GC	3	6	2828217	2828222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54160	NC_012668	A	6	6	2828232	2828237	100 %	0 %	0 %	0 %	229608625
54161	NC_012668	T	6	6	2828269	2828274	0 %	100 %	0 %	0 %	229608625
54162	NC_012668	TAA	2	6	2828292	2828297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229608625
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54164	NC_012668	TGAG	2	8	2828362	2828369	25 %	25 %	50 %	0 %	229608626
54165	NC_012668	AAGC	2	8	2828389	2828396	50 %	0 %	25 %	25 %	229608626
54166	NC_012668	GAG	2	6	2828459	2828464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229608626
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54173	NC_012668	AAAAT	2	10	2828921	2828930	80 %	20 %	0 %	0 %	229608626
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54181	NC_012668	CCCA	2	8	2829498	2829505	25 %	0 %	0 %	75 %	229608627
54182	NC_012668	TGCGGT	2	12	2829560	2829571	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	229608627
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54192	NC_012668	TGAT	3	12	2829890	2829901	25 %	50 %	25 %	0 %	229608627
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54200	NC_012668	AC	3	6	2830240	2830245	50 %	0 %	0 %	50 %	229608627
54201	NC_012668	CCA	2	6	2830270	2830275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608627
54202	NC_012668	TCAT	2	8	2830359	2830366	25 %	50 %	0 %	25 %	229608627
54203	NC_012668	TGCT	2	8	2830384	2830391	0 %	50 %	25 %	25 %	229608628
54204	NC_012668	GCA	2	6	2830407	2830412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608628
54205	NC_012668	AGCTTG	2	12	2830531	2830542	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229608628
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54208	NC_012668	TGAGCA	2	12	2830694	2830705	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	229608628
54209	NC_012668	GC	3	6	2830763	2830768	0 %	0 %	50 %	50 %	229608628
54210	NC_012668	CTG	2	6	2830870	2830875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608628
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54212	NC_012668	GTT	2	6	2830998	2831003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229608628
54213	NC_012668	T	6	6	2831047	2831052	0 %	100 %	0 %	0 %	229608628
54214	NC_012668	A	6	6	2831089	2831094	100 %	0 %	0 %	0 %	229608628
54215	NC_012668	GCA	2	6	2831111	2831116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608628
54216	NC_012668	CAG	2	6	2831143	2831148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608628
54217	NC_012668	TCG	2	6	2831202	2831207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608628
54218	NC_012668	CTG	2	6	2831251	2831256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608628
54219	NC_012668	AATAA	2	10	2831300	2831309	80 %	20 %	0 %	0 %	229608628
54220	NC_012668	TCA	2	6	2831363	2831368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54221	NC_012668	ATC	2	6	2831369	2831374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54222	NC_012668	TGC	2	6	2831636	2831641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608629
54223	NC_012668	GC	3	6	2831640	2831645	0 %	0 %	50 %	50 %	229608629
54224	NC_012668	GGC	2	6	2831783	2831788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608629
54225	NC_012668	CA	3	6	2831864	2831869	50 %	0 %	0 %	50 %	229608629
54226	NC_012668	CAC	2	6	2831896	2831901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229608629
54227	NC_012668	ATG	2	6	2831923	2831928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229608629
54228	NC_012668	AGC	2	6	2831936	2831941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608629
54229	NC_012668	GAA	2	6	2832019	2832024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608629
54230	NC_012668	GGC	2	6	2832027	2832032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229608629
54231	NC_012668	CT	3	6	2832154	2832159	0 %	50 %	0 %	50 %	229608629
54232	NC_012668	AC	3	6	2832161	2832166	50 %	0 %	0 %	50 %	229608629
54233	NC_012668	TGGC	2	8	2832219	2832226	0 %	25 %	50 %	25 %	229608629
54234	NC_012668	GC	3	6	2832248	2832253	0 %	0 %	50 %	50 %	229608629
54235	NC_012668	TGGCTG	2	12	2832286	2832297	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	229608629
54236	NC_012668	TGC	2	6	2832365	2832370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608629
54237	NC_012668	GCA	2	6	2832381	2832386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608629
54238	NC_012668	CTCG	2	8	2832390	2832397	0 %	25 %	25 %	50 %	229608629
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54247	NC_012668	CTG	2	6	2833224	2833229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229608630
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54253	NC_012668	ACTC	2	8	2833484	2833491	25 %	25 %	0 %	50 %	229608630
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54258	NC_012668	TTGC	2	8	2833697	2833704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54259	NC_012668	TAA	2	6	2833711	2833716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54340	NC_012668	GCA	2	6	2837929	2837934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608634
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54350	NC_012668	AAG	2	6	2838308	2838313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229608634
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54353	NC_012668	CGA	2	6	2838362	2838367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229608634
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54360	NC_012668	TTAA	2	8	2838576	2838583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54361	NC_012668	A	6	6	2838598	2838603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54365	NC_012668	ACA	2	6	2838701	2838706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54412	NC_012668	ATT	2	6	2840657	2840662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54462	NC_012668	T	6	6	2843270	2843275	0 %	100 %	0 %	0 %	229608637
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54467	NC_012668	ACA	2	6	2843422	2843427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229608637
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